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1、第一節(jié)第一節(jié) 化能異養(yǎng)菌的產(chǎn)能代謝化能異養(yǎng)菌的產(chǎn)能代謝 6.1.1 代謝和代謝途徑 6.1.2 糖分解代謝途徑 6.1.3 發(fā)酵 6.1.4 三羧酸循環(huán) 6.1.5 呼吸 代謝(metabolism)是對(duì)細(xì)胞所進(jìn)行的各種生化反應(yīng)的總稱(chēng),代謝 是所有生理活動(dòng)的化學(xué)基礎(chǔ);營(yíng)養(yǎng)是代謝的物質(zhì)和能量源泉; 細(xì)胞內(nèi)各種生化反應(yīng)相互聯(lián)系,各種代謝物通過(guò)生化反應(yīng)相互轉(zhuǎn)換, 構(gòu)成了細(xì)胞的代謝網(wǎng)絡(luò); 代謝途徑(pathway):生理功能相關(guān)的若干個(gè)順序排列的生化反應(yīng) 構(gòu)成一條代謝途徑; 代謝途徑的反應(yīng)速率(代謝通量)受到嚴(yán)格調(diào)控; 6.1.1 代謝和代謝途徑 根據(jù)代謝途徑的反應(yīng)特點(diǎn)和生理功能特點(diǎn),細(xì)胞內(nèi)眾多的代謝

2、途徑可概 括的劃分為: 分解代謝(catabolism):以氧化分解反應(yīng)為特征,將大分子或復(fù) 雜分子氧化分解為簡(jiǎn)單小分子,同時(shí)釋放能量,為合成代謝提供前 體物和能量; 合成代謝 (anabolism):以還原合成反應(yīng)為特征,利用小分子前 體物,消耗能量,合成大分子或復(fù)雜分子; 代謝途徑的類(lèi)型 細(xì)胞通過(guò)分解代謝,將營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)轉(zhuǎn)化為小分子“碳架”、氨基供體、巰 基供體、磷酸等前體物;同時(shí)產(chǎn)生能量(ATP)和還原力(NADPH); 也產(chǎn)生代謝廢物; 細(xì)胞通過(guò)合成代謝,利用分解代謝提供的各種前體物,消耗ATP和 NADPH,合成各種細(xì)胞組分(大分子、復(fù)雜分子和小分子),以及進(jìn) 行各種其它生理活動(dòng)所需的代

3、謝產(chǎn)物; 代謝的結(jié)果表現(xiàn)為細(xì)胞營(yíng)養(yǎng)、生長(zhǎng)、發(fā)育、繁殖、衰老、凋亡等生命活 動(dòng)特征; 代謝的基本生理功能 生化反應(yīng)的類(lèi)型和特點(diǎn)生化反應(yīng)的類(lèi)型和特點(diǎn) l細(xì)胞有多少個(gè)酶,就有多少個(gè)生 化反應(yīng),但酶的類(lèi)型,及所催化的 生化反應(yīng)類(lèi)型是有限的; 細(xì)胞內(nèi)的化學(xué)反應(yīng)幾乎都是生化反應(yīng),反應(yīng)由專(zhuān)一性的酶催化,即酶 促化學(xué)反應(yīng); 酶催化可以降低反應(yīng)活化能,反應(yīng)條件溫和;酶與底物相結(jié)合催化反 應(yīng),具有催化專(zhuān)一性; 氧化還原反應(yīng)是一類(lèi)最重要的生化反應(yīng),反應(yīng)涉及電子得失和能量轉(zhuǎn)化; 失去電子為氧化,得到為電子還原;代謝物的氧化還原一般與電子載體 的氧化還原偶聯(lián); 氧化還原反應(yīng) l與細(xì)胞氧化還原反應(yīng)偶聯(lián)的電子 載體有: N

4、AD+/NADH NADP+/NADPH FAD+/FADH2 碳分解代謝(carbon catabolism):異養(yǎng)菌部分或徹底氧化分解有 機(jī)碳源,產(chǎn)生ATP、NAD(P)H、小分子碳架或CO2的分解代謝途徑; 主要由以下代謝途徑組成,它們構(gòu)成異養(yǎng)菌的中心碳代謝(central carbon metabolism): 糖的吸收 糖分解代謝途徑(糖酵解途徑) 三羧酸循環(huán) 溢流代謝途徑(發(fā)酵) 呼吸 6.1.2 糖分解代謝途徑 各種有機(jī)碳源都有各自的運(yùn) 輸系統(tǒng),但最終都進(jìn)入中心 碳代謝途徑進(jìn)行氧化分解; 碳分解代謝的簡(jiǎn)并性 l微生物能夠利用何種碳源,取決于 是否有相應(yīng)的運(yùn)輸系統(tǒng)和進(jìn)入中心 碳代謝

5、的分支代謝途徑; 糖分解代謝途徑:指氧化分解葡萄糖的代謝途徑: 糖酵解途徑:產(chǎn)能 磷酸戊糖途徑:不產(chǎn)能 糖酵解(glycolysis)途徑:將葡萄糖部分氧化分解為丙酮酸,同時(shí) 底物水平磷酸化產(chǎn)能的代謝途徑; 廣泛存在的糖酵解途徑是EMP,還有存在于少部分微生物中的ED途徑、 磷酸解酮酶途徑等;由于EMP途徑首先發(fā)現(xiàn),所以糖酵解途徑又特指 EMP; 糖分解代謝途徑 糖酵解途徑(EMP) 熟悉生化物質(zhì)的化 學(xué)結(jié)構(gòu) 熟悉生化反應(yīng)類(lèi)型 掌握代謝途徑 理解生理功能 分解葡萄糖: 葡萄糖+ATP 1-磷酸葡萄糖+ADP(葡萄糖激酶) 1-磷酸葡萄糖 6-磷酸葡萄糖(變位酶) 6-磷酸葡萄糖 6-磷酸果糖(

