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第七章細(xì)菌和噬菌體的重組和連鎖基本知識細(xì)菌是單細(xì)胞,它的遺傳物質(zhì)是一個大型的環(huán)狀核酸分子,稱之為基因帶,也可稱為染色體。若細(xì)菌喪失產(chǎn)生某種營養(yǎng)物質(zhì)(如氨基酸)的能力就稱為營養(yǎng)缺陷型,相對于缺陷型的野生菌株叫原養(yǎng)型。病毒的結(jié)構(gòu)是由蛋白質(zhì)外殼和包裹在中間的一個單一的核酸分子(可稱基因帶或染色體)組成。例如:細(xì)菌的基因組
Onecircularchromosome(4-5Mb)7.1
細(xì)菌的遺傳分析細(xì)菌的雜交以大腸桿菌為例,大腸桿菌K12中兩個菌株A和B,菌株A是供體,含有F因子(F質(zhì)粒),記作F+,菌株B是受體,沒有F因子,記作F-。F因子又稱性因子或致育因子,它是能獨立增殖的環(huán)狀DNA分子。F+細(xì)菌的表面有稱作性傘毛的細(xì)長纖毛。當(dāng)F+細(xì)菌與F-細(xì)菌結(jié)合時,F(xiàn)因子通過性傘毛從F+細(xì)菌轉(zhuǎn)移到F-細(xì)菌,原來的細(xì)菌還仍為F+。不過染色體很少通過結(jié)合而轉(zhuǎn)移到F-細(xì)菌,所以染色體上的基因的重組頻率很低。細(xì)菌接合雜交實驗Lederberg和Tatum1946A+B-×A-B+A+B+回復(fù)突變or重組???細(xì)菌接合雜交實驗Lederberg和Tatum1946A+B+C-D-×A-B-C+D+A+B+C+D+
A品系:met-bio-thi+leu+thr+(thi:硫胺素B1)B品系:met+bio+thi-leu-thr-
AA+BB
基本培養(yǎng)基
met+bio
+
thi+leu+
thr+出現(xiàn)頻率:1/107細(xì)菌接合遺傳物質(zhì)的單方向轉(zhuǎn)移Hayes實驗A:met-thr+leu+thi+B:met+thr-leu-thi-Donor:AReceptor:B
大劑量鏈霉素A品系無影響
大劑量鏈霉素B品系阻止了重組F質(zhì)粒與細(xì)菌接合Hfr菌株因為F因子和細(xì)菌的DNA分子都是環(huán)狀的,在環(huán)狀的細(xì)菌染色體和環(huán)狀的F因子間通過一個交換,環(huán)狀F因子就整合到環(huán)狀的細(xì)菌染色體上。F因子整合到細(xì)菌染色體上的菌株就是高頻重組菌株,稱為Hfr菌株。高頻重組菌株(Hfr菌株)跟菌株B(F-)雜交時,細(xì)菌染色體上基因的重組頻率很高,即出現(xiàn)重組子的頻率很高。Highfrequencerecombination
(圖示F因子整合到細(xì)菌染色體的過程)Hfr與F-的接合(示:細(xì)菌的交換過程)Hfr品系與F+菌株的區(qū)別相同1、都能和F-雜交。2、雜交都要通過接合管和受體菌相聯(lián)接。3、高劑量鏈霉素處理后都不影響雜交,說明它們都是作為一種供體。不同1、產(chǎn)生重組子頻率不同,Hfr×F-為10-4,F(xiàn)+×F-為10-7。2、F+×F-后代F+,Hfr×F-后代F-。3、F+細(xì)菌經(jīng)吖啶橙處理變成F-,Hfr經(jīng)吖啶橙處理仍為Hfr。中斷雜交技術(shù):把Hfr細(xì)菌與F-細(xì)菌混合培養(yǎng),每隔一定時間取樣,將試樣攪拌并稀釋后在選擇培養(yǎng)基上培養(yǎng),使其只有重組子類型可以生長,分析Hfr染色體上基因進(jìn)入受體細(xì)胞(F-細(xì)菌)的順序各所需時間(分鐘),這種根據(jù)供體基因進(jìn)入受體細(xì)胞的順序和時間繪制連鎖圖的技術(shù),稱為中斷雜交技術(shù)。(1).Wollman和Jacob的實驗要解決的問題是:Hfr細(xì)菌在交配中,什么時候把基因轉(zhuǎn)移給F-細(xì)菌。方法:把兩個菌株混在一起,進(jìn)行雜交將二菌株在培養(yǎng)液中通氣培養(yǎng),Hfr細(xì)菌與F-細(xì)菌開始接觸,形成接合管。每隔一定時間取樣攪拌,斷開結(jié)合管,使配對的細(xì)菌分開。然后稀釋菌液,防止再度配對。