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生物化學(xué)第七版考研考點及其分布三第三篇DNA、RNA、蛋白質(zhì)的生物合成這三章考點分散,第十三章考研涉及的比較少(可能是資料不全的原因,這部分是考博考點高頻區(qū)),第十四章考過至少20次,集中在第二節(jié)(P352-356)第十章DNA生物合成1復(fù)制replication概念2DNA復(fù)制的基本規(guī)律:半保留復(fù)制,雙向復(fù)制,半不連續(xù)復(fù)制3origin復(fù)制起點、genome基因組、replicon復(fù)制子、leadingstrand領(lǐng)頭鏈、laggingstrand隨從鏈4原核生物DNA聚合酶分三種類型,其中DNA聚合酶I比較重要,其功能是什么,木瓜蛋白酶酶切可分成兩部分,Klenow片段,5P244“科學(xué)之家”的閱讀材料里,Kornberg家族父子三人各自的貢獻(2013簡答)6mismatchrepair錯配修復(fù)7DNA復(fù)制保真性(highfidelity)至少依賴三種機制:遵守嚴格的堿基配對規(guī)律;聚合酶在復(fù)制延長中對堿基的選擇功能;復(fù)制出錯時有即時校讀功能8DNAtopoisomeraseDNA拓撲異構(gòu)酶9原核與真核DNA生物合成過程10岡崎片段11衛(wèi)星DNAsatelliteDNA,中心體centrosome,端粒telomere12端粒酶telomerase概念、功能、爬行模型P25613reversetranscription逆轉(zhuǎn)錄,reversetranscriptase逆轉(zhuǎn)錄酶概念及作用、整合integration、ribozyme核酶、cDNAcomplementaryDNA、14噬菌體DNA滾環(huán)復(fù)制和線粒體DNA的D環(huán)復(fù)制再加上病毒的逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制及簡要說明各自過程(簡答)P25815AmestestAmes試驗P26116引起突變的分子類型17DNA損傷修復(fù)類型及修復(fù)過程(P263,考過7次以上)光修復(fù)酶photolyase(存在于植物中,人沒有)、調(diào)節(jié)子regulon、SOS修復(fù)第十一章RNA生物合成(21-23補充自王鏡巖生化,這些是RNA考點的高頻區(qū))1transcription轉(zhuǎn)錄2轉(zhuǎn)錄與復(fù)制相似之處:都是酶促核苷酸聚合;都以DNA為模板;都需依賴DNA的聚合酶;聚合過程都形成磷酸二酯鍵;都從5端向3端延伸;都遵從堿基配對規(guī)律區(qū)別:模板不同;原料不同;酶不同;產(chǎn)物不同;配對不同3結(jié)構(gòu)基因structuralgene、轉(zhuǎn)錄不對稱性4DNA兩條鏈編碼鏈=有意義鏈=正鏈=Crick鏈=與mRNA序列一致(T變U)模板鏈=反義鏈=負鏈=Waston鏈=編碼mRNA模板(4次以上)編碼鏈codingstrand5promoter啟動子6大腸桿菌只有一種RNA聚合酶全酶為α2ββ·δ核心酶α2ββ·利福平或利福霉素專一性結(jié)合RNA聚合酶的β亞基,抑制蛋白合成7RNA聚合酶保護法8Pribnow盒、轉(zhuǎn)錄泡transcriptionbubble、多聚核糖體polysome、發(fā)卡hairpin9原、真核RNA合成比較10真核生物三種RNA聚合酶,各自特點(2次簡單,2次以上的客觀題)11α-鵝膏覃堿敏感性、羧基末端結(jié)構(gòu)域carboxyl-terminaldomainDTD12啟動子核心序列、順式作用元件cis-actingelement、增強子enhancerHognest盒、管家基因housekeepinggene、GC盒和CAAT盒13轉(zhuǎn)錄因子transcriptionfactors分為:通用轉(zhuǎn)錄因子和特異性轉(zhuǎn)錄因子14中介子mediator、上游因子upstreamfactor、轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物pre-initiationcomplexPIC、可誘導(dǎo)因子induciblefactor、15II型基因中四類轉(zhuǎn)錄因子P27816P279拼版理論17真核mRNA加工:加帽、加尾、剪接的過程(加帽加尾沒考過,剪接高頻)斷裂基因splitgene、外顯子exon、內(nèi)含子intron、18內(nèi)含子功能(P284)與非編碼序列是兩個概念19mRAN剪接mRNAsplicing、剪接體spliceomsome、選擇性剪接alternativesplicing、RNA編輯RNAediting20tRNA前體的加工21RNA拼接的四種方式類型I自我拼接、類型II自我拼接、hnRNA拼接、tRNA酶促拼接,這四類均屬于順式拼接(cis-splicing),即都在同一初