6、異構(gòu)酶) 6-磷酸果糖+ATP 1,6-二磷酸果糖+ADP(激酶) 1,6-二磷酸果糖3-磷酸甘油醛磷酸二羥丙酮 (醛縮酶) 磷酸二羥丙酮 3-磷酸甘油醛(異構(gòu)酶) EMP的生化反應(yīng)及生理目的(一) 氧化、釋放能量、產(chǎn)ATP: 3-磷酸甘油醛 +2Pi 1,3-二磷酸甘油酸+2e+2H NAD2e2H NADHH(磷酸甘油脫氫酶) 1,3-2p甘油酸+ADP+Pi3-磷酸甘油酸+ATP(激酶) 3-磷酸甘油酸 2-磷酸甘油酸(變位酶) 2-磷酸甘油酸磷酸烯醇式丙酮酸(烯醇化酶) PEP+ADP+Pi 丙酮酸+ATP(丙酮酸激酶) EMP的生化反應(yīng)及生理目的(二) 氧化反應(yīng)是重要的生化反應(yīng),化合

7、物在氧化過(guò)程中,釋放高能電子和 能量; 釋放的高能電子還原氧化型的電子載體,產(chǎn)生還原態(tài)的電子載體; 釋放的能量?jī)?chǔ)存在高能化學(xué)鍵(磷酸鍵)中,形成高能化合物中間體; 3-磷酸甘油醛 +2Pi 1,3-二磷酸甘油酸+4e+4H 2NAD4e4H 2NADH2H 氧化反應(yīng) 化合物在氧化分解過(guò)程中,形成的高能化合物中間體的高能鍵水解, 偶聯(lián)ADP磷酸化形成ATP,這種產(chǎn)生ATP的方式叫做底物水平磷酸化; 1,3-二磷酸甘油酸 3-磷酸甘油酸Pi 磷酸稀醇式丙酮酸 丙酮酸Pi ADPPi ATP 底物水平磷酸化 一分子葡萄糖經(jīng)EMP部分氧化分解,產(chǎn)生兩分子丙酮酸,兩分子 NADH ,凈產(chǎn)生兩分子ATP;

8、 Glc+2ADP+2Pi+2NAD+2Pyr+2ATP+2NADH+2H+ EMP氧化分解葡萄糖,底物水平磷酸化產(chǎn)生ATP,為細(xì)胞提供能量; 產(chǎn)生多種“C3”小分子碳架,提供合成代謝前體物; 產(chǎn)生NADH,可進(jìn)一步通過(guò)呼吸產(chǎn)生ATP;也可以轉(zhuǎn)化為還原力- NADPH; EMP的生理功能 存在于某些發(fā)酵單胞菌、假單胞菌、固氮菌等G-菌,以及極少數(shù)G+菌 中的糖酵解途徑; 在代謝途徑上,ED途徑與EMP的區(qū)別在于:先葡萄糖進(jìn)行氧化脫水, 然后再分解氧化產(chǎn)生丙酮酸; 在生理功能上,ED途徑與EMP區(qū)別在于:一分子葡萄糖經(jīng)ED途徑氧化 分解,產(chǎn)兩分子丙酮酸、一分子H2O、一分子NADPH和一分子NA

9、DH, 凈產(chǎn)一分子ATP; ED途徑兼有產(chǎn)NADPH(還原力)的生理功能; ED 途徑 ED 途徑 glc+ADP+Pi+2NAD(P)+ 2pyr+ATP+NADH+NADPH+H2O (KDPG特征性中間代謝物) 6-磷酸葡萄糖+NADP+ 6-P葡萄糖酸+NADPHH ( 6-磷酸葡萄糖脫氫酶) 6-P葡萄糖酸 2-酮-3-脫氧-6-磷酸葡萄糖酸H2O (6-磷酸葡萄糖酸脫水酶) 2-酮-3-脫氧-6-P葡萄糖酸 3-P甘油醛+丙酮酸 (2-酮-3-脫氧-6-磷酸葡萄糖酸醛縮酶) 3-磷酸甘油醛 丙酮酸+ATP+NADH ED途徑的生化反應(yīng)和生理功能特點(diǎn) 存在于某些嚴(yán)格厭氧或耐氧的乳酸細(xì)

10、菌中的一種糖酵解途徑;葡萄糖分 解方式與EMP不同; 磷酸解酮酶途徑可區(qū)分為兩種途徑: 己糖磷酸解酮酶途徑(HK):產(chǎn)生小分子碳架、ATP、 NADH 戊糖磷酸解酮酶途徑(PK):產(chǎn)生小分子碳架、ATP、NADH、 NADPH HK途徑先分解、重排、再分解氧化;PK途徑先部分氧化、異構(gòu)、再分 解氧化; 磷酸解酮酶途徑 HK途徑 6-磷酸果糖 4-磷酸赤蘚糖乙酰磷酸6-磷酸果糖 25-磷酸木酮糖 23-磷酸甘油醛2乙酰磷酸 碳架重排和異構(gòu) 2丙酮酸+2NADH+4ATP 磷酸解酮酶 磷酸解酮酶 乙酸+ATP 2乙酸+2ATP 轉(zhuǎn)酮酶、轉(zhuǎn)醛酶 2果糖 2丙酮酸3乙酸+5ATP+2NADH PK途徑

11、 6-磷酸葡萄糖 6-磷酸葡萄糖酸5-磷酸核酮糖 5-磷酸木酮糖 3-磷酸甘油醛 乙酰磷酸 丙酮酸+ATP+NADH 磷酸解酮酶 乙酸+ATP 葡萄糖丙酮酸乙酸+2ATP+NADPH+NADH+CO2 CO2+2NADPH 葡萄糖脫氫酶 葡萄糖酸脫氫酶 分解: (磷酸解酮酶) 6-磷酸果糖+Pi 4-磷酸赤蘚糖乙酰磷酸(HK) 5-磷酸木酮糖+Pi 3-P甘油醛乙酰-P 氧化:(葡萄糖脫氫酶;葡萄糖酸脫氫酶)(PK) 6-磷酸葡萄糖+NADP+6-P葡萄糖酸NADPHH 6-P葡萄糖酸+NADP+5-P核酮糖+NADPH+H+CO2 底物水平磷酸化:(乙酸激酶) 乙酰磷酸+ADP + Pi 乙

