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文檔簡(jiǎn)介

1、第一部分開關(guān)機(jī)A A、開機(jī)1打開UPS電源,打開氮?dú)獍l(fā)生器(氣瓶),確認(rèn)Curtain gas的輸入壓力為0.4MPa, gas1/2為 0.7MPa,exhuast為 0.4MPa。2. 打開機(jī)械泵電源開關(guān)(5500系列直接打開質(zhì)譜主機(jī)電源,儀器自動(dòng)啟動(dòng)機(jī)械泵)3. 等機(jī)械泵工作至少30min5. 打開質(zhì)譜主機(jī)電源開關(guān)6. 過夜抽真空B B、關(guān)機(jī)1停止輸液:關(guān)停針泵或液相泵,或斷開輸液管線(一般質(zhì)譜主機(jī)Sta ndby后液相系統(tǒng)也自動(dòng)待機(jī),輸液泵自動(dòng)關(guān)停,但建議操作人員再次確認(rèn),必須保證沒有任何 液體再泵入質(zhì)譜)2使儀器待機(jī),并滅活配置2關(guān)閉質(zhì)譜儀主機(jī)電源開關(guān)(5500系列只需按下電源開關(guān)旁

2、的VENT按鍵排放 真空)3機(jī)械泵繼續(xù)工作至少30min4關(guān)閉機(jī)械泵上的電源開關(guān)(5500系列會(huì)自動(dòng)關(guān)停機(jī)械泵,待機(jī)械泵停止后即可 關(guān)閉5500系列主機(jī)上的電源開關(guān))5關(guān)閉氣體發(fā)生器或氣瓶第二部分調(diào)諧1、PPG就是正離子校正液,PPG3000負(fù)離子調(diào)諧液,本臺(tái)儀器只用兩瓶校正液,正離 子一瓶,負(fù)離子一瓶。洗液一瓶50%的甲醇水。調(diào)諧前先用洗液洗針兩次。吸校正液的時(shí)候慢慢吸,避免吸入氣泡,吸好以后將針泵卡住。再將高度調(diào)到5,將管路重新連接。不再連接六通閥,由質(zhì)譜直接進(jìn)樣,且將針泵的速度調(diào)到10卩L/ml。2、 調(diào)諧液弄好后在儀器面板工具欄上:TOOIt項(xiàng)目t創(chuàng)建項(xiàng)目。此項(xiàng)目為一個(gè)文件夾,文件夾里

3、面包括所有此次采集的信息,方法、序列等,且所有采集的項(xiàng)目都固定在一個(gè)文件夾下面:D:/Analyst Data/Project。新建項(xiàng)目的時(shí)候,彈出窗口中有個(gè)Add All,可以創(chuàng)建孫文件夾。3、 聯(lián)機(jī):軟件打開后在左上方硬件配置(單機(jī)選中,雙擊打開)t只需選中儀器MA active profi le。圖標(biāo)變?yōu)榫G色,表示聯(lián)機(jī)成功。調(diào)諧只需要選中質(zhì)譜。儀器的實(shí)時(shí)狀態(tài) 可以點(diǎn)擊右下方的圖標(biāo),質(zhì)譜和液相都是單獨(dú)觀察,質(zhì)譜要注意真空度,為0.5.4、 調(diào)諧t手動(dòng)調(diào)諧t項(xiàng)目(文件夾)選中下拉菜單中的(為系統(tǒng)默認(rèn)的調(diào)諧文件夾), 先start syring pump (打開針泵)tstart (質(zhì)譜),開

4、始采集以后觀察基線是否平衡,若 等兩分鐘還未平衡好,則手動(dòng)將針泵往上抬。5、 平衡好后(基線平穩(wěn)則為平衡好),重新進(jìn)樣,重新點(diǎn)擊start syring pump o Resolution (分辨率)tadvaneed (高級(jí)選項(xiàng))(看到結(jié)果后調(diào)節(jié)質(zhì)量軸和分辨率做準(zhǔn)備,只能先打開這個(gè),再打開譜圖)t實(shí)時(shí)質(zhì)譜圖右鍵 topen file 極便點(diǎn)一個(gè)框t軟件上方的從譜圖校正t PPGPOS(正離子)t start岀現(xiàn)三行:(1、質(zhì)量軸。2、分辨率。3、兩次調(diào)諧的差異)t若質(zhì)量軸有差異 t右上角 tyesT若分辨率飛離出虛線 toffset (偏大調(diào)大,偏小調(diào)?。┹?入校正的數(shù)值,再重新進(jìn)樣,如此反

