DB14-T 2663-2023 實(shí)驗(yàn)用小型豬遺傳質(zhì)量控制

ICS65.020.30CCSB4414IDB14/T2663—2023前言 2規(guī)范性引用文件 3術(shù)語(yǔ)和定義 4遺傳分類(lèi)及命名 5繁殖方法 26遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè) 27判定結(jié)論 68報(bào)告 6DB14/T2663—2023本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分：標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起草。本文件由山西省科學(xué)技術(shù)廳提出、組織實(shí)施和監(jiān)督檢查。山西省市場(chǎng)監(jiān)督管理局對(duì)標(biāo)準(zhǔn)的組織實(shí)施情況進(jìn)行監(jiān)督檢查。本文件由山西省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)歸口。本文件起草單位：山西醫(yī)科大學(xué)。本文件主要起草人：宋國(guó)華、高繼萍、陳朝陽(yáng)、王曉堂、宋曉娜、楊鈞婷、閆曉如、郭永昌。1DB14/T2663—2023實(shí)驗(yàn)用小型豬遺傳質(zhì)量控制本文件規(guī)定了實(shí)驗(yàn)用小型豬的遺傳分類(lèi)與命名、繁殖方法、遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)、判定結(jié)論和報(bào)告。本文件適用于實(shí)驗(yàn)用小型豬的遺傳質(zhì)量控制。2規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中，注日期的引用文件，僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改單）適用于本文件。GB14923實(shí)驗(yàn)動(dòng)物哺乳類(lèi)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的遺傳質(zhì)量控制NY/T1673畜禽微衛(wèi)星DNA遺傳多樣性檢測(cè)技術(shù)規(guī)程3術(shù)語(yǔ)和定義下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。3.1實(shí)驗(yàn)用小型豬experimentalminipig經(jīng)人工飼育，對(duì)其攜帶的病原微生物和寄生蟲(chóng)實(shí)行控制，遺傳背景明確或者來(lái)源清楚，用于科學(xué)研究、教學(xué)、生產(chǎn)、檢定以及其他科學(xué)實(shí)驗(yàn)的小型豬。3.2近交系inbredstrain經(jīng)連續(xù)20代及以上的全同胞兄妹或親代與子代交配培育而成，品系內(nèi)所有個(gè)體都可追溯到起源于第20代或以后代數(shù)的一對(duì)共同祖先。近交系數(shù)（inbreedingcoefficient）應(yīng)大于99%。3.3封閉群closedcolony以非近親交配方式進(jìn)行繁殖生產(chǎn)的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物種群，在不從外部引入新個(gè)體的條件下，至少連續(xù)繁殖4代以上。4遺傳分類(lèi)及命名41遺傳分類(lèi)根據(jù)遺傳特點(diǎn)的不同，實(shí)驗(yàn)用小型豬分為近交系和封閉群。4.2命名4.2.1近交系命名近交系一般以大寫(xiě)英文字母或加阿拉伯?dāng)?shù)字命名，符號(hào)應(yīng)盡量簡(jiǎn)短，如WSZ。4.2.2近交代數(shù)2DB14/T2663—2023近交代數(shù)用大寫(xiě)英文字母F表示。例如當(dāng)一個(gè)近交系的近交代數(shù)為30代時(shí)，寫(xiě)成（F30）。4.2.3其它近交系亞系、重組近交系、重組同類(lèi)系、同源突變近交系、同源導(dǎo)入近交系的定義和命名按照GB14923執(zhí)行。4.2.4封閉群命名封閉群的命名按照GB14923執(zhí)行。5繁殖方法5.1近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬繁殖方法5.1.1原則保持近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬的同基因性及基因純合性。5.1.2引種近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬繁殖用種子應(yīng)來(lái)自于近交系的基礎(chǔ)群或血緣擴(kuò)大群，遺傳背景明確，有完整的資料（包括品系名稱(chēng)、來(lái)源、近交代數(shù)、遺傳基因特點(diǎn)及主要生物學(xué)特征等）。5.1.3方法基礎(chǔ)群、血緣擴(kuò)大群和生產(chǎn)群的繁殖方法按照GB14923執(zhí)行。