12、酸ATP HK和PK途徑的反應(yīng)特點(diǎn) 采用磷酸解酮酶催化分解酮糖的方式氧化分解葡萄糖,可以提高產(chǎn)能 效率: HK途徑分解一分子葡萄糖凈產(chǎn)生2.5個(gè)ATP,但只形成一分子 NADH; PK途徑先氧化,后酮解一分子葡萄糖凈產(chǎn)生2個(gè)ATP,同時(shí)產(chǎn)生一 個(gè)NADPH和NADH,產(chǎn)生一個(gè)CO2; HK和PK途徑存在只有底物水平磷酸化一種方式產(chǎn)能的專(zhuān)性厭氧或耐氧 菌中,盡量提高產(chǎn)能效率; HK和PK途徑的生理特點(diǎn) 碳架重排反應(yīng):丙糖、丁糖、戊糖、己糖和庚糖之間相互轉(zhuǎn)化的反應(yīng), 通過(guò)相互間轉(zhuǎn)移二羥丙酮基(轉(zhuǎn)酮)或羥乙醛基(轉(zhuǎn)醛),實(shí)現(xiàn)分子重 排; 轉(zhuǎn)酮反應(yīng):由轉(zhuǎn)二羥丙酮基酶(轉(zhuǎn)酮酶)催化: 4-P赤蘚糖 6-

13、P果糖 7-P景天庚酮糖3-P甘油醛 轉(zhuǎn)醛反應(yīng):由轉(zhuǎn)羥乙醛基酶(轉(zhuǎn)醛酶)催化: 7-P景天庚酮糖3-P甘油醛 5-P核糖5-P木酮糖 HK途徑的碳架重排反應(yīng) 碳架重排轉(zhuǎn)醛和轉(zhuǎn)酮反應(yīng) 轉(zhuǎn)酮酶 轉(zhuǎn)醛酶 磷酸戊糖途徑(HMP or PP):普遍存在的葡萄糖氧化分解途徑,主要 生理功能為產(chǎn)生NADPH和C3C7的小分子碳架,沒(méi)有底物水平磷酸化 產(chǎn)ATP功能; 氧化反應(yīng),將6-磷酸葡萄糖氧化分解為CO2和5-磷酸核酮糖 ,并產(chǎn) 生2個(gè)NADPH ; 非氧化還原的循環(huán)反應(yīng),將6個(gè) 5-磷酸核酮糖重排為5個(gè) 6-磷酸果糖; 總反應(yīng):Glc+12NADP+6H2O6CO2+12NADPH12H+ 磷酸戊糖途徑

14、 磷酸戊糖途徑的氧化反應(yīng)部分 與PK途徑的上半部反應(yīng)完全相同,目的是產(chǎn)生 NADPH; Glc-6-Pi +2NADP+H2OCO2 +2NADPH2H+Ru-Pi 2.6-磷酸葡萄糖脫氫酶 3.6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶 磷酸戊糖途徑的循環(huán)反應(yīng)部分 轉(zhuǎn)酮酶 轉(zhuǎn)醛酶 轉(zhuǎn)醛酶 65-P核酮糖 56-P果糖 56-P葡萄糖 代謝中間物為合成代謝提供 C3C7前體物 發(fā)酵(fermentation) :碳分解代謝的不完全氧化產(chǎn)物(丙酮酸、 NADH)轉(zhuǎn)化為末端發(fā)酵產(chǎn)物,并排出細(xì)胞的代謝途徑;也叫溢流代謝 (overflow metabolism) ; 發(fā)酵是中心碳代謝的一個(gè)組成部分,是在無(wú)氧條件下(不需

15、要氧)對(duì)糖 酵解的延續(xù)代謝,所以稱(chēng)為發(fā)酵,一般存在于厭氧菌和兼性厭氧菌中; 不同微生物的發(fā)酵代謝途徑不同,產(chǎn)生的末端發(fā)酵產(chǎn)物也不同,由此構(gòu) 成了各種發(fā)酵類(lèi)型; 6.1.3 發(fā)酵 發(fā)酵的生理功能 細(xì)胞通過(guò)發(fā)酵,使糖酵解途徑的產(chǎn)物-丙酮酸和NADH轉(zhuǎn)化為末端發(fā)酵 產(chǎn)物,并排出細(xì)胞: 避免丙酮酸在胞內(nèi)過(guò)量積累而產(chǎn)生毒害作用; 使NAD+ 再生,維持胞內(nèi)NAD+/NADH平衡; 發(fā)酵與糖酵解途徑共同構(gòu)成了完整的葡萄糖部分氧化分解代謝,在這一 過(guò)程中,實(shí)現(xiàn)了底物水平磷酸化產(chǎn)能(發(fā)酵產(chǎn)能)、產(chǎn)生碳架的生理功 能; 這一代謝不需要氧參與,為厭氧菌和兼性厭氧菌采用; 乙醇發(fā)酵 乙酸發(fā)酵 乳酸發(fā)酵 丙酸發(fā)酵 丁

