
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文檔簡介
院分子生物學(xué)課程詳解演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有134頁\編輯于星期三(優(yōu)選)院分子生物學(xué)課程現(xiàn)在是2頁\一共有134頁\編輯于星期三BREAKTHROUGHOFTHEYEAR2007:
HumanGeneticVariation
21DECEMBER2007SCIENCE現(xiàn)在是3頁\一共有134頁\編輯于星期三BREAKTHROUGHOFTHEYEAR2008:
ReprogrammingCells
iPS(inducedpluripotentstemcell)Runners-Up:
DirectViewsofExoplanets
TheDNAofCancerNewClassofHigh-TSuperconductors
Proteinfloppingandfolding
SplittingWater
BeginningofLife,theMovieColorCodedFat
ComputingtheBasics
DNAontheCheap
現(xiàn)在是4頁\一共有134頁\編輯于星期三拓展伽馬射線天空脫落酸受體(abscisicacid,ABA)發(fā)現(xiàn)模擬磁單極子長壽健康
科學(xué)家揭示月球存在冰基因治療回來了
石墨烯研究取得新進(jìn)展哈勃重生第一臺X射線激光器閃亮登場BREAKTHROUGHOFTHEYEAR2009:
Ardipithecusramidus
(始祖地猿)
Runners-Up:
現(xiàn)在是5頁\一共有134頁\編輯于星期三2010年科研熱點
IPS細(xì)胞
宇宙射線眼
外顯子組研究生物化學(xué)戰(zhàn)勝癌癥?
人類太空飛行
現(xiàn)在是6頁\一共有134頁\編輯于星期三一、核酸研究簡史第一階段:核酸的發(fā)現(xiàn)第二階段:發(fā)現(xiàn)核酸是遺傳物質(zhì)第三階段:為分子生物學(xué)奠定基礎(chǔ)的時期第四階段:分子生物學(xué)高速發(fā)展時期第一節(jié)DNA的結(jié)構(gòu)與功能現(xiàn)在是7頁\一共有134頁\編輯于星期三1889年R.Altman從動物細(xì)胞與酵母菌中制備了核酸
1869年F.Miescher從膿細(xì)胞中得到核質(zhì)“Nuclein”第一階段:核酸的發(fā)現(xiàn)1894年A.Kossel和A.Neumann從胸腺中提取核酸現(xiàn)在是8頁\一共有134頁\編輯于星期三1930年正式提出核酸分為兩大類:核糖核酸(RNA)脫氧核糖核酸(DNA)1904年Hammars證明核酸中的糖是戊糖.1909年Levene和Jacobs鑒定核酸中的糖是D-核糖.1912年Levene認(rèn)為核酸由4種核苷酸組成1929年Levene和Jacobs確定胸腺核苷酸中的糖是2-脫氧-D-核糖
現(xiàn)在是9頁\一共有134頁\編輯于星期三第二階段:發(fā)現(xiàn)核酸是遺傳物質(zhì)1944年Avery等揭示了DNA是細(xì)菌的遺傳物質(zhì)有莢膜的光滑型肺炎球菌(S型)致病無莢膜的粗糙型肺炎球菌(R型)不致病現(xiàn)在是10頁\一共有134頁\編輯于星期三
R型菌R型菌R型菌+++S型菌DNAS型菌DNAS型菌DNA(經(jīng)蛋白酶水解)(經(jīng)核酸酶水解)↓↓↓部分克隆變?yōu)椴糠挚寺∽優(yōu)椴荒茏優(yōu)镾型菌S型菌S型菌現(xiàn)在是11頁\一共有134頁\編輯于星期三1952年HersheyChase通過噬菌體感染細(xì)菌的實驗表明病毒的遺傳物質(zhì)是DNA?,F(xiàn)在是12頁\一共有134頁\編輯于星期三1953年J.D.Watson和F.Crick建立了DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型
第三階段:為分子生物學(xué)奠定基礎(chǔ)的時期現(xiàn)在是13頁\一共有134頁\編輯于星期三1958年*Kornberg等發(fā)現(xiàn)了DNA聚合酶(DNApolymerase)
*
