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1、聚合酶鏈反應(yīng)及其應(yīng)用,檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)院 周 蘭 ,分子診斷學(xué),重醫(yī)醫(yī)學(xué)學(xué)士(1979年,臨床醫(yī)學(xué)) 重醫(yī)醫(yī)學(xué)碩士(1986年,病理生理學(xué)) 重醫(yī)醫(yī)學(xué)博士(1994年,臨床檢驗(yàn)診斷學(xué)) 芝加哥大學(xué)博后(00-03年,分子腫瘤實(shí)驗(yàn)室) 電子郵箱 ,檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)院 周 蘭,本講內(nèi)容,1 PCR概述 2 PCR原理 3 PCR產(chǎn)物檢測(cè)與分析方法 4 PCR特點(diǎn)及應(yīng)用 5 PCR技術(shù)發(fā)展簡(jiǎn)史 6 PCR衍生技術(shù) 7 熒光定量PCR 8 其它基因擴(kuò)增檢驗(yàn)技術(shù) 9 PCR相關(guān)檢驗(yàn)的質(zhì)量管理,1-1 基因擴(kuò)增及其方式 gene amplification gene magnification,1 PCR(Polymer
2、ase chain reaction)概述,1-1 基因擴(kuò)增,1)定義:指基因拷貝數(shù)增加的現(xiàn)象 是基因表達(dá)增加的一種重要機(jī)制 一般說來 正常細(xì)胞中,特定基因的擴(kuò)增與其對(duì)內(nèi)外環(huán)境因素的應(yīng)激反應(yīng)有關(guān) 病變細(xì)胞中,基因擴(kuò)增則是致病因素所致的異常擴(kuò)增,如腫瘤細(xì)胞中常見癌基因的擴(kuò)增 2)方式?,2) 基因擴(kuò)增的方式,(1)天然擴(kuò)增-機(jī)體細(xì)胞內(nèi)的擴(kuò)增 在各種因素(發(fā)育和進(jìn)化的需要、對(duì)環(huán)境刺激的應(yīng)答等)作用下,機(jī)體細(xì)胞內(nèi)相關(guān)基因的復(fù)制擴(kuò)增 (2)人為擴(kuò)增 分子克隆-體外、細(xì)胞內(nèi) DNA合成儀-試管內(nèi)(無細(xì)胞體系) PCR-試管內(nèi)(無細(xì)胞體系),重組DNA,目的基因,載體,復(fù)制子,宿主細(xì)胞,擴(kuò)增,擴(kuò)增,提取目
3、的DNA分子,1)基礎(chǔ)研究的需要 *醫(yī)學(xué)生命科學(xué)研究 *農(nóng)林畜牧魚業(yè)的基礎(chǔ)研究 2)應(yīng)用研究及應(yīng)用的需要 *醫(yī)學(xué)領(lǐng)域(如基因診斷、法醫(yī)學(xué)檢測(cè)) *現(xiàn)代生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)(藥物開發(fā),疫苗, 高質(zhì)量食品和日常生活用品等) ,1-2 PCR技術(shù)誕生所依賴的社會(huì)需求,1-3 PCR的定義,模板DNA 引物(引子序列,一對(duì)) 耐熱DNA聚合酶 四種單核苷酸 Mg 2+,PCR的基本原理,PCR反應(yīng)條件 PCR過程 PCR的特點(diǎn),模板DNA,PCR的基本原理,PCR反應(yīng)條件 PCR過程 PCR的特點(diǎn),引物1,引物2,PCR的基本原理,PCR反應(yīng)條件 PCR過程 PCR的特點(diǎn),引物1,引物2,Taq酶,Taq酶,