5、復(fù),直到點(diǎn)落在虛線以內(nèi),實(shí)線代表最合適。6、 校正好后儀器會(huì)自動(dòng)保存,直接關(guān)掉窗口即可。負(fù)離子調(diào)諧和正離子調(diào)諧步驟一樣,只是在選擇方法的時(shí)候要注意選擇負(fù)離子模式。還有看結(jié)果時(shí)要選擇PPG3000.此為負(fù)離子調(diào)諧液。調(diào)諧因針泵流速很小,10卩L/ml,所以不需要設(shè)定離子源溫度及輔助氣,直接設(shè)定噴霧器流速為50,就可以將樣品霧化,氣簾氣也不需要設(shè)置,因?yàn)闆]有多余的溶劑需要吹走。第三部分:方法優(yōu)化1. 在 Analyst 軟件 Tools 菜單中選擇 Project t Create Project在 Project name項(xiàng)下 輸入新建的Project名稱。注意,不要點(diǎn)選窗口中的其他按鈕!點(diǎn)擊

6、0K,確認(rèn)新 建 Project。2. 在Analyst軟件界面下,雙擊導(dǎo)航欄內(nèi) Hardware Configuration。在彈出窗口中 選擇MassO nl y,點(diǎn)擊Activate Profile,激活Mass On ly (只聯(lián)接質(zhì)譜主機(jī))。3. 在導(dǎo)航欄內(nèi)單擊Tune and Calibrate進(jìn)入調(diào)諧模式。點(diǎn)擊上方工具條中的T鈕。 此時(shí),應(yīng)注意到主機(jī)有 “撲”聲音,表明進(jìn)入調(diào)諧狀態(tài)。此時(shí)右下角質(zhì)譜狀態(tài)顯示 綠色。雙擊Manual Tuning,進(jìn)入質(zhì)譜參數(shù)設(shè)置及運(yùn)行窗口。4. 使用 1mL 玻璃進(jìn)樣針吸取適當(dāng)標(biāo)準(zhǔn)溶液,置于進(jìn)樣針座上。點(diǎn)擊 MS Method 下拉菜單,選擇 Sy

7、ringe Pump Method,設(shè)定針泵流速 Flow Rate為10卩L/mirt5. 點(diǎn)擊Start Syringe Pump按鈕開針泵進(jìn)樣。6. 返回MS Method,選擇掃描模式 Scan Type為Q1 MS,設(shè)定掃描速度Scan Rate 為10Da/s,設(shè)定掃描范圍StartStop設(shè)定為50化合物分子量。DP預(yù)輸入 60。7. 點(diǎn)擊start開始采集數(shù)據(jù)。運(yùn)行穩(wěn)定后,注意觀察是否有預(yù)期的母離子出現(xiàn),并 控制其響應(yīng)值在約E4以下。點(diǎn)擊stop,選擇第一個(gè)峰(后面是同位素峰)的平 穩(wěn)段,雙擊,選中母離子。點(diǎn)擊右鍵,選擇 Delete Pane。8. 設(shè)定Scan type為產(chǎn)

8、物離子掃描 Product Ion (Ms2),掃描速度200Da/s,選擇掃描正/負(fù)離子,輸入母離子(product of),設(shè)定掃描范圍startstop為50MW+20,覆蓋可能的子離子質(zhì)量范圍,點(diǎn)擊 compoud標(biāo)簽,設(shè)定(DP) 60,( CE) 5。9. 點(diǎn)擊start,開始采集數(shù)據(jù),注意觀察是否有預(yù)期的母離子出現(xiàn)。手動(dòng)調(diào)節(jié)CE, 以 5eV 為步長(zhǎng),逐漸增加。每次增加后稍作等待,直至目標(biāo)化合物的子離子清 晰看見。選擇平穩(wěn)的一段,雙擊,選擇子離子。10. 選擇Scan Type為MRM。設(shè)定參數(shù)表格中的Q1對(duì)應(yīng)的母離子,Q3對(duì)應(yīng)的子 離子,time (ms)為50, ID值設(shè)為

9、名稱1 (定量),名稱2 (定性)。11點(diǎn)擊 Edit Ramp,在 Parameter下選擇 Collision Energy,點(diǎn)擊 OK。點(diǎn)擊 start 開始采集數(shù)據(jù),記錄每個(gè) MRM 通道的最佳 CE 電壓。在 MRM 參數(shù)設(shè)定表中, 右鍵點(diǎn)擊。選擇 Collision Energy CE,調(diào)出表格中的CE列,輸入每個(gè) MRM通 道的最佳CE電壓值,精確到個(gè)位數(shù)。重復(fù)以上步驟,在Parameter項(xiàng)下選擇Declustering Potential,優(yōu)化并保存DP。完成后選擇菜單File/Save保存采樣方法, 文件名 .dam。第四部分:方法建立一、LCMS方法的建立:1、連接儀器:

10、打開HPLC質(zhì)譜電源,將HPLC系統(tǒng)接上柱子,將6號(hào)出口管線與離子源連好。調(diào)離子源噴霧針位置到2mm處,雙擊HardwareCon figure,在硬件配置菜單下單擊LCMS (液相與質(zhì)譜聯(lián)用),單擊Activate profile激活儀器,會(huì)聽到笛的一聲,說明儀器已經(jīng)連接上。2、 確認(rèn)液質(zhì)同步:選擇項(xiàng)目(之前優(yōu)化方法的時(shí)候已經(jīng)建立的項(xiàng)目);雙擊 Build acquisition method新建方法,彈出新建方法模板。在模板左側(cè)點(diǎn)擊 acquisition method, 模板右邊顯示對(duì)應(yīng)的參數(shù),確認(rèn) synchronization mode選擇 LC Sync,表示液質(zhì)同步。3、 設(shè)置M

11、RM參數(shù):點(diǎn)擊方法模板左側(cè)的 MRM ,在模板右側(cè)Scan Type 下選擇 MRM ; 在 polarity下選擇化合物極性:Positive(正離子)、Negative (負(fù) 離子);Duration為15min (與液相分離相同的時(shí)間);表格中Q1:母離子分子量, Q3(Da):子離子分子量,Time( msec): 50,ID欄:化合物名稱(離子對(duì)名稱 后空格加1為定量,空格加2為定性),在表格中右鍵分別單擊 DP、CE,點(diǎn)擊 工具欄的OPEN打開之前優(yōu)化的方法參數(shù),調(diào)出DP,CE值,選中整行,Ctrl+c (復(fù) 制)參數(shù),關(guān)閉窗口,再Ctrl+v (粘貼)參數(shù));最后點(diǎn)擊Edit p

12、arameter設(shè)置離子 源參數(shù):Source/Gas項(xiàng)用以下推薦值:CUR 35 , IS:5500(正離子)或-4500 (負(fù)離 子),TEM 600,GS1 60,GS2 70,點(diǎn)擊 OK。4、設(shè)置液相參數(shù):點(diǎn)擊模板左邊的shimadzu LC system,在右邊的pumps 欄下,設(shè)置stop time (運(yùn)行時(shí)間)為15min, flow流速為1mL/min,A為水 相設(shè)為95%, B為有機(jī)相設(shè)為5% (設(shè)置時(shí)改B,A自動(dòng)),泵最大壓力為50; 點(diǎn)擊time program設(shè)置液相梯度:例咪唑類梯度設(shè)置:Time(mi n)AB95%5%55%95%105%95%10.195%5%

13、1595%5%接著在右邊的Auto sampler欄下,設(shè)置清洗時(shí)間,在Rinse mode下選擇Before and after (前后都洗),并設(shè)置清洗時(shí)間為5s,清洗液用50%甲醇水。最后點(diǎn)擊保 存按鈕,在保存窗口輸入該方法的名稱。二、建立批處理:1、雙擊Build acquisition batch,在右邊窗口 set欄為批處理保存的文件夾 命名以便識(shí)別,再點(diǎn)擊add set,最后點(diǎn)擊add sample,再選擇之前建立的LC-MS 方法,在彈出的窗口內(nèi)的number(進(jìn)樣樣品數(shù))處填入需要進(jìn)樣的 樣品個(gè)數(shù), 點(diǎn)擊OK。2、在加入的樣品列表內(nèi)依次填寫 sample name (樣品名稱

14、)、via position (樣 品瓶的位置)、inj.volunme (進(jìn)樣體積:一般5微升或10微升)。3、在submit項(xiàng)下點(diǎn)擊submit按鈕以提交樣品序列。4、點(diǎn)擊工具條上左上角的view queue按鈕,可查看已提交的樣品。此時(shí)將儀器從校正狀態(tài)退出,進(jìn)入分析模式。確認(rèn)泵已打開,首次進(jìn)樣液相 先排氣,再平衡儀器:先點(diǎn)擊工具條上的equilibrate平衡按鈕,在彈出的平衡 窗口中輸入平衡時(shí)間10min,點(diǎn)擊ok。右下角圖標(biāo)會(huì)變黃,待平衡結(jié)束后此處 圖標(biāo)會(huì)變成綠色,此時(shí)即可點(diǎn)擊start sample按鈕采集樣品信息,儀器會(huì)自動(dòng)對(duì) 已提交的全部樣品進(jìn)行采集。第五部分?jǐn)?shù)據(jù)處理1. 雙擊