Meselson等提出半保留復(fù)制,闡明DNA復(fù)制的機理*Crick提出了遺傳信息傳遞的中心法則現(xiàn)在是14頁\一共有134頁\編輯于星期三1965年中國科學(xué)家人工合成牛胰島素1970年Temin等發(fā)現(xiàn)了從RNA→DNA反轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,使中心法則更完善1961年以后Jacob、Nirenberg和Monod等取得三個有意義的進(jìn)展:1)證實了mRNA攜帶著DNA到蛋白質(zhì)合成機制所需要的信息2)發(fā)現(xiàn)了遺傳密碼3)發(fā)現(xiàn)了蛋白質(zhì)依靠tRNA和核糖體的幫助翻譯現(xiàn)在是15頁\一共有134頁\編輯于星期三遺傳信息傳遞的中心法則
(centraldogma)DNAmRNA轉(zhuǎn)錄多肽鏈翻譯蛋白質(zhì)翻譯后加工DNA復(fù)制逆轉(zhuǎn)錄RNA復(fù)制現(xiàn)在是16頁\一共有134頁\編輯于星期三第四階段:分子生物學(xué)高速發(fā)展時期1.1971年限制性內(nèi)切酶發(fā)現(xiàn),DNA的分離成為可能現(xiàn)在是17頁\一共有134頁\編輯于星期三2.直讀核苷酸序列方法(1975年Sanger發(fā)明)現(xiàn)在是18頁\一共有134頁\編輯于星期三3.DNA體外重組技術(shù)(1972年Berg發(fā)明)
現(xiàn)在是19頁\一共有134頁\編輯于星期三1982年中國科學(xué)家人工合成酵母丙氨酸t(yī)RNA1985年Mullis建立PCR技術(shù)1981年T.Cech發(fā)現(xiàn)四膜蟲rRNA前體的自我拼接,稱為ribozyme.
現(xiàn)在是20頁\一共有134頁\編輯于星期三人類科學(xué)史上的三大工程人類基因組計劃曼哈頓原子計劃阿波羅登月計劃
1990年美國正式啟動人類基因組計劃。(humangenomeproject,HGP)
現(xiàn)在是21頁\一共有134頁\編輯于星期三1999年7月我國得到完成人類3號染色體短臂上一個約30Mb區(qū)域的測序任務(wù),該區(qū)域約占人類整個基因組的1%,簡稱1%項目。提前兩年于2001年8月26日,繪制完成“中國卷”,贏得了國際科學(xué)界的贊譽。
現(xiàn)在是22頁\一共有134頁\編輯于星期三2003年4月美、英、日、法、德、中等國政府首腦聯(lián)名發(fā)表《六國政府首腦關(guān)于完成人類基因組序列圖的聯(lián)合聲明》?,F(xiàn)在是23頁\一共有134頁\編輯于星期三1997年英國愛丁堡羅斯林研究所首次育成克隆羊。
現(xiàn)在是24頁\一共有134頁\編輯于星期三水稻基因組(RiceGenome)2001年10月,中科院、科技部和國家計委聯(lián)合向全世界宣布,中國率先完成水稻(秈稻)基因組工作“框架圖”的繪制2002年4月5日,在Science雜志上以封面文章的形式發(fā)表?,F(xiàn)在是25頁\一共有134頁\編輯于星期三**后基因組計劃(post-genomeproject)
又稱為功能基因組學(xué)(functionalgenomics)**蛋白質(zhì)組(proteome)計劃又稱為蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)現(xiàn)在是26頁\一共有134頁\編輯于星期三**隨著許多新的RNA功能陸續(xù)被發(fā)現(xiàn),2000年各國科學(xué)家提出了RNA組的研究,稱為RNA組學(xué)(RNomics)**生物信息學(xué)(bioinformatics)**系統(tǒng)生物學(xué)(systemsbiology)現(xiàn)在是27頁\一共有134頁\編輯于星期三二、DNA研究的臨床應(yīng)用1.疾病發(fā)病機理的研究1)遺傳性疾病
基因變異或基因缺陷是疾病發(fā)生的根本原因如:鐮刀狀紅細(xì)胞性貧血的致病因素是由于珠蛋白第6位氨基酸由谷氨酸突變?yōu)槔i氨酸。
現(xiàn)在是28頁\一共有134頁\編輯于星期三
如:心血管疾?、笮透咧鞍籽Y的形成主要是由于ApoE基因中第112位和第158位的G和C發(fā)生變異,蛋白質(zhì)肽鏈上原來Arg變成Cys,失去與ApoE受體結(jié)合的能力,使血脂升高現(xiàn)在是29頁\一共有134頁\編輯于星期三
2)腫瘤癌基因激活和抑癌基因失活→分化受阻→腫瘤細(xì)胞(永生型)如:上世紀(jì)70年代發(fā)現(xiàn)了癌基因(H-ras)與抑癌基因(Rb)。
現(xiàn)在是30頁\一共有134頁\編輯于星期三
2.
