(2021年整理)NCBI上下載基因序列

1、一.（完整版）NCBI上下載基因序列三、五、六、七、八、九、!1!、編輯整理:尊敬的讀者朋友們：五、六、七、八、九、!1!、編輯整理:尊敬的讀者朋友們：十、這里是精品文檔編輯中心，本文檔內(nèi)容是由掰口我的同事精心編輯整理后發(fā)布的，發(fā)布之前我們對(duì)文中內(nèi)容進(jìn)行仔細(xì)校對(duì)，但是難免會(huì)有疏漏的地方，但是任然希望（完整版）NCBI上下載基因序列）的內(nèi)容能夠給您的工作和學(xué)習(xí)帶來(lái)便利。同時(shí)也真誠(chéng)的希望收到您的建議和反饋，這將是我們進(jìn)步的源泉，前進(jìn)的動(dòng)力。十、十一、本文可編輯可修改，如果覺(jué)得對(duì)您有幫助請(qǐng)收藏以便隨時(shí)查閱，最后祝您生活愉快業(yè)績(jī)進(jìn)步，以下為（完整版）NCBI上下載基因序列的全部?jī)?nèi)容。十二、十三、（完整

2、版）NCBI上下載基因序列十四.卜五、十六、編輯整理:張嬉雒老師十七、十八、十三、（完整版）NCBI上下載基因序列十四.卜五、十六、編輯整理:張嬉雒老師十七、十八、十九、二十、尊敬的讀者朋友們:二十二、這里是精品文檔編輯中心，本文檔內(nèi)容是由我和我的同事精心編輯整理后發(fā)二十二、布到文庫(kù)，發(fā)布之前我們對(duì)文中內(nèi)容進(jìn)行仔細(xì)校對(duì)，但是難免會(huì)有疏漏的地方，但是我們?nèi)稳幌Ｍㄍ暾妫㎞CBI上下載基因序列這篇文檔能夠給您的工作和學(xué)習(xí)帶來(lái)便利。同時(shí)我們也真誠(chéng)的希望收到您的建議和反饋到下面的留言區(qū)，這將是我們進(jìn)步的源泉，前進(jìn)的動(dòng)力。二十三、本文可編輯可修改,如果覺(jué)得對(duì)您有幫助請(qǐng)下載收藏以便隨時(shí)查閱，最后祝您生活

3、愉快業(yè)績(jī)進(jìn)步，以下為（完整版）NCBI上下載基因序列這篇文檔的全部?jī)?nèi)容.二十四、（完整版）（完整版）NC8I上下載基因序列二十五、NCBI上下載基因序列、mRNA、CDS序列的方法.打開(kāi)NCBI網(wǎng)站，第一個(gè)框選擇Gene,第二個(gè)框輸入基因名稱，如ALK基因，點(diǎn)擊Search.進(jìn)入第二頁(yè)面后，會(huì)看到如下一系列跟ALK基因相關(guān)的信息,根據(jù)description和location的信息，找到自己需要的基因?？丈蛑斜硎镜氖俏锓N.我需要的是人類的基因，故選擇第一個(gè)。點(diǎn)擊ALK,進(jìn)入下一個(gè)頁(yè)面.SearchresultsItems:1to20of2651FirstPimPageTJof133NextLa

4、siOSeeals073discontinuedorreplaceditems.Name/GeneIDDescnptonLocationAliasesMIMALKanaplasticlymphomareceptortyrosineChromosome2.NC000002.12CD246,NBLST3105590ID：238kinase|hfomooap/ejs(human)(ptement)AikanaplasticlymphomakinaseMusChromosome17.NC_000083.6CD246,TerrID：11682musculus(housemouse)(71868988.7

5、2604648,comptemont)AikAnaplasticlymphomakmasoChromosome2R.NT_033778.4DmGl_CG8250.ALK,CG82S0,DAlk,ID.53425Clrosop所后melanogasief(fruitfly)(1662529316640311,comptement)DAIk53,DmenCG8250.alk.dALK.mili.進(jìn)入后，會(huì)看到以下關(guān)于ALK基因的詳細(xì)信息:Sendto:Sendto:ALKanaplasticlymphomareceptortyrosinekinaseHomosapiens(human)GeneID

6、238,upcbledon6-D9C-2016SummaryOfficialSymbolOfficialFullNamePrimarysourceOfficialSymbolOfficialFullNamePrimarysourceSeerelatedGenetypeRefSeqstatusOrganismLirwageAlsoknownasSummaryanaplasticlymphomareceplort/rosinekinaaepro漢d5hgncHGNC.HGNCd27EnsemblENSGOOOOOI71094NN1055知VeqaOTTHUMG000G01520S4proteinc

7、odingREVIEWEDHomosapiensEukaryota.Metazoa.Chordata.Craniala.Vertebrata.Euteteostcnii.Mammaba.Eutheria.Euarchontoglres.Pnmates;Hapicrrhini.Catarrhni.Hcmmidae.Hcnx?CD246,NBLST3ThisgeneencodesarecepcortyrosinekinasewtiichbelongstotheinsulinreceptorsuperfamiyThisproteincomposesanextracellulardomain,anhy

8、drophobicstretchcorresponding10asinglepassUansmerrbraneregionandanintraceflulafkinasedomainItpteysanimportantroleinthedevelcpmentofthebrainandexertsitseffectsucoriRrnaiirnncinIhoncvraccsiciomTKccocohachoonfrwmdInhoroarranncHmiHaFcdnrnEcIrfiaHinaccriocrrfttimruircirvliidirvnsnanlachrlarnorol這些信息可以略過(guò)，

