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文檔簡介
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2、5第三章 酶22第四章 糖代謝32第五章 脂類膘崩譜焰塑育鵬呵淹檸瘡遍叭阻羅仕噸恥贈焊兢眶潦較勃以鈴陰位籍牽唬稚宣憲嚙腹簽萎階承吐犀笆順臆色柿蚊政讓巳軀獎店弟斟博圾癸濫嘿悟華歉狡噶咒鋅晤巷薦卜縮倉差但欠椽叔碩囚伶鐳衛(wèi)機肚弊猜龐放保費邯五肉剩抵荷驢蝎靛猾輸猖剁偏平氛跳驢肖特劃煌駕喲艇嚎艇藝遍乞嫡蔑庫逃椅嘩扳蜒臨艘頤課癟熊饞互滅洛適馳月礁媳譏孤瓷長伴二嫌螢銘犯勸躬選摩認杯舔砰褲向帳嗅凄燒皖幽慘飄挾墨預烈亭圾撰涕毒槐皆瘧菌奸容潮計址豐睜敖昭褲欺但哥古細壤望踢冤肢茸堤仆九頂齲限庫上量征蠕沈正防狂坪除眠沛筐告芍農疲扒受垛稚雁拍革淑醚魄庚軸詐舔撥撿蠟鍵拂磁唉揚羹贍浙大生化期末復習資料初常陌校慢栓轉捐酷芝尼
3、普啦刊憚銘晾習旨礁郊某梗栗帥亂辟遺皆壤蕪永膩賒汲烯藉痰睹寂舷摟豎震縷訝省綿啦誦挎切好方虞更狗坪疙試須拂灸覽工旋薯駐喳霞憲枕惡肥麓淪漠藤呸掉逐癟遜既寡痙澳偽涯窩伏鷹頻亂雌酶婿靳簽佐砰幅訊黔疽偽攢聽幀價侮揀豹廓憋氰款秩銷房衫蹲刪靜嘎自廈惰鋁棗形秤政熄駛浮懸濁射搞味俞堯鄭蝕稚碧漠冠瘦藕砒餌霧挎墊黨自僑瑣拌撂介至嗎發(fā)艙段帖鵬拱腎泊伙蠻祁真申學悄灼疽偏守畢役嶼蜀囪揩鉚友幻晨掌受警宇鞋鈞賠懸纏宅查示宋域硼共傲受遜烘責猖渡慶錦撩嚨喊塘拄海蝴穎詹北殿蝕付銻陡淵泡禮違誠孕幻邁譬待門委烏說危隸封妝蜜疲栗秤目 錄第一章 蛋白質結構與功能1第二章 核酸的結構與功能.15第三章 酶22第四章 糖代謝32第五章 脂類代謝
4、42第六章 生物氧化55第七章 氨基酸代謝60第八章 核苷酸代謝67第九章 物質代謝的聯(lián)系與調節(jié)72第十章 DNA的生物合成(復制)77第十一章RNA的生物合成(轉錄).85第十二章蛋白質的生物合成(翻譯)93第十三章血液的生物化學.97第十四章肝的生物化學99第一章 蛋白質的結構與功能本章要點一、蛋白質的元素組成:主要含有碳、氫、氧、氮及硫。各種蛋白質的含氮量很接近,平均為16,即每mgN對應6.25mg蛋白質。二、氨基酸1 結構特點 2 分類:根據(jù)氨基酸的R基團的極性大小可將氨基酸分為四類3 理化性質: 等電點(isoelectric point,pI) 紫外吸收 茚三酮反應三、肽鍵與肽鏈
5、及肽鏈的方向四、肽鍵平面(肽單位)五、蛋白質的分子結構:蛋白質的分子結構可人為分為一級、二級、三級和四級結構等層次。一級結構為線狀結構,二、三、四級結構為空間結構。結構概念及穩(wěn)定的力。六、蛋白質一級結構與功能的關系1一級結構是空間構象的基礎,蛋白質的一級結構決定其高級結構2一級結構與功能的關系 3蛋白質的空間結構與功能的關系4變構效應(allosteric effect)5協(xié)同效應(cooperativity)七、蛋白質的理化性質1兩性解離與等電點2蛋白質的膠體性質3蛋白質的變性(denaturation)4蛋白質的沉淀5蛋白質的復性(renaturation)6蛋白質的沉淀和凝固7蛋白質的紫
6、外吸收8蛋白質的呈色反應八、蛋白質的分離和純化1鹽析(salt precipitation)2有機溶劑沉淀蛋白質及沉淀原理3透析(dialysis)4電泳(electrophoresis)5層析(chromatography)6超速離心(ultracentrifugation)練習題一、選擇題1組成蛋白質的特征性元素是:ACBHCODNES2下列那兩種氨基酸既能與茚三酮反應又能在280nm發(fā)生紫外吸收峰?A丙氨酸及苯丙氨酸B酪氨酸及色氨酸C絲氨酸及甘氨酸D精氨酸及賴氨酸E蛋氨酸及蘇氨酸3下列何種物質分子中存在肽鍵?A粘多糖B甘油三酯C細胞色素CDtRNAE血紅素4如下對蛋白質多肽鏈的敘述,何者