疾病的基因診斷DNA診斷:*快速DNA點雜交*限制性內(nèi)切酶酶譜分析法*DNA限制性片段長度多態(tài)性分析法(RFLP)*聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)產(chǎn)前診斷、植床前診斷
現(xiàn)在是31頁\一共有134頁\編輯于星期三
ABKb123123Kb8.3hcs-L
6.7hcs-B5.8hcs-A3.8hGH-N3.0hGH-V1.2hHG-V25.021.817.914.8單純性生長激素缺乏癥(IGHD)(isolatedgrowthhormonedeficience)圖中A為BamHI酶解片段與hGHcDNA探針雜交放射自顯影圖B為HindIⅢ酶解片段與hGHcDNA探針雜交放射自顯影圖1為正常人.2為IGHD患者.3為雜合子DNA
hcs為人絨毛膜促乳素.hGH為人生長激素現(xiàn)在是32頁\一共有134頁\編輯于星期三父親母親孩子…GTCGTACGTGACACACACACACACACACACAGTACGATACGT……GTCGTACGTGACACACACACACACACACACAGTACGATACGT……GTCGTACGTGACACACACACACACACACACACAGTACGATACGT……GTCGTACGTGACACACACACACACACACAGTACGATACGT……GTCGTACGTGACACACACACACACACACACAGTACGATACGT……GTCGTACGTGACACACACACACACACACAGTACGATACGT…父親母親孩子46bp42bp40bp42bp42bp46bp40bp42bp40bpPCR結(jié)果的凝膠電泳:圖:某個CA2核苷酸重復(fù)的微衛(wèi)星在一個家系中的PCR檢測結(jié)果示意圖短串聯(lián)重復(fù)(shorttandemrepeat,STR)多態(tài)性分析現(xiàn)在是33頁\一共有134頁\編輯于星期三3.
疾病的預(yù)防與基因治療1)采用基因工程產(chǎn)生疫苗藥物2)基因治療現(xiàn)在是34頁\一共有134頁\編輯于星期三世界首例癌癥疫苗由美國Merck公司研制,專門針對人乳頭狀瘤病毒(HPV)的疫苗——“加德西”(Gardasil),2006年6月8日獲得美國FDA的上市批準(zhǔn)。這是世界上第一個,也是惟一一個獲準(zhǔn)上市的用來預(yù)防由HPV
6、11、16和18型引起的宮頸癌和生殖器官癌前病變的癌癥疫苗,保護(hù)率超過95%。
該癌癥疫苗的推出,將是人類首次真正嘗試通過疫苗將一種癌癥徹底消除。
德國科學(xué)家拉爾德·楚爾·豪森2008年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎現(xiàn)在是35頁\一共有134頁\編輯于星期三構(gòu)件分子—核苷酸nucleotide核苷nucleoside
磷酸phosphate
堿基bases戊糖pentose
嘧啶pyrimidine
嘌呤purine
核糖ribose
脫氧核糖deoxyribose三、核酸的結(jié)構(gòu)核酸(多核苷酸Polynucleotide)(一)分子組成現(xiàn)在是36頁\一共有134頁\編輯于星期三1.含氮有機堿(1)嘧啶堿:胞嘧啶Cytosine
胸腺嘧啶Thymine
尿嘧啶Uracil(2)嘌呤堿:腺嘌呤Adenine鳥嘌呤Guanine
現(xiàn)在是37頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是38頁\一共有134頁\編輯于星期三堿基上有修飾:核苷的大寫字母前加上代表修飾基團(tuán)的小寫字母右上方寫明堿基的第幾位
m2G表示2-N-甲基鳥苷
位置
m3227G表示N2,N2,7-三甲鳥苷
數(shù)量
S4U表示4-硫代尿嘧啶甲基(3)稀有堿基現(xiàn)在是39頁\一共有134頁\編輯于星期三R苷現(xiàn)在是40頁\一共有134頁\編輯于星期三2.戊糖現(xiàn)在是41頁\一共有134頁\編輯于星期三順式腺苷反式腺苷3.核苷:C-N糖苷鍵
嘌呤堿N9嘧啶堿N1戊糖C1現(xiàn)在是42頁\一共有134頁\編輯于星期三**順式和反式構(gòu)象的定義:相對于糖的一部分,堿基沿糖苷鍵C’-N(對于嘧啶是N1,對嘌呤是N9)??梢圆扇?種主要的取向,順式和反式構(gòu)象?,F(xiàn)在是43頁\一共有134頁\編輯于星期三假尿苷51’現(xiàn)在是44頁\一共有134頁\編輯于星期三4.
