(12.7.3.3)-pubmed新司法鑒定的奧秘

PubMed內(nèi)容提要一、概況二、PUBMED特點三、檢索方法與技巧四、檢索結(jié)果處理五、MyNCBIPubMed是由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)的下屬部門NCBI(NationalCenterofBiotechnologyInformation)開發(fā)的面向全球的免費的權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文獻檢索工具。PubMed以前年報道大約是40萬條，每年文獻量都在大量增長，2008年報道67萬多條，預(yù)計2009年將突破71萬條，到目前為止共收錄了1900多萬篇文獻。其收錄的文獻以英文文獻為主，大約占80%，3/4有英文摘要。2009年收錄了80多個國家或地區(qū)37種語言，5200多種期刊。收錄期刊以歐美為主，其中美國出版的期刊大約占47%。一、概況數(shù)據(jù)構(gòu)成：MEDLINE-（1948-現(xiàn)在）

over16.5million(92.7%)PreMedline-InProcessrecords-over238,000(1.3%)OLDMEDLINE-（1865-1948）

over450,000(2.5%)PubMed-onlyrecords-over612,000(3.5%)——Publishersupplied——以2007年為例MEDLINE是印刷刊《IndexMedicus》》（醫(yī)學(xué)索引）、《IndextoDentalLiterature》（牙科文獻索引）和《InternationgalNursingIndex》（國際護理索引）的光盤版每周更新。內(nèi)容涉及：醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、牙醫(yī)學(xué)、護理學(xué)、衛(wèi)生保健、獸醫(yī)學(xué)等專業(yè)。記錄標(biāo)注[PubMed-indexedforMEDLINE]使用MeSH進行主題標(biāo)引。PreMEDLINE是PubMed每天接收所新數(shù)據(jù)的臨時性醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫，新數(shù)據(jù)在沒有被MeSH詞表索引之前和添加到MEDLINE數(shù)據(jù)庫之前，都標(biāo)記為[PubMed-InProcessCitations]經(jīng)MeSH詞表標(biāo)引后而未添加到MEDLINE之前，記錄標(biāo)注[PubMed-inprocess]每周向MEDLINE添加一次，添加到MEDLINE中的數(shù)據(jù)就從PreMEDLINE中刪去。PublisherSuppliedCitation

出版商直接向PubMed提交的文獻記錄，標(biāo)注[PubMed-assuppliedbypublisher

]，其狀態(tài)顯示為[in-process

],如果以后該數(shù)據(jù)被MEDLINE收錄，則顯示為[indexedforMEDLINE

]，否則還是顯示為[PubMed-assuppliedbypublisher

]或[PubMed].

如果出版社提交的數(shù)據(jù)先于印刷版出版時間[Epubaheadofprint].

。

注：提供的數(shù)據(jù)如果超出MEDLINE數(shù)據(jù)庫的收錄范圍，如在綜合性科學(xué)雜志（Science，Nature）上發(fā)表的地理學(xué)文章等，將不被采用。每天更新，時差短操作簡便、快捷提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配免費提供題錄、文摘及部分全文提供原文鏈接(部分可免費獲取）提供與NCBI其他數(shù)據(jù)庫的鏈接二、PubMed的特點自動轉(zhuǎn)換匹配：

PubMed對輸入檢索框中的檢索詞進行智能化地校對，將其逐步地與其數(shù)據(jù)庫中的各類術(shù)語匹配的原則。MeSHTranslationTable主題詞注釋表JournalsTranslationTable期刊注釋表CommonPhraseList常用詞組表AuthorIndex作者索引表NoMapping檢索詞拆分AND基本檢索輸入框工具欄提供輔助檢索功能側(cè)欄提供其他檢索如期刊數(shù)據(jù)庫檢索、主題詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻檢索檢索按鈕JournalsDatabase

