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文檔簡介

1、基因工程試驗綠色熒光蛋白(GFP)在E·coliBL21中的表達(dá)前言綠色螢光蛋白(green fluorescent protein),簡稱GFP,這種蛋白質(zhì)最早是由下村修等人在1962年在一種學(xué)名Aequorea victoria的水母中發(fā)現(xiàn)。分子質(zhì)量為26kDa,由238個氨基酸構(gòu)成,其基因所產(chǎn)生的蛋白質(zhì),在藍(lán)色波長范圍的光線激發(fā)下,會發(fā)出綠色螢光(第6567位氨基酸(Ser-Tyr-Gly)形成發(fā)光團,是主要發(fā)光的位置)。這個發(fā)光的過程中還需要冷光蛋白質(zhì)Aequorin的幫助,且這個冷光蛋白質(zhì)與鈣離子(Ca2+)可產(chǎn)生交互作用。其發(fā)光團的形成不具物種專一性,發(fā)出熒光穩(wěn)定,且不需

2、依賴任何輔因子或其他基質(zhì)而發(fā)光。綠色熒光蛋白基因轉(zhuǎn)化入宿主細(xì)胞后很穩(wěn)定,對多數(shù)宿主的生理無影響,是常用的報道基因。應(yīng)用:1 GFP作為報告基因GFP作為基因報告可用來檢測轉(zhuǎn)基因效率,把GFP基因連接到目的基因的啟動子之后,通過測定GFP的熒光強度就可以對該基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測。2 GFP作為融合標(biāo)簽GFP最成功的一類應(yīng)用就是把GFP作為標(biāo)簽融合到主體蛋白中來檢測蛋白質(zhì)分子的定位、遷移、構(gòu)象變化以及分子間的相互作用,或者靶向標(biāo)記某些細(xì)胞器。3.作為生物傳感器4. 檢測pH 野生型GFP和其許多突變體都具有依賴于pH的熒光變化,因而可以被用來檢測活細(xì)胞內(nèi)的pH。3.2.2 檢測鹵素離子 YFP(

3、H148Q)變體不但對pH敏感而且對不同離子也同樣敏感,故可以用來檢測亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中鹵素離子的濃度和傳遞17。5. 其他檢測應(yīng)用 另外,GFP可以應(yīng)用于檢測電位、氧化還原水平以及在信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中作為Ca2+指示劑18。6. GFP在細(xì)胞生物學(xué)上的應(yīng)用GFP具有同宿主蛋白構(gòu)成融合子的性質(zhì),利用這一性質(zhì),可以將GFP定位到特定的細(xì)胞器和膜系統(tǒng)中,進(jìn)行細(xì)胞生理過程、細(xì)胞動力學(xué)等的實時觀測,或直接應(yīng)用于定量分析。7.GFP在篩選方面的應(yīng)用1) GFP用于細(xì)胞的篩選 基于GFP的熒光特性,并且熒光穩(wěn)定以及檢測方法快速、方便,GFP在細(xì)胞篩選上得到應(yīng)用廣泛。2).GFP用于藥物的篩選 利用GFP對目的物進(jìn)行標(biāo)記

4、,追蹤GFP,分析目的物在細(xì)胞中的變化情況,如酶分子分布狀態(tài)、生物活性、受體、離子通道等變化,從而篩選出與體內(nèi)信號分子功能相似的化合物。一材料1.1試驗儀器1.5mL離心管,0.2mLPCR管,1mL吸頭,100uL吸頭,10uL吸頭,1mL移液器,100uL移液器,10uL移液器,電泳儀,三角瓶,試管,燒杯,量筒,記號筆,IPTG,氨芐青霉素,TAE緩沖液及其配制,瓊脂糖凝膠板及其制備。1.2試驗試劑大腸桿菌菌株:E. coli JM109;E. coli BL21質(zhì)粒:pCAMBIA還有GFP基因,作為模板;pMD19-T克隆載體(T載體),用于PCR產(chǎn)物的克?。籶ET21b大腸桿菌中的表

