分子生物學(xué)問(wèn)答(含答案)_第1頁(yè)
分子生物學(xué)問(wèn)答(含答案)_第2頁(yè)
分子生物學(xué)問(wèn)答(含答案)_第3頁(yè)
分子生物學(xué)問(wèn)答(含答案)_第4頁(yè)
分子生物學(xué)問(wèn)答(含答案)_第5頁(yè)
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分子生物學(xué)人類(lèi)基因組計(jì)劃的精髓?答:答案一:人類(lèi)基因組計(jì)劃的精髓是人類(lèi)基因組圖譜,包括遺傳圖譜、物理圖譜、序列圖譜、轉(zhuǎn)錄圖譜。遺傳圖譜:又稱連鎖圖譜,是以具有遺傳多態(tài)性的遺傳標(biāo)記為“路標(biāo)”,以遺傳學(xué)距離為圖距的基因組圖。遺傳圖譜的建立為基因識(shí)別和完成基因定位創(chuàng)造了條件。物理圖譜:指有關(guān)構(gòu)成基因組的全部基因的排列和間距的信息。繪制物理圖譜的目的是把有關(guān)基因的遺傳信息及其在每條染色體上的相對(duì)位置線性而系統(tǒng)地排列出來(lái)。序列圖譜:指測(cè)定每條染色體的DNA序列,通過(guò)DNA序列可以直接推出基因結(jié)構(gòu)、定位已知基因、研究基因起源。轉(zhuǎn)錄圖譜:指在識(shí)別基因組所包含的蛋白質(zhì)編碼序列的基礎(chǔ)上繪制的結(jié)合有關(guān)基因序列、位置及表達(dá)模式等信息的圖譜。通過(guò)這張圖可以了解某一基因在不同時(shí)間不同組織、不同水平的表達(dá);也可以了解一種組織中不同時(shí)間、不同基因中不同水平的表達(dá),還可以了解某一特定時(shí)間、不同組織中的不同基因不同水平的表達(dá)。答案二:人類(lèi)基因組計(jì)劃(英語(yǔ):HumanGenomeProject,HGP)是一項(xiàng)規(guī)模宏大,跨國(guó)跨學(xué)科的科學(xué)探索工程。其宗旨在于測(cè)定組成人類(lèi)染色體(指單倍體)中所包含的30億個(gè)堿基對(duì)組成的核苷酸序列,從而繪制人類(lèi)基因組圖譜,并且辨識(shí)其載有的基因及其序列,達(dá)到破譯人類(lèi)遺傳信息的最終目的?;蚪M計(jì)劃精髓在于讓人類(lèi)解碼生命、了解生命的起源、了解生命體生長(zhǎng)發(fā)育的規(guī)律、認(rèn)識(shí)種屬之間和個(gè)體之間存在差異的起因、認(rèn)識(shí)疾病產(chǎn)生的機(jī)制以及長(zhǎng)壽與衰老等生命現(xiàn)象、為疾病的診治提供科學(xué)依據(jù)。草圖,許多疾病相關(guān)的基因被識(shí)別;SNP(人與人之間的區(qū)別),草圖提供了一個(gè)理解遺傳基礎(chǔ)和人類(lèi)特征進(jìn)化的框架。草圖后,研究人員有了新的工具來(lái)研究調(diào)節(jié)區(qū)和基因網(wǎng)絡(luò)。比較其它基因組可以揭示共同的調(diào)控元件,和其他物種共享的基因的環(huán)境也許提供在個(gè)體水平之上的關(guān)于功能和調(diào)節(jié)的信息。草圖同樣是研究基因組三維壓縮到細(xì)胞核中的一個(gè)起點(diǎn)。這樣的壓縮可能影響到基因調(diào)控;在應(yīng)用上,草圖信息可以開(kāi)發(fā)新的技術(shù),如DNA芯片、蛋白質(zhì)芯片,作為傳統(tǒng)方法的補(bǔ)充,目前,這樣的芯片可以包含蛋白質(zhì)家族中所有的成員,從而在特定的疾病組織中可以找到那些是活躍的。如何利用人類(lèi)基因組計(jì)劃輔助臨床醫(yī)學(xué)?答:答案一:人類(lèi)疾病相關(guān)的基因是人類(lèi)基因組中結(jié)構(gòu)和功能完整性至關(guān)重要的信息。對(duì)于單基因病,采用“定位克隆”和“定位候選克隆”的全新思路,導(dǎo)致了亨廷頓氏舞蹈癥、遺傳性結(jié)腸癌和乳腺癌等一大批單基因遺傳病致病基因的發(fā)現(xiàn),為這些疾病的基因診斷和基因治療奠定了基礎(chǔ)。對(duì)于心血管疾病、腫瘤、糖尿病、神經(jīng)精神類(lèi)疾病、自身免疫性疾病等多基因疾病是目前疾病基因研究的重點(diǎn)。健康相關(guān)研究是HGP的重要組成部分,自1997年相繼提出:“腫瘤基因組解剖計(jì)劃”“環(huán)境基因組學(xué)計(jì)劃”。同時(shí),基因診斷、基因治療和基于基因組知識(shí)的治療、基于基因組信息的疾病預(yù)防、疾病易感基因的識(shí)別、風(fēng)險(xiǎn)人群生活方式、環(huán)境因子的干預(yù)也為疾病診斷治療提供重大變革。答案二:人類(lèi)疾病相關(guān)的基因是人類(lèi)基因組中結(jié)構(gòu)和功能完整性至關(guān)重要的信息。人類(lèi)基因組基礎(chǔ)研究主要通過(guò)基因診斷、基因治療和基于基因組知識(shí)的治療、基于基因組信息的疾病預(yù)防、疾病易感基因的識(shí)別、風(fēng)險(xiǎn)人群生活方式、環(huán)境因子的干預(yù)等方式輔助臨床醫(yī)學(xué);具體的方式如下:1)基因工程藥物:分泌蛋白(多肽激素,生長(zhǎng)因子,趨化因子,凝血和抗凝血因子等)及其受體。2)診斷和研究試劑產(chǎn)業(yè):基因和抗體試劑盒、診斷和研究用生物芯片、疾病和篩藥模型。3)對(duì)細(xì)胞、胚胎、組織工程的推動(dòng):胚胎和成年期干細(xì)胞、克隆技術(shù)、器官再造。