教學(xué)培訓(xùn)-外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索工具M(jìn)edline-與-PubMed課件

1、Medline 與 PubMed山西醫(yī)科大學(xué)信息檢索教研室第四章 外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索工具M(jìn)edline 與 PubMed山西醫(yī)科大學(xué)信息檢索教研室Medline & PubMedIndex Medcus(1879-2006) 印刷版Medline(1969-) 國際聯(lián)機(jī)DIALOGMedline(1983-) 光盤版 PubMed(1997-) 網(wǎng)絡(luò)版Medline & PubMedIndex Medcus(1 第一節(jié) MEDLINE一、概況 收錄范圍：1950年至今 國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM) 世界權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 70多個國家的3700多種期刊（中國50種）內(nèi)容涉及生物醫(yī)學(xué)各個領(lǐng)域 網(wǎng)

2、絡(luò)檢索入口多 第一節(jié) MEDLINE一、概況一、 概況3種索引： Index Medicus (醫(yī)學(xué)索引) Index to Dental Literature(牙科索引) International Nursing Index(國際護(hù)理索引) 除了不能進(jìn)行分類和中文主題詞途徑檢索外，其他與CBM(中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫)相似。 一、 概況3種索引：二、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu) (數(shù)據(jù)庫常用字段)TI：Title 篇名AU：Authors 著者姓名AD：Address 著者地址SO：Source 文獻(xiàn)出處（刊名，年卷期頁）PY：Publication Year 出版年AB：Abstract 文摘 PT：Pu

3、blication Type 出版類型MeSH: Medical Subject Headings 醫(yī)學(xué)主題詞二、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu) (數(shù)據(jù)庫常用字段)TI：Title MJME： 主要主題詞MIME： 次要主題詞ISSN: International Standard Serial Number 國際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版號LA: Language of Article 文獻(xiàn)語種CP: Country of Publication 出版國AN: Accession Number 登錄號UD: Update Code 更新號二、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu) (數(shù)據(jù)庫常用字段)MJME： 主要主題詞二、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu) (數(shù)據(jù)庫常用三、

4、檢索途徑與方法自由詞檢索（Searches）索引詞檢索（Index）主題詞檢索（Thesaurus）字段檢索（Specific Fields）指定詞檢索（Add to Search）主題詞提示檢索（Suggest）三、檢索途徑與方法自由詞檢索（Searches）基本檢索索引檢索工具按鈕欄檢索區(qū)檢索 區(qū)結(jié)果顯示區(qū)主題詞檢索主題詞提示檢索界面指定詞檢索其它功能基本檢索索引檢索工具按鈕欄檢索區(qū)檢索 區(qū)結(jié)果顯示區(qū)主題詞檢四、醫(yī)學(xué)主題詞表-MeSHMedical Subject Headings使用CBM、Medline、PubMed的指南用于醫(yī)學(xué)主題詞的規(guī)范由字順表和樹狀結(jié)構(gòu)表組成主題詞約2萬個，副主

5、題詞83個動態(tài)性四、醫(yī)學(xué)主題詞表-MeSHMedical Subject字順表（Alphabetic List)按字順排列提供主題詞、副主題詞、分類號注釋及相關(guān)詞樹狀結(jié)構(gòu)部分詞倒置，如KIDNEY FAILURE, ACUTE幫助用戶規(guī)范和了解主題詞字順表（Alphabetic List)按字順排列主題詞樹狀結(jié)構(gòu)號注釋與說明相關(guān)檢索詞副主題詞 注釋樹狀結(jié)構(gòu)主題詞樹狀結(jié)構(gòu)號注釋與說明相關(guān)檢索詞副主題詞 注釋樹狀結(jié)構(gòu)樹狀結(jié)構(gòu)表（Tree Structrue ）根據(jù)詞義范疇和學(xué)科屬性排列16類（解剖學(xué)、生物、疾病)較好的體現(xiàn)了詞間的隸屬、平行、派生關(guān)系一個主題詞可有多個樹狀結(jié)構(gòu)號幫助用戶查找規(guī)范主題

