怎樣用seqman看測(cè)序結(jié)果

1、怎樣用seqman看測(cè)序結(jié)果1打開seqman軟件，點(diǎn)巾le,點(diǎn)New,點(diǎn)王過2彈出新的對(duì)話框，點(diǎn)擊fesembleAidSequencesDTrimlEndsnOptidins口找到測(cè)序文件所在文件夾，在文件類型中選中文件類率QQtbiTraceFiles(*.abi;*.abl)1,選中四個(gè)測(cè)序結(jié)果AcM_6_©503-93)FF_F04110S001678GAchE_B_©503-94)RF_DD<11050D167BGAchE_9_CD503-93)FF_G04_l1050016T9G配膽目_®5(33-94jRf_EM_1105而187rg,點(diǎn)“打

2、開”，再點(diǎn)done3再點(diǎn)Assemble軟件就會(huì)自動(dòng)拼裝序列UnlocatedContigsL.jContig129640?力老占，4,加入¥們已知的參考序列（就是NCBI下下來的那個(gè)）。點(diǎn)菜單欄的sequence中的AddOne,找到參考序列所在文件夾，單擊它（這里我命名的叫Amplificationproduct）/,打開。就談加了一個(gè)參考序列。I5,雙擊，彈出框框。ConsensusUhE_0_05D3-94)RPJJ0<L10S001W8G.dbl(1>261)JU503-94FP_E1口寫口8479G.flibl(13>266*-liClcaEloxLpE

3、aducc.seq(2>293)T1ch£=B=(O5D3-«FP=FD<11D5D01676Gabl(1>25$)thE_S_(0503-53)Fpl&D<LlD50O1679G.abl(15>266*口三口邛4P506PTTCGGOTAATATGGGTCTGm&MTCAGGCTCT&HTCTMGiVT閑iTrCGGCTAATOGGGTCTGTOGGATCAGGCTCT&GCTCTCAGAT閑CTCAg&GJLCMCGC寫其GGCITT匚CT&FOJLTjarrGGGTTTGTGGGATrAGG

4、tnTTGGCmTHGjTrGGCTCjLGGCJlCJLlJrGCGGCGGCiTCirrAATmG&TCTCTCGGATCACGCTCT&lrcrCA&ATreCTCAGCCACAACGtC&CGGC>CTO-CT-TA&ATGGCTCAG&GACACGCGCCGGCl&ATGGCTCA.GG<3AC-AC&CGG&5C看到小灰色箭頭了嗎，每個(gè)都單擊一下。就會(huì)出現(xiàn)以下詳細(xì)資料idsn303口雷。白。竄口：，i，JI，,L一,，1rrncn；,林中加;門工丁卯汽：1遇704小謔1門"跖尸中不徜時(shí)仃匚

5、齦五町和*5”出葉也丁1口拓*寸匚；向測(cè)序irA：JlE_g5JD3-=«fliliSJ,_Ea-lLLCi£QD1673G-a&l(££i-Z.E6ti參考序列311式上“pEddlMTt.MeU1口£93U，口UWF白inM-BajiFPriUJ_LCiSC：DlGlSGr4iklf1)T血拗隨曲岫扁H一I二ctb二丁工山一工匚匚廣一彳：二人jrr?一1一后口二臬心工：日曰二示不二人.u，17175匚后二-1力匚入燈由四U'小W向:T”感K而H點(diǎn)4幀A珈'崛神；曲蜘極岫恤媼州.2.UGLr.l./jr.VtUGc,l

6、-JVJJiGA-febnLAMikUxjUlAbb；LjJ.'.L'tbLJt盧'FELLT：-FT11!：/mF->It-:L>wr-r-門廣正向測(cè)序的前端A.zhE_9_lOSCS-a_504_LLCi5CDltMkabJflitGLh一玲。海冷用也彼慍M、詠杷ICTG-£T-T-Afik匚BGECjlIKKiiJ-CECGGCGdSCCTKGaLid.二1門.1-bL1C-MM飆M.。9，14LG紅色峰代表T,啰變不kb,外色代表A,黑色代表G。大部"蜂是何昕T比如這樣而峰。但是有小部分的峰是不清楚的，比如這樣的峰。清晰的峰可以判斷這個(gè)堿基，但是不清晰的峰我們一般不判斷，就省略過去，因?yàn)椴磺逦姆宀淮罂尚?。這里要提一點(diǎn)的是，華大小規(guī)模測(cè)序用的是SANGER法，這種方法有個(gè)弊端就是靠近引物一端的大約20-50個(gè)堿基的峰圖是可能不清楚，之后的才很清晰。我說這個(gè)話，其實(shí)可以通過圖里就能反映出來。注意看上面兩個(gè)，第一個(gè)是8號(hào)PCR產(chǎn)物的反向測(cè)序，第二個(gè)是9號(hào)PCR產(chǎn)物的反向測(cè)序（就是由后引物那邊測(cè)過來的）。第三、第四個(gè)分別是8號(hào)、9號(hào)個(gè)體的壬向洲序。那我們來看看反向測(cè)序的情況反向測(cè)序的前端參考序列正向測(cè)序的后端是否看到，反向測(cè)