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第五章柯斯質(zhì)粒等其他高級(jí)載體用于克隆大片段DNA的載體特殊用途的載體1本文檔共41頁;當(dāng)前第1頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分用于連入更長DNA片段的載體基因組繪圖與測序需要把更長(>18kb)的片段連入載體柯斯質(zhì)粒(cosmid)Fosmids噬菌體P1載體系統(tǒng)(bacteriophageP1vector)BAC(bacterialartificialchromosome)PAC(P1-derivedartificialchromosome)YAC(Yeastartificialchromosome)Mega-YAC2本文檔共41頁;當(dāng)前第2頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分3本文檔共41頁;當(dāng)前第3頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分柯斯質(zhì)粒載體“柯斯克隆”(cosmidcloning)的理論依據(jù):在λphage線性DNA分子的每一端都具有彼此互補(bǔ)的單鏈突出序列,即所謂的粘性末端(cos位點(diǎn))λphage的多連體分子是由cos連接而成的。末端酶(terminase)或叫Ter體系——即λphage具有一種位點(diǎn)特異的切割體系(site-specificcuttingsystem).coscoscoscoscoscos4本文檔共41頁;當(dāng)前第4頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分柯斯質(zhì)粒載體中克隆的簡化示意圖5本文檔共41頁;當(dāng)前第5頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分6本文檔共41頁;當(dāng)前第6頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分7本文檔共41頁;當(dāng)前第7頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分柯斯載體的特點(diǎn)第一,具有λ噬菌體的特性。第二,具有質(zhì)粒載體的持性。第三,具有高容量的克隆能力。第四,具有與同源序列的質(zhì)粒進(jìn)行重組的能力。8本文檔共41頁;當(dāng)前第8頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分柯斯克隆技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)由于柯斯載體兼具了質(zhì)粒和λ噬菌體兩方面的特性,提高了克隆外源DNA片段的能力,可達(dá)45kb左右,因此對(duì)于構(gòu)建真核生物基因文庫是一種特別有用的克隆載體;應(yīng)用柯斯質(zhì)粒作克隆載體,所形成的非重組體的克隆本底比較低,從而提高了篩選具外源DNA的重組體質(zhì)粒的幾率。9本文檔共41頁;當(dāng)前第9頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分柯斯克隆技術(shù)的缺點(diǎn)由于經(jīng)核酸內(nèi)切酶切割作用產(chǎn)生的線性的柯斯質(zhì)粒載體,彼此間會(huì)通過分子內(nèi)重組形成多聚體分子。由于經(jīng)核酸內(nèi)切酶做局部消化的折合基因組產(chǎn)生出來的DNA片段,在隨后的連接反應(yīng)中,往往會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)或數(shù)個(gè)片段隨機(jī)連接在一起的情況。10本文檔共41頁;當(dāng)前第10頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分
缺點(diǎn)克服辦法
a.堿性磷酸酶的脫磷酸作用為克服上述的局限性,一般是在連接反應(yīng)之前,先用堿性磷酸酶對(duì)線性的柯斯質(zhì)粒DNA,使之脫磷酸,以阻止它們之間發(fā)生自連。b.電泳分部分離克服上述局限性的另一種較為有效的辦法是,在連接反應(yīng)前,先將局部消化的DNA進(jìn)行電泳分部分離,富集大分子量的片段(31-45Kb),再同線性化的柯斯載體DNA連接。11本文檔共41頁;當(dāng)前第11頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分Ish-Horowicz-Burke柯斯克隆方案12本文檔共41頁;當(dāng)前第12頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分13本文檔共41頁;當(dāng)前第13頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分Bates-Swift柯斯克隆方案柯斯質(zhì)粒載體c2XB具有兩個(gè)被平末端限制酶SmaI分隔開來的cos位點(diǎn)。這些平末端在所用的條件下僅以極低的效率發(fā)生連接,因此可以有效的避免形成多個(gè)載體拷貝的重組子14本文檔共41頁;當(dāng)前第14頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分pWE和sCos系列的現(xiàn)代柯斯質(zhì)粒特征:對(duì)未經(jīng)大小選擇的DNA進(jìn)行簡單克隆的多克隆位點(diǎn);在克隆位點(diǎn)旁邊的噬菌體啟動(dòng)子;克隆位點(diǎn)兩側(cè)的單一Not
I,SacI或SfiI位點(diǎn),可將單一片段插入從載體上切除下來。如果需要向哺乳動(dòng)物細(xì)胞轉(zhuǎn)移基因,載體上還可以包含編碼顯性選擇標(biāo)記的哺乳動(dòng)物表達(dá)元件。15本文檔共41頁;當(dāng)前第15頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分16本文檔共41頁;當(dāng)前第16頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分柯斯質(zhì)粒的替代者BAC和PAC17本文檔共41頁;當(dāng)前第17頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分噬菌體Pl18本文檔共41頁;當(dāng)前第18頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分BAC系統(tǒng)(細(xì)菌人工染色體)19本文檔共41頁;當(dāng)前第19頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分利用重組酶的體內(nèi)DNA重組技術(shù)20本文檔共41頁;當(dāng)前第20頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分載體的選擇21本文檔共41頁;當(dāng)前第21頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分特殊用途載體可用于產(chǎn)生測序所需的單鏈DNA的載體表達(dá)載體制備RNA探針的載體最大量合成蛋白質(zhì)的載體簡化蛋白純化的載體促進(jìn)表達(dá)蛋白溶解的載體促進(jìn)蛋白外運(yùn)的載體合而為一:組合了多種特性的載體22本文檔共41頁;當(dāng)前第22頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分制備RNA探針的載體23本文檔共41頁;當(dāng)前第23頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分制備RNA探針?biāo)玫腖ITMUS載體的結(jié)構(gòu)和用途24本文檔共41頁;當(dāng)前第24頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分25本文檔共41頁;當(dāng)前第25頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分表達(dá)載體Thebasesequenceofthe?10and?35regionsoffournaturalpromoters,twohybridpromoters,andtheconsensuspromoter.26本文檔共41頁;當(dāng)前第26頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分Structureofafactor-independenttranscriptionalterminator.27本文檔共41頁;當(dāng)前第27頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分影響克隆基因表達(dá)的因素28本文檔共41頁;當(dāng)前第28頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分對(duì)插入基因進(jìn)行可控表達(dá)29本文檔共41頁;當(dāng)前第29頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分克隆到pET載體中的基因表達(dá)調(diào)控策略30本文檔共41頁;當(dāng)前第30頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分ControlofclonedgeneexpressionusingtheλcIpromoter31本文檔共41頁;當(dāng)前第31頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分RegulationofthepBADpromoter.32本文檔共41頁;當(dāng)前第32頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分簡化蛋白純化的載體Structureofavector(pBAD/His,InvitrogenCorporation)designedfortheexpressionofaclonedgeneasafusionproteincontainingapolyhistidinesequence.33本文檔共41頁;當(dāng)前第33頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分融合標(biāo)簽及其抗體34本文檔共41頁;當(dāng)前第34頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分Purificationofaclonedgeneproductsynthesizedasafusiontothebiotincarboxylasecarrierprotein(tag).35本文檔共41頁;當(dāng)前第35頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分內(nèi)含肽,外含肽和蛋白切割36本文檔共41頁;當(dāng)前第36頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分與內(nèi)含肽融合合成的克隆基因產(chǎn)物的純化37本文檔共41頁;當(dāng)前第37頁;編輯于星期二\12點(diǎn)24分促進(jìn)表達(dá)蛋白溶解的載體要減少包涵體的形成,可以
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