6、詞樹狀結(jié)構(gòu)表（Tree Structrue ）根據(jù)詞義范疇和學(xué)教學(xué)培訓(xùn)_外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索工具M(jìn)edline-與-PubMed課件教學(xué)培訓(xùn)_外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索工具M(jìn)edline-與-PubMed課件第二節(jié) PubMed1、主辦單位 國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)2、收錄學(xué)科內(nèi)容 主要收錄生物醫(yī)學(xué)和健康科學(xué)以及生命科學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的文獻(xiàn)。包括行為科學(xué)、健康專業(yè)所需要的化學(xué)、生物工藝學(xué)，基礎(chǔ)研究和臨床、護(hù)理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生 發(fā)展或相關(guān)教育活動的內(nèi)容。2000年起增加了生物、環(huán)境科學(xué)、海洋生物、植物和動物學(xué)、生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究內(nèi)容。2022/10/415第二節(jié) PubMed1、主辦單位 國立

7、醫(yī)學(xué)圖書館(NL3、文獻(xiàn)來源 全球70多個國家和地區(qū)近5000種生物醫(yī)學(xué)期刊涉及40多個語種47%為 本土出版文獻(xiàn)，90%為英文文獻(xiàn)，79%的文獻(xiàn)有著者撰寫的英文文摘2022/10/416一、數(shù)據(jù)庫概況3、文獻(xiàn)來源 2022/10/216一、數(shù)據(jù)庫概況4、PubMed收錄數(shù)據(jù) MEDLINE Indexed1966 to prensent的MEDLINE已標(biāo)引數(shù)據(jù)，有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有PubMed-indexed for MEDLINE OldMDENLINE1949-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù)，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有PubMed-OLDMEDLINE for

8、 Pre1966 2022/10/417一、數(shù)據(jù)庫概況4、PubMed收錄數(shù)據(jù) 2022/10/217一、數(shù)據(jù)庫概4、PubMed收錄數(shù)據(jù) MEDLINE Inprocess最新的MDENLINE尚未標(biāo)引的處理中數(shù)據(jù)。每條記錄標(biāo)有PubMed-in process。Not MEDLINE是出版商提供的電子文獻(xiàn)，PubMed 收錄，而MDENLINE不收錄的數(shù)據(jù)。每條記錄標(biāo)有PubMed-as supplied by publisher。2022/10/418一、數(shù)據(jù)庫概況4、PubMed收錄數(shù)據(jù) 2022/10/218一、數(shù)據(jù)庫概2022/10/419基本檢索輸入框工具與資源：提供期刊數(shù)據(jù)庫檢

9、索、規(guī)范詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻(xiàn)檢索等高級檢索5、主頁介紹數(shù)據(jù)庫選擇2022/10/219基本檢索輸入框工具與資源：提供期刊數(shù)據(jù)2022/10/420可以在檢索欄中輸入一個或多個檢索詞（空格=AND） 如：placenta growth oxygen可以在檢索欄中輸入布爾邏輯運(yùn)算式（運(yùn)算符大寫） 如：asthma AND (therapy OR treatment)二、基本檢索規(guī)則2022/10/220可以在檢索欄中輸入一個或多個檢索詞（空二、PubMed 基本檢索規(guī)則字段限定符： ，按詞組匹配 如：Stem cell transplantationti截詞符：treat*強(qiáng)迫短語檢索符：“in

10、terleukin 2” 嚴(yán)格按輸入形式匹配，不再自動轉(zhuǎn)換匹配和擴(kuò)展檢索，常用于詞組和專有名詞檢索。2022/10/421二、PubMed 基本檢索規(guī)則字段限定符： ，按詞組匹二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞：對常用醫(yī)學(xué)名詞進(jìn)行自動在規(guī)范詞索引、文本詞及所有記錄字段中轉(zhuǎn)換匹配。renal failure kidney failureMESH OR kidneyAll Field OR renal failure All Field2022/10/422二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞：2022/二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動擴(kuò)展檢索：系統(tǒng)自動對主題詞、副主題

11、詞擴(kuò)展檢索。如：輸入hypertension therapy，系統(tǒng)自動檢索高血壓的藥物治療（drug therapy）、飲食療法(diet therapy)2022/10/423二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動擴(kuò)展檢索：2022/10/二、PubMed 基本檢索規(guī)則著者檢索(authors)：姓全稱在前，名縮寫在后 加字段限定符如： genbacev oau moore amau2002年以后的文章可以查著者全名 如：joshua lederberg au2022/10/424二、PubMed 基本檢索規(guī)則著者檢索(authors)：2二、PubMed 基本檢索規(guī)則期刊檢索（journals