將上述菌液涂布在含有鏈霉素,但不含有蘇氨酸和亮氨酸的培養(yǎng)基上。這樣,帶thr+和leu+的Hfr菌株對鏈霉素敏感;而帶有strr的F-菌不能合成蘇氨酸和亮氨酸,都不能生長。只有帶thr+和leu+的Hfr菌和帶有strr的F-菌的重組子可以生長。把中斷雜交的細(xì)菌放在完全培養(yǎng)基上培養(yǎng),顯然供體、受體菌都能生長。影響檢測。我們只需要把發(fā)生重組的重組子檢出。這就必須有一個可供選擇用的供體標(biāo)記基因。這樣可以認(rèn)出重組子,如在基本培養(yǎng)基中培養(yǎng)選擇thr+leu+重組子。這時thr+leu+為標(biāo)記基因,可排除受體菌株,但供體菌還能繼續(xù)存在。為了不選擇供體細(xì)胞本身,供體細(xì)菌也應(yīng)該帶有一個特殊的標(biāo)記,能使自己不被選擇。例如供體菌對鏈霉素敏感,這樣當(dāng)結(jié)合體在含有鏈霉素的培養(yǎng)基上生長時,供體菌株就被殺死了。如何檢出某一基因的重組子?對每一時刻的重組thr+leu+strr的菌落影印培養(yǎng)接種到不同的培養(yǎng)基上(如乳糖lae++伊紅+美蘭→紅色,反之則是粉紅色的。記錄重組子中每一非選擇標(biāo)記出現(xiàn)的時間、出現(xiàn)的頻率和持續(xù)時間,得圖(Hfr的非選擇標(biāo)記基因進(jìn)入F-所需的時間,以及根據(jù)非選擇標(biāo)記在各個時間出現(xiàn)的頻率作圖)。在發(fā)生重組的菌落中,如何檢別非選擇標(biāo)記基因各培養(yǎng)基分別具有不同的營養(yǎng)缺陷或某種抑制性物質(zhì)存在。Wollman和Jacob對重組子thr+leu+strr進(jìn)行菌落影印培養(yǎng)實驗。分析Hfr染色體上其它非選擇性標(biāo)記基因進(jìn)入F-細(xì)菌的順序和所需時間(分鐘),繪制連鎖圖。從Hfr菌株某基因在F-細(xì)菌中出現(xiàn)開始,隨著時間的推移,具有該基因的菌落逐漸增加,直到某一百分?jǐn)?shù)為止。而且某一基因出現(xiàn)的時間愈早,它達(dá)到的頻率愈高。如疊氮化鈉抗性基因出現(xiàn)最早,在24分鐘時就達(dá)到大約90%的F-菌落;半乳糖發(fā)酵基因出現(xiàn)最遲,即使在混和后60分鐘也只有30%的菌落屬于能利用型。(3).結(jié)論染色體從一端開始,(這一端稱為原點(origin)或O),以線性方式進(jìn)入F-細(xì)胞中。基因離原點越遠(yuǎn),進(jìn)入F-細(xì)胞越遲。離開原點較遠(yuǎn)的基因,可能在轉(zhuǎn)移過程停止以前,仍未轉(zhuǎn)移,因而斜率較低,達(dá)到的最高值也較小。如果讓Hfr×F-雜交繼續(xù)進(jìn)行,長達(dá)二小時,然后使之中斷,這樣發(fā)現(xiàn)某些F-受體轉(zhuǎn)變?yōu)镠fr。致育因子是最后轉(zhuǎn)移到受體的,并使它們成為供體其效率很低,是因為致育因子是線性染色體最后一個單位,它最晚進(jìn)入F-細(xì)胞。細(xì)菌的交換過程重組子(即重組類型)的產(chǎn)生是由于不同的DNA分子之間發(fā)生交換的結(jié)果。細(xì)菌重組子的產(chǎn)生是由于細(xì)菌染色體(F-染色體)與供體DNA分子(部分Hfr染色體)之間發(fā)生交換的結(jié)果。但發(fā)生單交換是沒有用的,只有發(fā)生偶數(shù)的交換才能產(chǎn)生有活性的重組子。根據(jù)重組子頻率來確定兩基因之間的距離并繪制出連鎖圖,這種根據(jù)重組頻率作圖的方法稱之為重組作圖。ABbabaABABbaABba+ABba部分二倍體圖示:細(xì)菌基因的交換Hfrlac+ade+(strs)×F-lac-ade-(strr)完全培養(yǎng)基混合培養(yǎng)基本培養(yǎng)基(F-ade+菌落)(無腺嘌呤、加鏈霉素)EMB培養(yǎng)基(影印培養(yǎng))F-ade+lac-基因間發(fā)生交換F-ade+lac+基因間未發(fā)生交換加乳糖實驗方法:
將重組子菌落影印培養(yǎng)在加有曙紅和美藍(lán)的培養(yǎng)基上:以檢驗?zāi)芊窭萌樘?。如能發(fā)酵乳糖(lac+),菌落是紫紅色的。如不能利用(lac-),菌落是粉紅色的。試驗結(jié)果:親組合52重組合15計算重組頻率:
