兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究課件

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究研究背景

過敏性紫癜(HSP)是兒童時(shí)期最常見的以小血管炎癥為主要病變的系統(tǒng)性血管炎，以皮膚紫癜、胃腸道癥狀、關(guān)節(jié)腫痛、腎臟損害為主要臨床表現(xiàn)兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

HSP發(fā)病率有逐年增多趨勢江西省兒童醫(yī)院每年收治新發(fā)HSP住院人數(shù)研究背景兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究皮疹反復(fù)出現(xiàn)暴發(fā)性、壞死性皮膚紫癜腎臟損傷嚴(yán)重的胃腸道大出血新發(fā)病例嚴(yán)重腎臟損傷者逐漸增多

紫癜性腎炎占兒童繼發(fā)性腎臟疾病第一位兒童時(shí)期終末期腎臟病的主要原因

研究背景兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

HSP患兒腎臟是否受累及受累程度是決定其預(yù)后的最主要因素

腎臟損傷在過敏性紫癜中的發(fā)生率達(dá)30％～50％研究背景兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究病因及發(fā)病機(jī)制仍未完全闡明臨床上尚缺乏有效的治療措施加強(qiáng)對過敏性紫癜發(fā)病機(jī)制、特別是分子發(fā)病機(jī)制的研究以試圖尋找更科學(xué)、更有效的治療方法來控制其進(jìn)一步發(fā)生與發(fā)展成為廣大兒腎工作者努力的方向研究背景兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

許多研究者、臨床工作者均在努力尋找能夠減少HSP疾病發(fā)生、導(dǎo)致腎損害的各種因素，以期能指導(dǎo)臨床治療，改善HSP的預(yù)后兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

目前的研究多集中在單一細(xì)胞因子或者單一基因在過敏性紫癜發(fā)病及進(jìn)展中的作用和關(guān)系上血清中IL-6、TNF-α水平能夠反映HSP患兒的疾病嚴(yán)重程度

LinCY,YangYH,LeeCC,etal.Thrombopoietinandinterleukin-6levelsinHenoch-Sch?nleinpurpura[J].JMicrobiolImmunolInfect,2006;39(6):476-82

HSP患兒血清VCAM-1水平與HSP患兒的疾病嚴(yán)重程度有關(guān)

傅睿，胡寶金，等.可溶性血管細(xì)胞粘附分子1（sVCAM-1）在紫癜性腎炎發(fā)病中的作用探討[J].中國免疫學(xué)雜志，2003；19（2）：129－131.

研究現(xiàn)狀兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究基因多態(tài)性及表達(dá)異常與HSP的易感性、腎損傷進(jìn)展、預(yù)后有相關(guān)性

人類白細(xì)胞抗原(HLA)-DQAI、HIA-B35、HLA–DRBI腎素-血管緊張素系統(tǒng)(RAS)基因細(xì)胞毒性T細(xì)胞相關(guān)蛋白4基因

家族性地中?；?/p>

C4基因、PAX2

只是從某一方面反映了其中某些單一因素在過敏性紫癜發(fā)病中的作用只是針對一個(gè)或幾個(gè)基因進(jìn)行研究，無法達(dá)到對基因網(wǎng)絡(luò)化、高通量分析的要求

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究我科開展的課題血管細(xì)胞粘附分子-1(VCAM-1)在紫癜性腎炎發(fā)病中的作用及其臨床意義的研究巨噬細(xì)胞移動抑制因子在紫癜性腎炎發(fā)病中作用及意義巨噬細(xì)胞移動抑制因子-173G/C基因多態(tài)性與紫癜性腎炎發(fā)病的關(guān)系足細(xì)胞蛋白Podocalyxin在紫癜性腎炎發(fā)病機(jī)制中的研究松弛素與兒童過敏性紫癜復(fù)發(fā)及腎損害關(guān)系的研究免疫吸附血液灌流技術(shù)在兒童重癥過敏性紫癜中的臨床應(yīng)用

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究問題目前研究手段的局限性及單一方面性參與HSP發(fā)生、發(fā)展過程中的主要基因?qū)е翲SP患兒腎損傷的基因

目前并不十分清楚，需要更先進(jìn)的研究方法兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究基因芯片技術(shù)提供研究平臺

將幾千個(gè)基因特異的探針或其cDNA片斷固定在載體上能夠高通量、準(zhǔn)確、快速同時(shí)進(jìn)行成千上萬條基因表達(dá)的測定

對來源于不同個(gè)體、不同組織、不同細(xì)胞周期、不同發(fā)育階段、不同分化階段、不同病變、不同刺激下的細(xì)胞內(nèi)的mRNA或逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物cDNA進(jìn)行檢測大規(guī)模對這些基因表達(dá)的個(gè)體特異性、組織特異性、發(fā)育階段特異性、分化階段特異性、病變特異性、刺激特異性進(jìn)行綜合分析和判斷疾病的診斷、鑒別診斷、治療藥物選擇、預(yù)后判斷兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究基因芯片技術(shù)在腎臟疾病診斷和治療中的應(yīng)用兒童腎病綜合征基因表達(dá)譜分析系統(tǒng)性紅斑狼瘡Alport綜合征UUO大鼠腎間質(zhì)纖維化的分子機(jī)制糖尿病腎病大鼠兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究研究內(nèi)容及目的