4)制藥工業(yè):篩選藥物的靶點(diǎn):與組合化學(xué)和天然化合物分離技術(shù)結(jié)合,建立高通量的受體、酶結(jié)合試驗(yàn)以知識(shí)為基礎(chǔ)的藥物設(shè)計(jì):基因蛋白產(chǎn)物的高級(jí)結(jié)構(gòu)分析、預(yù)測(cè)、模擬—藥物作用“口袋”。個(gè)體化的藥物治療:藥物基因組學(xué)。5)基礎(chǔ)生物學(xué):基因功能的定位;6)交叉學(xué)科的興起。如:基因組學(xué)和生物信息學(xué)等。什么是基因表達(dá)?試述基因表達(dá)的特點(diǎn)及其調(diào)控對(duì)生物體的重要性?答︰(1)基因表達(dá)︰從DNA到蛋白質(zhì)的過(guò)程(是指原核生物和真核生物基因組中特定的結(jié)構(gòu)基因所攜帶的遺傳信息,經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄、翻譯等一系列過(guò)程,合成具有特定的生物學(xué)功能的各種蛋白質(zhì),表現(xiàn)出特定的生物學(xué)效應(yīng)的全過(guò)程)。(2)特點(diǎn)①組織特異性︰不同組織細(xì)胞中不僅表達(dá)的基因數(shù)量不同,而且基因表達(dá)的強(qiáng)度和種類(lèi)也不相同。②階段特異性︰細(xì)胞分化發(fā)育的不同時(shí)期,基因表達(dá)的情況不相同。③與環(huán)境相適應(yīng)︰當(dāng)周?chē)臓I(yíng)養(yǎng)、溫度、濕度、酸度及各條件變化時(shí),生物體就要改變自身的基因表達(dá)狀況,以調(diào)整體內(nèi)執(zhí)行和相應(yīng)功能的蛋白質(zhì)的種類(lèi)、數(shù)量,從而改變自身的代謝活動(dòng)度以來(lái)適應(yīng)環(huán)境。(3)對(duì)生物體的重要性︰1、適應(yīng)環(huán)境、維持生長(zhǎng)和繁殖。2、維持個(gè)體發(fā)育和分化。真核生物中,基因表達(dá)受不同水平的調(diào)控,請(qǐng)列舉三種。答︰A.轉(zhuǎn)錄前調(diào)控︰基因丟失;(原生動(dòng)物、線蟲(chóng)、昆蟲(chóng)和甲殼類(lèi)動(dòng)物)轉(zhuǎn)錄前調(diào)控,非洲蛙蟾的卵母細(xì)胞中原有的rRNA基因約500bp,卵裂期和胚胎期需要大量的rRNA,基因會(huì)大量復(fù)制rRNA,使拷貝數(shù)達(dá)到200萬(wàn)倍,擴(kuò)增約4000倍?;驍U(kuò)增(geneamplification);基因重排(generearrangement)。DNA的甲基化(DNAmethylation)組蛋白修飾(Histonemodification)/及組蛋白的修飾。B.轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控︰轉(zhuǎn)錄調(diào)控是通過(guò)各種調(diào)控元件相互作用來(lái)實(shí)現(xiàn)的,調(diào)控元件主要包括順式作用元件和反式作用因子。C.轉(zhuǎn)錄后調(diào)控︰hnRNA的選擇性加工運(yùn)輸;mRNA前體的選擇性剪接;RNA編輯;RNAi。D.翻譯調(diào)控︰翻譯因子的磷酸化調(diào)控;mRNA穩(wěn)定性調(diào)控。E.翻譯后調(diào)控-蛋白質(zhì)修飾。為什么說(shuō)轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是基因表達(dá)調(diào)控的中心環(huán)節(jié)?答︰基因調(diào)控主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄階段,尤其起始階段,因?yàn)檫@些是表達(dá)的起始階段,可以避免那些不需要的轉(zhuǎn)錄所造成的資源浪費(fèi)。轉(zhuǎn)錄調(diào)控是通過(guò)各種調(diào)控元件相互作用來(lái)實(shí)現(xiàn)的,調(diào)控元件主要包括順式作用元件和反式作用因子。而且轉(zhuǎn)錄起始是基因表達(dá)的基本調(diào)控點(diǎn),涉及DNA序列調(diào)控蛋白及這些因素對(duì)RNA聚合酶活性的影響,順式作用元件和反式作用因子之間相互作用,均在轉(zhuǎn)錄起始來(lái)表達(dá),而轉(zhuǎn)錄后的加工修飾為RNA以及翻譯及翻譯后的蛋白質(zhì)修飾都是以轉(zhuǎn)錄水平為基礎(chǔ)的。舉例說(shuō)明DNA甲基化與腫瘤的關(guān)系答︰DNA甲基化是基因表達(dá)修飾方式之一,與基因表達(dá)調(diào)控密切相關(guān),它能關(guān)閉一些基因的活性,而去甲基化能誘導(dǎo)基因的重新活化及表達(dá)。DNA甲基化修飾通過(guò)改變基因的表達(dá),參與了細(xì)胞的生長(zhǎng)、發(fā)育過(guò)程及X染色體失活等的調(diào)控。DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA的穩(wěn)定性、DNA與蛋白質(zhì)相互作用方面的改變,從而控制基因表達(dá)。加計(jì)劃的狀態(tài)的改變是引起腫瘤的一個(gè)重要因素。這種變化包括︰(1)整體甲基化水平降低;(2)正常非甲基化CpG島的高甲基化;(3)維持甲基化模式酶的調(diào)節(jié)失控。從而導(dǎo)致基因組的不穩(wěn)定(如︰染色體的不穩(wěn)定,可移動(dòng)遺傳因子的激活,原癌基因的表達(dá))和抑癌基因的不表達(dá)。