5、達(dá)載體,表達(dá)外源基因用。培養(yǎng)基:LB液體培養(yǎng)基,LB固體培養(yǎng)基。試劑:taqDNA聚合酶,T4DNA連接酶,氨芐青霉素,限制性內(nèi)切酶:EcoRI,HindIII;IPTG;質(zhì)粒提取試劑盒和膠回收試劑盒(北京康為世紀(jì)生物科技有限公司),大腸桿菌感受態(tài)(takala,大連寶生物公司);瓊脂糖,TAE buffer,PCR相關(guān)試劑:10Xbuffer,dNTP,Mg2+, H2O。二試驗方法實驗路線:用pCAMBIA載體作為模板-PCR擴增GFP基因- DNA電泳檢測有無PCR產(chǎn)物-PCR產(chǎn)物和T載體連接-轉(zhuǎn)化大腸桿菌JM109,涂0.2mL菌液和氨芐青霉素于LB平板,37C培養(yǎng)過夜-含重組質(zhì)粒(p

6、MD18T-GFP)陽性克隆的篩選-陽性菌株接種5mL LB液體試管-37C培養(yǎng)過夜-提質(zhì)粒(質(zhì)粒提取試劑盒)-酶切質(zhì)粒(EcoRI/HindIII),同時將pET21b載體做同樣雙酶切-電泳觀察-回收pET21b載體和GFP基因片段(膠回收試劑盒)-GFP和pET21b連接-轉(zhuǎn)化大腸桿菌JM109,涂0.2mL菌液和氨芐青霉素于LB平板,37C培養(yǎng)過夜-挑取陽性克隆-接種5mL LB液體試管,37C培養(yǎng)過夜-提質(zhì)粒-轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21-涂0.2mL菌液,IPTG和氨芐青霉素于LB平板,37C培養(yǎng)過夜-此日在紫外線下觀察結(jié)果,看是否有綠色熒光出現(xiàn)在大腸桿菌菌落上。2.1 PCR擴增GFP模板

7、(25ul)2.1.1在滅菌的PCR管里,依次加入:ddH2O 16.5µ l 10× PCR Buffer(含) 2.5µ l Mg2+ 0.5µ l dNTP(10mM) 2µ l引物 1µ l個模板DNA 1µ lTaq酶(5U/µ l) 0.5µ l總體積 25µ l2.1.2混合后按下面程序進(jìn)行擴增 94 5min 94 45s 58 45s(30個循環(huán)) 72 1min30s 72 10min 4 2.1.3 GFP擴增引物:5端引物:CCGGAATTCGATGGTAGATCTGAC

8、 3' EcoR I3端引物:CCCAAGCTTTCACACGTGGTGGTG 3 Hind III2.2電泳取8µl采用1%瓊脂糖凝膠電泳檢查產(chǎn)物情況2.3和PMD-18T連接轉(zhuǎn)化E.coliJM109挑選陽性克隆培養(yǎng)取5µlPCR擴增產(chǎn)物與大腸桿菌感受態(tài)混合均勻,在0吸附30分鐘,在42熱激30秒(大腸桿菌膨脹,細(xì)胞表面DNA進(jìn)入細(xì)胞),再在0保溫2-3分鐘(使細(xì)胞收縮,防止進(jìn)入細(xì)胞的DNA再出來),加入20µlLB培養(yǎng)基在37的溫度條件下在搖床上震蕩45分鐘,取出一定量的培養(yǎng)物涂平板,培養(yǎng)12-16小時。2.4提質(zhì)粒2.4.1取15毫升個過夜培養(yǎng)的菌

9、懸液,加入離心管中,12000rpm離心1分鐘,盡量吸去上清。注意:如果所提質(zhì)粒為低拷貝質(zhì)?;虼笥?0kb的大質(zhì)粒,應(yīng)加大菌體使用量,同時按比例增加BufferP1,P2,N3的用量;可以適當(dāng)延長吸附和洗脫時間,以提高洗脫效率。2.4.2向留有菌體沉淀的離心管中加入250微升BufferP1,使用移液器或渦旋振蕩器徹底懸浮細(xì)菌沉淀。注意:如果細(xì)菌未徹底混勻,將會影響裂解效果,使提取量和純度偏低。2.4.3向離心管中加入250微升BfferP2,溫和的上下顛倒混勻4-6次,使菌體充分裂解,此時菌液應(yīng)變的清亮粘稠。所用時間不應(yīng)超過5分鐘,以免質(zhì)粒受到破壞。注意:不要劇烈震蕩,以免造成所提質(zhì)粒中出現(xiàn)