利用基因芯片技術(shù)檢測HSP患兒外周血、HSPN患兒腎組織基因表達(dá)譜，以正常兒童外周血及正常腎組織基因表達(dá)譜為對照，對差異表達(dá)基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析，篩選出HSP患兒疾病發(fā)生及腎損傷相關(guān)基因，以探討HSP發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究研究對象病例組：HSP患兒6例，根據(jù)有無尿改變分為非腎損傷組(NHSPN)3例，腎損傷組(HSPN)3例。對照組：選取年齡、性別與病例組相匹配的3例健康體檢兒童外周血；正常腎組織1例來自腎腫瘤切除術(shù)后遠(yuǎn)離腫瘤的正常腎組織。

HSP診斷符合《實(shí)用兒科學(xué)》第7版中HSP的診斷標(biāo)準(zhǔn)。HSPN診斷符合中華醫(yī)學(xué)會兒科分會腎臟病學(xué)組制定的診斷標(biāo)準(zhǔn)。

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究對照組NHSPN組HSPN組外周血或腎組織治療前及病情緩解2周后留取外周血治療前外周血及腎組織外周血及腎組織總RNA抽提及鑒定cDNAmicroarray芯片制備及雜交信號掃描和分析RT-PCR法芯片結(jié)果驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果用SPSS10.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析研究方法及技術(shù)路線兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

研究結(jié)果與討論總RNA質(zhì)量檢測

芯片數(shù)據(jù)評估

芯片結(jié)果

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究總RNA質(zhì)量檢測

總RNA經(jīng)生物分光光度計(jì)檢測，OD230/OD260/OD280比值均接近1:2:1瓊脂糖凝膠電泳圖均可以清晰地看到5S、18S和28S條帶，亮度28S:18S接近2:1

說明所提取的總RNA完整性好、純度高，質(zhì)量符合表達(dá)譜芯片實(shí)驗(yàn)要求兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究芯片數(shù)據(jù)評估

芯片熒光信號掃描圖：芯片信號強(qiáng)度高且均一，基因點(diǎn)清晰，沒有基因點(diǎn)漏點(diǎn)、點(diǎn)重疊以及不正常熒光的情況

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化后作Box-Plot圖：所有樣本的信號分布幾乎是相同的，無明顯差異，均可用于進(jìn)一步數(shù)據(jù)分析

兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

散點(diǎn)圖：形象化評估兩個(gè)比較組間的基因表達(dá)差異，X/Y軸是每個(gè)樣本的標(biāo)準(zhǔn)化信號值（log2形式），綠色線是折疊變化線，在頂面綠色線以上和底下綠色線以下的基因代表兩個(gè)比較組間的差異表達(dá)基因兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

層次分析聚類：將具有相似表達(dá)譜的樣品聚集到一類，可以檢測同一類樣本之間重復(fù)性。本研究樣本各組能聚到一類,說明同一類樣本間的重復(fù)性良好兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究芯片結(jié)果

組間差異表達(dá)基因篩選標(biāo)準(zhǔn)：火山圖（VolcanoPlots）：兩條垂直線代表上下調(diào)1.5倍，水平線代表T檢驗(yàn)P值＜0.05，圖中紅點(diǎn)代表具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異表達(dá)基因兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究單純過敏性紫癜組與對照組間共有1064條差異表達(dá)基因，其中上調(diào)基因661條，下調(diào)基因403條，Pathway分析共有21條通路發(fā)生顯著性異常改變兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究單純過敏性紫癜組與對照組部分上調(diào)差異表達(dá)基因GENE-IDGENE-NAME

基因描述GO生物過程51286BM88BM88抗原無注釋7077TIMP2組織金屬蛋白酶抑制劑2細(xì)胞增殖64129TINAGL1小管間質(zhì)性腎炎抗原樣1炎癥/免疫114904C1QTNF6補(bǔ)體C1Q腫瘤壞死蛋白6無注釋30835CD209CD209分子炎癥/免疫163702IL28RA白細(xì)胞介素28受體α（??干擾素λ受體）信號轉(zhuǎn)導(dǎo)炎癥/免疫5228PGF胎盤生長因子，血管內(nèi)皮生長因子相關(guān)蛋白信號轉(zhuǎn)導(dǎo)4485MST1巨噬細(xì)胞刺激1（類肝細(xì)胞生長因子）蛋白水解兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究