核苷酸現(xiàn)在是45頁\一共有134頁\編輯于星期三1’2’3’4’5’現(xiàn)在是46頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是47頁\一共有134頁\編輯于星期三5’3’環(huán)核苷酸cAMP、cGMP
表示磷酸與3’、5’核苷羥基相接
現(xiàn)在是48頁\一共有134頁\編輯于星期三(二)、游離核苷酸的功能ATP、GTP、UTP、CTP參于代謝5FU(5-氟尿嘧啶)抗癌藥物6MP(6-巰基嘌呤)抗癌藥物5’-碘脫氧尿苷治療病毒性心肌炎AZT抗AIDS病毒(Azidothymidine疊氮基胸苷)cAMP、cGMP第二信使
現(xiàn)在是49頁\一共有134頁\編輯于星期三(三)DNA的一級結(jié)構(gòu)1.DNA的一級結(jié)構(gòu)是指脫氧核苷酸(堿基)在DNA分子中的排列順序2.DNA分子中脫氧核苷酸的連接方式
3’,5’磷酸二酯鍵3.直線形DNA有二個末端:5’磷酸末端3’羥基末端
現(xiàn)在是50頁\一共有134頁\編輯于星期三
A.分子結(jié)構(gòu)式B.線條式C.字母式現(xiàn)在是51頁\一共有134頁\編輯于星期三1)端粒DNA的結(jié)構(gòu)
真核生物線性染色體末端的DNA序列,稱為端粒。端粒DNA序列相當(dāng)保守,端粒DNA的3’末端是由數(shù)百個串聯(lián)的重復(fù)序列,長5-10kb。重復(fù)序列由G-T豐富的6個核苷酸組成。人:5’-AGGGTTAGGGTT-------3’
4.端粒(telomere)DNA結(jié)構(gòu)與功能
現(xiàn)在是52頁\一共有134頁\編輯于星期三熒光原位雜交顯示端粒和端粒序列現(xiàn)在是53頁\一共有134頁\編輯于星期三端粒的重復(fù)序列是由端粒酶(telomerase)合成后添加到染色體末端。端粒酶是一種核糖核蛋白復(fù)合物,具有逆轉(zhuǎn)錄酶的性質(zhì),以物種專一的內(nèi)在RNA為模板,把合成的DNA添加到染色體的3‘端。端粒起到細(xì)胞分裂計時器的作用,核苷酸復(fù)制和基因DNA每復(fù)制一次,端粒減少50-100bp,正常體細(xì)胞染色體缺乏端粒酶活性,故隨細(xì)胞分裂而變短,細(xì)胞隨之衰老。人的生殖細(xì)胞,部分干細(xì)胞染色體,腫瘤細(xì)胞和永生細(xì)胞系具有端粒酶活性?,F(xiàn)在是54頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是55頁\一共有134頁\編輯于星期三
2)端粒DNA的功能a保證線性DNA的完整復(fù)制b維持染色體的穩(wěn)定c決定細(xì)胞的壽命現(xiàn)在是56頁\一共有134頁\編輯于星期三2009諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎------
端粒酶(telomerase)ElizabethBlackburnJackSzostakCarolGreider現(xiàn)在是57頁\一共有134頁\編輯于星期三1)DNA分子十分巨大,最小的DNA分子也包含有幾千bp,分子量在106以上。人類基因組含有約3.1647×109bp。5.DNA的一級結(jié)構(gòu)特點現(xiàn)在是58頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是59頁\一共有134頁\編輯于星期三