10、基因組DNA污染。如果溶液未變的清亮,提示可能菌量過大,裂解不徹底,應(yīng)減少菌體量。2.4.4向離心管中加入350微升BufferN3,立即溫和的上下顛倒4-6次,此時將出現(xiàn)白色絮狀沉淀,12000rpm離心10分鐘,此時在離心管底部形成沉淀。注意:BufferN3加入后應(yīng)立即充分混勻,避免產(chǎn)生局部沉淀。如果上清中和還有微小白色沉淀,可再次離心后取上清。2.4.5柱平衡:向已裝入收集個管的吸附柱中加入200微升BufferPS,12000rpm離心2分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。2.4.6將步驟4中所得上清液加入到已裝入收集管的吸附中,注意不要析出沉淀,12000rpm離心

11、1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱放回收集管中。2.4.7向收集管中加入600微升BufferPW,12000rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的液體。2.4.8重復(fù)步驟7。2.4.9將吸附柱重新放回收集管中,12000rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液。將吸附柱置于室溫數(shù)分鐘,以徹底涼干。注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余乙醇去除,乙醇?xì)埩魰绊懞罄m(xù)的酶促反應(yīng)。2.4.10將吸附柱置于一個新的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50100微升BufferEB,室溫放置數(shù)分鐘,12000rpm離心1分鐘,將質(zhì)粒溶液收集到離心管中。-20保存質(zhì)粒.注意1)為了增加質(zhì)粒的回收效率,可將得到的溶液重

12、新加入到吸附柱中,重復(fù)步驟10.BufferEB在65-70水域預(yù)熱,適當(dāng)延長吸附和洗脫時間,可以增加提取效率。2)洗脫液的pH值對于洗脫效率有很大影響。若用水作洗脫液,應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5,pH值低于7會影響洗脫效率。3)如果使用TE洗脫,需要考慮其中含有的EDTA是否會影響后續(xù)的酶促反應(yīng)。2.5表達(dá)載體和目的蛋白的酶切酶切質(zhì)粒(EcoRI/HindIII),同時將pET21b載體做同樣雙酶切。2.6膠回收試劑盒組成Dp209_02(50次)Dp209_-3(200次)平衡液LB30ml120 ml溶液膠PN50 ml2*100 ml漂洗液pw15 ml50 ml洗脫緩沖液EB15

13、 ml30 ml吸附柱CA250個200個收集管(2ml)50個200個說明書1份1份2.6.1將單一目的DNA條帶從瓊脂糖凝膠中切下(盡量切出多余部分),放入干凈的離心管中,稱取重量。注意:若膠塊的體積過大,可將膠塊切成碎塊。2.6.2向膠塊中加入3倍體積BufferPG:當(dāng)瓊脂糖凝膠濃度2時,建議使用6倍體積BufferPG。2.6.3 50孵育10分鐘,其間不斷溫和的上下顛倒離心管,以確保膠塊充分溶解。入股還有微解的膠塊,可再補加一些溶膠液或繼續(xù)放置幾分,直至膠塊完全溶解。2.6.4 柱平衡:向已裝入收集管中的吸附柱中加入200微升BufferPs,12000rpm離心2分鐘,倒掉艘集管

14、中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。2.5.5將步驟3或步驟4中所得溶液加入到已裝入收集管的吸附柱中,室溫放置2分鐘,12000rpm離心1分鐘,倒掉吸附柱中的廢液,將吸附柱放回收集管中。2.6.6向吸附柱中加入650微升BufferPW,12000rpm離心1分鐘,倒掉吸附柱中的廢液,將吸附柱放回收集管中。2.6.7 12000rpm離心2分鐘,倒掉吸附柱中的廢液。將吸附柱置于室溫數(shù)分鐘,以徹底涼干。注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余乙醇去除,乙醇?xì)埩魰绊懞罄m(xù)的酶促反應(yīng)。2.6.8將吸附柱放到一個新離心管中,向吸附膜中間位置懸空滴加50微升BufferEB(pH8.5),室溫放置2分鐘,1

15、2000rpm離心2分鐘,收集DNA溶液。-20保存DNA。注意:1)洗脫液的pH值對于洗脫效率喲很大影響。若用水作洗脫液,應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5。2)為了提高DNA的回收量,可將離心得到的溶液重新滴加到吸附柱中,重復(fù)步驟10。3)洗脫體積不應(yīng)小于30微升,體積過少會影響洗脫效率。4)如果用TE脫,需要考慮其中含有的EDTA是否會影響后續(xù)的酶促反應(yīng)。5)回收大于10kb的DNA片段時,BufferEB應(yīng)在50水浴中預(yù)熱,適當(dāng)延長吸附和洗脫時間,可增加回收效率。2.7 重組質(zhì)粒的構(gòu)建2.7.1 jm109 和BL-21感受態(tài)細(xì)胞的制備1) 將04 保存的jm109和BL-21菌種分別接種