16、醇發(fā)酵 所有發(fā)酵的生理功能完全相同,但代謝途徑和代謝產(chǎn)物各不相同,通常 以主要末端發(fā)酵產(chǎn)物命名發(fā)酵類(lèi)型; 發(fā)酵反應(yīng)必然包括還原反應(yīng),由NADH提供電子; 發(fā)酵的類(lèi)型 乙醇發(fā)酵:從丙酮酸到乙醇,兩步反應(yīng);丙酮酸脫羧生成乙醛和CO2, 消耗 NADH還原乙醛生成乙醇和NAD+再生,乙醇排出細(xì)胞; 乙醇發(fā)酵 總反應(yīng)式:葡萄糖2乙醇2CO22ATP 丙酮酸 乙醛 CO2 丙酮酸脫羧酶 乙醛NADH乙醇NAD 乙醇脫氫酶 釀酒酵母在無(wú)氧條件下,通過(guò)EMP分解葡萄糖產(chǎn)生丙酮酸、 NADH和 ATP; 然后經(jīng)乙醇發(fā)酵將丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙醛和CO2,排出細(xì)胞外;同時(shí)再生 NAD+; 利用上述代謝,使釀酒酵母在不需

17、要氧的條件下,完成分解葡萄糖,產(chǎn) 生碳架和ATP的生理功能;同時(shí)避免了不完全氧化的代謝中間物在胞內(nèi) 的積累,以及胞內(nèi)NAD+/NADH不平衡; 釀酒酵母的乙醇發(fā)酵 l運(yùn)動(dòng)發(fā)酵單孢菌(Zymomonas mobilis)為微好氧菌,在較低的氧分壓下 生長(zhǎng);經(jīng)ED途經(jīng)分解葡萄糖為丙酮酸、 NADPH、NADH和ATP; l由于缺氧,部分丙酮酸不能徹底氧化,只能進(jìn)入乙醇發(fā)酵途徑:經(jīng)脫羧反 應(yīng)和還原反應(yīng),消耗NADH,產(chǎn)生乙醇和CO2; 總反應(yīng)式:葡萄糖 2乙醇2CO2NADPHATP 運(yùn)動(dòng)發(fā)酵單胞菌的乙醇發(fā)酵 工業(yè)上利用釀酒酵母的EMP和乙醇發(fā)酵,或者利用運(yùn)動(dòng)發(fā)酵單孢菌的 ED途徑和乙醇發(fā)酵,以葡萄

18、糖為主要原料發(fā)酵生產(chǎn)乙醇:工業(yè)乙醇、 醫(yī)用酒精、食用酒精、各種酒類(lèi)、燃料乙醇(fuel ethanol); 發(fā)展方向:以來(lái)自農(nóng)產(chǎn)品廢棄物的纖維素和半纖維素為發(fā)酵原料,進(jìn) 行糖化和發(fā)酵過(guò)程相耦合的己糖和戊糖共代謝發(fā)酵;以降低乙醇發(fā)酵 成本,實(shí)現(xiàn)資源綜合利用; 乙醇發(fā)酵的工業(yè)應(yīng)用和發(fā)展方向 許多細(xì)菌具有乳酸發(fā)酵,特別是沒(méi)有徹底氧化有機(jī)物的代謝途徑的耐 氧菌,多采用乳酸發(fā)酵; 葡萄糖經(jīng)糖酵解途徑分解產(chǎn)生丙酮酸、 NADH和ATP;丙酮酸直接被 NADH還原為乳酸,排出細(xì)胞; 根據(jù)末端發(fā)酵產(chǎn)物的種類(lèi),乳酸發(fā)酵可分為同型和異型乳酸發(fā)酵; 乳酸發(fā)酵 丙酮酸 NADH乳酸NAD+ 乳酸脫氫酶 乳桿菌屬(La

19、ctobacillus)時(shí)典型的進(jìn)行同型乳酸發(fā)酵的菌屬;經(jīng) EMP分解葡萄糖產(chǎn)生丙酮酸、 NADH和ATP;丙酮酸經(jīng)乳酸發(fā)酵被轉(zhuǎn) 化為乳酸排出細(xì)胞,同時(shí)NAD+再生; 總反應(yīng):葡萄糖2乳酸2ATP 這種乳酸發(fā)酵由于末端發(fā)酵產(chǎn)物只有乳酸一種產(chǎn)物,稱(chēng)為同型乳酸發(fā) 酵(homofermentation) ; 同型乳酸發(fā)酵 兩歧雙歧桿菌(Bifidobacterium bifidum)是嚴(yán)格厭氧菌,沒(méi)有徹 底氧化有機(jī)物的代謝途徑; 經(jīng)HK途徑分解葡萄糖,產(chǎn)生丙酮酸、乙酸(乙醇)、NADH和ATP; 乙酸或乙醇被直接排出細(xì)胞;丙酮酸經(jīng)乳酸發(fā)酵轉(zhuǎn)化為乳酸排出細(xì)胞; 由于末端發(fā)酵產(chǎn)物除乳酸外還有乙酸或乙醇,

20、被稱(chēng)為異型乳酸發(fā)酵 (heterofermentation); 總反應(yīng):2葡萄糖2乳酸3乙酸5ATP 兩歧雙歧桿菌的異型乳酸發(fā)酵 腸膜狀明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)是兼性厭氧菌, 在無(wú)氧條件下經(jīng)PK途徑分解葡萄糖,產(chǎn)生丙酮酸、乙酸(乙醇)、 CO2、 NADPH、 NADH和ATP; 乙酸(乙醇)和 CO2直接排出細(xì)胞;丙酮酸經(jīng)乳酸發(fā)酵,消耗NADH, 被還原為乳酸排出細(xì)胞; 由于末端發(fā)酵產(chǎn)物除乳酸外,還有CO2、乙酸或乙醇,也為異型乳酸 發(fā)酵; 總反應(yīng):葡萄糖 乳酸+乙酸+2ATP+NADPH+CO2 腸膜狀明串珠菌的異型乳酸發(fā)酵 乙酰磷酸的代謝途徑 當(dāng)細(xì)胞