MeSHDatabase

SingleCitationMatcher

BatchCitationMatcher

ClinicalQueries

SpecialQueries

LinkOut

MyNCBI舊版PubMed檢索界面快速檢索幫助區(qū)工具相關(guān)資源限制檢索、高級檢索新版PubMed檢索界面?zhèn)€性化服務(wù)快速檢索（QuickSearch）限制檢索（Limits)高級檢索（AdvancedSearch）主題詞檢索（MeSHDatabase）期刊檢索（JournalDatabase）臨床查詢（ClinicalQueries）特定文獻查找（Single/BatchCitationMatcher）三、檢索方法（一）單詞、詞組(可以是主題詞和副主題詞，也可是自由詞）檢索（二）字段限制檢索（三）截詞檢索（四）帶邏輯運算符的復(fù)合檢索快速檢索（一）單詞、詞組檢索提供索引詞表（相關(guān)檢索）及自動轉(zhuǎn)換匹配，此外詞組檢索還提供自動分詞功能，可幫助提高查全率也可進行精確短語檢索單詞檢索系統(tǒng)自動進行轉(zhuǎn)換匹配后生成的檢索式詞組檢索（固定搭配）自動轉(zhuǎn)換匹配后，進行邏輯或的運算詞組檢索（非固定搭配）精確（強制）詞組檢索針對特定的短語和詞組的檢索，需要在短語或者詞組上加上雙引號（加上引號后，系統(tǒng)不會再進行自動轉(zhuǎn)換或自動分詞）。（二）字段限制檢索某些字段可直接輸入檢索詞，如作者姓名；另一些字段則需要用語法命令來表達。語法命令表達方式：檢索詞[字段標(biāo)識符]字段標(biāo)識符（p.127)AB-AbstractLA-LanguageAD-AffiliationMH-MeSHTermsAU-AuthorsPMID-PubMedUniqueIdentifierCY-CountryPT-PublicationTypeDP-PublicationDateSO-SourceEDAT-EntrezDateTA-JournalTitleAbbreviationGS-GeneSymbo

TI-TitleIS-ISSNUID-UniqueIdentifiers作者姓名檢索格式：姓+名縮寫(不用標(biāo)點)，如要查找王智彪教授發(fā)表的文章，輸入格式為：wang

zbORwangz，系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進行檢索。PubMed對2002年起的文獻可以用全稱檢索，但檢索結(jié)果顯示的還是姓全稱，名縮寫的形式。使用姓名全稱可提高查準率

使用期刊名稱檢索字段標(biāo)識[ta]或者是[so],以免當(dāng)期刊名稱正好是一個單詞或詞組時被系統(tǒng)當(dāng)作自由詞進行檢索。期刊刊名檢索注：期刊檢索可以使用刊名全稱、縮寫和ISSN。例：Journalofleukocytebiology、Jleukoc

biol、0741-5400（三）截詞檢索截詞符：*表示任意數(shù)量的字符

在詞的末尾加“*”號，PubMed就會檢索出以該詞為詞根的所有的詞。截詞檢索將關(guān)閉自動詞語匹配功能。（四）使用邏輯運算符的復(fù)合檢索布爾邏輯運算符：與：AND或：OR非：NOT