2)每一物種DNA都具有其特有的堿基組成3)有些堿基常被甲基修飾,稱為甲基化(methylation)現(xiàn)在是60頁\一共有134頁\編輯于星期三(1)細(xì)菌DNA甲基化①各種細(xì)菌都具有一定的甲基化模式,在DNA分子中平均1%的堿基被甲基化。②甲基化最多的是腺嘌呤和胞嘧啶現(xiàn)在是61頁\一共有134頁\編輯于星期三③細(xì)菌DNA甲基化作用的生物學(xué)意義a.影響DNA的構(gòu)象,影響蛋白質(zhì)與DNA的相互作用,以調(diào)節(jié)DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、修復(fù)、重組和包裝的過程。如:發(fā)生在-GATC-的腺嘌呤,于DNA復(fù)制產(chǎn)生的錯誤堿基修復(fù)中起作用b.多發(fā)生于內(nèi)切酶酶切位點,防止噬菌體入侵,是一種細(xì)菌自身保護(hù)機制。
現(xiàn)在是62頁\一共有134頁\編輯于星期三(2)真核細(xì)胞的DNA甲基化①真核細(xì)胞DNA中胞嘧啶甲基化最多,約5%,甲基化為5-甲基胞嘧啶,大多數(shù)甲基化發(fā)生在CpG重復(fù)序列中。②真核細(xì)胞中甲基化酶與去甲基化酶成雙成對存在,都對CpG二核苷酸序列有特異性,使甲基化與去甲基化成為可逆的生物學(xué)過程?,F(xiàn)在是63頁\一共有134頁\編輯于星期三③多種基因的啟動子區(qū)和第一外顯子(60%)富含CpG,稱為CpG島,通常為非甲基化狀態(tài)。散在的CpG則為甲基化的。④DNA甲基化通常抑制基因表達(dá),與人類發(fā)育和腫瘤疾病關(guān)系密切。
現(xiàn)在是64頁\一共有134頁\編輯于星期三
**CpG島:在基因的末端通常存在一些富含雙核苷酸“CG”的區(qū)域,稱為“CpG島”
①通過分析5-甲基胞嘧啶在真核細(xì)胞基因組中的分布,發(fā)現(xiàn)CpG島的存在,這些區(qū)域是非甲基化的,通常為1-2kb,絕大多數(shù)在基因的5’末端。
現(xiàn)在是65頁\一共有134頁\編輯于星期三②在人類基因組內(nèi),存在有近3萬個CpG島;在大多數(shù)染色體上,平均每100萬堿基含有5~15個CpG島,這些CpG島不僅是基因的一種標(biāo)志,而且還參與基因表達(dá)的調(diào)控和影響染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)。
現(xiàn)在是66頁\一共有134頁\編輯于星期三
6.DNA的一級結(jié)構(gòu)的測定1)雙脫氧末端終止法――Sanger法
2)化學(xué)法――Maxan-Gilbert法現(xiàn)在是67頁\一共有134頁\編輯于星期三Sanger雙脫氧末端終止法測序的基本原理現(xiàn)在是68頁\一共有134頁\編輯于星期三Maxan-Gilbert化學(xué)法測序基本原理現(xiàn)在是69頁\一共有134頁\編輯于星期三DNA自動序列測定的基本原理現(xiàn)在是70頁\一共有134頁\編輯于星期三第一步:加入復(fù)制終止劑熒光檢測探頭電泳,看誰跑得快現(xiàn)在是71頁\一共有134頁\編輯于星期三第二步:熒光檢測現(xiàn)在是72頁\一共有134頁\編輯于星期三DNA全自動分析儀:ABIPrism?