16、在LB液體培養(yǎng)基中37 下250 r/min過夜培養(yǎng)16 h 。2) 將分別接種過夜菌:LB按1:50的比例接種于2 mL的LB液體培養(yǎng)基中,37 活化培養(yǎng)23 h至OD=0.30.5 。3) 取1.5 mL菌液轉(zhuǎn)入EP管中,置于冰上10 min, 然后于4 下5000 r/min離心5 min。棄上清液,沉淀加入0.1 mL預(yù)冷的0.1 mol/L CaCl2緩和懸菌。冰上放置15-30 min后,4 下5000 r/min離心10 min。4) 棄上清液,沉淀用0.1 mL預(yù)冷的0.1 mol/L CaCl2(含15%甘油)緩和懸菌,放在20 冰箱內(nèi)保存。2.7.1 感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化1)

17、取制備好的感受態(tài)細(xì)胞100 l,冰上解凍,均勻懸浮。2) 加入2 l酶連產(chǎn)物,輕輕混勻,冰上靜置10-30 min。3) 42 水浴中熱擊70 sec后,冰上放置2 min。4) 加入200 l LB液體培養(yǎng)基,37 ,50-100 rpm振蕩培養(yǎng)1 h。5) 取200 l懸浮細(xì)胞涂布在含合適抗生素的LB固體培養(yǎng)基上,用涂布器均勻涂布,平皿正放靜置1-2 h后,封口膜封好平皿, 37 培養(yǎng)倒置12-16 h。2.7.3 堿法提質(zhì)粒1) 感受態(tài)細(xì)胞經(jīng)轉(zhuǎn)化培養(yǎng)后,平皿內(nèi)有但菌落長出。2) 用滅菌吸頭挑取單菌落,浸沒于2 mL含有抗生素的LB液體培養(yǎng)基中,37 , 180 r/min振蕩培養(yǎng)過夜。3

18、) 取1.5 ml 培養(yǎng)物倒入微量離心管中,用微量離心機于4 、11000 r/min 離心1分鐘,吸棄上清。4) 向離心管中加入150 ml用冰預(yù)冷的溶液,用微量移液器吹打重懸沉淀。5) 加入200 ml新配制的溶液 ,蓋緊管口,快速顛倒離心管5次,冰上放置5分鐘。6) 加入150 ml用冰預(yù)冷的溶液 ,輕輕混勻,冰上放置35分鐘。7) 用微量離心機于4 、11000 r/min離心5分鐘,吸取上清轉(zhuǎn)移到另一離心管。8) 加等體積氯仿400 ml抽提,振蕩混勻,用微量離心機于4 、11000 rpm離心2分鐘,將上清轉(zhuǎn)移到另一離心管中。9) 吸取上清液300 ml,向上清中加入2倍體積的無水

19、乙醇,混勻后,于室溫放置2分鐘;用微量離心機于4 、11000 rpm離心5分鐘,棄上清。10) 用70%乙醇洗滌2次,再次4 、11000 rpm離心5分鐘,沉淀于空氣中干燥。向已干燥的離心管內(nèi)加20 ml超純水溶解質(zhì)粒DNA,加入2 ml 10 mg/ml RNA酶,37 處理1小時后于-20 貯存。2.7.4 酶切鑒定1) 取提取的質(zhì)粒8 ml于另一微量離心管中,加入2 ml Bam H I和Not I的酶切混合液,輕彈管外混勻反應(yīng)物。2) 離心,使溶液聚集在管底部。3) 37 ,酶切反應(yīng)。2.7.5 瓊脂糖凝膠電泳1) 稱取0.8 g瓊脂糖,放入到錐形瓶中,加入100 mL 1