列如︰對(duì)家族性和散發(fā)型乳腺癌和結(jié)腸癌的研究中發(fā)現(xiàn),家族性腫瘤中序列無(wú)突變的10個(gè)抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化常見(jiàn),但在突變的抑癌基因中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)甲基化的現(xiàn)象。由此可見(jiàn)︰DNA甲基化模式的改變和腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。如何動(dòng)物建模來(lái)評(píng)價(jià)促創(chuàng)傷愈合的新藥作用效果?答:動(dòng)物建模:1.準(zhǔn)備20只體重在25-30克之間的標(biāo)準(zhǔn)化的KM小鼠;2.在每只小鼠的鼠背上分別建立兩個(gè)面積為6*6mm的全皮層傷口A組和B組,A組傷口用新藥處理,B組傷口做空白對(duì)照;3.分別在傷后的第3、7、8、9天隨機(jī)處死一些小鼠,收集其皮膚組織樣本分別作組織學(xué)和免疫組化分析;4.對(duì)A、B兩組傷口用數(shù)碼相機(jī)記錄傷口創(chuàng)面愈合情況,用相關(guān)計(jì)算機(jī)程序測(cè)定殘余傷口面積占初始傷口面積百分比并獲得傷口愈合曲線,進(jìn)行比較;5.組織學(xué)分析:創(chuàng)面標(biāo)本做切片HE染色,測(cè)量新上皮從傷口邊緣遷移的長(zhǎng)度來(lái)確定新上皮成形率;6.免疫組化分析:?7.根據(jù)宏觀形態(tài)的照片、HE染色以及免疫組化的結(jié)果評(píng)價(jià)新藥的效果。參考文獻(xiàn):ASmallPeptidewithPotentialAbilitytoPromoteWoundHealing對(duì)于新型促愈合藥物可能的作用機(jī)制的研究思路?試述外源基因在原核體系中的表達(dá)需要具備的條件,及影響外源基因表達(dá)的因素。答:答︰外源基因表達(dá)所要具備的條件︰(1)編碼區(qū)不含插入序列(mRNA-cDNA);(2)位于啟動(dòng)子下游,方向一致,原有的讀碼框不變;(3)含起始密碼子(AUG),終止密碼(TAA);(4)轉(zhuǎn)錄的必須有SD序列,調(diào)節(jié)SD序列與第一個(gè)AUG間的距離;(5)選擇系統(tǒng)編號(hào)的簡(jiǎn)并密碼;(6)增強(qiáng)產(chǎn)物的穩(wěn)定(如︰融合蛋白,信號(hào)肽)。影響因素︰(1)啟動(dòng)子的強(qiáng)弱(主要因素);(2)基因的劑量;(3)RNA轉(zhuǎn)錄效率(SD互補(bǔ),AUGSD距離及序列,AUG前后核苷酸序列的適宜性);(4)密碼子;(5)表達(dá)產(chǎn)物的大??;(6)產(chǎn)物的穩(wěn)定性。蛋白質(zhì)的分離純化技術(shù)依據(jù)蛋白質(zhì)的性質(zhì)分為哪幾大類(lèi),請(qǐng)例舉其中一類(lèi),談?wù)勊脑砑皯?yīng)用。答:答︰蛋白質(zhì)的分離純化可分為︰①依據(jù)溶解度差別,如硫酸銨分離法;②依據(jù)分子大小不同︰透析、超過(guò)濾、離心法、凝膠過(guò)濾層析、凝膠電泳;③依據(jù)蛋白質(zhì)分子帶點(diǎn)性質(zhì)不同︰電泳、離子交換層析;④依據(jù)蛋白質(zhì)吸附性質(zhì)不同︰吸附柱層析、吸附薄層層析;⑤利用蛋白質(zhì)的特異性配體︰親和層析。舉例︰電泳。其原理︰在一定PH值下,細(xì)胞表面帶有凈的正或負(fù)電荷,能在外加電場(chǎng)的作用下發(fā)生泳動(dòng),向正極或負(fù)極移動(dòng)。各種細(xì)胞或處于不同生理狀態(tài)的同種蛋白質(zhì)所帶電荷的電量不同,故在一定的電場(chǎng)中的泳動(dòng)速度也不同。(影響顆粒電泳遷移率的因素︰緩沖液,電場(chǎng),支持介質(zhì))類(lèi)型︰SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳、等電點(diǎn)聚焦電泳、毛細(xì)管電泳。應(yīng)用︰電泳的類(lèi)型很多,應(yīng)用范圍也很廣,如︰SDS,常用于蛋白質(zhì)分子量的測(cè)定︰目前,雙向凝膠電泳已成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù)。以2GM—CSF為例,寫(xiě)出獲得該基因工程重組蛋白純品的流程。答:1、GM—CSF全基因及可溶性sGM—CSF基因PCR擴(kuò)增。2、含腸激酶位點(diǎn)的pth10HisA·sGM—CSF表達(dá)載體的構(gòu)建(純化后的GM—CSF,sGM—CSF及質(zhì)檢)。3、誘導(dǎo)表達(dá)pth10HisA·sGM—CSF在大腸桿菌BL21中誘導(dǎo)表達(dá)。4、sGM—CSF融合蛋白的制備<1度工程菌的培養(yǎng)2度超聲破壞菌體。5、sGM—CSF融合蛋白的純化<1度融合表達(dá)載體pthhisa在硫氧還蛋白融合段有組氨酸標(biāo)簽,用M2+固相化的chelatingsepharosefastflow填材料進(jìn)行親和,層析2度將可溶性表達(dá)產(chǎn)物(超聲波,噬菌體的離心上清)與親和柱結(jié)合,用2信柱床體積以上的A液過(guò)柱至基線平穩(wěn),用B液(A液加入朱唑至濃度為50mmol/L)梯度習(xí)脫5—10個(gè)柱體體積,用AKATAExplore進(jìn)行檢測(cè),收集各洗脫液)。6、sGM—CSF融合蛋白的腸激酶切割及純化。7、sGM—CSF融合蛋白及非融合蛋白的westernBlot檢測(cè)。干細(xì)胞應(yīng)具備哪些生物學(xué)特點(diǎn)?