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文檔簡(jiǎn)介
1、 遺傳密碼表是完全錯(cuò)誤的 Crick 4*4*4 遺傳密碼表是完全錯(cuò)誤的 -C、H、O、N、P、S 所構(gòu)物質(zhì)分子彼此 完全加成反應(yīng)通
2、用原則的發(fā)現(xiàn)意義之 一 摘要: 本文通過(guò)排列數(shù)計(jì)算、邏輯對(duì)應(yīng)、實(shí)驗(yàn)體系上化學(xué)反應(yīng)機(jī)理從反應(yīng)物到生成物的排列數(shù)模型探索和43密碼表的應(yīng)用等多方面論述,指出了Crick所排43 遺傳密碼表的多
3、個(gè)系列錯(cuò)誤。主要包括: (一)根據(jù)蛋白質(zhì)單位種類(lèi)數(shù)20 和DNA 核苷酸單位種類(lèi)數(shù) 4 做出對(duì)DNA的核苷酸單位腺苷酸、鳥(niǎo)苷酸、胞苷酸、胸腺苷酸選三排列的排列數(shù)計(jì)算,從而建立核苷酸的64 個(gè)三排列一一對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的甘氨酸、絲氨酸等20種氨基酸的遺傳密碼表,本質(zhì)上是排列數(shù)應(yīng)用中用具體的顯性排列一一對(duì)應(yīng)隱性排列的具體元素,不是用具體的顯性排列一一對(duì)應(yīng)相應(yīng)的隱性排列,所以,是完全錯(cuò)誤的排列數(shù)應(yīng)用計(jì)算。 (二)43密碼表回避DNA分子關(guān)于腺苷酸、鳥(niǎo)苷酸、胞苷酸、胸腺苷酸的
4、空間排列數(shù)模型(真實(shí)的雙股螺旋的空間幾何形象在平面內(nèi)單一方向上的排列數(shù)模型),和該四個(gè)核苷酸分子關(guān)于C、H、O、N、P等原子的空間排列數(shù)模型(真實(shí)堿基分子的構(gòu)造和構(gòu)象在平面內(nèi)單一方向上的排列數(shù)模型),造成密碼表中平面內(nèi)一維直線上的三字母單向排列代替r維空間DNA分子真實(shí)空間構(gòu)造的排列表達(dá)錯(cuò)誤和對(duì)腺苷酸、鳥(niǎo)苷酸、胞苷酸、胸腺苷酸四分子選三分子進(jìn)行排列的排列數(shù)計(jì)算錯(cuò)誤。 (三)43 密碼表用DNA分子的連續(xù)空間位置指示蛋白質(zhì)長(zhǎng)鏈上給定位置上的氨基酸分子,造成此物體所在空間位置規(guī)定彼空間位置所存在物體的邏輯對(duì)應(yīng)上的混亂。
5、0; (四)“密碼子的氨基酸意義”破譯實(shí)驗(yàn)中,將反應(yīng)物多個(gè)不同類(lèi)核苷酸分子共聚體的空間幾何形象描述為密碼表中三個(gè)字母的直線上單向排列,造成用一維空間剛量描述r維空間向量的數(shù)學(xué)描述錯(cuò)誤。 (五)密碼表應(yīng)用體系中,從DNA分子到m RNA分子到t RNA,再到核糖體到肽鏈,沒(méi)有一步使用了排列數(shù)計(jì)算方法,從而造成DNA分子信息傳遞時(shí)步步失真,最后變成了肽鏈具體位置上的氨基酸分子,這里的每一步信息傳遞都是對(duì)密碼表的錯(cuò)誤運(yùn)用。 關(guān)鍵詞:43遺傳密碼表;排列數(shù)計(jì)算;錯(cuò)誤;
6、 2004年4月,筆者在中國(guó)化學(xué)會(huì)24屆學(xué)術(shù)年會(huì)上以墻報(bào)形式展出了C、所構(gòu)物質(zhì)分子彼此加成反應(yīng)的通用原則1 一文,在討論該加成反應(yīng)通式對(duì)生物大分子反應(yīng)的意義時(shí),本人提出了對(duì)當(dāng)前國(guó)內(nèi)外基因工程、遺傳學(xué)、生物化學(xué)、植物生理學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域正在通用的Crick (1969) 所排 遺傳密碼表的懷疑,引起與會(huì)專(zhuān)家的興趣,現(xiàn)就本人的這一工作進(jìn)行詳細(xì)匯報(bào). 引 言 1954年月,美國(guó)物理學(xué)家Gamow根據(jù)Watson 和Crick發(fā)表
