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課題2土壤(tǔrǎng)中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)第一頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)課題(kètí)背景1、關(guān)于(guānyú)尿素尿素是一種(yīzhǒnɡ)重要的農(nóng)業(yè)氮肥。但是它不能直接被農(nóng)作物吸收。只有當(dāng)土壤中的細(xì)菌將尿素分解成氨之后才能被植物利用。2、細(xì)菌分解尿素的原因——脲酶土壤中的細(xì)菌分解尿素是因為它們能合成脲酶CO(NH2)2脲酶+CO2NH3+H2O第二頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)
課題(kètí)目的:一、從土壤中分離(fēnlí)出能夠分解尿素的細(xì)菌二、統(tǒng)計每克土壤樣品中究竟含有(hányǒu)多少這樣的細(xì)菌第三頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)一、如何從土壤中分離(fēnlí)出能夠分解尿素的細(xì)菌?土壤有“微生物的天然培養(yǎng)基”之稱。同其他生物環(huán)境相比,土壤中的微生物,數(shù)量最大,種類最多。尤其是在富含有機(jī)質(zhì)的土壤中,有更多的微生物。而這些微生物中只有一小部分能夠分解尿素(niàosù)。那么如何能從眾多的微生物中篩選出能夠分解尿素(niàosù)的細(xì)菌呢?第四頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)資料(zīliào)一:思考:1、科學(xué)家為什么能從熱泉中篩選(shāixuǎn)出耐高溫的Taq細(xì)菌?
DNA多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種在體外將少量DNA大量復(fù)制的技術(shù)(jìshù),而此項技術(shù)(jìshù)的實施必須使用耐高溫(930C)的DNA聚合酶。美國微生物學(xué)家托馬斯·布魯克于1966年在美國黃石國家公園的一個熱泉中發(fā)現(xiàn)了水生耐熱細(xì)菌Taq,并從它體內(nèi)分離出了耐高溫的TaqDNA聚合酶。因為熱泉溫度為70~800C,淘汰了絕大多數(shù)微生物只有Taq細(xì)菌被篩選出來。第五頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)啟示:尋找目的(mùdì)菌種時要根據(jù)它對生存環(huán)境的要求,到相應(yīng)的環(huán)境中去尋找。2、從上述資料中你能得到(dédào)什么啟示?第六頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)實驗室中微生物的篩選(shāixuǎn),也是應(yīng)用同樣的原理:即人為提供有利于目的菌株生長的條件(包括營養(yǎng)、溫度、pH等),同時抑制或阻止其他微生物生長。也就是利用選擇培養(yǎng)基篩選出你想要的目的菌株。比如:不加氮源的培養(yǎng)基——固氮菌不加碳源的培養(yǎng)基——自養(yǎng)微生物加入高濃度食鹽的培養(yǎng)基——金黃色葡萄球菌
允許特定種類的微生物生長,同時抑制(yìzhì)或阻止其他種類微生物生長的培養(yǎng)基。第七頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)以尿素(niàosù)為唯一氮源的培養(yǎng)基——能夠分離尿素的細(xì)菌只有能分解尿素的細(xì)菌才能分解尿素,以尿素作為氮源。而不能分解尿素的微生物由于不能分解尿素,缺乏氮源而無法生長繁殖,所以(suǒyǐ)用此培養(yǎng)基就能夠選擇出能夠分解尿素的細(xì)菌。思考:什么樣的培養(yǎng)基能選擇培養(yǎng)出能夠分離(fēnlí)尿素的細(xì)菌呢?第八頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)思考:1、該培養(yǎng)基中有哪些成分?它們分別為微生物生長(shēngzhǎng)提供了什么營養(yǎng)?2、從物理性質(zhì)看此培養(yǎng)基屬于哪類?從功能上看屬于哪類?第九頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)1、顯微鏡直接計數(shù)法——全部細(xì)菌數(shù)利用血球計數(shù)(jìshù)板,在顯微鏡下計算一定容積里樣品中微生物的數(shù)量。統(tǒng)計菌落(jūnluò)數(shù)目的方法:二、如何統(tǒng)計每克土壤樣品中究竟含有多少(duōshǎo)這樣的細(xì)菌?2、稀釋涂布平板法——活菌數(shù)(最常用)3、濾膜法第十頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)計算方法:
每克樣品中的菌落數(shù)=(C÷V)×M
其中,C—某一稀釋度下平板上生長的平均菌落數(shù),
V—涂布平板時所用的稀釋液的體積(tǐjī)(ml),