答:干細(xì)胞是人體最原始的細(xì)胞,具有很強(qiáng)的再生能力,在干細(xì)胞因子和多種白細(xì)胞介素的聯(lián)合作用下,可誘導(dǎo)分化出各種類(lèi)型的細(xì)胞。干細(xì)胞是自我更新能力,高度增殖和多向分化潛能的細(xì)胞。A:自我更新能力:干細(xì)胞可不對(duì)稱分裂為1個(gè)子代干細(xì)胞和1個(gè)功能細(xì)胞,從而使組織和器官保持生長(zhǎng)和衰退的動(dòng)態(tài)平衡,但干細(xì)胞的分裂實(shí)際是不對(duì)稱的,干細(xì)胞在其發(fā)育期間也能夠?qū)ΨQ性地分裂以擴(kuò)增它們的數(shù)量。B:高度增殖能力:因干細(xì)胞數(shù)量不多,所以其高度增殖的生物學(xué)特性有其重要意義:體內(nèi):如造血干細(xì)胞通過(guò)高度擴(kuò)增,可補(bǔ)充由于細(xì)胞正常衰老死亡而喪失的血細(xì)胞。體外:體外擴(kuò)增干細(xì)胞是干細(xì)胞研究和應(yīng)用的前提和關(guān)鍵。因此,高度擴(kuò)增的生物學(xué)特征不但對(duì)干細(xì)胞的研究和應(yīng)用有著重要作用,而且對(duì)機(jī)體正常功能的維持也起著重要作用。C、多功能性或全能性一分化干細(xì)胞具有分化為多種細(xì)胞類(lèi)型的潛能,但不同干細(xì)胞的分化潛能有所不同。胚胎干細(xì)胞:全能性神經(jīng)干細(xì)胞:多功能性。何為干細(xì)胞不對(duì)稱分裂?答:干細(xì)胞不對(duì)稱分裂為1個(gè)子代干細(xì)胞和1個(gè)功能細(xì)胞,從而使組織和器官保持生長(zhǎng)和衰退的動(dòng)態(tài)平衡。例如:皮膚更新,干細(xì)胞分裂后,其中一個(gè)成為干細(xì)胞,另一個(gè)則分化為上皮細(xì)胞或基底細(xì)胞等等。什么是細(xì)胞分化?為什么說(shuō)細(xì)胞分化是基因選擇性表達(dá)的結(jié)果?答:(1)細(xì)胞分化(celldifferentiation):指?jìng)€(gè)體發(fā)育過(guò)程中,細(xì)胞后代之間在形態(tài)結(jié)構(gòu)、生化組成和功能上向?qū)R恍院吞禺愋苑较虬l(fā)展,逐漸產(chǎn)生穩(wěn)定性差異的過(guò)程。(2)原因:細(xì)胞分化的主要特征是新的、特異性蛋白質(zhì)的合成,隨后細(xì)胞在生化、結(jié)構(gòu)、功能上發(fā)生變化,細(xì)胞表型出現(xiàn)差異,從分子層次上看,這是由于基因選擇性表達(dá)的結(jié)果,即奢侈基因表達(dá)使細(xì)胞合成特異蛋白。由于基因基因的選擇性表達(dá)而合成分化細(xì)胞的某些特異性蛋白,執(zhí)行特殊功能,因此細(xì)胞分化的本質(zhì)就是基因表達(dá)調(diào)控的問(wèn)題。在細(xì)胞內(nèi)與分化有關(guān)的基因按其功能分為兩類(lèi):一類(lèi)是管家基因,表達(dá)的產(chǎn)物用以維持細(xì)胞自身的正常的新陳代謝;另一類(lèi)是奢侈基因,表達(dá)形成細(xì)胞功能的多樣性。細(xì)胞分化正是奢侈基因的選擇性表達(dá)的結(jié)果。因此細(xì)胞分化的實(shí)質(zhì)就是基因的選擇性表達(dá)的結(jié)果。何為細(xì)胞全能性?如何證明分化成熟細(xì)胞的全能性?答:(1)細(xì)胞全能性(totipotency):?jiǎn)蝹€(gè)細(xì)胞在一定條件下可分化發(fā)育為完整個(gè)體的分化潛能稱為全能性。(2)證明分化成熟體細(xì)胞的全能性:由于DNA的半保留復(fù)制和細(xì)胞的有絲分裂,從而使生物體的任何體細(xì)胞都具有了與原初的受精卵(有性生殖過(guò)程中)或起始細(xì)胞(無(wú)性生殖過(guò)程)相同的一整套基因。依然受精卵或起始細(xì)胞可以發(fā)育成為一個(gè)新整體,那么受精卵或起始細(xì)胞復(fù)制而來(lái)的與受精卵或起始細(xì)胞具有相同的一整套基因的體細(xì)胞依然應(yīng)該能發(fā)育成為一個(gè)完整的個(gè)體,即分化成熟的體細(xì)胞也是全能的。體細(xì)胞的核移植到受精卵的胞質(zhì)中時(shí),這個(gè)具有新核的細(xì)胞可以發(fā)育為一個(gè)新的個(gè)體。這說(shuō)明分化成熟的體細(xì)胞核仍然保持完整的,在一定條件下的細(xì)胞全能性。如克隆羊。什么是表觀遺傳學(xué)?它主要研究什么內(nèi)容?答︰(1)基因的DNA序列不發(fā)上改變的情況下,基因的表達(dá)水平與功能發(fā)生改變,并產(chǎn)生可遺傳的表型。不依賴于DNA序列的遺傳現(xiàn)象。(2)①DNA甲基化修飾︰基因選擇性轉(zhuǎn)錄表達(dá)的調(diào)控,主要表現(xiàn)為基因組DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基間的共價(jià)結(jié)合,胞嘧啶由此被修飾為5-甲基胞嘧啶。②非編碼RNA的調(diào)控作用︰miRNA調(diào)節(jié)大約30%的人類(lèi)基因表達(dá)。miRNA可以通過(guò)靶向DNA或組蛋白修飾酶等表觀遺傳復(fù)合物而實(shí)現(xiàn)調(diào)節(jié)作用。siRNA通過(guò)誘導(dǎo)染色質(zhì)的形成來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控。piRNA主要表現(xiàn)為在配子形成過(guò)程中對(duì)轉(zhuǎn)座子元件的沉默作用,是生殖細(xì)胞發(fā)育所必須的。