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熒光原位雜交實(shí)驗(yàn)演示文稿當(dāng)前1頁(yè),總共30頁(yè)。(優(yōu)選)熒光原位雜交實(shí)驗(yàn)當(dāng)前2頁(yè),總共30頁(yè)。實(shí)驗(yàn)的基本原理:FISHisthedetectionofhighlyspecificDNAprobeswhichhavebeenhybridizedtoeitherinterphaseormetaphasechromosomesusingfluorescencemicroscopy.
當(dāng)前3頁(yè),總共30頁(yè)。DNAforprobeuseislabeledwithfluorescent(directmethod)ornonfluorescentmoleculeswhicharethendetectedbyfluorescentantibodies(indirectmethod).Theprobesbindtoaspecificregionorregionsonthetargetchromosome.Thechromosomesarethenstainedusingacontrastingcolor,andthecellsareviewedusingafluorescencemicroscope.
當(dāng)前4頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前5頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前6頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前7頁(yè),總共30頁(yè)。**熒光原位雜交的特點(diǎn):
1)快速;2)信號(hào)強(qiáng);3)特異性高;4)多色。
**FISH有上述優(yōu)點(diǎn)的原因:
使用了熒光標(biāo)記與檢測(cè)系統(tǒng)取代放射性標(biāo)記與檢測(cè)系統(tǒng)
標(biāo)記探針的物質(zhì):(1)生物素(biotin)/地高辛(digoxigenin)
——半抗原報(bào)告分子(間接標(biāo)記)
(2)熒光物質(zhì)(直接標(biāo)記)
當(dāng)前8頁(yè),總共30頁(yè)。FLUORESCENTlabeleddUTP
HAPTENElabeleddUTP
AMCA-6-dUTPCascadeBlue-4-dUTPFluorescein-12-dUTPRhodamine-6-dUTPTexasRed-6-dUTPCy3-6-dUTPCy5-dUTPBiotin(BIO)-11-dUTPDigoxygenin(DIG)-11-dUTPDinitrophenyl(DNP)-11-dUTP
當(dāng)前9頁(yè),總共30頁(yè)。染色體復(fù)染的物質(zhì):
PropidiumIodide(PI)(紅色)DAPI(蘭色)quinacrine(綠色)chromomycineA3(綠色)
當(dāng)前10頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前11頁(yè),總共30頁(yè)。染色體“原位抑制”雜交(chromosomeinsitusuppression,CISS)
克服散在的重復(fù)序列造成的雜交背景,提高信號(hào)的特異性,在探針中加入過(guò)量的未標(biāo)記的競(jìng)爭(zhēng)性DNA(competitorDNA),如humanCot-1DNA,進(jìn)行雜交前的預(yù)復(fù)性。探針中的重復(fù)序列與加入的競(jìng)爭(zhēng)物中的大量重復(fù)序列優(yōu)先復(fù)性,而特異性的單拷貝序列因競(jìng)爭(zhēng)物中同源序列拷貝數(shù)少,絕大部分仍保持單鏈狀態(tài)。
**FISH技術(shù)的應(yīng)用
1)基因(或DNA片段)的染色體定位;
2)染色體數(shù)目與結(jié)構(gòu)異常的檢測(cè);
3)間期細(xì)胞遺傳學(xué)(絨毛/羊水/精子/卵裂球/其它間期細(xì)胞研究與診斷);
4)腫瘤遺傳學(xué)研究當(dāng)前12頁(yè),總共30頁(yè)。**用于FISH的探針
1)單拷貝探針:
(1)種類:YAC,BAC,Cosmid,Plasmid,cDNA片段
(2)應(yīng)用
(a)定位DNA片段及嵌合體克隆驗(yàn)證;
(b)確定染色體微小缺失與重復(fù);
(c)染色體斷裂點(diǎn)分析。
(d)間期細(xì)胞染色體數(shù)目異常診斷。當(dāng)前13頁(yè),總共30頁(yè)。DNA片段的染色體定位當(dāng)前14頁(yè),總共30頁(yè)。FISH檢測(cè)微小缺失當(dāng)前15頁(yè),總共30頁(yè)。染色體片段重復(fù)當(dāng)前16頁(yè),總共30頁(yè)。21q22.2BAC克隆在Down綜合征間期細(xì)胞中的雜交信號(hào)當(dāng)前17頁(yè),總共30頁(yè)。2)簡(jiǎn)單重復(fù)序列探針(simplerepetitiveprobes)