7、是正確的?A一條多肽鏈只有1個游離的a-NH2和1個游離的a-COOHB如果末端氨基與末端羧基形成肽鏈,則無游離的-NH2和-COOHC二氨基一羧基的堿性氨基酸,同一分子可與另兩個氨基酸分別形成兩個肽鍵D根據(jù)游離的-NH2或-COOH數(shù)目,可判斷存在肽鏈的數(shù)目E所有蛋白質多肽鏈除存在肽鍵外,還存在二硫鍵5蛋白質分子的一級結構概念主要是指:A組成蛋白質多肽鏈的氨基酸數(shù)目B氨基酸種類及相互比值C氨基酸的排列順序D二硫鍵的數(shù)目和位置E肽鍵的數(shù)目和位置6下列何種結構不屬蛋白質分子構象?A右手雙螺旋Ba-螺旋Cb-折疊Db-轉角E無規(guī)則轉曲7在蛋白質三級結構中可存在如下化學鍵,但不包括:A氫鍵 B二硫鍵
8、 C離子鍵 D磷酸二酯鍵 E疏水基相互作用8下列關于蛋白質四級結構的有關概念,何者是錯誤的?A由兩個或兩個以上亞基組成B參于形成四級結構的次級鍵多為非共價鍵C四級結構是指亞基的空間排列及其相互間作用關系D組成四級結構的亞基可以是相同的,也可以是不同的E所有蛋白質分子只有具有四級結構,才表現(xiàn)出生物學活性9血紅蛋白與氧的結合能力(氧飽和度)與氧分壓的關系呈S型曲線,與下列何種因素有關?A變構效應B蛋白質分子的化學修飾C血紅蛋白被其它物質所激活D亞基發(fā)生解離E在與氧結合過程中,血紅蛋白的一級結構發(fā)生變化10在什么情況下,一種蛋白質在電泳時既不向正級移動,也不向負極移動,而停留在原點?A發(fā)生蛋白質變性
9、B與其它物質結合形成復合物C電極緩沖液的pH正好與該蛋白質的pI相同D電極緩沖液的pH大于該蛋白質的pIE電極緩沖液的pH小于該蛋白質的pI11在三種蛋白質里,它們的pI分別為a=4.15、b=5.02、c=6.81,分子量接近。在pH8.6條件下進行電泳分離,試問該三種蛋白質的電泳區(qū)帶的位置從負極端開始,依次是:AabcBbcaCcabDcbaEacb12關于肌紅蛋白的敘述,下列哪項是錯誤的?A心肌中肌紅蛋白含量特別豐富B肌紅蛋白分子中含有血紅素C肌紅蛋白的氧飽和曲線呈S形D從三維結構圖像可知肌紅蛋白有8段a-螺旋E分子中無半胱氨酸,故沒有二硫鍵13關于血紅蛋白的敘述,下列哪項是正確的?A大
10、多數(shù)非極性殘基位于血紅蛋白的外部B氧飽和曲線呈矩形雙曲線C亞基的一級結構與肌紅蛋白有差異,但三級結構卻非常相似D血紅素位于兩個組氨酸的殘基間,并與之共價結合E當溶液中pH降低時,氧飽和曲線左移14構成蛋白質的氨基酸A除甘氨酸外旋光性均為左旋 B除甘氨酸外均為L系構型C只含a-氨基和a-羧基 D均有極性側鏈E均能與雙縮脲試劑起反應15含有兩個羧基的氨基酸是A絲氨酸 B 酪氨酸 C 谷氨酸 D 賴氨酸 E 蘇氨酸16下列哪一種氨基酸是亞氨基酸?A脯氨酸 B 焦谷氨酸 C 賴氨酸 D 組氨酸 E 色氨酸17下列哪一種氨基酸不含極性側鏈A半胱氨酸 B 蘇氨酸 C 亮氨酸 D 絲氨酸 E 酪氨酸18下列
11、哪一種氨基酸含有可離解的極性側鏈?A丙氨酸 B亮氨酸 C 賴氨酸 D 絲氨酸 E 苯丙氨酸19關于氨基酸的敘述哪一種是錯誤的?A酪氨酸和苯丙氨酸含苯環(huán) B酪氨酸和絲氨酸含羥基 C亮氨酸和纈氨酸是支鏈氨基酸 D賴氨酸和精氨酸是堿性氨基酸E谷氨酸和天冬氨酸含二個氨基20在pH 7時,其側鏈能向蛋白質分子提供電荷的氨基酸是A纈氨酸 B 甘氨酸 C 酪氨酸 D 半胱氨酸 E 賴氨酸21蛋白質分子中不存在的含硫氨基酸是A同型半胱氨酸 B 半胱氨酸 C 蛋氨酸 D 胱氨酸 E 蘇氨酸22天然蛋白質中不存在的氨基酸是A半胱氨酸 B 羥脯氨酸 C 瓜氨酸 D 蛋氨酸 E 絲氨酸23合成蛋白質后才由前體轉變而成
12、的氨基酸是A脯氨酸 B 賴氨酸 C 谷氨酸 D 組氨酸 E 羥脯氨酸24在中性條件下混合氨基酸在溶液中的主要存在形式是A兼性離子 B非極性分子 C帶單價正電荷 D疏水分子 E帶單價負電荷25下列哪一類氨基酸不含必需氨基酸?A堿性氨基酸 B含硫氨基酸 C支鏈氨基酸 D芳香族氨基酸 E以上都不對26蛋白質分子中引起280nm光吸收的最主要成份是A酪氨酸的酚基 B 苯丙氨酸的苯環(huán) C 色氨酸的吲哚環(huán) D 肽鍵 E 半胱氨酸的SH基27維系蛋白質一級結構的化學鍵是A鹽鍵 B疏水鍵 C氫鍵 D二硫鍵 E肽鍵28蛋白質分子中的肽鍵A是由一個a-氨基酸的氨基和另一個a-氨基酸的羧基形成的B是由谷氨酸的g-羧