4、PCR的基本原理,PCR反應(yīng)條件 PCR過程 PCR的特點(diǎn),第1輪結(jié)束,第2輪開始,一個(gè)分子DNA變成兩個(gè)分子,PCR的基本原理,PCR反應(yīng)條件 PCR過程 PCR的特點(diǎn),Taq,Taq,Taq,Taq,PCR的基本原理,PCR反應(yīng)條件 PCR過程 PCR的特點(diǎn),第2輪結(jié)束,兩分子DNA變成4分子DNA,利用DNA聚合酶催化一對(duì)引物間的特定DNA片段在體外實(shí)現(xiàn)快速、大量擴(kuò)增的方法 也稱:無細(xì)胞克隆技術(shù) 或:特異性DNA序列體外引物定向酶促擴(kuò)增法 是一種模擬體內(nèi)天然DNA復(fù)制過程的體外核酸擴(kuò)增技術(shù),是基因擴(kuò)增技術(shù)的一次重大革新,1-3 PCR定義,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用到分子生物學(xué)研究、臨床檢測(cè)等各個(gè)領(lǐng)域
5、。 優(yōu)點(diǎn): 特異、敏感、簡(jiǎn)便 自動(dòng)化 快速、高效(數(shù)小時(shí)內(nèi)可使模板擴(kuò)增107108倍),2-1 DNA的變性和復(fù)性 2-2 PCR標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系及反應(yīng)過程-三步曲 2-3 反應(yīng)的結(jié)果 2-4 PCR的反應(yīng)條件及其對(duì)PCR的影響 2-5 產(chǎn)物片段及其累積過程,2 PCR原理,2-1 DNA的變性與復(fù)性,DNA的變性(denaturation) 熱變性是實(shí)驗(yàn)室最常用的方法 DNA的復(fù)性(renaturation),1)標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系(五要素) (1)DNA模板(template):靶基因 (2)原料:dNTPs(dATP,dGTP,dCTP,dTTP) (3)催化酶:耐高溫的DNA聚合酶(如:Taq酶
6、) (4) 一對(duì)引物(primer):擴(kuò)增序列的決定者 其與靶基因兩側(cè)序列互補(bǔ) (5) Mg2+ 和 Buffer,2-2 PCR標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系及反應(yīng)過程,高溫變性:在高溫(95)下,待擴(kuò)增的靶DNA雙鏈?zhǔn)軣嶙冃猿蔀閮蓷l單鏈DNA模板 低溫退火:在低溫(3755)下,兩條人工合成的寡核苷酸引物分別與互補(bǔ)的單鏈DNA模板結(jié)合,形成部分雙鏈 適溫延伸:在耐熱DNA聚合酶的最適溫度(72)下,以引物的3端為合成的起點(diǎn),以單核苷酸為原料,沿模板以53方向延伸,合成DNA新鏈,2) 反應(yīng)過程-三步曲,2)PCR的反應(yīng)過程,重復(fù)13步 2530輪,目的DNA片段 擴(kuò)增100萬倍以上,DNA雙螺旋,DNA單鏈
7、 與引物復(fù)性,DNA變性 形成2條單鏈,子鏈延伸 DNA加倍,PCR原理示意圖,Sample denaturatation Primer annealing Primer extension,2-2 反應(yīng)過程,播放PCR短片,1)每一條雙鏈DNA模板,在一次熱循環(huán)后就成了 兩條雙鏈DNA分子 2)每次循環(huán)產(chǎn)生的DNA均能成為下次循環(huán)的模板 3)每一次循環(huán)都使兩條人工合成的引物間的DNA特異區(qū)拷貝數(shù)擴(kuò)增一倍,PCR產(chǎn)物以指數(shù)形式(2n)迅速擴(kuò)增 4)經(jīng)過2530個(gè)循環(huán)后, 理論上可使基因擴(kuò)增109倍以上 實(shí)際上一般可達(dá)106107倍( why?),2-3 PCR的結(jié)果,式中:Y 表示擴(kuò)增產(chǎn)物的量
8、 A 表示n-1次擴(kuò)增時(shí)DNA分子數(shù)量 E 表示擴(kuò)增效率 n 表示循環(huán)次數(shù) 擴(kuò)增30個(gè)循環(huán),即n=30時(shí) 若E=100%,則y=230=1073741824(109) 若E=80%,則y=1.830=45517159.6(107) 由此可見,其擴(kuò)增的倍數(shù)是巨大的!,PCR反應(yīng)動(dòng)力學(xué)公式:Y=A(1+ E)n,2-3 PCR的結(jié)果 30次循環(huán)后靶序列擴(kuò)增的數(shù)量,No. ofNo. Amplicon CyclesCopies of Target 12 24 38 416 532 664 201,048,576 301,073,741,824,1 cycle = 2 Amplicon,2 cycle