③組蛋白修飾︰構(gòu)成核小體的組蛋白,氨基端可以被多種酶進(jìn)行各種修飾,如磷酸化,乙酰化,甲基化和泛素化,組蛋白的這類(lèi)修飾可以改變DNA-組蛋白的相互作用,是染色質(zhì)的構(gòu)型發(fā)生改變,稱為染色質(zhì)構(gòu)型重塑。什么是甲基化,在調(diào)控基因表達(dá)過(guò)程中起什么作用?答:(1)從活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上催化其甲基轉(zhuǎn)移到其他化合物的過(guò)程??尚纬筛鞣N甲基化合物,或者是對(duì)某些蛋白質(zhì)或核酸等進(jìn)行化學(xué)修飾形成甲基化產(chǎn)物。(2)甲基化是蛋白質(zhì)和核酸的一種重要的修飾,調(diào)節(jié)基因的表達(dá)和關(guān)閉,與癌癥、衰老、老年癡呆等許多疾病密切相關(guān),是表觀遺傳學(xué)的重要研究?jī)?nèi)容之一。最常見(jiàn)的甲基化修飾有DNA甲基化和組蛋白甲基化。DNA甲基化能關(guān)閉某些基因的活性,去甲基化則又到了基因的重新活化和表達(dá)。DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達(dá)。研究證實(shí),CpG二核苷酸中胞嘧啶的甲基化導(dǎo)致了人體1/3以上由于堿基轉(zhuǎn)換而引起的遺傳病。DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)和少量的N6-甲基腺嘌呤(N6-mA)及7-甲基鳥(niǎo)嘌呤(7-mG)。在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出現(xiàn)在CpG序列、CpXpG、CCA/TGG和GATC中。DNA甲基化是指生物體在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNAmethyltransferase,DMT)的催化下,以s-腺苷甲硫氨酸(SAM)為甲基供體,將甲基轉(zhuǎn)移到特定的堿基上的過(guò)程。DNA甲基化可以發(fā)生在腺嘌呤的N-6位、胞嘧啶的N-4位、鳥(niǎo)嘌呤的N-7位或胞嘧啶的C-5位等。但在哺乳動(dòng)物中DNA甲基化主要發(fā)生在5ˊ-CpG-3ˊ的C上生成5-甲基胞嘧啶(5mC)。什么是基因印記?它的主要特征是什么?答:基因印跡,是表觀遺傳調(diào)節(jié)的一種形式,是指兩個(gè)親本等位基因的差異性甲基化造成了一個(gè)親本等位基因的沉默,另一個(gè)親本等位基因保持單等位基因活性。2.特征;a每一個(gè)印記基因簇由一個(gè)印記控制元件(imprintcontrolelement,ICE)所控制。B也稱為印記控制區(qū)域(imprintcontrolregion,ICR)或者印記中心(imprintcentre,IC)c絕大多數(shù)都有CpGislands,能夠發(fā)生dna甲基化。D在CpGislands,內(nèi)或附近常有成簇的、有向的重復(fù)片段。請(qǐng)敘述肝細(xì)胞對(duì)胰高血糖素或腎上腺素的反應(yīng)過(guò)程。答:腎上腺素能受體激活——與Gi偶聯(lián)——AC活性下降——cAMP活性下降——平滑肌舒張。胰高血糖素能受體——激活Gs、增加AC活性——cAMP——PKA(增加肝糖原分解)細(xì)胞膜在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的過(guò)程中起到怎樣的作用?答:屏障作用,位于細(xì)胞膜的某些能特異性地與外源性物質(zhì)結(jié)婚,并誘發(fā)細(xì)胞產(chǎn)生某些特定的生理生化反應(yīng),并最終產(chǎn)生生物學(xué)效應(yīng)的物質(zhì)。簡(jiǎn)述CRISPR/Cas-9的基本原理及優(yōu)點(diǎn)(與傳統(tǒng)的基于同源重組的胚胎干細(xì)胞基因敲除相比較)。答:CRISPR/Cas-9此系統(tǒng)的工作原理是crRNA(CRISPR-derivedRNA)通過(guò)堿基配對(duì)與tracrRNA(trans-activatingRNA)結(jié)合形成tracrRNA/crRNa復(fù)合物,此復(fù)合物引導(dǎo)核酸酶Cas9蛋白在與crRNA配對(duì)的序列靶位點(diǎn)剪切雙連DNA。而通過(guò)人工設(shè)計(jì)這兩種RNA,可以改造形成具有引導(dǎo)作用的sgDNA(shortguideRNA),足以引導(dǎo)Case9對(duì)DNA的定點(diǎn)切割。作為一種RNA導(dǎo)向的dsDNA結(jié)合蛋白,cas9效應(yīng)物核酸酶是已知的第一個(gè)統(tǒng)一因子(unifyingfactor),能夠共定位RNA、DNA和蛋白,從而擁有巨大的改造潛力。將蛋白與無(wú)核酸酶的Case9(Cas9nuclease-null)融合,并表達(dá)適當(dāng)?shù)膕gDNA,可靶定任何dsDNA序列,而sgDNA的末端可連接到目標(biāo)DNA,不影響cas9的結(jié)合。因此,cas9能在任何dsDNA序列處帶來(lái)任何融合蛋白及RNA,這為生物體的研究和改造帶來(lái)巨大潛力。優(yōu)點(diǎn):1、靶向精確性更高。RNA靶向序列和基因組序必須完全匹配Cas9才會(huì)對(duì)DNA進(jìn)行剪切。2、可實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因多個(gè)位點(diǎn)同時(shí)敲出。3、實(shí)驗(yàn)周期短,最快僅需2個(gè)月,節(jié)省大量時(shí)間和成本。4、無(wú)物種限制。