21、需ATP時(shí),乙酰磷酸水解產(chǎn)生ATP和乙酸; 當(dāng)細(xì)胞需要NAD時(shí),在磷酸轉(zhuǎn)乙?;复呋?(phosphotransacetylase),乙酰磷酸變成乙酰輔酶A,然后消耗兩 個(gè)NADH被還原為乙醇,同時(shí)NAD 再生; 乙酸CoA NADH 乙醛 HCoA NAD 乙酸磷酸HCoA乙酰CoAPi 乙醛NADH 乙醇 NAD 進(jìn)行乳酸發(fā)酵的大多是G菌,主要分布在厚壁菌門(mén)芽孢桿菌綱:芽孢 乳桿菌屬(Sporolactobacillus)、乳桿菌屬(Lactobacillus)、片 球菌屬(Pediococcus)、產(chǎn)乳酸球菌屬(Lactosphaera)、明串珠 菌屬(Leuconostoc)、乳球菌

22、屬(Lactococcus); 以及屬于放線菌門(mén)的雙歧桿菌目(Bifidobacteriales)的雙歧桿菌屬 (Bifidobacterium); 乳酸發(fā)酵的真核微生物:米根霉(Rhizopus oruzae); 乳酸發(fā)酵的主要微生物屬 能分解乳糖進(jìn)行乳酸發(fā)酵的厭氧菌、兼性厭氧菌或耐氧菌細(xì)菌都稱(chēng)為 乳酸細(xì)菌; 乳酸細(xì)菌應(yīng)用于乳品行業(yè),主要以牛乳為原料發(fā)酵生產(chǎn)酸奶、干酪、 酸性奶油、酸性酪乳; 乳酸發(fā)酵的微生物用于乳酸的工業(yè)發(fā)酵生產(chǎn),分為L(zhǎng)-乳酸發(fā)酵和D-乳 酸發(fā)酵; L-乳酸用于合成可降解高分子材料聚乳酸,以及生產(chǎn)有機(jī)容 積乳酸乙酯; D-乳酸是醫(yī)藥中間體; 乳酸細(xì)菌及應(yīng)用 腸桿菌科(Ent

23、erobacteriaceae)一類(lèi)兼性厭氧的G桿菌,多數(shù)種 中心碳代謝包括EMP和甲酸或產(chǎn)氣發(fā)酵; 甲酸發(fā)酵:丙酮酸裂解產(chǎn)生甲酸和乙酰輔酶A,甲酸為主要的末端發(fā)酵 產(chǎn)物,還有少量乙酸和乙醇; 如甲酸進(jìn)一步分解則產(chǎn)生 CO2 和H2,為產(chǎn)氣發(fā)酵; 甲酸裂解酶 丙酮酸HCoA乙酰CoA甲酸 CO2 H2 甲酸氫解酶 甲酸 甲酸發(fā)酵和產(chǎn)氣發(fā)酵 E. coli是腸桿菌科埃希氏菌屬(Escherichia)的模式種,是典型的兼 性厭氧的G桿菌; 在無(wú)氧條件下, E. coli 的中心碳代謝由EMP和混合酸發(fā)酵構(gòu)成,既 產(chǎn)酸又產(chǎn)氣,屬異型發(fā)酵; l混合酸發(fā)酵產(chǎn)物包括:乳酸、琥珀酸、 乙酸、甲酸、乙醇、C

24、O2和H2; 大腸桿菌的混合酸發(fā)酵 甲酸 CO2 H2(偏酸性環(huán)境) 大腸桿菌混合酸發(fā)酵反應(yīng)和酶 乙酰CoA 乙酰磷酸乙酸ATP 草酰乙酸3NADH蘋(píng)果酸延胡索酸琥珀酸3NAD 乙酰CoA 2NADH 乙醛乙醇2NAD 乳酸脫氫酶 丙酮酸NADH乳酸NAD 甲酸裂解酶 乙酰CoA甲酸丙酮酸HCoA 丙酮酸羧化酶 草酰乙酸丙酮酸CO2 腸桿菌科腸桿菌屬( Enterobacter )的典型種:產(chǎn)氣腸桿菌 (Enterobacter aerogenes),EMP糖酵解; 丁二醇發(fā)酵 l在無(wú)氧條件下進(jìn)行丁二醇發(fā)酵,末 端發(fā)酵產(chǎn)物除有少量乳酸、乙醇、 CO2和H2外,主要發(fā)酵產(chǎn)物為2,3-丁 二醇;

25、乙酰乳酸合成酶(acetolactate synthase)催化兩分子丙酮酸縮合 脫羧,生成乙酰乳酸; 乙酰乳酸脫羧酶(acetolactate decarboxylase)催化脫羧,生成 3-羥基丁酮(acetoin); 羥基丁酮還原酶(acetoin reductase)催化,消耗NADH還原3-羥 基丁酮為2,3-丁二醇; 腸桿菌屬細(xì)菌的丁二醇發(fā)酵反應(yīng) V.P.反應(yīng)是鑒定丁二醇發(fā)酵的試驗(yàn),出現(xiàn)紅色為陽(yáng)性反應(yīng),表示存在丁 二醇發(fā)酵; 原理:乙酰甲基甲醇在堿性條件下被氧化為二乙酰,二乙酰與精氨酸 的胍反應(yīng)產(chǎn)生紅色化合物; V.P.反應(yīng) 枯草芽孢桿菌的異型丁二醇發(fā)酵枯草芽孢桿菌的異型丁二醇發(fā)酵

26、 枯草芽孢桿菌異型丁二醇發(fā)酵,產(chǎn)物包括:乳酸、乙酸、2,3-丁二醇 和痕量的乙醇; 用枯草芽孢桿菌代替釀酒酵母進(jìn)行燃料乙醇生產(chǎn)是發(fā)展趨勢(shì)之一; 丙酮丁醇梭狀芽孢桿菌(Clostridium acetobutylicum)是厚壁菌 門(mén)梭菌科(Clostridaceae )梭菌屬的典型種,為低GC的G專(zhuān)性 厭氧產(chǎn)芽孢菌; 丙丁梭菌的中心碳代謝只有ED途徑和丙酮丁醇發(fā)酵途徑,缺乏三羧酸 循環(huán)和呼吸; 丙酮丁醇發(fā)酵:末端發(fā)酵產(chǎn)物主要為丙酮和丁醇,同時(shí)還有甲酸、乙 酸、乙醇、丁酸、CO2和H2; 丙酮丁醇發(fā)酵 丙丁梭菌的丙酮丁醇發(fā)酵途徑 丙酮酸 甲酸CO2(丙酮酸甲酸裂解酶) 丙酮酸 乙醛CO2 (丙酮