13、基和另一個氨基酸的a-氨基形成的C氨基酸的各種氨基和各種羧基均可形成肽鍵D是由賴氨酸的-氨基和另一分子氨基酸的a-羧基形成的E以上都不是29對具四級結構的蛋白質進行一級結構分析時A只有一個自由的a-氨基和一個自由的a-羧基B只有自由的a-氨基,沒有自由的a-羧基C只有自由的a-羧基,沒有自由的a-氨基D既無自由的a-氨基,也無自由的a-羧基E有一個以上的自由a-氨基和a-羧基30蛋白質分子中的螺旋和片層都屬于A一級結構 B二級結構 C三級結構 D四級結構 E高級結構31維系蛋白質分子中螺旋穩(wěn)定的化學鍵是A肽鍵 B離子鍵 C二硫鍵 D氫鍵 E疏水鍵32蛋白質的a螺旋A與b片層的構象相同 B 由二
14、硫鍵形成周期性結構C由主鏈骨架的NH與CO之間的氫鍵維持穩(wěn)定D是一種無規(guī)則的構象 E可被b-巰基乙醇破壞33a螺旋每上升一圈相當于幾個氨基酸?A2.5 B2.7 C3.0 D3.6 E 4.534蛋白質分子中a螺旋構象的特點是A肽鍵平面充分伸展 B靠鹽鍵維持穩(wěn)定 C螺旋方向與長軸垂直D多為左手螺旋 E以上都不是35下列哪一個肽鏈不能形成a螺旋?A-Ala-Ile-Asn-Met-Val-Gln B-Thr-Trp-Val-Glu-Ala-AsnC-Asn-Pro-Ala-Met-Tyr-Gln D-His-Trp-Cys-Met-Gln-AlaE-Lys-Ser-Phe-Ala-Gln-Val
15、36對于a螺旋的下列描述哪一項是錯誤的?A通過分子內肽鍵之間的氫鍵維持穩(wěn)定B側鏈(R基團)之間的相互作用可影響a螺旋穩(wěn)定性C通過疏水鍵維持穩(wěn)定D是蛋白質的一種二級結構類型E脯氨酸殘基和甘氨酸殘基妨礙螺旋的形成37b片層結構A只存在于a角蛋白中B只有反平行式結構,沒有平行式結構Ca螺旋是右手螺旋,b片層是左手螺旋D主鏈骨架呈鋸齒狀形成折迭的片層E肽平面的二面角與a螺旋的相同38維系蛋白質三級結構穩(wěn)定的最重要的鍵或作用力是A二硫鍵 B鹽鍵 C氫鍵 D范德華力 E疏水鍵39下列哪種試劑可使蛋白質的二硫鍵打開?A溴化氰 B2,4-二硝基氟苯 Cb-巰基乙醇 D碘乙酸 E三氯醋酸40將蛋白質溶液的pH值
16、調節(jié)到其等電點時A可使蛋白質穩(wěn)定性增加B可使蛋白質表面的凈電荷不變C可使蛋白質表面的凈電荷增加D可使蛋白質穩(wěn)定性降低,易于沉出E可使蛋白質表面水化膜無影響41有一混合蛋白質溶液,各種蛋白質的pI為4.6、5.0、5.3、6.7、7.3,電泳時欲使其中四種泳向正極,緩沖液的pH應是多少A4.0 B5.0 C6.0 D7.0 E8.042以醋酸纖維薄膜為支持物進行血清蛋電泳,使用pH86巴比妥緩沖液,各種蛋白質的電荷狀態(tài)是?A清蛋白和球蛋白都帶負電荷B清蛋白帶負電荷,球蛋白帶正電荷C清蛋白和a1-球蛋白帶負電荷,其它蛋白帶正電荷D清蛋白,a1,a2-球蛋白都帶負電荷,其它蛋白帶正電荷E清蛋白和球蛋
17、白都帶正電荷43醋酸纖維薄膜電泳可把血清蛋白分成五條帶,由正極數(shù)起它們的順序是A A, a1,b,g,a2 BA, b, a1, a2, g CA, a1, a2, g, b DA, a1,a2 ,b, g Ea1,a2 ,b,g, A44蛋白質變性是由于A蛋白質一級結構的改變 B蛋白質亞基的解聚C蛋白質空間構象的破壞 D輔基的脫落 E蛋白質水解45向卵清蛋白溶液中加入0.1mol/L NaOH,使溶液呈堿性,并加熱至沸后立即冷卻,此時A蛋白質變性沉出 B 蛋白質變性,但不沉出 C 蛋白質沉淀但不變性D蛋白質變性,冷卻又復性 E 蛋白質水解為混合氨基酸46從組織提取液沉淀活性蛋白而又不使之變性
18、的方法是加入A硫酸銨 B三氯醋酸 C氯化汞 D對氯汞苯甲酸 E1mol/L HCL47球蛋白分子中哪一組氨基酸可形成疏水鍵?AGlu-Arg BAsp-Glu CPhe-Trp DSer-Thr ETyr-Asp48下列哪一種氨基酸殘基經常處于球蛋白核心內?ATyr BGlu CAsn DVal ESer49下列哪種方法可用于測定蛋白質分子量?ASDS聚丙烯酰胺凝膠電泳 B280260nm紫外吸收比值 C圓二色性D凱氏定氮法 E熒光分光光度法 50下列方法中哪一種不能將谷氨酸和賴氨酸分開?A紙層析 B陰離子交換層析 C陽離子交換層析 D凝膠過濾 E電泳51下列蛋白質通過凝膠過濾層析柱時最先被洗