9、 = 4 Amplicon,3 cycle = 8 Amplicon,4 cycle = 16 Amplicon,5 cycle = 32 Amplicon,6 cycle = 64 Amplicon,7 cycle = 128 Amplicon,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳,經(jīng)溴化乙錠(EB)等染色,在紫外燈照射下可見到DNA的特異擴(kuò)增區(qū)帶,是一種熒光染料,可嵌入核酸雙鏈的堿基對(duì)之間,在紫外線激發(fā)下發(fā)出紅色熒光 根據(jù)情況,可在凝膠電泳液中加入終濃度為 0.5ug/ml的EB;有時(shí)亦可在電泳后,將凝膠浸入該濃度的溶液中染色1015min EB染色后,肉眼可見核酸電泳帶的DNA量一般5ng 它是一種高誘變
10、性的化學(xué)物質(zhì) SYBR-green 和 gelred 是毒性更小的染料,溴化乙錠(ethidium bromide,EB),2-4 PCR的反應(yīng)條件及其對(duì)PCR的影響,PCR操作程序 向一微量離心管中依次加入雙蒸水、緩沖液、Mg2+、dNTPs、引物、DNA模板和Taq DNA聚合酶 混勻后,離心數(shù)秒,使反應(yīng)成分集于管底 加礦物油50100l于反應(yīng)液表面,防蒸發(fā) 置反應(yīng)管于PCR儀上,設(shè)置程序,進(jìn)行熱循環(huán),PCR反應(yīng)五要素 引物(primer) 酶(Taq DNA polymerase) dNTPs (dATP,dGTP,dCTP,dTTP) 模板(template) Mg2+ (magnes
11、ium),1)模板:* 單、雙鏈均可 *幾乎不需要純化 *但,必須了解靶基因兩側(cè)的核酸序列 *一般臨床檢測(cè)標(biāo)本,可采用快速簡(jiǎn)便的方法溶解細(xì)胞或裂解病原體,再消化除去染色體的蛋白質(zhì)以游離靶基因,便可直接用于PCR擴(kuò)增 * RNA模板提取時(shí),要防止RNase降解RNA 注意:不能混有蛋白酶、核酸酶、 DNA聚合酶抑制劑、DNA結(jié)合蛋白類, 微生物 細(xì)胞:血痕、精斑、口腔拭子、陰道拭子、尿樣、單根毛發(fā)、指甲削刮的碎屑、牙刷、琥珀中的昆蟲、木乃伊 固定和包埋的組織標(biāo)本:脫蠟、蛋白酶K消化 模板DNA的濃度: 0.12ug/100ul體系 *PCR產(chǎn)量隨模板DNA濃度的增加而顯著升高 *但,模板DNA濃
12、度過高,則致非特異性產(chǎn)物增加,模板DNA的來源,2)耐熱的DNA聚合酶,來自嗜熱水生菌,耐熱 具有 5-3方向的聚合酶活性 5-3外切酶活性 逆轉(zhuǎn)錄酶活性 酶量增加:降低反應(yīng)的特異性 酶量過少:降低反應(yīng)的產(chǎn)量 來源: 有提純產(chǎn)物 也有基因工程產(chǎn)品,例:經(jīng)典的Taq DNA聚合酶的特性,該基因2496bp(832aa),酶蛋白為94KDa 酶催化反應(yīng)速度與溫度的關(guān)系 7580:延伸約150nt/酶分子/s 70: 延伸60nt/酶分子/s 55: 延伸24nt/酶分子/s 溫度過高(90以上) 過低(22以下),都降低Taq DNA酶活性,良好的熱穩(wěn)定性: PCR混合物中的Taq DNA聚合酶
13、92.5 X 130min 95 X 40min 97.5 X 56min 其熱穩(wěn)定性是該酶用于PCR反應(yīng)的前提條件 也是PCR技術(shù)能迅速發(fā)展和廣泛應(yīng)用的重要基礎(chǔ),仍可保持50%的活性,例:經(jīng)典的Taq DNA聚合酶的特性,忠實(shí)性 該酶無35外切活性 SO,在PCR反應(yīng)中如發(fā)生某些堿基的錯(cuò)配,該酶無法予以校正 即其保真性不如Pfu DNA聚合酶等 其堿基錯(cuò)配機(jī)率:2.110-4,例:經(jīng)典的Taq DNA聚合酶的特性,離子依賴性 Taq 酶依賴Mg2+,對(duì)Mg2+非常敏感 *以活性程度很低的鮭魚精子DNA為模板,dNTP的濃度為0.70.8mmol/L時(shí),用不同濃度Mg2+進(jìn)行PCR反應(yīng)10mi
