基因工程原理 第4章 質(zhì)粒和噬菌體載體的基礎(chǔ)生物學(xué)課件_第1頁
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1、1思考題什么是基因工程?你對(duì)轉(zhuǎn)基因有何看法?發(fā)揮想象力,開發(fā)一種基因工程產(chǎn)品。主題報(bào)告重組DNA技術(shù)的應(yīng)用全班同學(xué)分為六個(gè)小組:六個(gè)主題,可以突破,自己選題,保證與基因工程相關(guān)班長負(fù)責(zé)分組,安排報(bào)告時(shí)間,從第14周開始。23第四章 質(zhì)粒和噬菌體載體的基礎(chǔ)生物學(xué)第一節(jié) 質(zhì)粒生物學(xué)質(zhì)粒是在染色體外穩(wěn)定遺傳的復(fù)制體大多數(shù)質(zhì)粒是以雙鏈環(huán)狀DNA分子的形式存在共價(jià)閉環(huán)DNA, cccDNA開環(huán)DNA, ocDNA45線性超螺旋開環(huán)質(zhì)粒酶切圖譜7溴化乙錠影響質(zhì)粒的超螺旋8質(zhì)粒所攜帶基因的表型特征10質(zhì)粒的分類接合型和非接合型 依據(jù)是否攜帶有一套促進(jìn)細(xì)菌接合的轉(zhuǎn)移基因(tra基因)松弛型和嚴(yán)謹(jǐn)型 取決于單個(gè)

2、細(xì)胞中的拷貝數(shù)1112質(zhì)粒的拷貝數(shù)通過調(diào)控質(zhì)粒復(fù)制的起始來決定。兩種調(diào)控機(jī)制: 通過反義RNA調(diào)控 (RNA II 和 RNA I ) 通過關(guān)鍵蛋白與重復(fù)區(qū)結(jié)合來進(jìn)行調(diào)控 Rop促進(jìn)RNA I 和RNA II的配對(duì) RepA 蛋白14Col E1衍生質(zhì)粒的復(fù)制調(diào)控1517質(zhì)粒的分配和分離穩(wěn)定性人們把由于錯(cuò)誤的分配而造成的質(zhì)粒丟失稱為分離不穩(wěn)定性。Par分配機(jī)制涉及DNA的超旋性質(zhì)粒形成多聚體18質(zhì)粒的不相容性在沒有選擇壓力的情況下,兩種質(zhì)粒不能共存于同一個(gè)宿主細(xì)胞內(nèi)。如果質(zhì)粒擁有相同的復(fù)制調(diào)控機(jī)制,它們就不相容。19第二節(jié) 質(zhì)粒DNA的純化Vinograd的經(jīng)典方法:CsCl,EtBr密度梯度

3、離心Binrnboim和Doly:堿裂解法20CsCl,EtBr密度梯度離心21堿裂解法NaOH和SDS裂解乙酸鈉中和離心,取上清沉淀TER消化RNA沉淀,75%乙醇洗干燥、溶解22質(zhì)??寺≥d體的理想特性相對(duì)分子量小(易于操作、拷貝數(shù)高、利于出現(xiàn)單一酶切位點(diǎn))可以在宿主細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生便于選擇的表型特性(便于篩選)存在多種限制性酶的單一位點(diǎn)區(qū)域,且最好位于易測(cè)表型基因上(便于克隆、篩選)pBR322載體252728pBR322衍生出更好的載體29pUC8質(zhì)粒衍生自pBR322含有復(fù)制起始位點(diǎn)(ori)和另兩個(gè)基因:氨芐青霉素抗性基因和lacZ基因30Lac篩選(藍(lán)白斑篩選)pUC質(zhì)粒含LacZ基因,

4、該酶能分解生色底物X-gal產(chǎn)生藍(lán)色,從而使菌株變藍(lán)。當(dāng)外源DNA插入LacZ基因后失活,菌株呈白色,稱之為藍(lán)白斑篩選。31pUC8等大腸桿菌質(zhì)粒的缺點(diǎn)不能操作大于10kb的DNA片段大片段的插入會(huì)引起重組或干擾質(zhì)粒的復(fù)制體系,且重組DNA分子在宿主細(xì)胞中丟失32第三節(jié) 噬菌體線性的雙螺旋分子,大約長48.5kb每個(gè)末端都有短的12個(gè)核苷酸的單鏈5突出,它們?cè)谛蛄猩匣パa(bǔ),進(jìn)入宿主細(xì)胞后形成環(huán)形結(jié)構(gòu)33噬菌體的基因組34噬菌體非必須DNA噬菌體基因組大小為48.5kb,其中有15kb只在噬菌體DNA整合到大腸桿菌染色體過程(即溶源性感染周期)中必須,該片段的刪除不影響噬菌體感染細(xì)菌的能力,也不影

5、響裂解周期中新的噬菌體顆粒合成,稱為隨意DNA。35噬菌體的生活周期36噬菌體裂解性感染周期與溶源性感染周期為了能夠復(fù)制,噬菌體必須進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞并促使細(xì)菌的酶表達(dá)噬菌體基因所包含的信息,以便于細(xì)菌能合成新的噬菌體。一旦復(fù)制完成,新的噬菌體便離開細(xì)菌,并通常引起細(xì)菌死亡,并繼續(xù)感染新的細(xì)胞,這稱為裂解性感染周期。噬菌體基因組整合到細(xì)菌染色體上,保持多代的休眠狀態(tài),并隨細(xì)胞分裂而與宿主染色體一起復(fù)制,稱為溶源性感染周期。3738噬菌體的主要啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)噬菌體載體插入型載體(insertion vector),部分或全部隨意DNA被刪除,并在刪除后的基因組內(nèi)部某位點(diǎn)引入單一的限制性酶切位點(diǎn)。取代型載體(replacement vector),隨意DNA兩側(cè)引入限制性酶切位點(diǎn),用需克隆的DNA在連入時(shí)替代隨意DNA。39噬菌體克隆載體EMBL3和EMBL4 的結(jié)構(gòu)40噬菌體的體外包裝4142混合裂解液中串聯(lián)噬菌體DNA的體外包裝43用單鏈DNA載體進(jìn)行DNA克隆M13、f1和fd是包含一個(gè)環(huán)形的單鏈DNA分子的絲狀大腸桿菌噬菌體。開發(fā)成克隆載體44M13生活

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