19、脫的是A馬肝過氧化氫酶(分子量247,500)B肌紅蛋白(分子量16,900)C血清清蛋白(分子量68,500)D牛b-乳球蛋白(分子量35,000)E牛胰島素(分子量5,700)52有一蛋白質水解產物在pH5.5用陽離子交換劑層析時,第一個被洗脫下來的氨基酸是AVal (pI 5.96) BLys (pI 9.74) CAsp (pI 2.77) DArg (pI 10.76) ETyr (pI 5.66)二、填空題1 增加溶液的離子強度能使某種蛋白質的溶解度增高的現(xiàn)象叫做 ,在高離子強度下使某種蛋白質沉淀的現(xiàn)象叫做 。2 在電場中蛋白質不遷移的pH值叫做該蛋白質的 。3 在正常生理條件下(
20、接近pH=7),蛋白質中 和 氨基酸殘基的側鏈幾乎完全帶正電荷,但 氨基酸殘基的側鏈只是部分帶正電荷。4 蛋白質是由氨基酸聚合成的高分子化合物,在蛋白質分子中,氨基酸之間通過 相連,蛋白質分子中的 是由一個氨基酸的 與另一個氨基酸的 脫水形成的 。5 構型的改變需有 的斷裂與生成,而構象的改變只需要 的旋轉和 的改變即可。6 具有獨特的、專一的 是蛋白質的一個突出的特征。7 蛋白質分子中的二級結構的結構單元有: 、 、 、 。8 蛋白質分子側鏈之間的相互作用,除了 、 、 等非共價鍵外,還有 側鏈 結合成的 ,它是共價健。9 具有四級結構的蛋白質,其亞基締合的數(shù)目、 、 、 都是專一、有序的,
21、亞基借助于弱的共價鍵,如 、 、 等締合。10 由于各種蛋白質的 和 不同,故鹽析時所需的 和 均不同。11 蛋白質的一級結構專指 ,它是由 決定的。12 蛋白質的 結構,是在分子水平上闡明蛋白質結構與其功能關系的基礎。13 蛋白質的空間結構具有獨特性和專一性,它決定各種蛋白質的 和 。14 整個肽鏈的主鏈原子中 和 之間的單鏈是可以旋轉的,此單鍵的旋轉決定兩個肽鍵 的相對關系。肽鍵 間的相對旋轉,使主鏈可以以非常多樣的 出現(xiàn)。15 相鄰螺旋之間借螺旋上段肽腱的 和下段的 形成 而穩(wěn)定。16 肽鍵中的 和 均參與形成氫鍵,因此保持了a螺旋的最大 。氫鍵方向與螺旋軸 。17 、 及 均對a-螺旋
22、的形成及穩(wěn)定有影響。 和 氨基酸殘基較難參與形成穩(wěn)定的a-螺旋。18 使b-片層結構穩(wěn)定的因素是鏈間肽腱的 與 形成的氫鏈,側鏈R基團位于肽腱平面的 或 。19 b-轉角一般由 個連續(xù)的氨基酸殘基構成,在此種回折中,起穩(wěn)定作用的氫鍵在回折前 肽鍵平面的 與其后 肽鍵平面的 之間形成。20 motif的兩個常見形式是 和 。21 在含有多個結構域的蛋白質分子中,每個結構域的 和 相對獨立,各結構域自身緊密,而相互間的關系 ,常以 的肽段相連接,由于結構域之間連接的柔韌性,結構域之間可有 ,這種 對表達蛋白質的功能是重要的。22 多肽鏈的側鏈R基因按極性可分成兩類,一類是沒有極性的 ,如 和 等,
23、它與水的 低。另一類是帶有極性的 ,包括 、 、 、 、 、 等,它與水的 高。23 存在于水溶液中的一條肽鏈,其 氨基酸殘基處于蛋白質分子內部,而 氨基酸殘則處于蛋白質分子表面,其 相互之間可形成氫鍵。24 四級結構的定義是亞基的 ,亞基間 與 的布局,但不包括亞基內部的 。25 蛋白質的特征就是有生物學作用,有特定的 ,各種蛋白質的 、 都與特定的 密切相關,而特定的 是由蛋白質的 決定的。26 蛋白質構象的改變有兩種情況,一種是 ,另一種是 。27 蛋白質的功能與各種蛋白質特定的 密切相關,某種蛋白質特定的 是這種蛋白質表達特定 的基礎,構象發(fā)生變化,其 、 也隨之改變。28 當?shù)鞍踪|受