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上發(fā)生的剪接,還有一種mRNA反式拼接(trans-splicing):在剪接過程中,兩條不同(或相同)的hnRNA分子間發(fā)生了剪接,將來自兩個hnRNA分子上的外顯子連接在一起,目前主要在錐蟲和線蟲中發(fā)現(xiàn)22由于存在拼接(splicing)、編輯(editing)和再編碼(recoding),斷裂基因(splitgene/interruptedgene)可以產(chǎn)生多種蛋白,即同源蛋白(同源體isoform)mRNA編輯、mRNA剪接、剪切cleavage、再編碼recoding概念的區(qū)別:剪切cleavage:剪去某些內(nèi)含子,然后在上游外顯子3端直接進行多聚腺苷化,不進行相鄰?fù)怙@子之間的鏈接反應(yīng)。剪切RNA的5種方式:普通方式外顯子滑動、外顯子延長、內(nèi)含子保留、選擇性外顯子mRNAeditingmRNA編輯:指在mRNA水平上改變遺傳信息的過程,即mRNA分子中由于核苷酸的缺失、插入或置換使基因轉(zhuǎn)錄物序列與基因編碼序列不互補,使翻譯出的蛋白氨基酸序列與不同于基因序列中編碼信息的現(xiàn)象。mRNA編輯的方向是從3端向5端進行,與其他的相反mRNA編輯的意義:可消除移碼突變的危害;增加基因產(chǎn)物多樣性,轉(zhuǎn)錄出多種同源蛋白;與生物分化發(fā)育有關(guān),是基因重要調(diào)控方式;可使基因產(chǎn)物獲得新結(jié)構(gòu)和功能,利于生物進化;可能與學(xué)習(xí)和記憶有關(guān)mRNAsplicingmRNA剪接:除去初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中的內(nèi)含子,把外顯子連接為成熟的mRNA稱為剪接RNA剪接的意義:生物機體進化中形成,是進化的結(jié)果;是基因表達調(diào)控重要環(huán)節(jié);主要存在于真核生物,原核生物中極少見但并非沒有;內(nèi)含子與外顯子是相對的,有些內(nèi)含子也能編碼產(chǎn)生蛋白或功能RNAmRNArecodingmRNA再編碼:mRNA改變原來的編碼信息,以不同的方式進行翻譯這種mRNA編碼和讀碼方式的改變成為mRAN再編碼。23RNA的生物功能多樣性表現(xiàn):在遺傳信息翻譯中起著決定多用;有重要的催化功能和其他持家功能;RNA轉(zhuǎn)錄后加工和修飾依賴于各類小RNA和其他蛋白復(fù)合物;對基因表達和細胞功能具有重要調(diào)節(jié)作用;RNA在生物進化中其重要作用第十二章蛋白質(zhì)生物合成1蛋白生物合成三個過程:氨基酸活化;肽鏈合成;肽鏈形成后修飾2mRNA、tRNA在蛋白合成中的作用,原、真中的異同(簡答、論述各一次)3codon密碼子、openreadingframe開放閱讀框、起始密碼子AUG,終止密碼子UAA、UGA、UAG,密碼子五個特點:方向性,連續(xù)性,簡并性(degenerate),通用性,擺動性(wobble)框移突變frameshifmutation、nonsensemutation無義突變4核糖體結(jié)構(gòu)與功能,注意哪些部分有催化功能P295(至少4次,考過簡答或論述)5原、真核蛋白合成過程以及區(qū)別,區(qū)別見P306頁圖各種酶、起始復(fù)合物(initiationcomplex)、SD序列(Shine-Dalgarnosequence)KozakconsensussequenceKozak共有序列(3次)、多肽延長的循環(huán)過程:進位、成肽、轉(zhuǎn)位,具體過程與能量消耗起始蛋白因子:真核的eIF-2與原核的EF-G功能類似延長因子和釋放因子原、真核也有類似的P3046蛋白質(zhì)翻譯后修飾(09-12年至少4次,其中論述題1次)主要為三大要點:多肽鏈折疊為天然構(gòu)象的蛋白;蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)修飾主要是肽鍵水解和化學(xué)修飾;蛋白空間結(jié)構(gòu)修飾包括亞基聚合和輔基連接——這三大要點又可各自獨立稱為簡答題P308-3127翻譯后修飾posttranslationalmodification、蛋白的靶向輸送proteintargeting、分子伴侶molecularchaperon、伴侶蛋白(伴侶素)chaperonin蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶、肽-脯氨酰順反異構(gòu)酶8蛋白質(zhì)靶向運輸機理信號序列signalsequence、信號肽signalpeptide、核定位序列nuclearlocalizationsequence,NLS、信號肽識別顆粒signalrecognitionparticleSRP、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)滯留信號序列endoplasmicreticulumretentionsignal(KDEL)、導(dǎo)肽(線粒體基質(zhì)蛋白前體N-端保守的長度為20-35個氨基酸的信號序列,富含SerThr及堿性氨基酸)9antibiotic抗生素考過氯霉素(結(jié)合原核的50S亞基)鏈霉素(結(jié)合原核的30S亞基)利福平(原核RNA聚合酶的β亞基)作用10干擾素interferonIFN及其作用機制P319第十三章基因表達調(diào)控1基因表達geneexpression時序調(diào)節(jié)temporalregulation生命體在生長、發(fā)育等各個階段中,按照一定的時間順序?qū)ο嚓P(guān)基因進行調(diào)控表達的模式。