3700型全自動遺傳分析儀安瑪西亞DNA序列分析系統(tǒng)型號:MegaBACE500/1000/4000
現(xiàn)在是73頁\一共有134頁\編輯于星期三(四)DNA的二級結(jié)構(gòu)Dr.CrickDr.Watson現(xiàn)在是74頁\一共有134頁\編輯于星期三1.DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的提出Watson和Crick在1953年提出了著名的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。這個模型不僅解釋了DNA的理化性質(zhì),而且將結(jié)構(gòu)與功能聯(lián)系起來,大大推動了分子生物學(xué)的發(fā)展。
現(xiàn)在是75頁\一共有134頁\編輯于星期三**雙螺旋提出的根據(jù)1)DNA纖維晶體的x-衍射研究1952年Wilkins等2)Chargaff的堿基分析A=TG=CA+T/G+C的比值不同來源DNA是不同的3)
堿基和核苷酸的結(jié)晶學(xué)資料現(xiàn)在是76頁\一共有134頁\編輯于星期三
Chargaff原則(1)不同種生物DNA分子中的核苷酸排列順序不同
(有種族特異性)(2)同種生物不同組織器官細(xì)胞中DNA分子的核苷酸排列順序相同
(無組織器官特異性)(3)某一特定生物,其DNA堿基組成恒定(4)任何生物DNA堿基組成都符合
A=T,G=C,A+G=T+C現(xiàn)在是77頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是78頁\一共有134頁\編輯于星期三a.DNA雙鏈反向平行
b.堿基配對
*A=TG≡C*堿基是一個平面環(huán)分子。堿基平面垂直于螺旋軸*相鄰堿基相距0.34nm,每10個堿基旋轉(zhuǎn)1圈,雙螺旋螺距為3.4nm,相鄰兩個堿基正好相差3602.DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)的特點:1)B型DNA結(jié)構(gòu)
現(xiàn)在是79頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是80頁\一共有134頁\編輯于星期三
堿基配對結(jié)構(gòu)基現(xiàn)在是81頁\一共有134頁\編輯于星期三c.在DNA雙螺旋分子上交替存在著大溝和小溝蛋白質(zhì)通過大溝和小溝識別堿基序列的特異性,其中大溝對于的識別、結(jié)合尤為重要?,F(xiàn)在是82頁\一共有134頁\編輯于星期三d.維持雙螺旋的力量氫鍵堿基堆積力(basestackingforce)堿基平面疊在一起,存在VanderWaals力堿基疏水性,在雙螺旋內(nèi)部形成疏水的力量
離子鍵現(xiàn)在是83頁\一共有134頁\編輯于星期三3.DNA的右手螺旋和左手螺旋*DNA構(gòu)象與核苷酸順序堿基組成有關(guān)并取決于環(huán)境條件(鹽類、相對濕度)
*主要構(gòu)象類型:右手螺旋:A、B、C、D、E、T型DNA左手螺旋:Z型DNA現(xiàn)在是84頁\一共有134頁\編輯于星期三濕度和鹽類對DNA構(gòu)象的影響多核苷酸鹽類相對濕度%構(gòu)象類型Na+75ANa+92BLi+44CLi+66BT2噬菌體DNANa+60TDNA-RNA雜合鏈Na+33-92A天然RNA(逆轉(zhuǎn)錄病毒)Na+高達(dá)92ANa+43ZNa+高達(dá)92ALi+81B天然DNAPoly(dG-dC)現(xiàn)在是85頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是86頁\一共有134頁\編輯于星期三
右手螺旋1)B型生理條件下最普遍的形式2)A型RNA雙螺旋及DNA-RNA雜交鏈(空間位阻小,有利于轉(zhuǎn)錄)3)C型線粒體DNA及一些病毒4)D型、E型存在于噬菌體等生物中
現(xiàn)在是87頁\一共有134頁\編輯于星期三
3.左手螺旋Z型DNA1)發(fā)現(xiàn):1979年A.Rich等人工合成六聚體d(CGCGCG)單晶進(jìn)行X-射線衍射分析,數(shù)據(jù)表明是Z型骨架,左手雙螺旋DNA
2)Z-DNA的結(jié)構(gòu)特點:每個螺旋由12個堿基對構(gòu)成,螺距4.46nm,直徑1.8nm現(xiàn)在是88頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是89頁\一共有134頁\編輯于星期三
b.脫氧胞苷的堿基取反式構(gòu)象,脫氧鳥苷的堿基是順式。在Z-DNA中G-C交替而出現(xiàn)順式和反式構(gòu)象交替。使糖-磷酸的主鏈的走向呈“之”字型,這