為何在篩選靶基因敲除的胚胎干細(xì)胞時(shí)還需經(jīng)歷陰性篩選過(guò)程?簡(jiǎn)述更昔洛韋(Ganciclovir)在胚胎干細(xì)胞陰性篩選中的作用機(jī)制。答:P24,26題基本概念siRNA&miRNA;Dicerprotein;RISC;PTGS答:siRNA:(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAaseⅢ家族中對(duì)雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發(fā)與之互補(bǔ)的目標(biāo)mRNA的沉默。miRNA:是在真核生物中發(fā)現(xiàn)的一類(lèi)內(nèi)源性的具有調(diào)控功能的非編碼RNA,其大小長(zhǎng)約20~25個(gè)核苷酸。成熟的miRNAs是由較長(zhǎng)的初級(jí)轉(zhuǎn)錄物經(jīng)過(guò)一系列核酸酶的剪切加工而產(chǎn)生的,隨后組裝進(jìn)RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體,通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)的方式識(shí)別靶mRNA,并根據(jù)互補(bǔ)程度的不同指導(dǎo)沉默復(fù)合體降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻譯。Dicerprotein:一種核糖核酸內(nèi)切酶,屬于RNaseIII家族中特異識(shí)別雙鏈RNA的一員,它能以一種ATP依賴的方式逐步切割由外源導(dǎo)入或者由轉(zhuǎn)基因,病毒感染等各種方式引入的雙鏈RNA,切割將RNA降解為19-21bp的雙鏈RNAs(dsRNAs),每個(gè)片段的3'端都有2個(gè)堿基突出。RISC:RNA-inducedsilencingcomplex(RISC):一種RNA-\o"醫(yī)學(xué)百科:蛋白質(zhì)"蛋白質(zhì)復(fù)合物,通過(guò)與目標(biāo)\o"醫(yī)學(xué)百科:mRNA"mRNA完全或者部分的互補(bǔ)配對(duì)來(lái)實(shí)施切割或者\(yùn)o"醫(yī)學(xué)百科:翻譯"翻譯\o"醫(yī)學(xué)百科:抑制"抑制\o"醫(yī)學(xué)百科:功能"功能。SiRNA組裝siRISC,\o"醫(yī)學(xué)百科:miRNA"miRNA組裝miRISC。RISCs(無(wú)論siRISC還是miRISC)包括兩種類(lèi)型:切割型和不切割型?,F(xiàn)在的研究表明,RISC當(dāng)中的\o"醫(yī)學(xué)百科:AGO"AGO蛋白質(zhì)決定了RISC是切割型的還是不切割型的。PTGS:轉(zhuǎn)錄后基因沉默:在基因轉(zhuǎn)錄后的水平上通過(guò)對(duì)靶RNA進(jìn)行特異性降解而使其失活。請(qǐng)說(shuō)明RNAi的作用機(jī)制。答:dsRNA進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),被一種具有類(lèi)似RNasetlI活性的核酸內(nèi)切酶Dicer結(jié)合,并被酶切成19~23nt的小干擾RNA(smallinterferenceRNA,siRNA),在ATP的作用下,siRNA與由多種蛋白質(zhì)結(jié)合形成且具有活性的RNA沉默復(fù)合物(RNA—in—ducedsilencingco1TIpiex,RISC)結(jié)合,RISC具有解螺旋酶的功能,使與其結(jié)合的siRNA雙鏈解螺旋成單鏈,釋放正義鏈,保留反義鏈,隨后識(shí)別并結(jié)合細(xì)胞內(nèi)與其反義鏈相互補(bǔ)的mRNA鏈。RISC將mRNA剪切成siRNA雙鏈,降解mRMA,使靶基因表達(dá)沉默。請(qǐng)分析解釋SUGuo的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。答:Su

Guo的實(shí)驗(yàn)證明了導(dǎo)入一個(gè)目的基因的正義與反義RNA可以達(dá)到敲除某個(gè)基因的效果。因?yàn)樵摶虻囊吧团c突變型在胚芽時(shí)有對(duì)稱與不對(duì)稱的差異,所以她想從RNA共抑制現(xiàn)象(以前的研究結(jié)果)的基礎(chǔ)上實(shí)現(xiàn)產(chǎn)生變異的效果,但是由于當(dāng)時(shí)還沒(méi)有研究清楚到底是哪種RNA起到了抑制的作用,所以她同時(shí)導(dǎo)入了正義與反義RNA,她當(dāng)時(shí)的分析是反義的RNA可以特異性的與mRNA結(jié)合,從而阻止RNA的翻譯以及以后的步驟,當(dāng)然最后她成功了,用現(xiàn)在的科學(xué)成果進(jìn)行分析和解釋?zhuān)捎谒龑?dǎo)入了正義與反義RNA,使得正義與反義RNA在細(xì)胞內(nèi)特異性的互補(bǔ)形成了dsRNA,然后在被Dicer酶切割為干擾dsRNA,然后隨著RISC形成并識(shí)別降解mRNA。什么是細(xì)胞凋亡?答:細(xì)胞凋亡是指為維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定,由基因控制的細(xì)胞自主的有序死亡。細(xì)胞凋亡有哪兩條主要的途徑?答:細(xì)胞凋亡信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的兩大途徑A:由死亡受體(FAS、TNFR)介導(dǎo)的外源途徑。在這條途徑中,啟動(dòng)capase-8首先被激活。