27、酸脫羧酶) 乙醛 乙醇(乙醇脫氫酶) 丙酮酸 乙酰CoACO2 (丙酮酸脫氫酶) 乙酰CoA 乙酰磷酸(磷酸轉(zhuǎn)乙酰基酶) 乙酰磷酸 乙酸(乙酸激酶) 乙酰CoA 乙醛(乙醛脫氫酶) 乙醛 乙醇(乙醇脫氫酶) 丙酮丁醇發(fā)酵反應(yīng)、酶和代謝產(chǎn)物(一) 2乙酰CoA 乙酰乙酰CoA (乙酰乙酰CoA 合酶) 乙酰乙酰CoA乙酰乙酸(乙酰乙酰CoA輔酶A轉(zhuǎn)移酶) 乙酰乙酸丙酮CO2(乙酰乙酸脫羧酶) 乙酰乙酰CoAb-羥丁酰CoA( b-羥丁酰CoA 脫氫酶) b-羥丁酰CoA 巴豆酰CoA( b-羥丁酰CoA 脫水酶) 巴豆酰CoA 丁酰CoA(巴豆酰CoA 脫氫酶) 丁酰CoA丁酰-P丁酸(丁酰磷酸

28、轉(zhuǎn)乙?;负图っ福?丁酰CoA 丁醛丁醇(丁醛脫氫酶和丁醇脫氫酶) 丙酮丁醇發(fā)酵反應(yīng)、酶和代謝產(chǎn)物(二) 用淀粉糖為原料,丙丁梭菌工業(yè)發(fā)酵生產(chǎn)丙酮丁醇在我國(guó)持續(xù)30年, 形成總?cè)軇┥a(chǎn)行業(yè);衰退近20年后,前年開(kāi)始復(fù)蘇,去年又衰退; 發(fā)酵生產(chǎn)丙酮丁醇的發(fā)展前景: 用纖維素降解糖,或半纖維素降解的戊糖代替淀粉水解糖為發(fā)酵原 料,發(fā)揮原料優(yōu)勢(shì); 可以提高發(fā)酵產(chǎn)物中丁醇的比例,生產(chǎn)燃料丁醇替代目前使用的燃 料乙醇; 丙酮丁醇發(fā)酵的工業(yè)應(yīng)用和發(fā)展前景 6.1.4 三羧酸循環(huán) l三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle,TCA循環(huán))是異養(yǎng)微生物徹底氧化 分解有機(jī)物,產(chǎn)生CO2、NAD

29、(P)H和FADH2的代謝途徑; 是糖酵解途徑的延續(xù),將不完全氧化的有機(jī)物(丙酮酸),徹底氧化 為CO2而釋放; 中間代謝物為合成代謝提供小分子碳架前體物; 有機(jī)物徹底氧化所釋放的高能電子,還原電子載體,產(chǎn)生NAD(P)H和 FADH2,為氧化磷酸化產(chǎn)生ATP提供前體物; 受體再生 氧化 受體結(jié)合 氧化 底物水平磷酸 化 異構(gòu) TCA循環(huán)的代謝途徑 丙酮酸脫氫酶 檸檬酸合成酶 順烏頭酸酶 異檸檬酸脫氫酶 a-酮戊二酸脫氫酶 琥珀酰輔酶A 合成酶 琥珀酸脫氫酶 延胡索酸酶 蘋(píng)果酸脫氫酶 氧化 氧化 水合 TCA循環(huán)的反應(yīng)特點(diǎn) l丙酮酸氧化脫羧生成乙酰CoA,然后進(jìn)入TCA循環(huán); l乙酰CoA與受

30、體草酰乙酸結(jié)合,生成檸檬酸; l檸檬酸異構(gòu)為異檸檬酸后,經(jīng)兩步氧化反應(yīng),脫掉兩個(gè)CO2,生成琥珀酰 CoA和兩個(gè)NAD(P)H ; l高能化合物琥珀酰CoA經(jīng)底物水平磷酸化,產(chǎn)生GTP和琥珀酸; l琥珀酸經(jīng)兩步氧化,一步水合反應(yīng),再生為T(mén)CA的受體草酰乙酸,同時(shí) 產(chǎn)生NAD(P)H 和FADH2; TCA循環(huán)的酶循環(huán)的酶 檸檬酸合成酶 順烏頭酸酶 異檸檬酸脫氫酶 a-酮戊二酸脫氫酶 琥珀酸輔酶A合成酶 琥珀酸脫氫酶 延胡索酸酶 蘋(píng)果酸脫氫酶 糖酵解途徑與TCA循環(huán)總反應(yīng) EMP:葡萄糖2丙酮酸+2NA DH+2ATP 2丙酮酸2乙酰CoA+2CO2+ 2NADH TCA循環(huán):2乙酰CoA 4C

31、O2 +6NAD(P)H+2FADH2 l總反應(yīng)式: Glc10NA(P)D+2FAD 4ADP4Pi 6CO210NAD(P)H2FADH24ATP 呼吸(respiration):氧化NAD(P)H和FADH2 ,將高能電子的能量 轉(zhuǎn)化為ATP的產(chǎn)能代謝途徑; 氧化NAD(P)H和FADH2,再生NAD(P)+和FAD2+; 高能電子沿呼吸鏈傳遞,還原最終電子受體,形成呼吸產(chǎn)物; 高能電子在傳遞過(guò)程中,其能量轉(zhuǎn)化為質(zhì)子動(dòng)力勢(shì)(PMF); 質(zhì)子動(dòng)力勢(shì)驅(qū)動(dòng)ATP合成酶,氧化磷酸化合成ATP; 6.1.5 呼吸 呼吸鏈(電子傳遞鏈):是細(xì)胞進(jìn)行呼吸的酶系統(tǒng),由一系列具有氧 化還原功能的電子載體蛋