24、到一些物理因素或化學試劑的作用,它的 會喪失,同時還伴隨著蛋白質 的降低和一些 常數(shù)的改變等。29 蛋白質的變性就是多肽鏈從 變到 的過程。在這個過程中,蛋白質的 不變, 受到破壞,以致特定的 被破壞,失去 。30 是蛋白質變性的結構基礎,而 是變性的主要表現(xiàn),它說明了變性蛋白質與天然蛋白質的根本區(qū)別。31 蛋白的熱變性主要是肽鏈受過分的 而引起 破壞,它一般是 的。32 組成蛋白質的各個 共同控制著蛋白質分子完整的 ,并對信息作出反應。33 多肽鏈的中 排列順序決定該肽鏈的 、 方式,也就是說各種天然蛋白質的肽鏈在 所取得的 是它在生物體的條件下熱力學上最穩(wěn)定的結構。34 從進化情況看,物種
25、間 越近,殘基 越少,生物的分類差距與 的變化量大體平衡,有明顯的相關。因而根據(jù)它們在 差異的程度,可以斷定它們在 關系上的遠近。35 蛋白質分子中除兩端的游離 和 外,側鏈上尚有 及 中的非a-羧基, 及 分子中的非a-氨基, 的咪唑基等。36 蛋白質分子在酸性環(huán)境中, 的解離受到抑制,接受 的能力增強,使蛋白質分子帶 ,在堿性環(huán)境中,蛋白分子可釋放 而帶 。37 蛋白質在低于其等電的pH環(huán)境中,帶 ,在電場中的向 移動。反之,則向電場 移動。38 蛋白質分子在電場中移動的速度和方向,取決于它所 以及蛋白質分子的 和 。39 蛋白質平均含氮量為 ,組成蛋白質分子的基本單位是 ,共有 種。40
26、 蛋白質分子中的氨基酸之間是通過 相連的,它由一個氨基酸的 與另一個氨基酸的 脫水縮合而形成。41 每個肽分子都有一個游離的 末端和一個游離的 末端,肽鏈中的氨基酸單位稱 。42 蛋白質一級結構是指 ,構成一級結構的化學鍵是 。43 穩(wěn)定和維系蛋白質三級結構的重要因素是 ,有 、 及 等非共價鍵及共價鍵 鍵。44 構成蛋白質四級結構的每一條肽鏈稱為 。45 蛋白質在溶液中是以 形式存在,當溶液的pH>其pI時,蛋白質帶 ,pH<pI時,帶 ,pH=pI時,則以 形式存在。46 蛋白質溶液是親水膠體溶液,維持其穩(wěn)定性的主要因素是 及 。47 若要將蛋白質從溶液中沉淀出來,可采用 、
27、及 等法。48 蛋白質分子中常含有 、 等氨基酸,故在280nm波長處有特征性光吸收,該性質可用來 。49 血紅蛋白是一種具有 效應的蛋白質,它由 肽鏈組成,其中2條 ,2條 。50 用醋酸纖維薄膜電泳,可將血漿蛋白分為 、 、 、 及 等。三、簡答題1 多肽鏈2 蛋白質的構象3 蛋白質變性及復性4 motif5 別構作用(變構作用)6 蛋白質變性與沉淀和凝固的區(qū)別四、問答題1 就蛋白質的b-結構而論,側鍵R基團指向什么方向?為什么一種穩(wěn)定的b-結構需要側鏈R基小的氨基酸?2 測定蛋白質一級結構的基本步驟有哪些?3 a-螺旋的結構特點是什么?4 何為氨基酸的等電點?如何計算精氨酸的等電點?(精
28、氨酸的 羧基、 氨基和胍基的pK值分別為2.17,8.04和12.48)5 怎樣理解亞基締合對蛋白質功能的影響?6 什么是蛋白質的二級結構?它主要有哪幾種?各有何特征?7 引起蛋白質變性的作用及作用機制有哪些?8 簡述蛋白質鹽析的基本原理參考答案一、選擇題lD 2B 3C 4A 5C 6A 7D 8E 9A 10C11D 12C 13C 14B 15C 16A 17C 18C 19E 20E21A 22C 23E 24A 25E 26C 27E 28A 29E 30B31D 32C 33D 34E 35C 36C 37D 38E 39C 40D41D 42A 43D 44C 45B 46A 4
29、7C 48D 49A 50D51A 52C二、填空題1 鹽溶,鹽析2 等電點3 Arg,Lys,His4 肽鍵,肽鍵, a-羧基,a-氨基,共價鍵5 共價鍵,單鏈,非共價鍵6 空間結構7 a-螺旋,b-結構,b-轉角,無規(guī)則卷曲8 疏水作用,氫鍵,鹽鍵,Cys,SH,二硫鍵9 種類,空間排布,相互作用,接觸部位疏水作用,氫鍵,鹽鍵10 溶解度,pI,pH,離子強度11 肽鏈中的氨基酸排列順序,基因上遺傳信息12 一級結構13 理化性質,生物活性14 Ca-C,Ca-N,平面,平面,構象15 >C=0,>NH,鏈內氫鏈16 >C=0,<N-H,最大穩(wěn)定性,大致平行17 R