單純過敏性紫癜組與對照組部分下調(diào)差異表達(dá)基因GENE-IDNAME

基因描述GO生物過程3428IFI16干擾素γ誘導(dǎo)蛋白16炎癥/免疫、細(xì)胞增殖/分化、轉(zhuǎn)錄25816TNFAIP8腫瘤壞死因子，α-誘導(dǎo)蛋白8凋亡的調(diào)控9516LITAF脂多糖誘導(dǎo)腫瘤壞死因子凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控8743TNFSF10腫瘤壞死因子（配體）超家族成員10凋亡、免疫、信號傳導(dǎo)3002GZMB

顆粒酶B（顆粒酶2，細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞相關(guān)絲氨酸酯酶1）蛋白水解、細(xì)胞凋亡/溶解313AOAHacyloxyacyl水解酶（中性粒細(xì)胞）炎癥/免疫、代謝5993RFX5調(diào)控因子X，5（影響人類白細(xì)胞抗原II類的表達(dá)）轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)10588MTHFS5,10甲酰四氫葉酸合成酶（5-甲酰四氫葉酸環(huán)連接酶）代謝兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究上調(diào)基因（661條）較下調(diào)基因（403條）多，HSP差異基因上調(diào)為主涉及目前在HSP發(fā)生發(fā)展中已被認(rèn)識的基因如：粘附分子類（BCAM、CEACAM1、CEACAM3、GLYCAM1）、補(bǔ)體及細(xì)胞因子（C1QC、C1QTNF6、C1QTNF8、CCL21、CD5L、CD209、IL28RA、IL31RA、IL5RA、MST1、TNFRSF6B、HIF3A）、血類管緊張素Ⅱ受體1（AGTRL1）等涉及一些未被認(rèn)識的可能參與HSP發(fā)生過程的基因如：抗原（BM88）、防御β126(DEFB126)、顆粒酶B(GZMB)、AOAH、調(diào)控因子（RFX5）等

單純過敏性紫癜組與對照組間差異表達(dá)基因兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究紫癜性腎炎組與單純過敏性紫癜組間共有830條差異表達(dá)基因，其中上調(diào)基因385條，下調(diào)基因445條，Pathway分析共有49條通路發(fā)生顯著性異常改變兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究紫癜性腎炎與單純過敏性紫癜組部分上調(diào)差異表達(dá)基因GENE-IDNAME

基因描述GO生物過程1879EBF早期B細(xì)胞因子轉(zhuǎn)錄調(diào)控9242ABF1/MSC激活的B細(xì)胞因子1轉(zhuǎn)錄調(diào)控3108HLA-DMA主要組織相容性復(fù)合體II類DMα炎癥/免疫3123HLA-DRB1主要組織相容性復(fù)合體Ⅱ類DRβ1炎癥/免疫7423VEGFB血管內(nèi)皮生長因子β

細(xì)胞增殖、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)7048TGFBR2

轉(zhuǎn)化生長因子β受體II（70/80kDa）信號通路、細(xì)胞增殖6648SOD2超氧化物歧化酶2氧化應(yīng)激、代謝、轉(zhuǎn)錄調(diào)控7127TNFAIP2腫瘤壞死因子α-誘導(dǎo)蛋白2血管發(fā)生、細(xì)胞分化兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究紫癜性腎炎與單純過敏性紫癜組部分下調(diào)差異表達(dá)基因GENE-IDNAME基因描述GO生物過程2161F12凝血因子XII血液凝固、纖溶3336HSPE1熱休克10KD蛋白1蛋白質(zhì)折疊3324HSP90AA2熱休克蛋白90kDaα（胞質(zhì)），A類成員2無注釋3070HELLS解旋酶，淋巴特定轉(zhuǎn)錄、有絲分裂2887GRB10生長因子受體10細(xì)胞內(nèi)的信號級聯(lián)、胰島素受體信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路3609ILF3白細(xì)胞介素增強(qiáng)子結(jié)合因子3轉(zhuǎn)錄、調(diào)控2574GAGE2G抗原2無注釋2576GAGE4G抗原4無注釋兒童過敏性紫癜相關(guān)基因表達(dá)譜研究紫癜性腎炎組與單純過敏性紫癜組間差異表達(dá)基因上調(diào)（385條）較下調(diào)（445條)少其中凝血因子12（F12）、熱休克10KD蛋白1（HSPE1）、HSP90AA2、MTHFS、G抗原2/4/6(GAGE2/4/6)、生長因子受體10（GRB10）、白細(xì)胞介素增強(qiáng)子結(jié)合因子3（ILF3）等基因上調(diào)倍數(shù)大于2.5倍HLA-DMA/DRB1、早期B細(xì)胞因子（EBF）、SOD2、TGFBR2、激活的B細(xì)胞因子1（ABF1）、干擾素-γ誘導(dǎo)蛋白16（