32、白,順序排列在生物膜上構(gòu)成; 呼吸鏈的一般組成: NADH脫氫酶復(fù)合物輔酶Q 細(xì)胞色素bc1復(fù)合物 細(xì)胞色素 c 細(xì)胞色素aa3(末端氧化酶復(fù)合物 ) 原核細(xì)胞的呼吸鏈位于細(xì)胞膜上,真核微生物的呼吸鏈存在于線粒體 的內(nèi)膜上; 呼吸鏈 電子載體蛋白按照還原電位由高到低順序排列; NADH脫氫酶復(fù)合物的電子載體為FMN、FeS;輔酶Q是具類(lèi)異戊二 烯尾的苯醌衍生物;cytbc1的電子載體有血紅素(heme )和FeS ; 其它c(diǎn)yt的電子載體都是血紅素; 電子載體蛋白及電子載體 NAD(P)H脫氫酶復(fù)合物催化氧化反應(yīng); NAD(P)H + H+ + FMN+NAD(P) + FMNH2 FMNH2

33、(FADH2)+ 2Fe3+S FMN+(FAD2+)+2Fe2+S+2H+ 呼吸的反應(yīng)過(guò)程N(yùn)AD(P)H和FADH2的氧化 實(shí)現(xiàn)NAD(P)和FAD2+再生 呼吸的反應(yīng)過(guò)程呼吸的反應(yīng)過(guò)程電子傳遞電子傳遞 NAD(P)H和FADH2氧化釋放的高能電子經(jīng)呼吸鏈傳遞給最終(末端) 電子受體: NAD(P)H脫氫酶復(fù)合物催化輔酶Q 還原: 2Fe2+S + CoQ + 2H+ 2Fe3+S + CoQH2 cytb催化輔酶Q氧化,自身被還原; cytc1催化cytb氧化,自身被還原; cytc催化cytc1 氧化,自身被還原; cytaa3催化cytc氧化和末端電子受體還原,并形成呼吸產(chǎn)物; FeS

34、只接受電子被還原,2H+則被排到膜外;輔酶Q被FeS還原時(shí),再?gòu)?基質(zhì)中吸收2H+; cytb只接受電子, 2H+被排到膜外; cytc1在從基質(zhì)中吸收2H+,還原cytc時(shí), 2H+再被排出; 呼吸的反應(yīng)過(guò)程呼吸的反應(yīng)過(guò)程質(zhì)子外排質(zhì)子外排 高能電子沿呼吸鏈傳遞過(guò)程中,在三個(gè)位點(diǎn)有三對(duì)H+被排到膜外,形 成膜內(nèi)外H+濃度差這種電勢(shì)能,即質(zhì)子動(dòng)力勢(shì)(PMF); 高能電子在經(jīng)呼吸鏈傳遞過(guò)程中,電子能量逐步降低并轉(zhuǎn)化為質(zhì)子動(dòng)力 勢(shì); 呼吸的反應(yīng)過(guò)程質(zhì)子動(dòng)力勢(shì)建立 氧化磷酸化(電子傳遞水平磷酸化):由質(zhì)子動(dòng)力勢(shì)推動(dòng)膜上的ATP合 成酶,使ADP磷酸化形成ATP; 通過(guò)呼吸(電子傳遞),高能電子的能量轉(zhuǎn)

35、化為PMF;通過(guò)氧化磷酸 化,PMF的勢(shì)能轉(zhuǎn)化為ATP的化學(xué)鍵能; 2H+跨膜運(yùn)輸,驅(qū)動(dòng)F1-F0ATP酶形成一個(gè)ATP; 氧化磷酸化 F1-F0ATP合成酶 氧化磷酸化由F1-F0ATP合成酶催化; F1-F0ATP合成酶由多個(gè)蛋白亞基構(gòu)成, 其中F0位于膜上,F(xiàn)1位于膜內(nèi);中間 有質(zhì)子通道; 當(dāng)質(zhì)子流穿過(guò)質(zhì)子通道時(shí),引起ATP 酶構(gòu)象改變,使ADP磷酸化形成ATP; 有氧呼吸:分子氧作為呼吸的最終電子受體(terminal electron acceptor),在細(xì)胞色素aa3的催化下,接受電子被還原,形成呼吸 產(chǎn)物水的呼吸過(guò)程; NAD(P)H(FADH2) NAD(P)+(FAD2+)

36、+2H+2e O2 2H+ 2e H2O 呼吸的末端反應(yīng)有氧呼吸 l進(jìn)行有氧呼吸的微生物為好氧 微生物; 無(wú)氧呼吸:用除O2以外的其它氧化態(tài)無(wú)機(jī)或有機(jī)物作為呼吸的最終電子 受體,在末端氧化酶催化下被還原,形成呼吸產(chǎn)物的呼吸過(guò)程; 無(wú)氧呼吸存在于某些兼性厭氧或?qū)P詤捬跷⑸镏校鶕?jù)呼吸的末端反 應(yīng)不同,可分為許多類(lèi)型: 硝酸鹽呼吸、亞硝酸鹽呼吸; 硫酸鹽呼吸、硫呼吸; 二氧化碳呼吸、延胡索酸呼吸; 鐵呼吸、錳呼吸; 呼吸的末端反應(yīng)無(wú)氧呼吸 葡萄糖經(jīng)糖酵解途徑和TCA循環(huán)被徹底氧化為CO2,并釋放出大量高能 電子而形成NAD(P)H或FADH2; 通過(guò)呼吸將NAD(P)H或FADH2重新氧化,使N