14、n,發(fā)現(xiàn):MgCl2在2.0mmol/L時(shí)TaqDNA聚合酶的活性最高 *Mg2+過高:抑制酶活性 Mg2+在10mmol/L時(shí)可抑制4050%的酶活性,例:經(jīng)典的Taq DNA聚合酶的特性,TaqDNA聚合酶,具有非模板依賴性活性,可將PCR雙鏈產(chǎn)物的每一條鏈的3端加入單核苷酸尾,故可使PCR產(chǎn)物具有3突出的單A核苷酸尾 另一方面,在僅有dTTP存在時(shí),它可將平端的質(zhì)粒的3端加入單T核苷酸尾,產(chǎn)生3端突出的單T核苷酸尾 應(yīng)用該特性,可實(shí)現(xiàn)PCR產(chǎn)物的T-A克隆法,除經(jīng)典的Taq酶外,還陸續(xù)發(fā)現(xiàn)下列耐熱酶 1)Tth DNA聚合酶: *從Thermus thermophilus HB8中提取而
15、得 *該酶在高溫和MnCl2條件下,能有效地逆轉(zhuǎn)錄RNA *當(dāng)再加入Mg 2+后,該酶的聚合活性大大增加 SO,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA與DNA的擴(kuò)增可用同一種酶催化 即該酶適用于RT-PCR,2)pfu DNA 聚合酶,是從Pyrococcus furiosis中精制而成的高保真耐高溫DNA聚合酶,它不具有5-3外切酶活性,但具有3-5外切酶活性,可校正PCR擴(kuò)增過程中產(chǎn)生的錯(cuò)誤,使產(chǎn)物的堿基錯(cuò)配率極低,催化DNA的忠實(shí)性比Taq DNA聚合酶 高12倍 PCR產(chǎn)物為平端(無3端突出的單A核苷酸),3)Vent DNA聚合酶 *是從Litoralis棲熱球菌中分離出的 *不具有5-3外切酶活性,但具
16、有3-5外切酶活性,可以去除錯(cuò)配的堿基,具有校對(duì)功能 *可擴(kuò)增 12kb的模板DNA,對(duì)PCR所用的聚合酶的選擇原則和參考信息 (自學(xué),了解),TaKaRa PCR Enzymes,1.TaKaRa TaqTM 1) 用于12 kbp以下的DNA片段的PCR擴(kuò)增 2) 比較經(jīng)濟(jì)的PCR用DNA聚合酶 3) 適用于一般的PCR擴(kuò)增或檢測(cè) 2.TaKaRa Ex TaqTM 1) 用于15 kbp以下的DNA片段的PCR擴(kuò)增 2)融合了LA- PCR技術(shù) 3) 可信度是TaKaRa TaqTM 的34倍 4)從擴(kuò)增靈敏度、擴(kuò)增量、PCR條件的通用性考慮,是一種萬能型PCR用DNA 聚合酶,3.Ta
17、KaRa LA TaqTM 1)用于10 kbp以上的DNA片段的PCR擴(kuò)增 2) 融合了LA PCR技術(shù) 3) 可信度是TaKaRa TaqTM 的7倍 4) 適于擴(kuò)增富含GC或復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)的DNA(用GC Buffer) 4.PyrobestTM DNA Polymerase 1)高保真性(High Fidelity):與Pfu、Vent DNA聚合酶相同,可信度是TaKaRa TaqTM的10倍以上 2)良好的擴(kuò)增性能:與TaKaRa TaqTM有相同的擴(kuò)增性能(優(yōu)于 Pfu、Vent DNA聚合酶),TaKaRa PCR Enzymes,TaKaRa PCR Enzymes,5.TaK