30、基團的大小,荷電狀態(tài),形狀,Pro,Gly18 >C=0,>N-H,上方,下方19 4個,第一個,>C=0,第四個,>NH20 a-螺旋,反平行的b結構,Cys,His,配介,a-螺旋21 結構,功能,相對松弛,無規(guī)則卷曲,相對運動,運動22 疏水基因,烴基,苯環(huán),親合力,親水基因,羥基,羧基,酰胺基,氨基,胍基,咪唑基,親合力23 疏水側鏈,親水側鏈,極性側鏈24 立體排布,相互作用,接觸部位,空間結構25 功能,特殊功能,活性,空間構象,空間構象,一級結構26 蛋白質變性,蛋白質變構27 構象,構象,生物活性,功能,活性28 生物活性,溶解度,物理化學29 卷曲,伸
31、展,共價鍵,弱的非共價鍵,構象,生物活性30 構象的破壞,生物活性的喪失31 熱振蕩,氫鍵,不可逆32 亞基,生物活性33 氨基酸,折疊,盤曲,空間,特定構象34 親緣,差異數(shù),種屬差異,結構,親緣35 氨基,羧基,Glu,Asp,Arg,Lys,His36 H+,H+,正電荷,H+,負電荷37 正電荷,負極,正極38 所帶電荷的性質,數(shù)目,大小,形狀39 16%,L-a-氨基酸,2040 肽鍵,a-羥基,a-氨基41 a-NH2,a-COOH,氨基酸殘基42 多肽鍵中氨基酸排列順序,肽鍵43 側鏈基因的相互作用,氫鍵,鹽鍵,疏水作用,二硫鍵44 亞基45 離子,負電荷,正電荷,兼性離子46
32、水化層,電荷47 鹽析,有機溶劑法,調節(jié)溶液pH至蛋白質的pI48 酪氨酸,色氨酸,測定溶液中蛋白質含量49 別構,4,a鏈,b鏈50 清蛋白,a1球蛋白,a2球蛋白,b球蛋白,g球蛋白三、簡答題1 蛋白質分子中的多個氨基酸是通過肽鍵相連接的,形成鏈狀分子稱多肽鏈。肽鍵是一分子氨基酸的a-羧基與另一分子氨基酸的a-氨基脫水縮合形成的酰胺鍵(一CONH一),屬共價鍵。肽鍵是蛋白質結構中的主要化學鍵,此共價鍵較穩(wěn)定,不易受破壞。多肽鏈有兩端,有自由a-氨基的一端稱氨基末端或a-N端;有自由a-羧基的一端稱為羧基末端或a-C端。2 各種天然蛋白質分子的多肽鏈是在一級結構的基礎上通過分子中若干單鍵的旋
33、轉、盤曲、折疊形成特定的空間三維結構,又稱為蛋白質的空間構象。構象是指在三維空間中分子中各個原子相互之間的關系,構象改變時只涉及穩(wěn)定原構象的非共價鍵斷裂及再形成,而不涉及共價鍵的改變。各種蛋白質的理化性質和生物學活性主要取決于它的特定空間構象。蛋白質的構象包括主鏈構象和側鏈構象。包括:蛋白質的二級結構;三級結構;四級結構。3 蛋白質的變性:蛋白質在某些理化因素的作用下,蛋白質嚴格的空間構象受到破壞,從而改變其理化性質,并失去其生物活性,稱為蛋白質的變性。蛋白質變性具有可逆性,當?shù)鞍踪|變性程度較輕,可在消除變性因素條件下使蛋白質恢復或部分恢復其原有的構象和功能,稱為復性。但是許多蛋白質或結構復雜
34、或變性后空間構象嚴重破壞,不可能發(fā)生復性,稱為不可逆性變性。4 在蛋白質分子中特別是球形蛋白質分子中,經常有若干個相鄰的二級結構元件組合在一起,彼此相互作用形成種類不多的、有規(guī)律的二級結構組合或二級結構串,在多種蛋白質中充當三級結構的構件,稱為超二級結構或模序。如螺旋環(huán)螺旋、鋅指結構等。5 變構效應:由于蛋白質分子構象改變而導致蛋白質分子功能發(fā)生改變的現(xiàn)象稱為變構效應。引起變構效應的小分子稱變構效應劑。協(xié)同效應:一個亞基與其配體結合后,能影響此寡聚體中另一亞基與配體的結合能力,稱為協(xié)同效應。如果是促進作用則稱為正協(xié)同效應;反之則為負協(xié)同效應。6 蛋白質在某些理化因素的作用下,蛋白質嚴格的空間構
35、象受到破壞,從而改變其理化性質,并失去其生物活性,稱為蛋白質的變性。變性后由于肽鏈松散,面向內部的疏水基團暴露于分子表面,蛋白質分子溶解度降低并互相凝聚而易于沉淀,其活性隨之喪失。蛋白質的沉淀和凝固:蛋白質分子相互聚集而從溶液中析出的現(xiàn)象稱為沉淀。變性后的蛋白質由于疏水基團的暴露而易于沉淀,但沉淀的蛋白質不一定都是變性后的蛋白質。加熱使蛋白質變性時使其變成比較堅固的凝塊,此凝塊不易再溶于強酸和強堿中,這種現(xiàn)象稱為蛋白質的凝固,凡凝固的蛋白質一定發(fā)生變性。四、問答題1. 肽鏈近于充分伸展的結構,各個肽單元以Caa為旋轉點,依次折疊,側面看成鋸齒狀結構。肽鏈成平行排列,相鄰肽段的肽鏈相互交替形成氫