M—稀釋倍數(shù)。當(dāng)樣品的稀釋度足夠高時,培養(yǎng)基表面生長的一個菌落,來源于樣品稀釋液中的一個活菌,通過統(tǒng)計平板上的菌落數(shù),就能推測出樣品中大約含有(hányǒu)多少活菌。原理(yuánlǐ):稀釋涂布平板法:第十一頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)注意事項:①為了保證結(jié)果準(zhǔn)確,一般選擇菌落數(shù)在30——300的平板進(jìn)行計數(shù)(jìshù)。②設(shè)置重復(fù)組:為使結(jié)果接近真實值可將同一稀釋度加到三個或三個以上的培養(yǎng)皿中,經(jīng)涂布,培養(yǎng)計算出菌落平均數(shù)。③設(shè)置對照組:將不加土樣的培養(yǎng)基置于相同條件下進(jìn)行培養(yǎng),作為空白對照。④統(tǒng)計的菌落往往比活菌的實際數(shù)目低。因為(yīnwèi)當(dāng)兩個或多個細(xì)胞連在一起時,平板上觀察到的只是一個菌落。第十二頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)討論題1:兩位同學(xué)用稀釋(xīshì)涂布平板法測定同一土壤樣品中的細(xì)菌數(shù)。在對應(yīng)稀釋(xīshì)倍數(shù)為106的培養(yǎng)基中,得到以下兩種統(tǒng)計結(jié)果。
1、第一位同學(xué)在該濃度下涂布了一個平板,統(tǒng)計的菌落數(shù)為230。
2、第二位同學(xué)在該濃度下涂布了三個平板,統(tǒng)計的菌落數(shù)分別為21、212、256,該同學(xué)以這三個平板上菌落數(shù)的平均值163作為統(tǒng)計結(jié)果。分析:你認(rèn)為哪位同學(xué)的結(jié)果更接近真實值?你認(rèn)為這兩位同學(xué)的實驗需要改進(jìn)嗎?如果需要,如何改進(jìn)?
甲只涂布了一個平板,沒有設(shè)置重復(fù)組,因此結(jié)果(jiēguǒ)不具有說服力。乙有一個平板與另外兩個平板相差很大,說明操作過程可能有誤,必須重做實驗。1、實驗時必須設(shè)置重復(fù)組,至少(zhìshǎo)要涂布3個平板。2、分析結(jié)果時,一定要考慮所設(shè)置的重復(fù)組結(jié)果是否一致,結(jié)果不一致,意味著操作有誤,需要重做實驗。第十三頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)討論題2:在做本課題的實驗時,A同學(xué)從對應(yīng)106倍稀釋的培養(yǎng)基中篩選出大約150個菌落。但是,其他同學(xué)在同樣(tóngyàng)的稀釋度下只選擇出大約50個菌落。其他同學(xué)認(rèn)為A同學(xué)的結(jié)果有問題。他們分析可能是A同學(xué)的培養(yǎng)基被雜菌污染了,或者培養(yǎng)基中混入了其他含氮物質(zhì),因而導(dǎo)致不能分解尿素的細(xì)菌也能在該培養(yǎng)基上生長。但是,A同學(xué)確信自己的實驗操作準(zhǔn)確無誤,與其他同學(xué)的結(jié)果之所以不相同,是因為自己所選用的土壤樣品不同。但是,A同學(xué)在設(shè)計實驗的時候并沒有設(shè)置對照,因而此時也拿了不出令人信服的證據(jù)。分析:你能通過設(shè)置對照,幫助A同學(xué)學(xué)排除上述兩個可能影響實驗結(jié)果的因素嗎?第十四頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)通過這個(zhège)事例可以看出,實驗結(jié)果要有說服力,對照的設(shè)置是必不可少的。方案(fāngàn)一:由其他同學(xué)用與A同學(xué)相同土樣進(jìn)行實驗方案二:將A同學(xué)(tóngxué)配制的培養(yǎng)基在不加土樣的情況下進(jìn)行培養(yǎng),作為空白對照,以證明培養(yǎng)基是否受到污染。
如果結(jié)果與A同學(xué)一致,則證明A無誤;如果結(jié)果不同,則證明A同學(xué)存在操作失誤或培養(yǎng)基的配制有問題。對照實驗是指除了被測試的條件以外,其他條件都相同的實驗,其作用是比照實驗組,排除任何其他可能原因的干擾第十五頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)三.實驗的具體操作
(一).土壤取樣
從肥沃、濕潤的土壤中取樣。先鏟去表層土3cm左右,再取樣,將樣品裝入事先準(zhǔn)備好的信封(xìnfēng)中?!羧⊥翗佑玫男¤F鏟和盛土樣的的信封在使用前都要滅菌。(二).制備培養(yǎng)基制備以尿素為唯一氮源的選擇培養(yǎng)基和牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基。篩選出能夠分解尿素(niàosù)的細(xì)菌與選擇(xuǎnzé)培養(yǎng)基作對照,檢測選擇(xuǎnzé)培養(yǎng)基是否具有選擇(xuǎnzé)作用第十六頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)◆應(yīng)在火焰(huǒyàn)旁稱取土壤10g?!粼谙♂屚寥廊芤旱倪^程中,每一步都要在火焰旁進(jìn)行◆分離不同(bùtónɡ)的微生物采用不同(bùtónɡ)的稀釋度
