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文檔簡介

1、三、數(shù)據(jù)庫檢索工具簡介EntrezSRS1、EntrezEntrez的特點(diǎn)鏈接的數(shù)據(jù)庫多使用方便實(shí)際匹配、相近匹配、查詢結(jié)果按匹配程度排列http:/gquery/gquery.fcgiEntrez集成的各種數(shù)據(jù)庫核酸序列蛋白質(zhì)序列生物大分子結(jié)構(gòu)基因組數(shù)據(jù)生物分類數(shù)據(jù)庫孟德爾人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)（OMIM）PubmedEntrezhttp:/Entrez/Entrez的查詢方式快速查詢限定查詢其他查詢方式 批處理查詢 交叉引用的信息查詢 Email查詢Entrez基本查詢功能主題詞（Subject）搜索短語（phrase）搜索文獻(xiàn)作者（Authous）搜索序列獨(dú)特識(shí)別信息（Unique Identi

2、fiers）搜索序列分子量搜索區(qū)域搜索通配符搜索2. SRSSRS（Sequence Retrieval System）是EMBL研制的一個(gè)基于WEB的查詢系統(tǒng),是目前生物信息界應(yīng)用最為廣泛的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。SRS在中國的鏡像站點(diǎn)建立在北京大學(xué)生物信息中心。SRS采用全菜單驅(qū)動(dòng)方式包括EMBL、EMBL_NEW、SwissProt、PIR等一級(jí)數(shù)據(jù)庫還包括許多二級(jí)數(shù)據(jù)庫如蛋白質(zhì)家族和結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫Prosite、限制酶數(shù)據(jù)庫ReBase、PDB序列子集數(shù)據(jù)庫NRL_3D、真核基因啟動(dòng)子數(shù)據(jù)庫EPD、E.coli 數(shù)據(jù)庫ECD、酶名稱和反應(yīng)數(shù)據(jù)庫ENZYME、生物計(jì)算文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫SEQANALREF等，還有與功能、疾病相關(guān)的數(shù)據(jù)庫，總共有80個(gè)數(shù)據(jù)庫。SRS與ENTREZ的區(qū)別 布林邏輯運(yùn)算 結(jié)果信息量 查詢速度NCBI AND,OR,BUT 小 快 SRS &, I, ! 大 慢http:/databa

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