12、）：刊名全稱檢索new england journal of medicinesoMEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)刊名縮寫檢索例：N Engl J Medso國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號檢索例：0028-4793so2022/10/425二、PubMed 基本檢索規(guī)則期刊檢索（journals）：PubMed記錄字段說明2022/10/426文摘第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻(xiàn)合著者文獻(xiàn)參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期PubMed記錄字段說明2022/10/226文摘2022/10/427電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓

13、名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋 編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號 立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱2022/10/227電子出版日期2022/10/428最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)編號2022/10/228最后修訂日期2022/10/429作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式（紙張或電子） 參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的

14、數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻(xiàn)標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻(xiàn)文獻(xiàn)正在更新期刊卷號2022/10/229作為主題詞的個人姓名1、基本檢索 2、高級檢索3、MeSH數(shù)據(jù)庫檢索4、期刊檢索5、臨床咨詢2022/10/430三、檢索方法1、基本檢索 2022/10/230三、檢索方法2022/10/431綜述免費(fèi)全文輸入多個檢索詞placenta growth oxygen2022/10/231綜述免費(fèi)全文輸入多個檢索詞2022/10/432字段限定 stem cell transplantationti2022/10/232字段限定2022/

15、10/433stem cellti AND transplantationti比空格多檢出400篇2022/10/233stem cellti AND t2022/10/434輸入renal failure自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞2022/10/234輸入renal failure自動轉(zhuǎn)換2022/10/435自動擴(kuò)展檢索2022/10/235自動擴(kuò)展檢索2022/10/436著者檢索moore amau2022/10/236著者檢索2022/10/437期刊檢索: New england journal of medicineso 2022/10/237期刊檢索: New england j教學(xué)培

16、訓(xùn)_外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索工具M(jìn)edline-與-PubMed課件主題詞約2萬個，副主題詞83個AN: Accession Number 登錄號多欄復(fù)合檢索時，檢索框中只能輸入檢索詞，不能輸入檢索式四、醫(yī)學(xué)主題詞表-MeSH山西醫(yī)科大學(xué)信息檢索教研室由字順表和樹狀結(jié)構(gòu)表組成包括SCI Expanded、SSCI、A&HCI三個數(shù)據(jù)庫全文、免費(fèi)全文、摘要限定嚴(yán)格按輸入形式匹配，不再自動轉(zhuǎn)換匹配和擴(kuò)展檢索，常用于詞組和專有名詞檢索。索引詞檢索（Index）全世界最大、最全面的化學(xué)化工領(lǐng)域的學(xué)術(shù)信息數(shù)據(jù)庫除了不能進(jìn)行分類和中文主題詞途徑檢索外，其他與CBM(中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫)相似。例：0028-47

17、93so使用CBM、Medline、PubMed的指南MEDLINE IndexedIndex Medicus (醫(yī)學(xué)索引)MeSH: Medical Subject Headings 醫(yī)學(xué)主題詞MEDLINE: （最完整，有標(biāo)識符）2、高級檢索在一個網(wǎng)頁中集基本檢索、檢索 、多欄復(fù)合檢索、索引查詢、邏輯算符選擇、檢索限制于一體 檢索史中顯示歷次檢索式、時間和檢出篇數(shù) 多欄復(fù)合檢索時，檢索框中只能輸入檢索詞，不能輸入檢索式 利用字段限制和邏輯算符，構(gòu)建復(fù)雜檢索式2022/10/439主題詞約2萬個，副主題詞83個2、高級檢索在一個網(wǎng)頁中集基本檢索 （Search History）以列表形式顯示