15、打開Multiquilt,選擇項(xiàng)目,點(diǎn)擊File下的熒光棒型圖標(biāo),點(diǎn)擊 sample, 選擇需要的標(biāo)準(zhǔn)品和樣品數(shù)據(jù),點(diǎn)擊 next,create new method為方法命名, 點(diǎn)擊next,選擇一個(gè)有代表性的樣品(一般選擇濃度較大的標(biāo)品數(shù)據(jù)),設(shè)置 分組(同一物質(zhì)定量離子和定性離子設(shè)置為一組),并指定內(nèi)標(biāo),n ext,對(duì)每 個(gè)物質(zhì)進(jìn)行積分。2. 設(shè)置積分參數(shù):a、 Causian Smoth (平滑):一般是0,如有毛刺可改成1或2;b、Expeceted Time (保留時(shí)間):一般不動(dòng)c、Expected time范圍:一般30s,表示在保留時(shí)間 5s范圍d、最小峰寬e、最小峰高f、背

16、景噪音扣除: 可調(diào)整目標(biāo)峰基線以下被積分的面積, 比例越高積分越往 下,必要時(shí)調(diào)整。g、分峰因子 :峰有分叉時(shí)設(shè)置,如有兩個(gè)分叉,設(shè)置為 2,峰分叉不能大 于2h、單位:設(shè)置單位,勾選 Apply units to all 可將此單位用于所有化合物 點(diǎn)擊next,點(diǎn)擊finish。在新跳出窗口內(nèi)將標(biāo)準(zhǔn)品選定,輸入濃度。查看各化合 物積分是否正常,點(diǎn)擊第三個(gè)圖標(biāo)查看標(biāo)準(zhǔn)曲線。報(bào)告打?。狐c(diǎn)擊 File,create report Report template (選擇報(bào)告模板,一般用 samplel 和標(biāo)線,內(nèi)標(biāo)報(bào)告只能用sample1,2,3),命名,選擇存儲(chǔ)報(bào)告位置,點(diǎn) ok。信噪比:選擇項(xiàng)目

17、,雙擊open date file,點(diǎn)擊sample,選擇低濃度樣品,點(diǎn)擊 ok,點(diǎn)擊 XIC,選擇定量離子,點(diǎn)擊ok,選中峰,按住shift,選峰附近的一段時(shí)間,點(diǎn) Script,點(diǎn)擊S-To NScript,即可得到結(jié)果。第六部分: LC-MS 離子阱原理及其應(yīng)用原理:在進(jìn)行多級(jí)質(zhì)譜分析(MS-MS)時(shí),首先限定目標(biāo)質(zhì)量的離子。通過調(diào)整交 變電壓,將大于以及小于目標(biāo)質(zhì)量的離子射出, 從而使得僅有一個(gè)質(zhì)量的離子存 在于離子阱中并將其富集。目標(biāo)質(zhì)量的范圍被稱為Isolation Width。之后通過向離子阱內(nèi)注入氣體(通常為氦氣或氮?dú)猓?,與離子發(fā)生碰撞使其被打成碎片。 操作方法:首先在 An

18、alyst 中打開一個(gè)成熟的 MRM 采樣方法,然后右鍵單擊Acquisition Method 中的 MRM,在彈出菜單中選擇 Add IDA Criteria Level。在新增的 IDA-First Level Criteria 頁面中設(shè)置相關(guān)邏輯選項(xiàng)(其中四項(xiàng)尤為重要)1)Select“ X” to “ Y” most in tense表示k多個(gè)組分色譜共流出時(shí),指定觸發(fā)最強(qiáng)的若干個(gè)母離子, “1 to 2表”示最強(qiáng)和次強(qiáng)的兩個(gè)母離子, “1 to 3 表”示最強(qiáng)和次強(qiáng)和第三位三個(gè)母離子,以此類推。請(qǐng)注意,如果 選擇了 “ 1 to 2或“ 1 to 3,則后續(xù)的EPI個(gè)數(shù)應(yīng)調(diào)整為對(duì)應(yīng)的兩個(gè)或三 個(gè)。(一般選擇兩個(gè)以下)2) After Dynamic Background Subtraction of Survey Scan 表示執(zhí)行動(dòng)態(tài)背景扣除,使得感興趣的母離子都盡可能的獲得觸發(fā)EPI的機(jī)會(huì)。該選項(xiàng)尤為重要,為必選項(xiàng)。3)Exclude former target ions在某些情況下,一次數(shù)據(jù)

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