B:線粒體介導(dǎo)的內(nèi)源途徑。在這條途徑中,啟動(dòng)caspase—9首先被激活。BCL—2家族的分類(lèi)和結(jié)構(gòu)特征?答:Bcl-2家族成員分為兩類(lèi)A:抗細(xì)胞凋亡,如Bcl-2、Bcl-xL、A1、Bcl-w、Mcl-1.在這類(lèi)分子中,都有Bcl-2同源區(qū)1-4的結(jié)構(gòu)。B:促進(jìn)細(xì)胞凋亡。在這類(lèi)分子中,又分為兩個(gè)亞族:Bax亞族,如Bax、Bak。Bok,有BH1、BH2和BH3的結(jié)構(gòu);BH-only亞族,如Bik,Bad,Bid、Bim,只有BH3的結(jié)構(gòu)。1988,Vaux等在依賴IL-3的B淋巴細(xì)胞中發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染Bcl-2基因能夠阻止剝奪了IL-3的B細(xì)胞的凋亡。因而,Bcl-2是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的靠阻止細(xì)胞死亡而非促進(jìn)細(xì)胞增殖起作用的癌基因。Bcl-2抗凋亡作用的機(jī)制:通過(guò)與促凋亡蛋白相互作用而抑制細(xì)胞凋亡。Bax是細(xì)胞凋亡促進(jìn)因子。Bax自身可以組成同二聚體,也可以與Bcl-2構(gòu)成異二聚體。Bcl-2與Bax蛋白量的比率決定異二聚體與同二聚體的比值。這對(duì)決定細(xì)胞凋亡的易感性起關(guān)鍵作用。如果Bcl-2的過(guò)度表達(dá),與BAx形成異二聚體中的Bax,使Bax游離而促進(jìn)細(xì)胞凋亡。Bad是細(xì)胞凋亡促進(jìn)因子。Bad可以置換Bcl-2/Bax異二聚體中的Bax,使Bax游離而促進(jìn)細(xì)胞凋亡。Bad缺乏典型的C端跨膜結(jié)構(gòu),說(shuō)明它并非一完整膜蛋白。P53基因在細(xì)胞DNA損傷中的作用?答:P53并非為所有細(xì)胞的凋亡過(guò)程所必需,但對(duì)DNA損傷而誘發(fā)的細(xì)胞凋亡卻是必不可少的。P53的兩大功能:A;使細(xì)胞在G1期停滯。當(dāng)DNA損傷后,P53首先誘導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)入G1期,抑制細(xì)胞增殖,直至損傷的DNA修復(fù)。B:一旦DNA不能被修復(fù),p53就會(huì)活化那些誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的基因轉(zhuǎn)錄,使細(xì)胞發(fā)生凋亡。轉(zhuǎn)錄組及蛋白組的概念分別是什么?其研究?jī)?nèi)容分別包括哪些方面?答:轉(zhuǎn)錄組指生命單元(通常是一種細(xì)胞)所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的可直接參與蛋白質(zhì)翻譯的mRNA總和,而其他所有非編碼RNA均可歸為RNA組。研究?jī)?nèi)容:目前,轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的側(cè)重點(diǎn)涉及基因轉(zhuǎn)錄的區(qū)域、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)、染色質(zhì)修飾、DNA甲基化位點(diǎn)等。蛋白組:細(xì)胞、組織或機(jī)體在特定時(shí)間和空間上表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究主要涉及兩個(gè)方面:一是蛋白質(zhì)組表達(dá)模式的研究,即結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)二是蛋白質(zhì)組功能模式的研究,即功能蛋白質(zhì)組學(xué)。(一)蛋白質(zhì)鑒定是蛋白質(zhì)組學(xué)的基本任務(wù)(二)翻譯后修飾的鑒定有助于蛋白質(zhì)功能的闡明(三)蛋白質(zhì)功能確定是蛋白質(zhì)組學(xué)的根本目的如何利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白組學(xué)的方法篩選相關(guān)基因?(寫(xiě)出主要的檢測(cè)指標(biāo)及其實(shí)驗(yàn)方法名稱)答:轉(zhuǎn)錄組的研究方法:cDNA芯片、基因芯片的探針。?;虮磉_(dá)系列分析技術(shù)(SAGE):①獲得能代表某一轉(zhuǎn)錄體特異性信息的標(biāo)簽(tag)約為9~14bp;②連接標(biāo)簽組成的DNA片段,即形成串聯(lián)體(Concatemer),進(jìn)行擴(kuò)增后測(cè)序分析,得到代表轉(zhuǎn)錄體信息的標(biāo)簽序列;③同一標(biāo)簽的重復(fù)次數(shù)代表該轉(zhuǎn)錄體的表達(dá)水平大規(guī)模平行信號(hào)測(cè)序系統(tǒng)(MPSS)其基本方法是從生物樣品中提取mRNA,將mRNA分子轉(zhuǎn)換成cDNA,通過(guò)固相克隆將該cDNA均勻地加載到特制的小分子載體表面,然后在小分子載體上進(jìn)行大量的PCR擴(kuò)增。將所有cDNA游離的一端進(jìn)行精確測(cè)序產(chǎn)生16至20個(gè)堿基。每一特定序列在整個(gè)生物樣品中所占的比例,就代表了含有該cDNA基因在樣品中的相對(duì)表達(dá)水平?;虮磉_(dá)聚類(lèi)分析。