當(dāng)近交系小型豬生產(chǎn)供應(yīng)數(shù)量不是很大時(shí)，一般不設(shè)血緣擴(kuò)大群，僅設(shè)基礎(chǔ)群和生產(chǎn)群。5.2封閉群實(shí)驗(yàn)用小型豬繁殖方法5.2.1原則保持封閉群小型豬的基因異質(zhì)性和多態(tài)性，以非近親交配方式進(jìn)行繁殖,避免近交系數(shù)隨繁殖代數(shù)增加而過(guò)快上升。5.2.2引種5.2.2.1封閉群小型豬繁殖用種子應(yīng)遺傳背景明確，有完整的資料（包括種群名稱(chēng)、來(lái)源、近交代數(shù)、遺傳基因特點(diǎn)及主要生物學(xué)特性等）。5.2.2.2根據(jù)繁殖方式，在保證每代近交系數(shù)增量不大于1%的前提下，決定最小引種規(guī)模。宜采用循環(huán)交配方式，最小引種規(guī)模為13對(duì)無(wú)血緣關(guān)系（三代以內(nèi)無(wú)共同祖先）的公母豬；若采用隨機(jī)交配的方式，最小引種規(guī)模為25對(duì)無(wú)血緣關(guān)系的公母豬。5.2.3方法具體繁殖方法按照GB14923執(zhí)行。6遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)6.1近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬的遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)3DB14/T2663—20236.1.1監(jiān)測(cè)方法采用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記檢測(cè)方法。具體方法按照NY/T1673執(zhí)行，各微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的染色體位置、等位基因數(shù)、等位基因分布范圍、引物序列、熒光標(biāo)記、退火溫度、鎂離子濃度等見(jiàn)表1。表1各微衛(wèi)星位點(diǎn)的名稱(chēng)、引物序列、PCR反應(yīng)的退火溫度、鎂離子濃度（Mg2+）、熒光標(biāo)記、染色體位置、等位基因數(shù)、等位基因分布范圍Mg2+8R-GTTTGAAAATGGGGTGTTTCC84768X86.1.2時(shí)間間隔近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬生產(chǎn)群每年至少進(jìn)行1次遺傳質(zhì)量檢測(cè)。6.1.3抽樣對(duì)基礎(chǔ)群，凡在子代留有種豬的雙親動(dòng)物都應(yīng)進(jìn)行檢測(cè)。對(duì)生產(chǎn)群，按照表2要求從每個(gè)近交系中隨機(jī)抽取非同窩成年實(shí)驗(yàn)用小型豬，公母各半。表2近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬生產(chǎn)群遺傳監(jiān)測(cè)抽樣要求4DB14/T2663—2023N≤5046N>1006.1.4結(jié)果判定近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)結(jié)果判定按照表3執(zhí)行。表3近交系實(shí)驗(yàn)用小型豬遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)結(jié)果判定6.2封閉群實(shí)驗(yàn)用小型豬遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)6.2.1監(jiān)測(cè)方法采用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記檢測(cè)方法。具體方法按照NY/T1673執(zhí)行，各微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的染色體位置、等位基因數(shù)、等位基因分布范圍、引物序列、退火溫度、鎂離子濃度等見(jiàn)表4。表4各微衛(wèi)星位點(diǎn)的名稱(chēng)、引物序列、PCR反應(yīng)的退火溫度、鎂離子濃度（Mg2+）、染色體位置、等位基因數(shù)、等位基因分布范圍12234567985DB14/T2663—2023表4各微衛(wèi)星位點(diǎn)的名稱(chēng)、引物序列、PCR反應(yīng)的退火溫度、鎂離子濃度（Mg2+）、染色體位置、等位基因數(shù)、等位基因分布范圍（續(xù)）8998X6.2.2時(shí)間間隔封閉群實(shí)驗(yàn)用小型豬生產(chǎn)群每年至少進(jìn)行1次遺傳質(zhì)量檢測(cè)。6.2.3抽樣按照表5要求從每個(gè)封閉群中隨機(jī)抽取非同窩成年實(shí)驗(yàn)用小型豬，公母各半。6DB14/T2663—2023表5封閉群實(shí)驗(yàn)用小型豬遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)抽樣要