18、歷次檢索式、檢索時間和檢出篇數(shù)Preview:系統(tǒng)不顯示命中文獻(xiàn)信息，而在History中直接顯示檢索式和檢出篇數(shù)。2022/10/4復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室40檢索式檢索時間檢出篇數(shù)檢索式編號可替代檢索式進(jìn)行輸入檢索如：#17 AND therapy檢索 （Search History）2022/10/22022/10/441索引查詢欄間邏輯組配查找Patrick Concannon于 年發(fā)表在The New England Journal of Medicine上的綜述。多欄復(fù)合檢索concannon p欄內(nèi)不能輸算符，檢索詞間空格默認(rèn)AND運(yùn)算2022/10/241索引查詢欄間邏輯組

19、配查找Patrick檢索限制(Limit)全文、免費(fèi)全文、摘要限定研究對象人/動物限制性別限制文獻(xiàn)類型限制語種限制子文檔限制年齡限制2022/10/442檢索限制(Limit)全文、免費(fèi)全文、摘要限定2022/102022/10/443全文、免費(fèi)全文、摘要限定Limit 檢索限制研究對象人/動物限定語種限定子文檔限定性別限定年齡限定文獻(xiàn)類型限定2022/10/243全文、免費(fèi)全文、摘要限定Limit 構(gòu)建檢索式構(gòu)建檢索式索引查詢（Index）2022/10/445索引查詢（Index）2022/10/245Details （檢索的詳細(xì)匹配過程）顯示檢索詞轉(zhuǎn)換匹配運(yùn)算詳細(xì)過程用途：轉(zhuǎn)換、確定規(guī)范

20、詞 如：liver cancer liver neoplasms修改檢索策略2022/10/446Details （檢索的詳細(xì)匹配過程）2022/10/2462022/10/447檢索明細(xì)數(shù)據(jù)庫匹配過程檢索詞轉(zhuǎn)換顯示用戶輸入的檢索式 2022/10/247檢索明細(xì)數(shù)據(jù)庫匹配過程檢索詞轉(zhuǎn)換顯示用3、Mesh Database 確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞擴(kuò)展主題詞確定主要主題詞檢索（加權(quán)檢索）2022/10/4483、Mesh Database 確定規(guī)范化主題詞2022進(jìn)入 MeSH進(jìn)入 MeSH檢索實(shí)例1：2006-09年有關(guān)舌根癌的治療進(jìn)展。要求： 用MeSH D

21、atabse(主題詞表選詞)檢索PubMed數(shù)據(jù)庫，并用自由詞檢索09年以來發(fā)表的最新文獻(xiàn)。2022/10/450檢索實(shí)例1：2006-09年有關(guān)舌根癌的治療進(jìn)展。2022/課題：提示舌根癌的不同表達(dá)形式：tongue base cancer、cancer/carcinoma/tumor of tongue base、cancer of the base of tongue治療包括：drug therapy、therapy、surgery、radiotherapy、rehabilitation2022/10/451課題：提示舌根癌的不同表達(dá)形式：2022/10/2512022/10/45220

22、22/10/2522022/10/453輸入舌根的自由詞檢索式，與舌腫瘤治療的檢索式進(jìn)行AND運(yùn)算。2022/10/253輸入舌根的自由詞檢索式，與舌腫瘤治療的2022/10/454初步結(jié)果，未限定年份進(jìn)入高級檢索進(jìn)一步限定2022/10/254初步結(jié)果，未限定年份進(jìn)入高級檢索進(jìn)一步2022/10/4552022/10/2552022/10/456檢索結(jié)果2022/10/256檢索結(jié)果4、 Journal database檢索 通過輸入刊名全稱或縮寫等了解該刊基本情況瀏覽期刊上發(fā)表的文獻(xiàn)獲得相關(guān)期刊信息提供電子全文的超鏈按鈕2022/10/4574、 Journal database檢索 20

23、22/102022/10/458期刊數(shù)據(jù)庫檢索2022/10/258期刊數(shù)據(jù)庫檢索2022/10/459輸入待檢期刊名獲得期刊詳細(xì)信息相關(guān)期刊鏈接 2022/10/259輸入待檢期刊名獲得期刊詳細(xì)信息相關(guān)期刊5、臨床咨詢（Clinical Queries)專門檢索臨床研究方面文獻(xiàn)，可進(jìn)行治療、診斷、病因、預(yù)后及臨床實(shí)踐指南五個類目限制，并選擇強(qiáng)調(diào)查全還是強(qiáng)調(diào)查準(zhǔn)2022/10/4605、臨床咨詢（Clinical Queries)專門檢索臨床出版模式（紙張或電子）BA(Biological Abstracts)Biosis Previews輸出方式(Send to)SO：Source 文獻(xiàn)出處