一般分離土壤中細(xì)菌,選用104、105、106倍的稀釋度
分離土壤中放線菌,選用103、104、105倍的稀釋度分離土壤中真菌,選用102、103、104倍的稀釋度◆第一次實驗可將稀釋度放寬一點,選擇103~107(三)樣品(yàngpǐn)的稀釋第十七頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)思考:
為什么分離不同的微生物要采用不同的稀釋度?測定土壤中細(xì)菌的總量和測定土壤中能分解尿素的細(xì)菌的數(shù)量,選用的稀釋范圍(fànwéi)相同嗎?原因:不同微生物在土壤(tǔrǎng)中的含量不同。目的:保證能從中選擇出菌落數(shù)在30~300間的平板進(jìn)行計數(shù)。第十八頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)(四).取樣(qǔyàng)涂布◆實驗時要對培養(yǎng)皿作好標(biāo)記。注明培養(yǎng)基類型、培養(yǎng)時間(shíjiān)、稀釋度、培養(yǎng)物等。◆如果得到了2個或2個以上菌落數(shù)目在30—300的平板,則說明稀釋操作比較成功(chénggōng),并能夠進(jìn)行菌落的計數(shù),如果同一稀釋倍數(shù)的三個重復(fù)的菌落數(shù)相差較大,表明試驗操作有誤,需要重新實驗。第十九頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)(五).微生物的培養(yǎng)(péiyǎng)與觀察◆在菌落計數(shù)時,每隔24h統(tǒng)計一次菌落數(shù)目。選取菌落數(shù)目穩(wěn)定時的記錄(jìlù)作為結(jié)果,以防止因培養(yǎng)時間不足而導(dǎo)致遺漏菌落的數(shù)目。◆不同的微生物會表現(xiàn)出不同的菌落特征,包括菌落的形狀、大小、顏色和隆起程度等等。這也是區(qū)別不同微生物的關(guān)鍵?!襞囵B(yǎng)不同微生物往往(wǎngwǎng)需要不同培養(yǎng)溫度和時間。細(xì)菌:30~37℃培養(yǎng)1~2d放線菌:25~28℃培養(yǎng)5~7d霉菌:25~28℃培養(yǎng)3~4d。第二十頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)第二十一頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)四、結(jié)果分析與評價1.培養(yǎng)物中是否有雜菌污染以及選擇培養(yǎng)基是否篩選出菌落:對照的培養(yǎng)皿在培養(yǎng)過程中沒有菌落生長(shēngzhǎng),說明培養(yǎng)基沒有被雜菌污染。牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基的菌落數(shù)目明顯大于選擇培養(yǎng)基的數(shù)目,說明選擇培養(yǎng)基已篩選出一些菌落。2.樣品的稀釋操作是否成功:如果得到了2個或2個以上菌落數(shù)目在30~300的平板,則說明稀釋操作比較成功,并能夠進(jìn)行菌落的計數(shù)。3.重復(fù)組的結(jié)果是否一致:如果學(xué)生選取的是同一種土樣,統(tǒng)計的結(jié)果應(yīng)該接近。如果結(jié)果相差太遠(yuǎn),則可能操作有誤,需要重做試驗。第二十二頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)五、操作(cāozuò)提示
無菌操作(cāozuò)
做好標(biāo)記(biāojì)
規(guī)劃時間
第二十三頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)六.課外延伸菌種的進(jìn)一步鑒定:
細(xì)菌合成的脲酶將尿素(niàosù)分解成了氨,氨會使培養(yǎng)基的堿性增強(qiáng),pH升高。那么我們就可以在以尿素為唯一氮源的培養(yǎng)基中加入酚紅指示劑。培養(yǎng)某種細(xì)菌后,如果PH升高,指示劑變紅,說明該細(xì)菌能夠分解尿素。加入酚紅指示劑的培養(yǎng)基從功能(gōngnéng)上劃分屬于什么培養(yǎng)基?第二十四頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)濾膜法:測定飲水中大腸桿菌數(shù)量的方法是將一定體積的水用細(xì)菌過濾(guòl(fā)ǜ)器過濾(guòl(fā)ǜ)后,將濾膜放到伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基上培養(yǎng),大腸桿菌菌落呈現(xiàn)黑色,通過記數(shù)得出水樣中大腸桿菌的數(shù)量。大腸桿菌(dàchánɡɡǎnjūn)呈黑色中心,有或無金屬光澤伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基從功能(gōngnéng)上劃分屬于什么培養(yǎng)基?第二十五頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)練習(xí)1、需要在火焰旁操作的有()①土壤取樣
②稱取土壤
③稀釋(xīshì)土壤溶液
④涂布平板
⑤微生物的培養(yǎng).