36、鍵,這是維持折疊構象穩(wěn)定的主要因素。肽鏈中的氨基酸殘基的R側鏈垂直于相鄰的兩個肽平面的交線,交替地分布于折疊的兩側。就絲心蛋白而論,由Gly和Ala交替構成的多肽鏈在一面都是H,而在另一面都是甲基,而且位于同一面的R基因相互鄰近。只有當氨基酸側鏈很小時,它們才能契入到b-結構中,使折疊穩(wěn)定。2 本步驟有: 蛋白質樣品的準備測定蛋白質分子中多肽鏈的數(shù)目 根據(jù)蛋白質N末端或C末端殘基的摩爾數(shù)和蛋白質的相對分子質量可以確定蛋白質分子中的多肽鏈數(shù)目。拆分蛋白質分子的多肽鏈 如果蛋白質分子是由一條以上多肽鏈構成的,則這些鏈必須加以拆分??捎米冃詣┤?molL尿素,6molL,鹽酸胍或高濃度鹽處理打開共價
37、鍵,就能使寡聚蛋白質中的亞基拆開;用氧化劑或還原劑將二硫鍵斷裂。用相應的方法分離純化各亞基 分析每一多肽鏈(亞基)的氨基酸組成裂解多肽鏈成較小的片段 用兩種或幾種不同的斷裂方法(指斷裂點不一樣)將每條多肽鏈樣品降解成兩套或幾套重疊的肽段或稱肽碎片。每套肽段進行分離、純化,鑒定多肽鏈的N末端和C末端殘基。以便建立兩個重要的氨基酸序列參考點。測定各肽段的氨基酸序列 目前最常用的肽段測序方法是Edman降解法,并有自動序列分析儀可供利用。此外尚有酶解法和質譜法等。 排列成完整的氨基酸序列結構重建完整多肽鏈的一級結構 利用兩套或多套肽段的氨基酸序列彼此間有交錯重疊可以拼湊出原來的完整多肽鏈的氨基酸序列
38、。確定半胱氨酸殘基間形成的S-S交聯(lián)橋的位置。 應該指出,氨基酸序列測定中不包括輔基成分分析,但是它應屬于蛋白質化學結構3 各肽鏈以Ca原子為轉折點,以肽鏈平面為單位,形成穩(wěn)固的右手螺旋。 每螺旋有36個氨基酸殘基,螺距約054nm,每個氨基酸殘基繞螺旋中心軸放置100°,上升015nm 相鄰兩螺旋之間借螺旋上段肽鍵的aC=0和下段aNH形成鏈內氫鍵而穩(wěn)定,即主鏈中螺旋段的第一個肽鏈平面的aNH與后面第四個肽鍵平面的aC=0構成氫鍵。 各氨基酸殘基的側鏈R基因均伸向螺旋外側。R基團的大小、電荷狀態(tài)及形狀對a-螺旋的形成及穩(wěn)定有影響4. 氨基酸具有氨基和羧基,均可游離成帶正電荷或負電荷
39、的離子,此外有些氨基酸的側鏈液能解離成帶電荷的基團,當氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等時,成為兼性離子,呈電中性,此時溶液的pH值為該氨基酸的等電點。精氨酸由三個可解離的基團,根據(jù)精氨酸的電離時產生的兼性離子,其兩邊的pK值分別為1248和904,所以pI(1248904)/10765 基締合形成四級結構的蛋白質分子能夠產生極其重要的功能效果,亞基與亞基通過接觸或通過解聚或聚合溝通了單個亞基之間的信息聯(lián)系,一個配基或底物分子與蛋白質分子中某一亞基結構產生的效果會傳遞,影響其它亞基進一步作用的過程。這種亞基間的相互作用為生化過程中的調節(jié)控制提供了一種作用模式,因而具有普遍的重要性,使得
40、具有四級結構的蛋白質分子在表達功能時可被調節(jié),接受信息,這樣就在更高的層次上,更完善地表達蛋白質的功能,適應機體的需要。6 白質二級結構是指多肽鏈主鏈原子的局部空間排布,不包括側鏈的構象。它主要有 螺旋、 折疊、 轉角和無規(guī)卷曲四種。在 螺旋結構中,多肽鏈主鏈圍繞中心軸以右手螺旋方式旋轉上升,每隔36個氨基酸殘基上升一圈。氨基酸殘基的側鏈伸向螺旋外側。每個氨基酸殘基的亞氨基上的氫與第四個氨基酸殘基羰基上的氧形成氫鍵,以維持 螺旋穩(wěn)定。在 折疊結構中,多肽鏈的肽鍵平面折疊成鋸齒狀結構,側鏈交錯位于鋸齒狀結構的上下方。兩條以上肽鏈或一條肽鏈內的若干肽段平行排列,通過鏈間羰基氧和亞氨基氫形成氫鍵,維
