怎樣用seqman看測序結(jié)果

1、怎樣用seqman看測序結(jié)果1打開seqman軟件，點(diǎn)巾le,點(diǎn)New,點(diǎn)王過2彈出新的對話框，點(diǎn)擊fesembleAidSequencesDTrimlEndsnOptidins口找到測序文件所在文件夾，在文件類型中選中文件類率QQtbiTraceFiles(*.abi;*.abl)1,選中四個(gè)測序結(jié)果AcM_6_©503-93)FF_F04110S001678GAchE_B_©503-94)RF_DD<11050D167BGAchE_9_CD503-93)FF_G04_l1050016T9G配膽目_®5(33-94jRf_EM_1105而187rg,點(diǎn)“打

2、開”，再點(diǎn)done3再點(diǎn)Assemble軟件就會(huì)自動(dòng)拼裝序列UnlocatedContigsL.jContig129640?力老占，4,加入¥們已知的參考序列（就是NCBI下下來的那個(gè)）。點(diǎn)菜單欄的sequence中的AddOne,找到參考序列所在文件夾，單擊它（這里我命名的叫Amplificationproduct）/,打開。就談加了一個(gè)參考序列。I5,雙擊，彈出框框。ConsensusUhE_0_05D3-94)RPJJ0<L10S001W8G.dbl(1>261)JU503-94FP_E1口寫口8479G.flibl(13>266*-liClcaEloxLpE

3、aducc.seq(2>293)T1ch£=B=(O5D3-«FP=FD<11D5D01676Gabl(1>25$)thE_S_(0503-53)Fpl&D<LlD50O1679G.abl(15>266*口三口邛4P506PTTCGGOTAATATGGGTCTGm&MTCAGGCTCT&HTCTMGiVT閑iTrCGGCTAATOGGGTCTGTOGGATCAGGCTCT&GCTCTCAGAT閑CTCAg&GJLCMCGC寫其GGCITT匚CT&FOJLTjarrGGGTTTGTGGGATrAGG

4、tnTTGGCmTHGjTrGGCTCjLGGCJlCJLlJrGCGGCGGCiTCirrAATmG&TCTCTCGGATCACGCTCT&lrcrCA&ATreCTCAGCCACAACGtC&CGGC>CTO-CT-TA&ATGGCTCAG&GACACGCGCCGGCl&ATGGCTCA.GG<3AC-AC&CGG&5C看到小灰色箭頭了嗎，每個(gè)都單擊一下。就會(huì)出現(xiàn)以下詳細(xì)資料idsn303口雷。白。竄口：，i，JI，,L一,，1rrncn；,林中加;門工丁卯汽：1遇704小謔1門"跖尸中不徜時(shí)仃匚

5、齦五町和*5”出葉也丁1口拓*寸匚；向測序irA：JlE_g5JD3-=«fliliSJ,_Ea-lLLCi£QD1673G-a&l(££i-Z.E6ti參考序列311式上“pEddlMTt.MeU1口£93U，口UWF白inM-BajiFPriUJ_LCiSC：DlGlSGr4iklf1)T血拗隨曲岫扁H一I二ctb二丁工山一工匚匚廣一彳：二人jrr?一1一后口二臬心工：日曰二示不二人.u，17175匚后二-1力匚入燈由四U'小W向:T”感K而H點(diǎn)4幀A珈'崛神；曲蜘極岫恤媼州.2.UGLr.l./jr.VtUGc,l

6、-JVJJiGA-febnLAMikUxjUlAbb；LjJ.'.L'tbLJt盧'FELLT：-FT11!：/mF->It-:L>wr-r-門廣正向測序的前端A.zhE_9_lOSCS-a_504_LLCi5CDltMkabJflitGLh一玲。海冷用也彼慍M、詠杷ICTG-£T-T-Afik匚BGECjlIKKiiJ-CECGGCGdSCCTKGaLid.二1門.1-bL1C-MM飆M.。9，14LG紅色峰代表T,啰變不kb,外色代表A,黑色代表G。大部"蜂是何昕T比如這樣而峰。但是有小部分的峰是不清楚的，比如這樣的峰。清晰的峰可以判斷這個(gè)堿基，但是不清晰的峰我們一般不判斷，就省略過去，因?yàn)椴磺逦姆宀淮罂尚拧＿@里要提一點(diǎn)的是，華大小規(guī)模測序用的是SANGER法，這種方法有個(gè)弊端就是靠近引物一端的大約20-50個(gè)堿基的峰圖是可能不清楚，之后的才很清晰。我說這個(gè)話，其實(shí)可以通過圖里就能反映出來。注意看上面兩個(gè)，第一個(gè)是8號(hào)PCR產(chǎn)物的反向測序，第二個(gè)是9號(hào)PCR產(chǎn)物的反向測序（就是由后引物那邊測過來的）。第三、第四個(gè)分別是8號(hào)、9號(hào)個(gè)體的壬向洲序。那我們來看看反向測序的情況反向測序的前端參考序列正向測序的后端是否看到，反向測