24、（刊名，年卷期頁）UD: Update Code 更新號1907年至今CA的全部內(nèi)容、Medline的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)以及歐美30多家專利機(jī)構(gòu)的信息1949-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù)，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有可以在檢索欄中輸入布爾邏輯運(yùn)算式（運(yùn)算符大寫）2006-09年有關(guān)舌根癌的治療進(jìn)展。BIOSIS Previews主題詞提示檢索（Suggest）基于Web版的生物醫(yī)學(xué)與藥學(xué)數(shù)據(jù)庫SO：Source 文獻(xiàn)出處（刊名，年卷期頁）International Nursing Index(國際護(hù)理索引)PT：Publication Type 出版類型2022/10/461查找系統(tǒng)評

25、價（Systematic Reviews)出版模式（紙張或電子）2022/10/261查找系統(tǒng)評價（S五、其它服務(wù)PubMed Central (PMC)Single Citation Matcher生物信息數(shù)據(jù)庫OMIMGeneBLASTGenome3D Domains2022/10/462StructureTaxonomyNucleotideProteinBookshelf五、其它服務(wù)PubMed Central (PMC)2022進(jìn)入PubMed Centre下拉主頁滾動條至低進(jìn)入PubMed Centre下拉主頁滾動條至低PMC首頁進(jìn)入高級檢索2022/10/464PMC首頁進(jìn)入高級檢

26、索2022/10/264查找腎衰竭的藥物療法2022/10/465全文鏈接查找腎衰竭的藥物療法2022/10/265全文鏈接六、檢索結(jié)果輸出顯示檢索結(jié)果全文獲取保存檢索結(jié)果保存檢索策略2022/10/466六、檢索結(jié)果輸出顯示檢索結(jié)果2022/10/266顯示字段選擇（Display）Summary：標(biāo)題、著者、出處、ID號Abstract: 來源期刊、標(biāo)題、著者、著者地址、記錄性質(zhì)、文獻(xiàn)類型、勘誤、評論、PMID或UI、摘要、MeSH詞等 。MEDLINE: （最完整，有標(biāo)識符）2022/10/467顯示字段選擇（Display）Summary：標(biāo)題、著者、出2022/10/468顯示格式選

27、擇顯示格式（Display Settings）點(diǎn)擊標(biāo)題顯示文摘增強(qiáng)格式排序方式選擇6篇有免費(fèi)全文2022/10/268顯示格式選擇顯示格式（Display 2022/10/469文摘增強(qiáng)格式相關(guān)論文論文涉及的MeSH詞，文獻(xiàn)類型等信息LinkOut外部資源鏈接收費(fèi)全文鏈接，我校訂購的數(shù)據(jù)庫可鏈出全文其他相關(guān)的網(wǎng)上免費(fèi)醫(yī)學(xué)指南信息2022/10/269文摘增強(qiáng)格式相關(guān)論文論文涉及的MeSH下載全文下載全文2022/10/471輸出方式(Send to)輸出方式選擇2022/10/271輸出方式(Send to)輸出方式選擇輸出方式選擇（send to）File：保存檢索結(jié)果Clipboard:

28、剪貼板，多次檢索，可暫存每次檢索需下載的記錄，最后一起保存。 最多允許存儲500條，保留8小時 Email: 通過郵件發(fā)送Collections：將檢索結(jié)果送至My NCBI中Order：全文傳遞服務(wù)，需帳號、收費(fèi) 2022/10/472輸出方式選擇（send to）File：保存檢索結(jié)果2022Medline與PubMed的區(qū)別收錄范圍不同數(shù)據(jù)更新周期不同檢索功能的區(qū)別Pubmed帶有網(wǎng)絡(luò)鏈接功能檢索結(jié)果輸出方式的區(qū)別Pubmed部分帶有全文鏈接Medline與PubMed的區(qū)別收錄范圍不同其它外文檢索工具IM(Index Medicus)Medline,PubMedBA(Biological Abstracts)Biosis PreviewsCA(Cemical Abstracts)SciFinder Schola