——異染色質(zhì)著絲粒探針(heterochromaticcentromerprobes)
其靶序列為α衛(wèi)星DNA或衛(wèi)星IIIDNA(alphasatellite/satelliteIIIDNA)多位于染色體的著絲粒和異染色質(zhì)區(qū)域,重復(fù)數(shù)百次至數(shù)千次。
特點(diǎn):信號(hào)強(qiáng)
應(yīng)用:(a)標(biāo)記染色體識(shí)別
(b)染色體數(shù)目異常檢測(cè)
(c)間期細(xì)胞遺傳學(xué)研究和臨床診斷
當(dāng)前18頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前19頁(yè),總共30頁(yè)。**間期細(xì)胞遺傳學(xué)的意義:
細(xì)胞分裂期僅占整個(gè)細(xì)胞周期的幾分之一至幾十分之一,經(jīng)細(xì)胞培養(yǎng)和相應(yīng)處理才能獲得染色體。人體的大部分細(xì)胞并不進(jìn)行分裂,很難通過(guò)培養(yǎng)獲得中期染色體分裂相,間期FISH為這一時(shí)期遺期傳物質(zhì)的研究提供了可能,而且快速。當(dāng)前20頁(yè),總共30頁(yè)。3)染色體涂染探針(chromosomepaintingprobes)
整條染色體探針或染色體區(qū)帶特異性探針
探針來(lái)源:
(1)含有人單條染色體的人-嚙齒類(human-rodent)體細(xì)胞雜種組織融合的產(chǎn)物;
(2)熒光激活的流式細(xì)胞儀(fluorescence-activatedcellsorter,FACS)分離整條染色體DNA,并以載體克隆/PCR擴(kuò)增;
(3)顯微切割得到染色體或染色體片段,PCR擴(kuò)增;
應(yīng)用(1)染色體數(shù)目和結(jié)構(gòu)異常分析;
(2)不同物種間的同源性比較;
(3)白血病及其它腫瘤的染色體診斷和研究。
當(dāng)前21頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前22頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前23頁(yè),總共30頁(yè)。多色FISH(muti-colorFISH)
多色復(fù)合染色體FISH探針(multiplexFISH,M-FISHprobes)
#兩種以上不同的非同位素標(biāo)記,不同的熒光檢測(cè)系統(tǒng),通過(guò)不同的濾光片組合或極少數(shù)幾種非同位素標(biāo)記探針后,按照不同的比例混合,可以顯示多種顏色。當(dāng)前24頁(yè),總共30頁(yè)。當(dāng)前25頁(yè),總共30頁(yè)。實(shí)驗(yàn)的基本操作步驟及時(shí)間安排一淋巴細(xì)胞的培養(yǎng)及染色體標(biāo)本制備第一天(星期一)采血、接種(10:00)第二天(星期二)培養(yǎng)第三天(星期三)培養(yǎng)第四天(星期四)上午7:00加秋水仙素,(終濃度0.2ug/ml)至上午10:00結(jié)束培養(yǎng)制片,不染色,在顯微鏡下挑選分散良好的標(biāo)本。將選好的標(biāo)本放入50℃烤片。當(dāng)前26頁(yè),總共30頁(yè)。第五天(星期五)探針變性:75℃水浴5分鐘,立即置于0℃(冰浴中)5-10分鐘。玻片標(biāo)本變性:1.50℃溫箱中2小時(shí)2.標(biāo)本在70-75℃,70%甲酰胺/2XSSC中變性2-3分鐘。3.立即脫水,70-90-100%順序,各5分鐘。4.室溫干燥當(dāng)前27頁(yè),總共30頁(yè)。原位雜交:將變性的DNA探針10ul滴于變性并脫水的玻片標(biāo)本上,蓋上蓋玻片,Parafilm封片,置于濕盒中37℃雜交過(guò)夜。(15-17hr)
第五天實(shí)驗(yàn)結(jié)束當(dāng)前28頁(yè),總共30頁(yè)。(第六天,星期六)洗脫、信號(hào)放大和免疫熒光檢測(cè)1.用刀片將蓋片揭起,輕輕移掉。2.45℃50%甲酰胺/2XSSC中洗3次,每次5分鐘。3.45℃1XSSC中洗3次,每次5分鐘。4.室溫下,2XSSC輕洗一下。5加180ul封閉液I,以薄膜蓋片,37℃溫育20分鐘,加入180ulavidin-FITC,37℃溫育45分鐘。6.取出標(biāo)本,45℃,4XSSC/0.1%Tween20中洗3次,每次5分鐘。當(dāng)前29頁(yè),總共30頁(yè)。7加封閉液II,37℃溫育20分鐘。8加180ulantiavidin于
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