7、的DNA雙股螺旋結(jié)構(gòu),提出了DNA的腺嘌呤N5C5H5 ,鳥(niǎo)嘌呤N5C5H5 O,胞嘧啶N3C4H5O和胸腺嘧啶N2C5H6O2等四種堿基可能就是密碼子的最初設(shè)想。1955-1956年,Gamow 陸續(xù)發(fā)表文章,從排列組合計(jì)算,1種堿基對(duì)應(yīng)1種氨基酸不夠,2種堿基的16種組合對(duì)應(yīng)20種氨基酸也不夠,4種堿基的256種組合對(duì)應(yīng)20種氨基酸太多,只有三種堿基組成64種組合對(duì)應(yīng)20種氨基酸較合適。1959年,Crick本人提出“中心法則”支持Gamow的假說(shuō);1961年,Crick 和Brenner用實(shí)驗(yàn)證明了細(xì)菌和噬菌體遺傳密碼的三聯(lián)性質(zhì)。1961年夏天,N
8、irenberg領(lǐng)導(dǎo)的生化小組合成了堿基尿嘧啶,然后用個(gè)尿嘧啶合成了苯丙氨酸分子 2,從而確定了Crick所排遺傳密碼表的第一個(gè)密碼子的意義:三個(gè)尿嘧啶是一個(gè)苯丙氨酸的密碼子,并由此拉開(kāi)了實(shí)驗(yàn)室里反應(yīng)發(fā)生結(jié)果論證Gamow所提四種堿基分子排列對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的二十種氨基酸分子的排列數(shù)計(jì)算的序幕。1964年,威斯康星大學(xué)的Khorana合成出了一個(gè)交替的共聚物UGUGUGUGUG,并用之作為合成蛋白質(zhì)的信使,產(chǎn)生了半胱氨酸和纈氨酸交替的多肽鏈半胱氨酸纈氨酸半胱氨酸纈氨酸,由此得出“是半胱氨酸的密碼子和是纈氨酸的密碼子”結(jié)論,并首創(chuàng)了實(shí)驗(yàn)室里“DNA鏈上堿基順序不同致使反應(yīng)發(fā)生的結(jié)果不同”分辨
9、Gamow 和Crick數(shù)學(xué)排列表中“某一類(lèi)元素相同但順序不同致使排列不同”的方法。1965-66,劍橋MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的Clark等做出起始密碼子結(jié)論;同一實(shí)驗(yàn)室的Brenner等和美國(guó)耶魯大學(xué)的AGaren等各自做出終止密碼子結(jié)論。到1966年,關(guān)于Gamow所提出的64個(gè)排列對(duì)應(yīng)20種氨基酸分子的遺傳密碼意義全部被實(shí)驗(yàn)室里的反應(yīng)所破譯。Crick在該系列反應(yīng)的基礎(chǔ)上排出了mRNA上的遺傳密碼表(1969)。 43 遺傳密碼表的排出被認(rèn)為是20世紀(jì)人類(lèi)自然科學(xué)史上的大事 2,被認(rèn)為是生物學(xué)上的元
10、素周期表 2 。Nirenberg、Khorana和Holley等因出色地做出了與該密碼有關(guān)的系列實(shí)驗(yàn),共獲了1968年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)(Crick本人因其1953年發(fā)表的DNA雙股螺旋結(jié)構(gòu),已分獲了1962年的諾貝爾醫(yī)學(xué)和生理學(xué)獎(jiǎng))。就當(dāng)前來(lái)看,Crick的43 遺傳密碼表仍是基因工程、細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)、生物化學(xué)、生物遺傳學(xué)等多個(gè)學(xué)術(shù)領(lǐng)域的核心內(nèi)容之一。 一、Crick 43 遺傳密碼表總的錯(cuò)誤 以1、2、3、4構(gòu)成多少個(gè)三位數(shù)和廣州、上海、北京三地有多少種直達(dá)火車(chē)票的排列數(shù)計(jì)算為例,排列數(shù)計(jì)算在具體應(yīng)用中是顯性排列(1、2、3、4
