第十一章分類鑒定

第十一章

微生物的分類鑒定

據(jù)保守估計(jì)，地球上真菌約150萬種，細(xì)菌4萬種，病毒130萬種但認(rèn)識(shí)的微生物僅是估計(jì)數(shù)量的5~10%，即15萬~20萬種要認(rèn)識(shí)、研究和利用類群龐大的微生物資源，必須對(duì)它們進(jìn)行分類。定義：按微生物的親緣關(guān)系把它們安排成條理清楚的各種分類單元或分類群的科學(xué)。任務(wù)：分類、鑒定、命名命名(nomenclature)：是根據(jù)命名法規(guī)，給每一個(gè)分類群一個(gè)專有的名稱；鑒定(identification或determination)：借助于現(xiàn)有的微生物分類系統(tǒng)，通過特征測(cè)定，確定未知的、或新發(fā)現(xiàn)的、或未明確分類地位的微生物所應(yīng)歸屬分類群的過程。分類(classification)：根據(jù)一定的原則對(duì)微生物進(jìn)行分群歸類，根據(jù)相似性或相關(guān)性水平排列成系統(tǒng)，并對(duì)各個(gè)分類群的特征進(jìn)行描述，以便查考和對(duì)未被分類的微生物進(jìn)行鑒定；第一節(jié) 細(xì)菌分類一、種以上的系統(tǒng)分類單元界Kingdom門Phylum（或Division）——亞門綱Class——亞綱 ——超目 目Order——亞目 科Family——亞科 ——族 ——亞族 屬Genus 種Species種是生物分類中基本的分類單元和分類等級(jí)。

微生物的種：指具有高度特征相似性的菌株群，這個(gè)菌株群與其他類群的菌株有很明顯的區(qū)別。二、種（species）種的具體代表：稱為“模式種”（typespecies）三、種以下的分類單元亞種（subspeciers）：種的進(jìn)一步細(xì)分，一般指其某一明顯而穩(wěn)定的特征與模式中不同的種.型：使用中用型作為后綴；表示細(xì)菌菌株菌株（strain）：表示任何由一個(gè)獨(dú)立分離的單細(xì)胞繁殖而成的純種群體極其一切后代；例如：抗原特征的差異，分為不同的血清型；對(duì)噬菌體裂解反應(yīng)的不同，分為不同的噬菌體型四、微生物的命名命名：菌種的學(xué)名是按照《國(guó)際細(xì)菌命名法規(guī)》命名的國(guó)際學(xué)術(shù)界公認(rèn)，并通用的名稱。命名原則：雙名法學(xué)名=屬名+種名+（首次定名人）+定名年份規(guī)定與常識(shí)：屬名應(yīng)大寫首字母，種的加詞代表一個(gè)種的次要特征，首字母小寫，屬名和種名采用斜體字。例如：

金黃色葡萄球菌，StaphylococcusaureusRosenbach1884

Bacillussubtilis(Ehrenberg,1835)Cohn1872五、細(xì)菌分類和伯杰氏手冊(cè)細(xì)菌：伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)（第八、第九版）、細(xì)菌系統(tǒng)學(xué)手冊(cè)（第一版）美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授伯杰(D.Bergey)主編。1957年第七版后，吸收了國(guó)際上細(xì)菌分類學(xué)家參加編寫，它的近代版本反映了出版年代細(xì)菌分類學(xué)的最新成果，因而逐漸確立了在國(guó)際上對(duì)細(xì)菌進(jìn)行全面分類的權(quán)威地位。第一版（1923年）~第八版（1974年）~第九版（1994年）

1984~1989年改為《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》，簡(jiǎn)稱《系統(tǒng)手冊(cè)》(Bergey’sManualofSystematicBacteriology)（第一版，分四卷）第二版，分五卷（根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育資料，對(duì)分類單元進(jìn)行了相當(dāng)大的調(diào)整，將細(xì)菌分成兩個(gè)域共25門39綱）第一卷：古生菌、藍(lán)細(xì)菌、光合細(xì)菌以及最早分支的細(xì)菌第二卷：變形桿菌（包括形態(tài)及生理學(xué)特征多樣的革氏陰性菌）第三卷：低G+C含量的革氏陽(yáng)性菌第四卷：高G+C含量的革氏陽(yáng)性菌第五卷：浮霉?fàn)罹⒙菪w、絲桿菌、擬桿菌和衣原體等伯杰氏手冊(cè)是目前進(jìn)行細(xì)菌分類、鑒定的最重要依據(jù)，其特點(diǎn)是描述非常詳細(xì)，包括對(duì)細(xì)菌各個(gè)屬種的特征及進(jìn)行鑒定所需做的實(shí)驗(yàn)的具體方法。第二節(jié) 微生物的分類系統(tǒng)一、生物的界級(jí)分類學(xué)說是在認(rèn)識(shí)發(fā)展過程中存在的對(duì)生物分類的不同階段的不同觀點(diǎn)。如：二界系統(tǒng)、三界系統(tǒng)、四界系統(tǒng)、五界系統(tǒng)、六界系統(tǒng)和三原界系統(tǒng)二、三原界系統(tǒng)

是1978年由Wose提出的，所有生物存在一個(gè)共同祖先，由它分三條進(jìn)化路線，就形成了三個(gè)原界：古細(xì)菌原界、真細(xì)菌原界、真核生物原界

1990年，又改為古生菌、真細(xì)菌、真核生物

三、系統(tǒng)發(fā)育樹

定義：p331第三節(jié) 微生物的分類鑒定方法菌種鑒定步驟：獲得純培養(yǎng)物測(cè)定必要的鑒定指標(biāo)查找權(quán)威性的菌種鑒定手冊(cè)一、傳統(tǒng)分類法1、形態(tài)特征：個(gè)體形態(tài)（形狀、大小、染色反應(yīng)等）群體形態(tài)（菌落特征、液體培養(yǎng)特點(diǎn)等）2、生理生化特征：營(yíng)養(yǎng)要求、代謝產(chǎn)物、酶的反應(yīng)等的測(cè)定3、生態(tài)特征：微生物間各種相互關(guān)系的利用