2可誘導(dǎo)基因induciblegene、可阻遏基因repressiblegene、誘導(dǎo)induction、阻遏repression、阻遏蛋白repressor、3協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)coordinateregulation4DNA重排rearrngement指為適應(yīng)特定需要,將一個基因從遠離啟動子的地方移到距啟動子很近的地方從而啟動轉(zhuǎn)錄的方式。DNAamplificationDNA擴增:為一特異蛋白質(zhì)編碼的基因的拷貝數(shù)選擇性地增加而其他基因并未按比例增加的過程。分解代謝物基因激活蛋白catabolitegeneactivatorproteinCAP:或稱cyclicAMPreceprorproteinCRP環(huán)腺苷酸受體蛋白,能與cAMP結(jié)合而活化,作用于啟動子區(qū)域,促進轉(zhuǎn)錄,也含有螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(HTH)的基序。5操縱子operon、乳糖操縱子lacoperon乳糖操縱子的兩個調(diào)節(jié)機制P3291阻遏蛋白負性調(diào)節(jié):a沒有乳糖存在時,調(diào)節(jié)基因(阻遏基因)表達阻遏蛋白;阻遏蛋白結(jié)合到操縱基因上,封閉結(jié)構(gòu)基因,不表達酶。b存在乳糖時,乳糖被β-半乳糖酶催化為半乳糖,半乳糖與阻遏蛋白結(jié)合使得阻遏蛋白不能與操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因被活化,相關(guān)酶表達。乳糖操縱子的阻遏蛋白含有螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(HTH)的基序。2CAP的正性調(diào)節(jié):a當有葡萄糖存在時,葡萄糖被組成酶(constitutiveenzyme)降解的產(chǎn)物抑制了腺苷酸環(huán)化酶活性,活化磷酸二酯酶,使cAMP濃度下降,CAP含量隨之下降。乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄受抑制;b反之,無葡萄糖時,CAP含量促進乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄。3協(xié)同調(diào)節(jié):當阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時,CAP對該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用。若無CAP存在,即使沒有阻遏蛋白與操縱子序列結(jié)合,操縱子仍無轉(zhuǎn)錄活性Crabtreeeffect克勒勃屈利效應(yīng),又稱葡萄糖效應(yīng):單純?nèi)樘谴嬖跁r,細菌利用乳糖作碳源;若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時,細菌首先利用葡萄糖而不利用乳糖的現(xiàn)象稱為葡萄糖現(xiàn)象。6色氨酸操縱子調(diào)節(jié),衰減attenuation機制1阻遏物-操縱基因調(diào)節(jié):trp操縱子轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控是通過阻遏蛋白實現(xiàn)的。調(diào)節(jié)基因產(chǎn)生阻遏蛋白結(jié)合于trp操縱基因特異序列,阻止轉(zhuǎn)錄起始。但阻遏蛋白的DNA結(jié)合活性受Trp調(diào)控,Trp起著一個效應(yīng)分子的作用。a在有高濃度Trp存在時,阻遏蛋白-色氨酸復(fù)合物形成一個同源二聚體,并且與色氨酸操縱子緊密結(jié)合,因此可以阻止轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白-色氨酸復(fù)合物與基因特異位點結(jié)合的能力很強,因此細胞內(nèi)阻遏蛋白數(shù)量僅有20~30分子已可充分發(fā)揮作用。b當Trp水平低時,阻遏蛋白以一種非活性形式存在,不能結(jié)合DNA。