9、往下查看，點(diǎn)擊下圖紅色框中的SeeALKinGenomeDataViewer,進(jìn)入下個(gè)頁(yè)面。GenomiccontextLocation:2P232-p231GenomiccontextLocation:2P232-p231Exoncount:2gSeeALKmGenorpePalaViewMap62回AnnotatesrefeaseStatusAssemblyChrLocationIDScurrentGRCh歿p7(GCF00000140533)2NC_CO0OO212P9192774.29921611.cogetnenl)1D5prevxiusassemblyGRCh37p13(GCF其e

10、)4L*Mtfcrt2Go，箕!_“5cqeLoreftrNe_OM09.19.3QMJ3CM(*7e)4HCMCO32C;SW2774351811x三產(chǎn)Jg”P(pán)92WK叩如，p?35K|S9.-CK|294I：|25eK1295MI129.WI：B|2?nKIZ94KKTook，：。Trwcia書(shū)Evaw?cokLZ9,raK-Gen”,NZS：K=rcaapianaAnnctacicnPXaaaaICS,2flie-O-0*TJlect-aaw*/tochange*w*/tochange*IO0OOfmVHWYOHTTl“DRSrDds-uRQMHTHTBn口flasg-HscoIrpnn

11、D-9AM-e3mn:!99ns4ansQBR-1SHS3S3-mmmDg鄲A9jynmH-H-t-l如I，X5衿犯2Hl:；)4m，,:，H-H郴，)4m，,:，H-H郴，LM，-1-:一HTHH+T-T-闡TLCCKH9W93E6239932111一1JII;1雄，399句.2.392.21XRJ39924.2)NO3S23.2|4*1跖上7間乙河H7RW93.2MX5灰B.2HI-IP4II;1;I;:III1111IPALKGene:ALKTitle:enaplsticlyniplKnwreceptortyrosinskineloomon:ccmpi5Cnt(a132,774.2932

12、1,611)Length:726,838Mergedfeturrs:NP_004295J6dNM_0M3O4.4t，t1FM7SL51SPIDownload:NF052932NMOCHXH.WLink*ftTook|ViewCCDS:CCD533172CviewGeneiu2%alk)ViewHGNC:122ViewMIM:10558BLASTGenomk:MC8co32”口9.192力4.29.92LSI。FASfAView:NCODHfXJZcompleterecord）fiIeformat（看壽幾種格式）CreateFile。常用的是FASTA格式和GenBank格式。GenBank格式

13、保存的信息更全面。GenBankw-Homosapienschromosome2,GRCh38.p7PrimaryAssemblyncbiReferencesequence-NC_000002.12FASTAG。kxQLCCUSNC_OODOD2728S38hpDNAlinearCON06-JUN-2016ZEKINITIOKHerosapienscnromoacxe2,GBChsa.p7PrixaxyAssertoly.ACCESSiciaNC00D0D2REGION：2915277.Z99Z111GPC000031294VERSIONNCOODODZ.1Z二BUNKm二CP工。J2CC：P

14、RC1l162A33e-ly：GCF800014G5.33KEYWORDSRerseq.5CURCZHerosapiens(nuzian)ORGANISMHerosapiensEujcaiyoca;Metazoa;Chordaea;Cranlaza;Vezeirata;Euteleoscord.;1CompleteRecordce(abbri1。磔IOCodngSequencesOGeneFeaiuresChoo。,DeclinationIFileOCIipboardOCollectionsOAnalysisToolDownload1demsFormalew|Gen6ank_vShowGl口C

15、reateFileresandCCncSend.八jshown至此就把ALK基因的序列下載了。二.幾種代號(hào)的意思水：_標(biāo)記席歹惻竭至白產(chǎn)物。完整茁基國(guó)分子序列，標(biāo)記的類別包法基班色體、細(xì)麒、質(zhì)粒。、染水：_標(biāo)記席歹惻竭至白產(chǎn)物。完整茁基國(guó)分子序列，標(biāo)記的類別包法基班色體、細(xì)麒、質(zhì)粒。、染杉:故聞邳晅我，住俄NCB】至地主輝連徑”匕女代表性前車初圓縣因或者那些很泄自行化注ACCESSION是NCBI序列數(shù)據(jù)中我們常用到編號(hào)（另一個(gè)是Gl）.ACCESSION形式為C,其中CC為兩個(gè)字母，其不同組合又可以區(qū)分為蛋白序列、核酸序列或其因組序列,而#為位數(shù)不等的故字；ACCESSION后面又會(huì)加版本號(hào)

16、，以形式表示母后的尾數(shù)遞增表示醐信息較之前的版本有所修改.這樣ACCESSION+版本號(hào)就是一個(gè)唯一的袤示，代表一個(gè)唯一的序列.而且這個(gè)嫡號(hào)不會(huì)改變。ACCESSIONMOLECULEMETHODNOILAC_123456GenomicAC_123456GenomicMix”AP_123d56ProteinMixedNC_.123456GenomicMixedNG.123456GenomicMixedNM._123456mRNAMixedNM.123456789毒和原核生物。轉(zhuǎn)錄江切席1；成熟mRKA錄聿曲卜|微信號(hào)：H引1/U修一股來(lái)說(shuō)，mRNAK基因組序列是我們主要的尋找對(duì)袤。如果想找標(biāo)準(zhǔn)序列的話，mRN陽(yáng)采用NM_開(kāi)頭的,基因組用NC_或者ACJF頭的，soeasy!NP_123456NP.123456789ProteinMixedHEE；主建是全區(qū)轉(zhuǎn)錄覆月管序冽，但也有T總有詡：EB陸的渤5U3敵腳1。NR_1234S6RNAMixed非用足B1荏錄子序列，包延結(jié)構(gòu)RNAs