樣Z-DNA主鏈呈鋸齒狀(Zig-Zag)走向。
c.大溝消失,小溝變深現(xiàn)在是90頁\一共有134頁\編輯于星期三
d.體內(nèi)存在的Z-DNA序列特點:(1)DNA序列必須是嘌呤嘧啶交替排列如:CGCGCGGCGCGC(2)序列中必須有5-甲基胞嘧啶的存在
現(xiàn)在是91頁\一共有134頁\編輯于星期三E.與Z-DNA結(jié)合的特殊蛋白質(zhì)F.Z-DNA有利于DNA的負(fù)超螺旋打開G.抗Z-DNA抗體現(xiàn)在是92頁\一共有134頁\編輯于星期三3)Z-DNA的功能:①基因表達(dá)有關(guān)Z-DNA抗體常常緊密地結(jié)合在染色體的疏松部位,增強轉(zhuǎn)錄活性的位點。
現(xiàn)在是93頁\一共有134頁\編輯于星期三②基因調(diào)控Hochschild等報道,一旦發(fā)現(xiàn)細(xì)菌調(diào)控蛋白緊密結(jié)合于它的調(diào)控位點,就通過RNA聚合酶來激活相關(guān)基因的表達(dá),Z-DNA可能參與識別調(diào)控蛋白質(zhì)。
現(xiàn)在是94頁\一共有134頁\編輯于星期三③基因重組Willia等做的黑粉菌實驗指出,Z-DNA在基因重組中起非常重要的過渡作用.在黑粉菌中有一種rec1酶能使染色體第一次配對后互相交換片段,在配對時由rec1酶使Z-DNA的雙鏈產(chǎn)生,并且這種酶與Z-DNA親和力比B-DNA高75倍,Z-DNA與rec1酶緊密結(jié)合是這一時期的主要特征.現(xiàn)在是95頁\一共有134頁\編輯于星期三④疾病治療與新藥開發(fā)Kim等研究表明,一種關(guān)鍵的痘病毒蛋白E3L蛋白(已知該蛋白是病毒摧毀動物細(xì)胞的防御系統(tǒng)所必需的)是通過Z-DNA結(jié)合、干擾防御系統(tǒng)的運行來行使功能的。E3L是牛痘的致病蛋白質(zhì)之一,通過修飾該蛋白質(zhì)的活躍位點可以使其喪失功能?,F(xiàn)在是96頁\一共有134頁\編輯于星期三表2右手螺旋與左手螺旋DNA分子的比較__________________________________________________項目A-DNAB-DNAZ-DNA__________________________________________________螺旋方向右旋右旋左旋每轉(zhuǎn)1圈堿基數(shù)1110.412螺旋直徑2.55nm2.37nm1.84nm螺距2.46nm3.32nm4.56nm堿基平面的傾角19olo9o大溝窄,很深寬,較深平小溝很寬,淺窄,較深很窄,深__________________________________________________現(xiàn)在是97頁\一共有134頁\編輯于星期三4.三螺旋DNA(HDNA)三螺旋DNA(triple-helicalDNA)三鏈DNA(triplestrandsofDNA)是一條DNA鏈在DNA的大溝與DNA雙螺旋中的一條DNA鏈以氫鍵相結(jié)合形成的三股螺旋結(jié)構(gòu)。
現(xiàn)在是98頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是99頁\一共有134頁\編輯于星期三1)三螺旋DNA結(jié)構(gòu):(1)三螺旋DNA是在DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成的,三鏈區(qū)的三鏈均為同型嘌呤(homopurineHPU)或同型嘧啶(homopyrimidineHPY)現(xiàn)在是100頁\一共有134頁\編輯于星期三
(2)
根據(jù)三條鏈組成及相對位置又可分為
Pu-Pu-Py(偏堿性介質(zhì)中穩(wěn)定)Py-Pu-Py(偏酸性介質(zhì)中穩(wěn)定)(3)
鏈中的堿基配對方式兩個堿基符合Watson-Crick堿基配對“-”,另個堿基按Hoogsteen模型“·”即T·A-TC+·G-C
(第三位上的“C”必須質(zhì)子化)A·A-T
現(xiàn)在是101頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是102頁\一共有134頁\編輯于星期三嘧啶核苷酸嘌呤核苷酸(a)嘧啶-嘌呤-嘧啶三螺旋DNA序列(b)三螺旋DNA結(jié)構(gòu)示意圖ab現(xiàn)在是103頁\一共有134頁\編輯于星期三2)生物學(xué)意義及應(yīng)用:(1)三螺旋DNA結(jié)構(gòu)常位于DNA一些重要的部位。如復(fù)制的起始點或終點,轉(zhuǎn)錄的調(diào)控區(qū)或調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合位點以及DNA重組位點,提示與這些功能相關(guān)。(2)豐富了DNA結(jié)構(gòu)學(xué)說現(xiàn)在是104頁\一共有134頁\編輯于星期三b.用寡聚DNA片段封閉轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合點關(guān)閉有害基因活病毒基因。(抗腫瘤,病毒,寄生蟲等)(3)基因治療中的應(yīng)用