18、aRa Z-TaqTM 1)反應(yīng)速度快,是TaKaRa TaqTM的5倍 2)擴(kuò)增性能良好,與TaKaRa Ex TaqTM 相同 3)可信度高,是TaKaRa TaqTM 的34倍,DNA Polymerase的可信度比較,TaKaRa PCR 酶的性能比較,PCR時(shí)酶的選用,引物:與靶基因兩側(cè)互補(bǔ)的寡核苷酸,其本質(zhì)是單鏈DNA,它決所得擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性和長(zhǎng)度 (1)引物長(zhǎng)度:18-40nt,常用20-24nt *至少18nt,這樣才能保證擴(kuò)增反應(yīng)的特異性 *太長(zhǎng),則致退火時(shí)引物與模板結(jié)合不充分,擴(kuò)增產(chǎn)物減少,3)引物(primer)及其濃度,(2)引物跨度:以200-500bp為宜 特定條
19、件下可擴(kuò)增長(zhǎng)至10kb的片段 (3)引物序列:除與靶序列兩側(cè)匹配外,還應(yīng)與核酸數(shù)據(jù)庫的其它序列不匹配(無明顯同源性) (4)引物濃度:一般是0.1-0.5 mol/L。理想狀態(tài)是-以最低引物量滿足對(duì)產(chǎn)物擴(kuò)增的最大需要 引物濃度偏高: 引起錯(cuò)配等,致反應(yīng)特異性下降 增加引物間二聚體的形成機(jī)會(huì),降低擴(kuò)增效率,引物間互補(bǔ) 形成引物二聚體,引物內(nèi)互補(bǔ) 形成二級(jí)結(jié)構(gòu),引物設(shè)計(jì)的最大原則 在擴(kuò)增的特異性和擴(kuò)增效率上取得平衡 即最大限度地提高擴(kuò)增反應(yīng)的特異性和效率 引物設(shè)計(jì)的軟件有很多 既可以在線設(shè)計(jì),如Primer3 /cgi-bin/primer3/prime
20、r3_www.cgi 也可以用Primer5、Oligo6.65 等等,序列應(yīng)針對(duì)靶基因的高度保守區(qū)(最特異的區(qū)) 同時(shí)與非擴(kuò)增區(qū)無同源序列(以減少非特異結(jié)合) 引物長(zhǎng)度以18-30nt為宜,多為20-24nt ATGC最好隨機(jī)分布(避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的 成串排列,尤其3-端不應(yīng)超過3個(gè)連續(xù)的G或C) G+C占45-55% (G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶) 兩引物之間:匹配的GC含量(why? ),引物設(shè)計(jì)原則(1),引物設(shè)計(jì)原則(2),引物內(nèi)部無互補(bǔ)序列,避免形成二級(jí)結(jié)構(gòu) 兩引物間無互補(bǔ)序列,避免形成引物二聚體 引物3端為關(guān)鍵堿基,其第1和2個(gè)堿基要嚴(yán)格配對(duì)
21、,否則致PCR失敗或擴(kuò)增效率和特異性降低 5端無嚴(yán)格限制,其堿基可不與模板DNA互補(bǔ)而呈游離狀態(tài),因此可在其外設(shè)計(jì)附加序列(見后,便于對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物的分析和克隆),其對(duì)PCR反應(yīng)無明顯影響,3,5,3,5,限制性內(nèi)切酶的識(shí)別序列 啟動(dòng)子序列 引入定點(diǎn)突變序列 探針標(biāo)記(讓引物中的核苷酸帶標(biāo)記),4)dNTP的質(zhì)量與濃度,(1)dNTP呈顆粒狀:保存不當(dāng)易變性失活 (2)dNTP溶液呈酸性:先配成高濃度、小量分裝,-20凍存 (以1M NaOH或1M Tris-HCl的緩沖液將其pH調(diào)節(jié)到7.07.5) 多次凍融會(huì)使dNTP降解 (3)濃度:取決于擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度(920-200mol/L) 濃度過高