A.①②④
B.①④⑤
C.②③⑤
D.
②③④2、在以尿素為唯一氮源的培養(yǎng)基中加入酚紅指示劑的目的是()
A.
篩選出能分解尿素的細(xì)菌B.培養(yǎng)基中缺乏酚紅指示劑作細(xì)菌的營養(yǎng)
C.對分離的菌種作進(jìn)一步的鑒定
D.如指示劑變藍(lán)就能準(zhǔn)確認(rèn)定該菌能分解尿素3、測定土壤中細(xì)菌數(shù)量一般選用104、105和106倍的稀釋液進(jìn)行平板培養(yǎng),而測定真菌的數(shù)量一般選用102、103和104倍稀釋,其原因是(
)A.細(xì)菌個體小,真菌個體大B.細(xì)菌易稀釋,真菌不易稀釋C.細(xì)菌在土壤中數(shù)量比真菌多D.隨機(jī)的,沒有原因4、分離土壤中分解尿素的細(xì)菌,對培養(yǎng)基的要求是(
)①加尿素②不加尿素③加瓊脂④不加瓊脂⑤加葡萄糖⑥不加葡萄糖⑦加硝酸鹽⑧不加硝酸鹽A.①③⑤⑦ B.②④⑥⑧C.①③⑤⑧ D.①④⑥⑦第二十六頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)5.下列說法不正確(zhèngquè)的是(
)
A.科學(xué)家從70-80度熱泉中分離到耐高溫的TaqDNA聚合酶
B.統(tǒng)計某一稀釋度的5個平板的菌落數(shù)依次為M1、M2、M3、M4、M5,以M3作為該樣品菌落數(shù)的估計值
C.設(shè)置對照實驗的主要目的是排除實驗組中非測試因素對實驗結(jié)果的影響,提高實驗結(jié)果的可信度
D.同其他生物環(huán)境相比,土壤中的微生物數(shù)量最大,種類最多。6、實驗測定鏈霉素對3種細(xì)菌的抗生素效應(yīng),用3種細(xì)菌在事先準(zhǔn)備好的瓊脂平板上畫3條等長的平行線(3條線均與圖中的鏈霉素帶接觸),將平板置于37℃條件下恒溫培養(yǎng)3天,結(jié)果如圖所示。從實驗結(jié)果分析,以下敘述不正確的是(
)A.鏈霉素能阻止結(jié)核菌的生長B.鏈霉素對結(jié)核菌比對霍亂菌更有效C.鏈霉素對結(jié)核菌比對傷寒菌更有效D.鏈霉素可以用于治療傷寒病人第二十七頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)7、用來判斷選擇培養(yǎng)基是否起到了選擇作用,需要設(shè)置的對照是(
)A.未接種的選擇培養(yǎng)基B.未接種的牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基C.接種了的牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基D.接種了的選擇培養(yǎng)基8、下列是關(guān)于“檢測土壤中細(xì)菌總數(shù)”實驗操作的敘述中,錯誤的是(
)A.用蒸餾水配制牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,經(jīng)高溫、高壓滅菌后倒平板B.取104、105、106倍的土壤稀釋液和無菌水各0.1mL,分別涂布于各組平板上C.將實驗組和對照組平板倒置,37℃恒溫培養(yǎng)24~48hD.確定對照組無菌后,選擇菌落數(shù)在300以上的實驗組平板進(jìn)行計數(shù)9、某同學(xué)從稀釋度為103倍的稀釋液中各取了0.1mL土壤菌液涂布到三個平板上得到(dédào)菌落數(shù)分別為200、215、210。求每克土壤樣品中的菌落數(shù)為_____。第二十八頁,共三十頁。土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離和計數(shù)10、人和哺乳動物的尿中含有尿素,大量尿素的存在會對環(huán)
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