a.單鏈DNA片段可攜帶切割劑(核酸內(nèi)切酶,EDTA-Fe等)攜帶至DNA的特定位點,選擇性切斷DNA。現(xiàn)在是105頁\一共有134頁\編輯于星期三5.四螺旋DNA1)發(fā)現(xiàn)在真核染色體末端含有一個富含G的單鏈DNA尾巴,它在體內(nèi)的超螺旋應(yīng)力作用下,可自身回折形成HoogsteenG-G堿基對。兩個DNA分子或染色體分子可彼此連接起來形成一個局部的四螺旋結(jié)構(gòu)?,F(xiàn)在是106頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是107頁\一共有134頁\編輯于星期三2)四螺旋DNA的結(jié)構(gòu)*四螺旋結(jié)構(gòu)由多個G-四堿基體形成右手螺旋,每圈含13個四堿基體DNA。
*在四堿基體中,四條鏈以對稱和反對稱構(gòu)象交替存在?,F(xiàn)在是108頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是109頁\一共有134頁\編輯于星期三3)可能的生物學(xué)意義兩個DNA分子或染色體分子可彼此連接起來形成一個局部的四螺旋結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)可能起著穩(wěn)定染色體的作用
現(xiàn)在是110頁\一共有134頁\編輯于星期三(五)DNA超螺旋結(jié)構(gòu)(三級結(jié)構(gòu))1.DNA三級結(jié)構(gòu)就是指雙螺旋DNA鏈進(jìn)一步扭曲、盤旋形成超螺旋結(jié)構(gòu)。
*超螺旋:負(fù)超螺旋(negativesupercoil)正超螺旋(positivesupercoil)現(xiàn)在是111頁\一共有134頁\編輯于星期三
2.生物體的閉環(huán)DNA都以超螺旋形式存在,如質(zhì)粒、病毒、線粒體的DNA
現(xiàn)在是112頁\一共有134頁\編輯于星期三(六)真核生物染色體DNA真核生物DNA分子呈線狀,其超螺旋結(jié)構(gòu)不同于上述環(huán)狀DNA。它們主要存在于染色體,以核小體的形式再進(jìn)一步盤繞折疊?,F(xiàn)在是113頁\一共有134頁\編輯于星期三*核小體Nucleosome1)核小體核心:組蛋白Histone八聚體
(H2A,H2B,H3,H4各兩分子)
1.75圈DNA超螺旋(146bp)2)連接區(qū):組蛋白H1和20-80bpDNA雙螺旋現(xiàn)在是114頁\一共有134頁\編輯于星期三現(xiàn)在是115頁\一共有134頁\編輯于星期三DNA(2nm)核小體鏈(11nm,每個核小體200bp)纖絲(30nm,每圈6個核小體)突環(huán)(150nm,每個突環(huán)大約75000bp)玫瑰花結(jié)(300nm,6個突環(huán))螺旋圈(700nm,每圈30個玫瑰花)染色體(1400nm,每個染色體含10個玫瑰花200bp)真核生物染色體DNA組裝現(xiàn)在是116頁\一共有134頁\編輯于星期三DNA的質(zhì)量、長度和濃度計算方法1.長度0.34×bp=(nm)2.分子質(zhì)量660×bp=(dal)
3.濃度50×OD260nm=μg/ml
(光徑為1cm)現(xiàn)在是117頁\一共有134頁\編輯于星期三(七)DNA的變性、復(fù)性和雜交1.變性(denaturation)1)概念:當(dāng)DNA的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)受到物理化學(xué)等因素的破壞而解體,其一級結(jié)構(gòu)核苷酸間共價鍵并不斷裂,使配對堿基間氫鍵斷裂,有序的螺旋解離成無序單鏈的過程稱為變性?,F(xiàn)在是118頁\一共有134頁\編輯于星期三**引起變性的因素:常見的有加熱、酸、堿、乙醇、丙酮、尿素、甲酰胺等作用,現(xiàn)在是119頁\一共有134頁\編輯于星期三2)變性過程中DNA物化性質(zhì)發(fā)生改變①
增色效應(yīng)(hyperchromiceffect)②
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