22、易產(chǎn)生錯(cuò)誤堿基的摻入,濃度過低則降低反應(yīng)產(chǎn)量 (4)四種dNTP濃度應(yīng)相等 任何一種dNTP濃度不同于其它時(shí),容易引起錯(cuò)配,Mg2+是DNA聚合酶的激活劑 *0.5mmol/L-2.5mmol/L反應(yīng)體系 *Mg2+過低和過高 Taq酶活性降低、特異性降低 PCR產(chǎn)物數(shù)量和質(zhì)量下降,5)Mg2+,6)循環(huán)參數(shù)(溫度、時(shí)間和次數(shù))的設(shè)置, 變性溫度與時(shí)間 通常用9394 x l min 或95 x 20-30sec 若低于93,則需延長(zhǎng)時(shí)間 溫度不能過高,否則降低酶的活性 由于模板DNA鏈比較長(zhǎng),因此PCR反應(yīng)的第一個(gè)循環(huán)的變性時(shí)間需要長(zhǎng)些 最后才是通過大量培養(yǎng)細(xì)菌來擴(kuò)增目的基因。要經(jīng)過DNA酶
23、切、連接、轉(zhuǎn)化和培養(yǎng)等、提取和回收等程序,操作復(fù)雜,一般需要2-7天左右時(shí)間,4)對(duì)標(biāo)本的純度要求低:血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細(xì)胞、活組織等組織的粗提DNA 5)重復(fù)性好 6)用途廣泛 (1)醫(yī)學(xué) 基因組DNA分析,遺傳物質(zhì)的鑒定和遺傳病、 腫瘤和感染性疾病等的診斷、治療和預(yù)防 (2)農(nóng)林牧漁業(yè) (3)環(huán)境科學(xué) (4)法醫(yī)學(xué) (5)考古學(xué),PCR技術(shù)的應(yīng)用,該方法首先被應(yīng)用于人-珠蛋白DNA的擴(kuò)增及鐮刀狀紅細(xì)胞貧血病的產(chǎn)前診斷 自1985年首次報(bào)道PCR方法以來,PCR被廣泛應(yīng)用于分子克隆、序列分析、基因突變、遺傳病、傳染病、性傳播性疾病、法醫(yī)鑒定和考古研究等多領(lǐng)域,并發(fā)揮著越來越大的作用
24、 九十年代中期PCR臨床應(yīng)用在國(guó)內(nèi)全面展開 1997年衛(wèi)生部下文禁止普通PCR在臨床診斷的應(yīng)用 1998年實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)開始在中國(guó)較廣泛的應(yīng)用于臨床檢測(cè),PCR技術(shù)的應(yīng)用舉例,* DNA重組:目的基因獲得和篩選 * 基因檢測(cè) 1)病原生物基因檢測(cè):感染性疾?。℉BV/HCV) 2)遺傳病的診斷:地中海貧血等 3)惡性腫瘤診斷:癌基因或抑癌基因突變、 耐藥基因表達(dá)水平、標(biāo)志物基因 4)性別基因鑒定 5)法醫(yī)學(xué)分析:個(gè)體識(shí)別、親緣鑒定,表 病原微生物檢測(cè)項(xiàng)目及方法,例如 癌基因或抑癌基因突變等 程序: PCR- 酶切-電泳 PCR-RFLP,正常,病人,PCR-RFLP,例如 基因鑒定,待測(cè)1
25、,待測(cè)2,Y引物,PCR 電泳,待2男性 待1女性,4 PCR特點(diǎn)及應(yīng)用,不足: 1)需靶DNA序列的信息 2)產(chǎn)物短小 3)錯(cuò)配,5 PCR技術(shù)簡(jiǎn)史,核酸體外擴(kuò)增的設(shè)想 聚合酶鏈反應(yīng)的發(fā)明,胡德(LE Hood)實(shí)驗(yàn)室的4大發(fā)明(ABI),蛋白質(zhì)測(cè)序儀:1977年(ABI) DNA合成儀:1982年(ABI) 1956年美國(guó)生物化學(xué)家科恩伯格與美國(guó)生化學(xué)家奧喬亞用人工合成的方法制得了DNA和RNA 1970年,印度血統(tǒng)的美籍學(xué)者科蘭納首次用化學(xué)方法人工合成了有77個(gè)核苷酸對(duì)的酵母丙氨酸的結(jié)構(gòu)基因 DNA測(cè)序儀:1986-06(ABI) 蛋白質(zhì)合成儀: 20世紀(jì)80年代(ABI) 1969年第