在這樣的條件下,trp操縱子被RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄,同時Trp生物合成途徑被激活。2弱化作用(attenuation)trp操縱子轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)控是通過弱化作用實現(xiàn)的。在色氨酸操縱子的前導(dǎo)區(qū)編碼的mRNA前導(dǎo)序列(leadersequence)有4個區(qū),且有相鄰的兩個色氨酸密碼子。a當Trp濃度很低時,負載有Trp的Trp-tRNATrp也就少,這樣翻譯通過兩個相鄰色氨酸密碼子的速度就會很慢,核糖體停留在mRNA前導(dǎo)序列1區(qū),轉(zhuǎn)錄得以完成;b高濃度的Trp使負載有Trp的Trp-tRNATrp增加,翻譯通過兩個相鄰色氨酸密碼子的速度就會很快,核糖體到達在mRNA前導(dǎo)序列2區(qū),使3-4區(qū)自我配對形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄終止。形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)的3-4區(qū)即衰減子(attenuator)序列。衰減子attenuator指原核生物操縱子上游中能顯著減弱甚至終止轉(zhuǎn)錄作用的一段核苷酸序列,該區(qū)域能形成不同的二級結(jié)構(gòu),利用原核微生物轉(zhuǎn)錄與翻譯的偶聯(lián)機制對轉(zhuǎn)錄進行調(diào)節(jié)。7真核基因組結(jié)構(gòu)特點P332(2010)單順反子monocistron、反向重復(fù)序列invertrepeat、衛(wèi)星DNAsatelliteDNA、8轉(zhuǎn)錄激活狀態(tài)染色質(zhì)的變化(至少5次)活性染色質(zhì)activechromatin、CpG島、基因組印記genomicimprinting印記控制區(qū)imprintingcontrolregionICR、組蛋白修飾histonemodification其中DNA堿基的甲基化修飾變化考過簡答,組蛋白變化為2013最后的論述題9增強子enhancer沉默子silencer鋅指zincfingerP33810運鐵蛋白受體tansferrinreceptorTfR、鐵反應(yīng)元件ironresponseelementIRE、ALA合酶P340-34111小分子RNA對基因表達的調(diào)節(jié)(考研2010論述題)P341-343尤其是P343的比較圖第十四章基因重組與基因工程1整合integration、化學(xué)裂解法與雙脫氧測序法2基因重組包括同源重組homologousrecombination、特異位點重組sitespecificrecombination、轉(zhuǎn)座重組transpositionalrecombination以及三個概念3Holliday模型的關(guān)鍵四步P346(問答)4細菌基因轉(zhuǎn)移與重組的四種方式:接合、轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞融合P347(問答及客觀題,其中轉(zhuǎn)化考頻極高)5P350頁免疫球蛋白的基因重排(考博真題出現(xiàn)過兩次論述題)只做了解6關(guān)于轉(zhuǎn)座轉(zhuǎn)座子transposon、逆轉(zhuǎn)座子(retrotransponsons):在基因組內(nèi)存在著通過DNA轉(zhuǎn)錄為RNA后,再經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄成為cDNA并插入到基因組的新位點上的因子,被稱為逆轉(zhuǎn)座子,逆轉(zhuǎn)座作用的關(guān)鍵酶為逆轉(zhuǎn)錄酶和整合酶。自身編碼逆轉(zhuǎn)錄酶和/或整合酶的非傳染性轉(zhuǎn)座因子稱為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子7P352DNA克隆標題下的三段話包含若干名詞解釋DNAclone/clone、復(fù)制子replicon、嵌合DNADNAchimeras、重組DNArecombinantDNA、基因工程geneticengineering、重組DNA技術(shù)recombinantDNAtechnology、轉(zhuǎn)染(transfection)指真核細胞由于外源DNA摻入而獲得新的遺傳標志的過程。常規(guī)轉(zhuǎn)染技術(shù)可分為瞬時轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染(永久轉(zhuǎn)染)兩大類8限制-修飾體系restriction-modificationsystem
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