11、組成的三位數(shù)的排列43;廣州、上海、北京三地間直達(dá)火車(chē)票的排列P32)截取或挑選隱性排列(1、2、3、4、5、6、7、8、9構(gòu)成的三位數(shù)的排列93;廣州、上海、北京、天津等n個(gè)地點(diǎn)間直達(dá)火車(chē)票的排列Pn2 ),不是一個(gè)排列數(shù)概念盲目對(duì)應(yīng)一個(gè)非排列數(shù)概念,所以一個(gè)正確的排列數(shù)應(yīng)用計(jì)算包含隱性排列(應(yīng)用對(duì)象,如“三位數(shù)”“直達(dá)火車(chē)票”自身的排列)和顯性排列(給定元素針對(duì)應(yīng)用對(duì)象的排列,如、2、3、4針對(duì)三位數(shù);北京、上海、廣州針對(duì)直達(dá)火車(chē)票)兩個(gè)性質(zhì)完全相同的排列,且隱性排列數(shù)總不小于顯性排列數(shù)。在排列數(shù)應(yīng)用中,當(dāng)隱性排列數(shù)小于顯性排列數(shù)時(shí),不能進(jìn)行排列數(shù)應(yīng)用計(jì)算;當(dāng)隱性排列(即應(yīng)用對(duì)象
12、)不存在排列數(shù)模型時(shí),除非明確規(guī)定其排列數(shù)模型,否則排列數(shù)應(yīng)用完全錯(cuò)誤。 Gamow (1954)和Crick(1968)將DNA鏈上的腺嘌呤N5C5H5、鳥(niǎo)嘌呤N5C5H5O、胞嘧啶NCH5O、胸腺嘧啶NC5H6O2四種堿基分子排列對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的甘氨酸NC2H5O2、絲氨酸NC3H7O3等二十種氨基酸分子,是個(gè)典型的沒(méi)有明確排列數(shù)應(yīng)用對(duì)象(64個(gè)字母三聯(lián)體排列是針對(duì)“氨基酸分子”?還是針對(duì)“蛋白質(zhì)分子”?)和沒(méi)有規(guī)定應(yīng)用對(duì)象的排列數(shù)模型(“氨基酸分子”的排列數(shù)模型是什么?或者,“蛋白蛋分子”的排列數(shù)模型是什么?)的完全錯(cuò)誤的排列數(shù)應(yīng)用案例。若明確“氨基酸分子”做隱性排列(排列數(shù)應(yīng)用對(duì)
13、象),則隱性排列可規(guī)定為具體氨基酸分子關(guān)于C、H、O、N原子的平面內(nèi)單一方向上的排列,但化學(xué)上沒(méi)有氨基酸分子關(guān)于C、H、O、N原子的排列模型,Gamow和Crick也都回避了氨基酸分子關(guān)于C、H、O、N原子的排列模型問(wèn)題,所以,不能進(jìn)行排列數(shù)應(yīng)用;若明確“蛋白質(zhì)分子”做隱性排列(排列數(shù)應(yīng)用對(duì)象),則隱性排列可規(guī)定為具體蛋白質(zhì)分子關(guān)于甘NC2H5O2、絲NC3H7O3等蛋白質(zhì)單位的平面內(nèi)單一方向上的排列,但有機(jī)化學(xué)上也沒(méi)有蛋白質(zhì)分子關(guān)于甘NC2H5O2、絲NC3H7O3等蛋白質(zhì)單位的排列數(shù)模型,Gamow和Crick又都回避了蛋白質(zhì)分子關(guān)于甘NC2H5O2、絲NC3H7O3等蛋白質(zhì)單位的排列數(shù)問(wèn)