20、5;TAE緩沖液,置微波爐或水浴加熱至完全融化,冷卻至60 左右。2) 輕緩倒入封好兩端和加上梳子的電泳膠板中,靜置冷卻30分鐘以上。3) 將膠板除去封膠帶,加電泳緩沖液至電泳槽中,加液量要使液面沒過膠面1-1.5毫米,輕輕拔除梳子。4) 吸取10 ml的質(zhì)粒與2 ml的上樣液混勻,吸取混合液將加入加樣孔。5) 接通電泳槽與電泳儀的電源,設(shè)置電泳數(shù)據(jù)U=100 V, I=30 mA。6) 當(dāng)溴酚藍(lán)染料移動到距凝膠前沿1-2 cm處,停止電泳。7) 在凝膠成像分析系統(tǒng)中觀察結(jié)果。2.7.6 PCR-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)1) 將PCR管放置在冰盒上,按如下表格加入PCR反應(yīng)體系各成分PCR反應(yīng)體系各成分

21、的量template0.1 mlP1(20 mM)0.2 mlP2(20 mM)0.2 mldNTPs(10 mM)0.4 mlTaqs(5 U/ml)0.2 ml10×PCR buffer2 mlddH2O16.9 mlTotal20 ml2) 將PCR管放入PCR儀中,設(shè)定PCR儀的循環(huán)參數(shù)。預(yù)變性95 3 min,變性95 30 s,退火60-55 30 s,延伸72 1 min 10個循環(huán),每個循環(huán)降0.5 。變性95 30 s,退火55 30 s,延伸72 1 min 20個循環(huán),72 延伸 2 min。3) PCR擴增完畢后,取出PCP管放在冰盒上。4) 取8 ml擴增后

22、產(chǎn)物,進(jìn)行瓊脂糖電泳檢測。2.7.7 pET-21b-GFP重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌jm109 1) 取100 l感受態(tài)jm109,冰上慢速解凍,均勻懸浮。加入2 l經(jīng)過酶切鑒定成功提取重組質(zhì)粒pET-28a-GFP,輕輕混勻,冰上靜置10-30 min。2) 42水浴熱激70 s,冰上放置2 min。3) 加入200 l 含抗生素的LB液體培養(yǎng)基,37 ,60 r/min震蕩培養(yǎng)30 min。4) 吸取200 l菌液涂布于含抗生素的LB平板上,用涂布器均勻涂布,平皿正放靜置1-2 h后,封口膜封好平皿, 37 培養(yǎng)倒置12-16 h。2.8轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21,重組綠色熒光蛋白(GFP)的誘導(dǎo)

23、表達(dá)。1) 挑選陽性克隆,取GFP重組菌接種于5 ml LB培養(yǎng)液(含Kana 100 mg/l)中,37 150-220 r/min過夜培養(yǎng)。2) 取100 l感受態(tài)BL21,冰上慢速解凍,均勻懸浮。加入2 l經(jīng)過酶切鑒定成功提取重組質(zhì)粒pET-28a-GFP,輕輕混勻,冰上靜置10-30 min。3) 42水浴熱激70 s,冰上放置2 min。4) 加入200 l 含抗生素的LB液體培養(yǎng)基,37 ,60 r/min震蕩培養(yǎng)30 min。5)吸取200ul菌液在涂有氨芐青霉素和IPTG培養(yǎng)基LB平板繼續(xù)培養(yǎng),37過夜. 4) 用紫外線照射菌體沉淀,保存照片。三實驗結(jié)果和分析在紫外燈的照射下,

24、培養(yǎng)基呈現(xiàn)綠色熒光。實驗成功。參考文獻(xiàn)1 梁國棟. 最新分子生物學(xué)實驗技術(shù) M . 北京: 科學(xué)技術(shù)出版社, 2001, 174.2 賈艷華,李國勛,張杰 熒光蛋白及其應(yīng)用3 Katharine Sanderson 2008 年諾貝爾化學(xué)獎成果:綠色熒光蛋白(GFP)的研究分子植物育種 624 Shimomura O,Johnson FH,Saiga Y. Extraction, purification and properties of aequorin, abioluminescent protein from the luminous hydromedusan, Aequorea J.

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26、as a reporter of gene exp ression and p rotein localization. biotechniques, 1995, 19 (4) : 6507 Phillip s GJ. Green fluorescent p rotein - a bright idea for the study of bacterial p rotein localization. FEMSmicrobial Lett, 2001, 204 (1) : 98 ChalfieM, Tu, EKivchen G, et al. Green fluorescent p rotein as a marker forgene exp ression. Science, 1994, 263(5148) : 8029 ChalfieM. Green fluorescent p rotein. Photochem Photobiol, 1995, 62 (4) : 65110 Larrick JW, Balint RF, Youvan

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