37、AD(P)+和FAD2+再生, 維持胞內(nèi)NAD(P)+/ NAD(P)H和FAD2+/ FADH2平衡;并通過(guò)氧化磷 酸化,高效率產(chǎn)生ATP: 由于大量NAD(P)H或FADH2來(lái)自于TCA循環(huán),所以呼吸和TCA循環(huán)不 可分割;當(dāng)無(wú)最終電子受體時(shí),呼吸停止,TCA也停止,減少NADH 的生成;然后開(kāi)通溢流代謝,實(shí)現(xiàn)NAD+的再生,同時(shí)降低產(chǎn)能效率; 呼吸與中心碳分解代謝的關(guān)系 一對(duì)電子從NADH沿呼吸鏈傳遞到O2,共排出32H+,可以形成三個(gè) ATP,即消耗一個(gè)氧原子,形成三個(gè)高能磷酸鍵(P/O3); 一對(duì)電子從FADH2傳遞到O2,排出22H+,可以形成兩個(gè)ATP(P/O 2); 有氧呼吸的

38、產(chǎn)能效率P/O 氧化磷酸化: EMP:2NADH 6 ATP 2丙酮酸2乙酰CoA:2NADH 6 ATP TCA循環(huán):6NADH18 ATP 2FADH24 ATP 底物水平磷酸化; EMP: 2 ATP; TCA循環(huán):2ATP 總計(jì):1分子葡萄糖34ATP4ATP38ATP 葡萄糖有氧呼吸產(chǎn)能的效率 E. coli的硝酸鹽呼吸 E. coli是兼性厭氧菌,有氧時(shí),有氧呼 吸; 無(wú)氧而有硝酸鹽時(shí),硝酸鹽呼吸;末端 氧化酶為硝酸鹽還原酶,最終電子受體 為硝酸,呼吸產(chǎn)物為亞硝酸; 無(wú)氧而無(wú)硝酸鹽時(shí),只進(jìn)行混合酸發(fā)酵; B. subtilis為好氧菌,兼性無(wú)氧呼吸,硝酸鹽和亞硝酸鹽呼吸,呼吸產(chǎn) 物

39、為氨,稱(chēng)氨化作用(ammonification); B. licheniformis也進(jìn)行硝酸鹽呼吸,呼吸產(chǎn)物為氮;稱(chēng)為脫氮作用 (denitrification); 硝酸鹽作為呼吸的電子受體而被還原的反應(yīng),也稱(chēng)為異化型硝酸鹽還原 反應(yīng)或者反硝化作用: 反硝化作用降低土壤肥力,用于污水處理; Bacillus. sp.的硝酸鹽呼吸 硫酸鹽呼吸:以硫酸鹽、亞硫酸鹽、硫代硫酸鹽等氧化態(tài)含硫無(wú)機(jī)物作 為呼吸的最終電子受體,呼吸產(chǎn)物為硫化氫的無(wú)氧呼吸,也稱(chēng)為異化型 硫酸鹽還原反應(yīng); 進(jìn)行硫酸鹽呼吸呼吸的細(xì)菌,統(tǒng)稱(chēng)為硫酸鹽還原菌(sulfate- reducing bacteria,SRB),也屬于脫硫

40、菌; 硫酸鹽還原菌是造成腐敗水體、物品惡臭的原因之一;可用于廢水處理, 去除水中的硫酸; 硫酸鹽呼吸: SO42- SO32-;S2O32- ;S;H2S; 硫呼吸: S H2S 硫酸鹽呼吸 多數(shù)硫酸鹽呼吸菌屬于變形菌門(mén) -d變形菌綱: 脫硫菌屬(Desulfurella) 脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)脫硫單胞 菌屬(Desulfomonas)脫硫桿菌屬(Desulfobacter)脫硫球菌屬 (Desulfococcus) 脫硫八疊球菌屬(Desulfosarcina) 脫硫小桿 菌屬(Desulfotalea) 厚壁菌門(mén)-梭菌目-消化球菌科(Peptococcaceae): 脫

41、硫腸狀菌屬(Desulfotomaculum)、脫硫芽孢彎曲菌屬 (Desulfosporosinus) 硫酸鹽還原菌的主要屬 進(jìn)行延胡索酸呼吸的細(xì)菌大多生活在牛的瘤胃中,呼吸產(chǎn)物主要為琥珀 酸;延胡索酸琥珀酸 在分類(lèi)系統(tǒng)中屬于d變形菌綱的琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae) 琥珀酸弧菌屬(Succinivibrio) 厭氧螺菌屬(Anaerobiospirillum) 瘤胃桿菌屬(Ruminobacter) 琥珀酸單胞菌屬(Succinimonas) 延胡索酸呼吸的細(xì)菌屬 所有產(chǎn)甲烷細(xì)菌進(jìn)行CO2或碳酸鹽呼吸,還原產(chǎn)物為甲烷(沼氣發(fā)酵) 或乙酸;CO2CH4 產(chǎn)甲烷細(xì)菌都屬于古生菌,在分類(lèi)系統(tǒng)中歸為廣古生菌門(mén) (Euryarchaeota phy. nov.) 甲烷桿菌綱(Methanobacteria class. nov.) 甲烷球菌綱(Methanococci class. nov.) 甲烷嗜高熱菌綱(Methanopyri class. nov.) 產(chǎn)甲烷菌的CO2呼吸 鐵還原菌以三價(jià)鐵作為呼吸的最終電子受體,呼吸產(chǎn)物為二價(jià)鐵;假 單胞菌和芽孢桿菌等很多細(xì)菌進(jìn)行兼性鐵呼吸菌; 專(zhuān)性鐵呼吸菌有鐵還原桿菌門(mén)(Deferribacteres)以及d變形菌綱的 鐵還原單胞菌屬(Ferrimomas); 專(zhuān)性鐵還原細(xì)菌還能以高價(jià)錳作為電

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