如我們要檢索腫瘤的診斷和治療方面的文獻，可在快速檢索輸入框中輸入：cancerAND(diagnosisORtherapy)。復(fù)合檢索式檢索限制檢索限制檢索（Limits）提供出版日期、文獻類型、語種、研究對象種屬、性別、子庫、研究對象年齡、是否要全文或摘要及檢索詞所在字段等限制。點擊進入限制檢索Limits——進入：限定檢索的時候檢索輸入框可以為空，也可以輸入詞匯全文、免費全文、摘要研究對象種屬性別原文語種文獻類型年齡子庫檢索詞所在字段出版時間限定——界面：例1：查找2005年以來PubMed中收錄的所有中文文獻例2：查找2005年以來PubMed中收錄的重慶醫(yī)科大學(xué)的作者發(fā)表的中文文獻（一）字段限定檢索/索引（Index）檢索（二）結(jié)果數(shù)量預(yù)覽（Preview)（三）檢索史管理（History）（四）布爾邏輯檢索（五）查看詳細匹配過程（Details）高級檢索高級檢索是一個綜合性界面，將舊版的預(yù)覽與索引檢索、檢索歷史、檢索詳情綜合在一起，更為易用。此狀態(tài)下可進行以下操作：點擊進入高級檢索高級檢索——進入：檢索歷史（History）即以前的預(yù)覽/索引（Preview/Index)檢索，可進行字段限制和布爾邏輯組配檢索，以及結(jié)果數(shù)量的預(yù)覽。高級檢索——界面：詳細匹配過程（Details）更多資源字段限制及索引檢索提供入口字段選擇、索引詞表選詞及邏輯組配功能例：查找重慶醫(yī)科大學(xué)作者發(fā)表的文獻①選擇入口字段②輸入檢索詞Chongqingmedicaluniversity③點擊index按鈕例：查找重慶醫(yī)科大學(xué)作者發(fā)表的文獻④點擊AND按鈕例：查找重慶醫(yī)科大學(xué)作者發(fā)表的文獻⑤輸入其他檢索詞Chongqinguniversityofmedicalscience⑥點擊index按鈕⑦選擇需要的詞⑧點擊OR按鈕例：查找重慶醫(yī)科大學(xué)作者發(fā)表的文獻⑨點擊Search或Preview(Chongqingmedicaluniversity[Affiliation])OR("chongqinguniversityofmedicalscience"[Affiliation]OR"chongqinguniversityofmedicalsciences"[Affiliation])預(yù)覽功能（Preview）不直接顯示檢索的結(jié)果，而是在檢索歷史中先預(yù)覽檢索結(jié)果數(shù)量，以節(jié)約時間。例：上一例中直接點擊Preview的結(jié)果檢索史管理（History）布爾邏輯運算檢索式刪除查看檢索結(jié)果查看詳細匹配過程檢索史保存查看更多檢索歷史刪除所有檢索歷史檢索序號檢索式檢索時間檢出篇數(shù)兩種方式：1、在序號上單擊鼠標(biāo)左鍵，選擇邏輯關(guān)系2、直接輸入序號組合例：查看雜志0741-5400上發(fā)表的與癌癥治療或診斷相關(guān)的文獻，可在#16處單擊鼠標(biāo)左鍵后選擇“AND”檢索史——邏輯組配例：查看雜志0741-5400上發(fā)表的#17這一內(nèi)容的文獻，也可直接輸入#16AND#17#17AND#16檢索史——刪除單個檢索式(Delete)序號#3的檢索歷史已經(jīng)被刪除了檢索史——刪除單個檢索式(Delete)其功能是查看詳細檢索結(jié)果均可以查看詳細檢索結(jié)果檢索史——查看具體的檢索結(jié)果(Go)檢索史——查看具體的檢索結(jié)果(Go)需要注冊并登錄(相當(dāng)于CBM中利用“我的空間”保存檢索策略）檢索史——保存到MyNCBI（SaveinMyNCBI)注冊輸入用戶名、密碼登錄檢索史——保存到MyNCBI（SaveinMyNCBI)登錄后，回到檢索歷史，選擇要保存的檢索式檢索史——保存到MyNCBI（SaveinMyNCBI)輸入檢索式的名稱，然后點擊SAVE檢索史——保存到MyNCBI（SaveinMyNCBI)是否需要將最新的文獻定期發(fā)送到你的郵箱進行更新檢索史——保存到MyNCBI（SaveinMyNCBI)檢索史已經(jīng)保存檢索史——保存到MyNCBI（SaveinMyNCBI)詳細匹配過程（Details）

點擊后，系統(tǒng)可以顯示其執(zhí)行的檢索式，可以看見系統(tǒng)詳細的轉(zhuǎn)換過程。有時可幫助我們找主題詞查看當(dāng)前檢索式的詳細匹配過程查看指定檢索式的詳細匹配過程檢索提問詞轉(zhuǎn)換結(jié)果檢索結(jié)果檢索詞語轉(zhuǎn)換——檢索詞語如何轉(zhuǎn)換成系統(tǒng)檢索用詞檢索詞語檢索史——查看詳細匹配過程（Details)期刊瀏覽檢索主題詞瀏覽檢索單篇引文匹配檢索臨床查詢其他檢索功能主題詞瀏覽檢索

（MeshDatabase）功能：確定規(guī)范檢索詞查看詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表副主題詞、擴展、主要主題詞主題詞檢索（MeSHDatabase)