26、一臺(tái)自動(dòng)多肽合成儀問世 第一個(gè)產(chǎn)品是核糖核酸酶A(梅里菲爾德) 2003-05 第一臺(tái)中國(guó)自制多肽自動(dòng)合成儀投產(chǎn) (中國(guó)地奧基團(tuán)-胸腺五肽) ABI發(fā)明四大生物研究設(shè)備,并成功實(shí)現(xiàn)了產(chǎn)業(yè)化,為現(xiàn)在分子生物學(xué)的發(fā)展打下了堅(jiān)實(shí)的技術(shù)基礎(chǔ),對(duì)世界生命科學(xué)研究和產(chǎn)業(yè)發(fā)展產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。胡德現(xiàn)任CNSI董事、美國(guó)納斯達(dá)克上市公司董事,他還是美國(guó)國(guó)家科學(xué)院(NAS)院士、美國(guó)學(xué)者協(xié)會(huì)會(huì)員、美國(guó)科學(xué)藝術(shù)學(xué)院院士,5 PCR技術(shù)簡(jiǎn)史,核酸體外擴(kuò)增的設(shè)想 聚合酶鏈反應(yīng)的發(fā)明,由于Klenow酶不耐熱,在DNA模板進(jìn)行熱變性時(shí),會(huì)導(dǎo)致此酶鈍化,每加入一次酶只能完成一個(gè)擴(kuò)增反應(yīng)周期,給PCR技術(shù)操作程序添了不少困
27、難 這使得PCR技術(shù)在一段時(shí)間內(nèi)沒能引起生物醫(yī)學(xué)界的足夠重視,1988年才木(Saiki) 等從嗜熱水生桿菌(Thermus aquaticus) 中提取到一種耐熱DNA聚合酶,命名為Taq DNA聚合酶 其用于PCR時(shí),在熱變性后不會(huì)被鈍化,不必在每次擴(kuò)增反應(yīng)后再加新酶,大大提高了擴(kuò)增片段特異性和擴(kuò)增效率,也增加了擴(kuò)增長(zhǎng)度(2.0kb),Thermus aquaticus,A hot spring in Yellowstone National Park,此菌于1969年由Brock分離自美國(guó)黃石公園溫泉,作為棲熱桿菌的標(biāo)準(zhǔn)菌株,其生長(zhǎng)溫度為7075。最初從中分離到分子量6068KDa,比活
28、性為20008000U/mg的DNA聚合酶 后來,Cetus公司的Kary Mullis等又分離到比活為20萬U/mg的純酶,分子量為93910。此種9.4KDa酶的最適溫度為7580,與單純核苷酸的結(jié)合率(Kcat)可達(dá)150核苷酸(nt)/s酶分子。以M13模板,用富含G+C的30bp引物延伸,70時(shí)Kact60nt/s;55可達(dá)24nt/s;37時(shí)為1.5nt/s,而22時(shí)低至0.25nt/s。高于90時(shí)DNA合成活性甚差,這種高溫條件下,引物與模板已不能牢固結(jié)合,5 PCR技術(shù)簡(jiǎn)史,核酸體外擴(kuò)增的設(shè)想 聚合酶鏈反應(yīng)的發(fā)明,Kary B. Mullis(1944),PCR技術(shù)問世背后的故
29、事,在一個(gè)春天的夜晚,Mullis與女友駕車于美國(guó)加州西岸的128號(hào)公路途中有了PCR的靈感 Cetus公司以1萬$獎(jiǎng)勵(lì)他發(fā)展PCR,其后卻于1991年轉(zhuǎn)手將專利權(quán)以3億3千5百萬$轉(zhuǎn)賣給全球最大的制藥廠-瑞士offman-LaRoche公司,而使得PCR這個(gè)技術(shù)成為史上最貴的專利 瑞士這家公司現(xiàn)在正以連鎖反應(yīng)般的速率賺進(jìn)美金 此后,PCR的應(yīng)用一日千里,相關(guān)的論文發(fā)表量令其他研究難望其項(xiàng)背 PCR對(duì)于基礎(chǔ)及臨床醫(yī)學(xué)的貢獻(xiàn)之深遠(yuǎn),也難以估量,有時(shí)候一個(gè)創(chuàng)造性的靈感在你不經(jīng)意中突然浮現(xiàn)出來 在1983年4月的一個(gè)星期五的晚上 ,我和一個(gè)化學(xué)家朋友正在驅(qū)車去Mendocino縣的路上,她睡著了,美國(guó)10l國(guó)道也沒有駕車要求了。我喜歡晚上駕車,每個(gè)周末我都要去我北部的小木屋并在車上靜靜地呆上3個(gè)小時(shí),來放縱我的思維。那個(gè)特殊的晚上我正在想著我計(jì)劃中的DNA測(cè)序?qū)嶒?yàn)。車行
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