系統(tǒng)與進(jìn)化生物學(xué)方法實(shí)踐-第一二講

PracticeofSystematicandEvolutionary、張富（中 植 系統(tǒng)與進(jìn)化生物學(xué)方第一部分：多種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的聯(lián)合運(yùn)用及操作實(shí)踐 ，6學(xué)時(shí)第二部分：系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建及方法比較 ，3學(xué)時(shí)第三部分：群體遺傳學(xué)基本參數(shù)的計(jì)算 ，3學(xué)時(shí) 第七部分：方法的綜合運(yùn)用 ，3學(xué)時(shí)第一部分：多種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的聯(lián)合運(yùn)用及操作實(shí)踐 ，6學(xué)時(shí)大數(shù)據(jù)時(shí)代，信息量倍增，如何獲取各種有用的信不是簡單的數(shù) 或者上傳 利用數(shù)據(jù)庫成自己的部分甚至全部研究工第一部分：多種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的聯(lián)合運(yùn)用及操作實(shí)踐 ，6學(xué)時(shí)1、系統(tǒng)與進(jìn)化生物學(xué)的主要研究2、NCBI數(shù)據(jù)庫的操作3、PFAM數(shù)據(jù)庫的操作4、利用ExPASy分析蛋白質(zhì)的基本性 5、比 組學(xué)數(shù)據(jù)庫Phytozome的操作實(shí) 6 表達(dá)數(shù)據(jù)庫的操作實(shí)7、多種數(shù)據(jù)庫聯(lián)合運(yùn)用的實(shí)踐第一部分：多種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的聯(lián)合運(yùn)用及操作實(shí)踐 ，6學(xué)時(shí)第一部分：多種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的聯(lián)合運(yùn)用及操作實(shí)踐 ，6學(xué)時(shí)比 組學(xué)數(shù)據(jù)第二部分：系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建及方法比較 ，3學(xué)時(shí)3、3、各種建樹方法1、建樹數(shù)據(jù)的類型及常用系統(tǒng)樹構(gòu)建的方法及其2、鄰接樹、簡約樹、似然樹 樹構(gòu)建的實(shí)踐操第三部分：群體遺傳學(xué)基本參數(shù)的計(jì)算 ，3學(xué)時(shí)第四部分：譜系生物地理學(xué)分析方法與實(shí)踐 ，3學(xué)時(shí)第三部分：群體遺傳學(xué)基本參數(shù)的計(jì)算 ，3學(xué)時(shí)33、中性檢(Tajima’sD，F(xiàn)uandLi’sD*and1、群體遺傳學(xué)常用參數(shù)的意2、等 多樣性（Hd）及核苷酸多態(tài)性（θ和π）計(jì)第四部分：譜系生物地理學(xué)分析方法與實(shí)踐 ，3學(xué)時(shí)11、核酸序列變異及多樣2、單倍型譜系分3、群體遺傳結(jié)構(gòu)分 ，3學(xué)時(shí)）第四部分：譜系生物地理學(xué)分析方法與實(shí)踐 ，3學(xué)時(shí)1997年7年畢業(yè)于華中師范大學(xué)生2000年7月在華中師范大學(xué)獲2003年7月 植物所獲博研究領(lǐng)域:分子系統(tǒng)學(xué)及生物地理第五部分 組學(xué)數(shù)據(jù)分析方法與實(shí)踐（張富民，9學(xué)時(shí)第五部分 組學(xué)數(shù)據(jù)分析方法與實(shí)踐（張富民，9學(xué)時(shí)1、二 數(shù)據(jù)的格式、特點(diǎn)和預(yù)處 2 組二 數(shù)據(jù)的分析流 3、比對(duì)參 4、檢測變5、校正檢6、轉(zhuǎn)錄組二 數(shù)據(jù)的分析流 7、比對(duì)參 8、檢 表達(dá)水9 差異表達(dá)分第五部分 組學(xué)數(shù)據(jù)分析方法與實(shí)踐（張富民，9學(xué)時(shí)張富民第六部分：蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)模擬 ，3學(xué)時(shí)第六部分：蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)模擬 ，3學(xué)時(shí)11、PDB數(shù)據(jù)庫介紹及操作2、基于SWISS-MODELRepository的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)3、基于InsightII生物分子模擬軟件平臺(tái)的蛋白質(zhì)三維第七部分：方法的綜合運(yùn)用 ，3學(xué)時(shí)第二部分：系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建及方法比較第三部分：群體遺傳學(xué)基本參數(shù)的計(jì) 預(yù)預(yù)修課統(tǒng)與進(jìn)化1、課程內(nèi)容設(shè)置 思想：實(shí)踐、基（強(qiáng)調(diào)操作，理論已經(jīng)在系統(tǒng)與進(jìn)化生物學(xué)課程中講過了（內(nèi)容不會(huì)面面俱到，只是“引進(jìn)門2、對(duì)學(xué)生的要求：課上拓展與課下3、教學(xué)方式：以“Project”（教師手把手指導(dǎo)并輔以簡單的課堂教學(xué)，把各種方法串起來（培養(yǎng)學(xué)生研究工作的系統(tǒng)性4、考試方式：大開課程信箱 1、系統(tǒng)與進(jìn)化生物學(xué)的主要研究2、NCBI數(shù)據(jù)庫的操作實(shí)3、PFAM數(shù)據(jù)庫的操作4、利用ExPASy分析蛋白質(zhì)的基本5、比 組學(xué)數(shù)據(jù)庫Phytozome的操作實(shí)6 表達(dá)數(shù)據(jù)庫的操作實(shí)7、多種數(shù)據(jù)庫聯(lián)合運(yùn)用的實(shí)踐Project如果你從某個(gè)未知樣品中通過PCR獲得一段cDNA序列，你是否想知1、這個(gè)序列來源于什么物2、這個(gè)序列是編碼什么3、如果的編碼蛋，編碼的