點擊這二處，均可進入主題詞檢索hepatitis12主題詞檢索（MeSHDatabase)3選擇合適主題詞，點擊主題詞進入副主題詞選擇界面主題詞檢索（MeSHDatabase)主題詞注釋可選副主題詞限定作為主要主題詞檢索不進行下位詞擴檢詞表中該主題詞的款目詞主題詞樹形結(jié)構(gòu)表4選擇合適副主題詞主題詞檢索（MeSHDatabase)Text:以文本方式顯示File：將選擇結(jié)果以文件方式保存到本地硬盤Printer:打印結(jié)果Clipboard:發(fā)送到剪貼板此處一般選SearchBoxwith,以便進行文獻檢索。5主題詞檢索（MeSHDatabase)6主題詞檢索（MeSHDatabase)主題詞檢索結(jié)果主題詞檢索（MeSHDatabase)在主題詞檢索的時候可以進行主題詞與主題詞之間邏輯組配例如：查詢肝炎并發(fā)肝癌相關(guān)的文獻主題詞檢索（MeSHDatabase)選擇副主題詞病因?qū)W生成主題詞肝炎與肝癌的邏輯組配檢索表達式點擊searchpubmed主題詞檢索（MeSHDatabase)肝炎并發(fā)肝癌的主題詞檢索結(jié)果主題詞檢索（MeSHDatabase)為何要使用主題詞檢索檢準率、檢全率更高可選擇副主題詞,縮小檢索范圍，提高查準率可進行加權(quán)檢索，提高查準率如何找到主題詞通過CBM查找主題詞.通過上位詞查找主題詞.期刊瀏覽檢索

（JournalDatabase）查看期刊相關(guān)信息便于準確查找某一種特定期刊期刊檢索（JournalsDatabase)可以輸入期刊名稱全稱、縮寫、ISSN號或期刊主題進行檢索期刊檢索（JournalsDatabase)cancer點擊期刊檢索（JournalsDatabase)單篇引文匹配檢索

（SingleCitationMatcher）輸入題錄信息，查找特定文獻。刊名要準確，縮寫要標(biāo)準著者姓名大小寫不敏感（可區(qū)分第一作者）如查找：王智彪教授1997年發(fā)表在Ultrason

Sonochem期刊上的一篇文章的其他作者的名字單篇引文匹配檢索（SingleCitationMatcher)Ultrason

Sonochem1997Wangzb得出其他著者臨床查詢（ClinicalQueries）

主要針對臨床醫(yī)生。檢索臨床研究方法學(xué)（循證醫(yī)學(xué)）文獻，主要涉及治療、診斷、病因、和預(yù)后等內(nèi)容，并提供強調(diào)選擇，即敏感度（強調(diào)查全）或特異度（強調(diào)查準）。有三個方面的內(nèi)容：臨床研究類別查詢：治療、診斷、病因?qū)W、預(yù)后及臨床指導(dǎo)系統(tǒng)評價查詢醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)查詢：診斷、臨床描述、管理、基因、分子遺傳學(xué)、基因測試等內(nèi)容。臨床查詢（ClinicalQueries)臨床研究類文獻查詢系統(tǒng)綜述文獻查詢醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)文獻查詢病因?qū)W診斷治療預(yù)后臨床預(yù)測指南——循證醫(yī)學(xué)資料查找特異度檢索敏感度檢索可以查詢系統(tǒng)綜述、meta分析、循證醫(yī)學(xué)、臨床試驗綜述等文獻可以通過下面的選項，查詢各類醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)文獻。四、檢索結(jié)果的處理顯示（Display)輸出（Sendto)檢索結(jié)果默認以題錄格式顯示檢索結(jié)果總數(shù)文獻標(biāo)題作者出處：刊名,出版時間;卷(期):頁碼改變顯示設(shè)置綜述與免費全文結(jié)果處理：顯示——題錄格式結(jié)果處理：顯示——顯示格式設(shè)置出處題名作者作者地址文摘全文鏈接文獻類型、主題詞、物質(zhì)名稱、基金項目等相關(guān)文獻結(jié)果處理：顯示——文摘格式查找相關(guān)數(shù)據(jù)Details（可修改檢索式）最近操作結(jié)果處理：顯示——輔助功能結(jié)果處理：顯示——輔助功能RSS：訂閱實時檢索結(jié)果Savesearch——(SaveinmyNCBI)Sendto:File:將檢索結(jié)果以文件的方式保存到本地硬盤Clipboard：將結(jié)果暫存在到剪貼板以便集中處理Collections：保存到myncbi的文獻集中（即創(chuàng)建個