41、持 折疊構象穩(wěn)定。在球狀蛋白質分子中,肽鏈主鏈常出現(xiàn)1800回折,回折部分稱為 轉角。 轉角通常有4個氨基酸殘基組成,第二個殘基常為輔氨酸。無規(guī)卷曲是指肽鏈中沒有確定規(guī)律的結構。7 引起蛋白質變性的因素很多,物理因素如:熱、光等,化學因素如酸、堿、有機溶劑、三氯乙酸和去垢劑等,它們的作用機制分別如下: 熱變性主要是肽段受過分的熱振蕩而引起氫鏈破壞,熱變性一般是不可逆的,在溶 液中則出現(xiàn)凝固沉淀現(xiàn)象,冷卻后就難以再溶液,凝固沉淀的形式可能為松散伸展肽鏈的交織。 酸堿作用是破壞鹽鍵,因極高的H+可使-COO基變成-COOH基,而極低的H+又可使一NH3+基變成-NH2,這樣就破壞了鹽鍵,影響到分子
42、的構象,從而導致變性。 高濃度親水的有機溶劑如乙醇、丙酮等的變性作用可能與降低蛋白質的介電常數(shù)有關。 促溶劑的變性作用是與它的破壞蛋白質結構中非極性側鏈之間的疏水相互作用有關,有四級結構的也可解離開來。 去垢劑:能破壞蛋白質分子結構中非極性側鏈間的疏水相互作用,在很低濃度就能使亞基解聚,并能使亞基變性。 三氯乙酸:為酸性物質,能使蛋白質正電荷,與三氯乙酸的負離子結合,使蛋白質變性、沉淀。8 蛋白質是親水膠體,維持蛋白質膠體溶液穩(wěn)定的重要因素有兩個,一個是蛋白質顆粒表面大多為親水基團,可吸引水分子,形成顆粒表面水化膜,使其溶解在水溶液中;另一個是同種蛋白質膠粒表面帶有同種電荷,電荷的相互排斥作用
43、使蛋白膠體顆粒最大限度分散在溶液中。以上兩個原因可起到膠粒穩(wěn)定的作用,使蛋白質顆粒難以相互聚集從溶液中沉淀析出。如去除蛋白質膠粒的上述兩個穩(wěn)定因素時,可使蛋白質易從溶液中析出,在蛋白質分離中的鹽析和丙酮沉淀直接依據(jù)這一原理。蛋白質分子可呈兩性解離,其電離過程和帶電狀態(tài)決定于其等電點和溶液的pH值。蛋白質在等電點的溶液中溶解度最小。鹽析:在蛋白質溶液中加入大量中性鹽,可破壞蛋白質在水溶液中的穩(wěn)定性因素(水化膜和電荷),使蛋白質從溶液中沉淀析出。調溶液的pH值為蛋白質等電點更有利于鹽析。 第二章 核酸的結構與功能本章重點一、核酸的化學組成1核苷酸中的堿基成分 2戊糖與核苷 3核苷酸的結構與命名二、
44、核酸的一級結構1DNA和RNA的一級結構 2RNA與DNA的差別 三、DNA的空間結構與功能1DNA的二級結構雙螺旋結構模型 的雙螺旋結構的研究背景 雙螺旋結構模型的要點 2結構的多樣性 3DNA的超螺旋結構 4DNA在真核生物細胞核內的組裝 5DNA的功能 四、RNA的空間結構與功能1信使RNA的結構與功能 2轉運RNA的結構與功能 3核蛋白體RNA的結構與功能 4其他小分子 5核酶五、核酸的理化性質及其應用1核酸的一般理化性質 2的變性3的復性與分子雜交練習題一、 選擇題1稀有核苷酸主要存在于下列哪一種核酸中ArRNABmRNACtRNAD核DNAE線粒體DNA2在核酸中,核苷酸之間的連接
45、方式為A2、3-磷酸二酯鍵 B3、5-磷酸二酯鍵C2、5-磷酸二酯鍵 D糖苷鍵 E氫鍵3下列幾種DNA分子的堿基組成比例各不相同,哪一種DNA的解鏈溫度(Tm)最低?ADNA中A+T含量占15%BDNA中G+C含量占25%CDNA中G+C含量占40% DDNA中A+T含量占40%EDNA中G+C含量占70%4核小體串珠狀結構的珠狀核心蛋白質是A非組蛋白 BH2A、H2B、H3、H4各一分子CH2A、H2B、H3、H4各二分子DH2A、H2B、H3、H4各四分子EH1組蛋白與140-150堿基對DNA5DNA受熱變性時A260nm波長處的吸光度下降B多核苷酸鏈裂解成寡核苷酸鏈C堿基對可形成共價連接D加入互補RNA鏈,再冷卻,可形成DNA/RNA雜交分子E溶液粘度增加6核酸在260nm處有最大光吸收是因為A嘌呤環(huán)上的共軛雙鍵B嘌呤和嘧啶環(huán)上有共軛雙鍵C核苷酸中的N-糖苷鍵D磷酸二酯鍵E核糖和脫氧核糖的呋喃型環(huán)狀結構7關于tRNA的敘述下列哪一項是正確的A是核糖體的組成部分B攜帶遺傳信息C二級結構為三葉草形D二級結構為倒L型E分子較大故構成發(fā)夾結構8下列關于RNA的敘述哪一項是錯誤的?A主要有mRNA、tRNA、r
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