重組菌落數(shù)/總菌落數(shù)×100%=(lac-ade+)/[(lac+ade+)+(lac-ade+)]×
100%=15/(52+15)×
100%≈20%已知中斷雜交實驗該兩個基因相距1分鐘,
重組作圖與中斷雜交作圖的圖距關(guān)系:
1分鐘圖距≈20%重組值前面提到,時間單位接近2分鐘時,測得的基因間的距離,不太可靠,故應(yīng)采用比較穩(wěn)定的重組作圖法。
Ecoli染色體全長:90分鐘;含有:3.6X106bp
20×
90≈1800cM
三點測交繪制基因圖譜F因子(F質(zhì)粒)是帶有部分細(xì)菌染色體的F因子。Hfr通過交換,可以形成帶有部分細(xì)菌染色體的F因子,而F因子又可通過交換整合到細(xì)菌染色體上的原來位置,回復(fù)到以前的Hfr狀態(tài)。F因子連同它所帶有的部分細(xì)菌染色體可一起轉(zhuǎn)移到F-細(xì)胞,并形成部分二倍體。這一特性叫做性導(dǎo)。F因子轉(zhuǎn)移到F-細(xì)胞的轉(zhuǎn)移速率近于F因子。但它把細(xì)菌染色體轉(zhuǎn)移過去的效率比Hfr低得多。不過Hfr的致育因子(F因子)極少進(jìn)入F-細(xì)胞。F質(zhì)粒F和F因子F品系轉(zhuǎn)變成Hfr品系的頻率要高于F+品系。F變成Hfr時F因子整合到相同位點上,而F+變成Hfr時可整合到不同位點。F×F-高頻傳遞特定的基因,形成部分二倍體,而F+×F-產(chǎn)生F+但不轉(zhuǎn)移任何基因,或以10-7將宿主的基因轉(zhuǎn)移,所轉(zhuǎn)移的基因是不同的。Hfr×F-將宿主的基因按順序轉(zhuǎn)入受體,產(chǎn)生重組子頻率較高,為10-4。但受體仍為F-(?)。性別細(xì)菌狀態(tài)F因子狀態(tài)♀F-無F因子♂F+F因子為游離狀態(tài)♂HfrF因子整合到宿主染色體上♂F帶有部分宿主染色體的F因子,為游離狀態(tài)小結(jié):1、細(xì)菌細(xì)胞的兩種性別、四種狀態(tài):F+F-丟失雜交F+Hfr整合到E.coli染色體規(guī)則脫離E.coli染色體F'Hfr
回復(fù)到Hfr染色體不規(guī)則脫離E.coli染色體2、F+、F-、Hfr、F'的關(guān)系轉(zhuǎn)變關(guān)系F+×F-低頻重組Hfr×F-高頻重組F′×F-一般為低頻重組,但對所攜帶的基因是高頻重組。重組頻率區(qū)別F+,Hfr,F(xiàn)的接合對照利用Hfr菌株,根據(jù)中斷雜交試驗和基因重組試驗及其它基因定位試驗的結(jié)果,已繪制出的E.coliK12的環(huán)狀染色體圖。7.2
噬菌體的遺傳分析烈性噬菌體:噬菌體侵染細(xì)菌后,把宿主菌的生物合成裝置接收過來,合成更多的噬菌體,最后使細(xì)菌細(xì)胞烈解并釋放出很多子代噬菌體。這種使宿主菌烈解的噬菌體叫烈性噬菌體。如T2噬菌體。溫和噬菌體:噬菌體侵染細(xì)菌后,細(xì)菌好象未被感染一樣能繼續(xù)增殖。如不經(jīng)誘導(dǎo)宿主菌不發(fā)生烈解,這種噬菌體叫溫和噬菌體。這種現(xiàn)象叫溶源性,這樣的細(xì)菌叫溶源性細(xì)菌或溶源菌。如P22、P1和λ噬菌體。
噬菌體的繁殖噬菌斑的鑒定(噬菌體遺傳特性的鑒定)一個噬菌斑中的噬菌體在遺傳上是均一的,相當(dāng)于一個克隆。由于噬菌體的基因型不同,噬菌斑可以是大的或小的,邊緣清晰的或模糊的;另外噬菌體的宿主范圍(hostrange)也可能不同,有些噬菌體可以侵染和裂解某些細(xì)菌但不能侵染和裂解另外一些細(xì)菌,根據(jù)這些就可以鑒定噬菌體遺傳特性。T2突變型的兩點測交T2突變型r-:快速溶菌,大界限分明噬菌斑野生型r+:緩慢溶菌,小溶菌斑寄主范圍突變型h-:能感染E.Coil品系1、品系2。感染E.Coil品系1、品系2共培養(yǎng),透明噬菌斑野生型h+:只能感染E.Coil品系1。感染E.Coil品系1、品系2共培養(yǎng),半透明噬菌斑T2突變
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