14、題,所以,也不能用排列數(shù)知識(shí)進(jìn)行計(jì)算。從Crick所排43 遺傳密碼表64個(gè)排列對(duì)應(yīng)64個(gè)氨基酸分子(雖然有個(gè)是始終信號(hào))的即成事實(shí)看,Gamow 和Crick根據(jù)氨基酸分子個(gè)數(shù)20(隱性排列的個(gè)數(shù))做出對(duì)堿基個(gè)數(shù)4(顯性排列的元素個(gè)數(shù))選三排列(4320,且4320),得出64個(gè)密碼子的結(jié)論,就像在回答1、2、3、4四個(gè)數(shù)組成多少個(gè)三位數(shù)時(shí),根據(jù)三位數(shù)100到999的總數(shù)900(隱性排列的個(gè)數(shù))做出對(duì)1、2、3、4等個(gè)數(shù)(顯性排列的元素?cái)?shù))選五排列(45900,且45900)的計(jì)算,從而得出1、2、3、4四個(gè)數(shù)組成的三位數(shù)有1024個(gè)的結(jié)論!不但結(jié)論完全錯(cuò)誤,而且排列數(shù)計(jì)
15、算步驟荒唐,所用方法令人費(fèi)解。比如:設(shè)某射擊場(chǎng)常規(guī)訓(xùn)練時(shí)有四名射擊手和20個(gè)不同靶子,若教練要求三個(gè)射擊手同時(shí)射擊同一靶子進(jìn)行常規(guī)訓(xùn)練,也許大家不會(huì)說(shuō)什么;但若教練要求三個(gè)射擊手按照6個(gè)不同的排列順序分射6個(gè)不同靶子和四個(gè)射擊手選三按照24個(gè)不同的排列順序分射20個(gè)不同靶子(4個(gè)靶子重復(fù)使用)進(jìn)行常規(guī)訓(xùn)練,那么大家會(huì)說(shuō)這位教練“有病”! 二、43 遺傳密碼表的邏輯錯(cuò)誤 例樣:某機(jī)車(chē)學(xué)校由n層高的摩天大樓組成,每個(gè)樓層設(shè)置一個(gè)專(zhuān)業(yè),共有制造、駕駛、維修、服務(wù)等四類(lèi)專(zhuān)業(yè);另有某列火車(chē)由m節(jié)車(chē)廂組成,每個(gè)車(chē)廂設(shè)置一個(gè)顏色,共有赤、橙等20種不同的顏色。現(xiàn)規(guī)定,該機(jī)車(chē)學(xué)校全權(quán)負(fù)責(zé)該列火車(chē)的制
16、造和運(yùn)營(yíng)。 比較發(fā)現(xiàn):Crick所排43 遺傳密碼表中的單個(gè)有序堿基三聯(lián)體對(duì)應(yīng)一個(gè)氨基酸分子,相當(dāng)于例樣中連續(xù)三層樓房制造和運(yùn)營(yíng)列車(chē)的一列車(chē)廂,不是連續(xù)三層樓房?jī)?nèi)的三個(gè)專(zhuān)業(yè)的師生制造和運(yùn)營(yíng)一節(jié)車(chē)廂(若用機(jī)車(chē)學(xué)校師生的話(huà),對(duì)四種不同專(zhuān)業(yè)的師生進(jìn)行組合就行了,沒(méi)必要對(duì)不同專(zhuān)業(yè)進(jìn)行排列)。密碼表應(yīng)用中DNA鏈上全部堿基翻譯為蛋白質(zhì)鏈上的全部氨基酸單位,相當(dāng)于樣例中機(jī)車(chē)學(xué)校的摩天大樓(n層高)制造了一列火車(chē)(m節(jié)),而不是摩天大樓內(nèi)×(n÷4)×( 4÷3)個(gè)專(zhuān)業(yè)的師生制造了這列列車(chē),且機(jī)車(chē)學(xué)校摩天大樓所制造的這列火車(chē)與摩天大樓的樓高有關(guān),即n : m=3 : 1(Fisers等1972報(bào)道過(guò)整個(gè)外殼蛋白基因的堿基排列順序,有一個(gè)起始密碼GUG和兩個(gè)終止密碼UAA,UAG,中間是用來(lái)編碼外殼蛋白的387個(gè)堿基,這個(gè)數(shù)目同外殼蛋白質(zhì)實(shí)際含有的129個(gè)氨基酸數(shù)目(387/3
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