蛋白組研究方法:蛋白質(zhì)分離技術(shù):凝膠雙向電泳、HPLC蛋白質(zhì)鑒定技術(shù):Edman測(cè)序、質(zhì)譜技術(shù)圖像分析與生物信息:圖像分析軟件,數(shù)據(jù)庫(kù)相互作用研究技術(shù):酵母雙雜交技術(shù)、免疫共沉淀、蛋白質(zhì)芯片等。結(jié)合你的專(zhuān)業(yè),論述線粒體與醫(yī)學(xué)的關(guān)系。答:線粒體的主要功能是進(jìn)行氧化磷酸化,合成ATP,為細(xì)胞生命活動(dòng)提供能量。線粒體是糖類(lèi)、脂肪和氨基酸等物質(zhì)最終氧化釋能的場(chǎng)所。糖類(lèi)和脂肪等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)在細(xì)胞質(zhì)中經(jīng)過(guò)降解作用產(chǎn)生丙酮酸和脂肪酸,這些物質(zhì)進(jìn)入線粒體基質(zhì)中,再經(jīng)過(guò)一系列分解代謝形成乙酰輔酶A,即可進(jìn)一步參加三羧酸循環(huán)。三羧酸循環(huán)中脫下的氫,經(jīng)線粒體內(nèi)膜上的電子傳遞鏈(呼吸鏈),最終傳遞給氧,生成水。線粒體與帕金森氏癥(Parkinson’sdisease。PD)帕金森病是一種慢性神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,是由中腦黑質(zhì)致密部多巴胺神經(jīng)元選擇性變性死亡、紋狀體多巴胺減少所致,其發(fā)病機(jī)制目前并不很清線粒體呼吸鏈?zhǔn)求w內(nèi)氧自由基產(chǎn)生的主要部位,呼吸鏈中任何部位受到抑制都會(huì)使自由基產(chǎn)生增多。PD患者黑質(zhì)中線粒體酶復(fù)合體I缺陷會(huì)導(dǎo)致自由基產(chǎn)生增多,ATP合成減少。能量的減少會(huì)造成細(xì)胞內(nèi)離子失衡,膜電位下降,導(dǎo)致一些電壓依賴的Ca2+通道的持續(xù)開(kāi)放,造成ca2+急劇內(nèi)流,細(xì)胞內(nèi)ca2+增多,耗竭細(xì)胞內(nèi)ATP,同時(shí)通過(guò)活化蛋白酶、脂肪酶、核酸內(nèi)切酶,介導(dǎo)了興奮毒性的細(xì)胞損傷,造成神經(jīng)元死亡。近年來(lái)還發(fā)現(xiàn),線粒體控制核的程序化死亡(apoptosis),體外試驗(yàn)表明低濃度的MPP+對(duì)酶復(fù)合體I的抑制可以造成培養(yǎng)的多巴胺能神經(jīng)元的程序化死亡,而高濃度主要引起細(xì)胞的壞死舊J。Mo—chizuki等發(fā)現(xiàn)PD患者黑質(zhì)致密帶多巴胺能神經(jīng)元呈現(xiàn)程序化死亡,這些結(jié)果提示,在PD多巴胺能神經(jīng)元死亡的早期,可能存在由酶復(fù)合體I抑制引起的程序化死亡,以后隨著生化缺陷的加劇,而出現(xiàn)由程序化死亡向壞死的轉(zhuǎn)變。表明在PD早期如能改善線粒體功能,阻止程序化死亡加劇,將有助于保護(hù)殘存的神經(jīng)元,阻止疾病進(jìn)程。2.2線粒體與阿爾茨海默病(Alzheimer’sdisease.AD)阿爾茨海默病(AD)作為老年性癡呆的一種重要類(lèi)型,是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的一種漸進(jìn)性退行性疾病。目前,AD的病因研究較多,其中線粒體因在能量代謝、自由基產(chǎn)生、衰老和神經(jīng)退行性變等方面的特殊作用而倍受關(guān)注。線粒體功能異??蓪?dǎo)致一系列相互作用的損傷過(guò)程:能量代謝障礙以及基于鈣穩(wěn)態(tài)破壞和活性氧產(chǎn)生為基礎(chǔ)的神經(jīng)元興奮性毒性。許多證據(jù)表明,線粒體能量代謝障礙在AD的發(fā)生中占有重要地位。正電子斷層掃描(Positronemissiontomography.PET)檢查顯示AD患者腦組織氧化,并且能量代謝受損,表現(xiàn)為腦部葡萄糖利用減少,腦脊液中乳酸含量增高,而琥珀酸、延胡索酸、谷氨酰胺含量降低,這些表明AD患者腦線粒體氧化代謝過(guò)程受損。神經(jīng)能量代澍障礙和興旮眭毒性作用可升高細(xì)胞內(nèi)ca2+水平,導(dǎo)致活性氧等自由基的產(chǎn)生。由于AI)患者腦部神經(jīng)元中線粒體DNA氧化程度為正常水平的3倍,說(shuō)明引起氧化損傷的自由基可能主要來(lái)源于線粒體。線粒體損傷及功能改變?cè)诩?xì)胞凋亡中發(fā)揮重要作用:線粒體呼吸功能的降低、氧化磷酸化一電子傳遞偶聯(lián)受損、膜電位降低等線粒體功能的改變(其變化早于核固縮和細(xì)胞膜完整性的破壞),最終導(dǎo)致AD患者的神經(jīng)細(xì)胞凋亡。2.3線粒體與線粒體糖尿病(Maternallyinheriteddiabetes)線粒體基因突變糖尿病是糖尿病單基因致病類(lèi)型。在最新的糖尿病分型中把其列為特殊類(lèi)型糖尿病,屬于13細(xì)胞遺傳缺陷疾病p’。線粒體糖尿病人mtDNA基因的3243位點(diǎn)處鳥(niǎo)嘌呤取代了腺嘌呤,有研究認(rèn)為該突變引起mtD—NA轉(zhuǎn)錄和翻譯的異常,致使mtDNA氧化磷酸化(OXPHOS)過(guò)程受損,無(wú)法產(chǎn)生足夠的ATP,從而使B細(xì)胞胰島素分泌受到抑制。同時(shí),自由基產(chǎn)生過(guò)多,使線粒體功能進(jìn)一步受損,嚴(yán)重時(shí)B細(xì)胞可死亡。骨骼肌同樣也存在OXPHOS障礙,外周葡萄糖攝取減少,肌肉的糖酵解增加,從而促進(jìn)乳酸循環(huán),肝糖異生亢進(jìn),致血糖增高。

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