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文檔簡介

1、Trizol 法提取 RNA:操作步驟:(在液氮中碾磨組織至粉末狀,加入2ml Trizol,搖勻2min,分裝出1ml至A-2ml 管中,-80C保存)1、室溫靜置10min,若凍融樣品,則不需靜置。4C預冷離心機。取冰一盒。2、去脂肪:加 600p l 氯仿(CHC13),手動搖勻 2min,冰浴 5min; 13000rpm,4C,15min 離心。3、去DNA:取上清至B-2m1離心管,加500p 1 (一般與水等體積)酸性酚氯仿(取液時槍 頭插到水相液面以下),手動搖勻2min,冰浴5min; 4C,13000rpm,10min離心。4、取上清至C-1.5m1管,加入500p 1異丙

2、醇(一般1m1Trizo1加0.5ml異丙醇);若RNA 量少加2p 1糖原。上下顛倒,至混勻。(-20C過夜)。5、4C,13000rpm,10min 離心;倒掉上清。6、去鹽:加500p 1 75%冰乙醇(-20C最上層中保存),洗滌(RNA量大則需反復吹打,量 少則不用吹打)7、4C,13000rpm,5min離心;棄上清,室溫干燥2-5min。8、100p 1 RNA-free 水溶解。反轉(zhuǎn)錄:操作步驟:1、測RNA濃度Crna2、計算需加水的體積:12-勿4睥RNA3、加卬 l Oligo(dT); 70C, 5min (PCR 儀中,13p l 體系);立即冰浴 5min or m

3、oreReverse-transcriptionStep1 Stage1 70.0 5:30Stage2 42.0 60:00Stage3 75.0 10:00Step2 16.04、冰上配制Mix:(配時反復吹打混勻) TOC o 1-5 h z Buffer5p ldNTP(2.5mM)5plRT1plRNaseln卬l每管加12p l Mix,混勻,離心以確保無氣泡5、PCR儀:體系調(diào)至25p l,run,溫度高于70C時,跳過第一步,溫度降至42C時快速放 入樣品。PCR產(chǎn)物回收(Axygen)操作步驟:1、加2V的Buffer DE-B (當回收片段400bp時,加3V異丙醇)2、上

4、柱,12000g 離心 1min3、加 500p l Buffer W1,12000g 離心 30s4、加 700p l Buffer W2,12000g 離心 30s5、加 700p l Buffer W2,12000g 離心 1min6、空甩離心,12000g,1min7、換1.5ml管,在柱子中央加30p l Eluent,室溫1min,12000g離心1min (Eluent加熱至65 C能提高洗脫效率)瓊脂糖凝膠電泳: (SYBR-Green 染色)操作步驟:1、配膠:1%左右(0.2g瓊脂糖+20ml TAE)2、5p l樣品+0.5p lSYBR-Green,常溫避光靜置染色15

5、min3、加 卬 l loading Buffer (6*),混勻4、上樣跑膠,記錄樣品的位置普通PCR:操作步驟:提前將除酶以外相應試劑放入4。冰箱解凍1、計算用量(詳見“PCR計算”表格)。在記錄本列好用量。取冰一盒。2、 從4C冰箱拿出相應試劑放入冰盒中(ddH2O, Buffer, cDNA, dNTP, Primer),注意濃 度,Buffer和酶要匹配。3、打開PCR儀并設(shè)定。4、鑷子取PCR管于小冰盒,標記,按順序配Mix,震蕩混勻;分裝至各管,并對應加入Primer。5、震蕩混勻,離心去氣泡,上樣,檢查管蓋是否蓋嚴,run (注意修改體系)。pcr2stage1: x194C

6、2:00Stage2: x3594C 0:2060 C72C0:30 (做定量引物的PCR時可調(diào)為20s)0:50(可調(diào):每 1000bp 需 1min)Stage3: of 1 72C 5min配藥:淤 S-Methopreme:p =0.913g/cm3=913ug/ul MW=310.530ug/ul=1ul Methopreme (4C保存,液粘,慢吸)+30ul Acetome(丙酮,分析純,常溫保存)步驟:(1)計算,找齊樣品,取一盒冰(均在冰上操作);(2)配制,點震,離心,包錫箔紙,一次性手套裝冰,放冰中拿至蟲房;(3)頭頸間注射。淤Precocene:1ul母液+8.29ul

7、 acetone (一般配10ul母液對應的即可)母液:7-Ethoxy-6-methoxy-2,2-dimethylchromene 99%(C H O )每次現(xiàn)配,一次配的最多使用兩天;用于處理剛羽化的蟲子(in 12h)LB溶液和LB平板的配制:1、LB 溶液+Amp+ TOC o 1-5 h z NaCl3gTryptone3gYeast extract1.5gddH2O300mlAmp(10ng/ul)1.5ml2、LB溶液(復蘇用)NaClTryptone Yeast extractddH2O3g3g 1.5g 300ml3、LB平板(每100ml可倒56個平板)NaClTrypt

8、oneYeast extractddH2O agar Amp3g3g1.5g300ml4.5g1.5ml (10ng/ul)4、配制Amp溶液:Stock solution: 0.2g+2ml ddH2O=100mg/mlWork solution:稀釋為 10mg/ml連接及轉(zhuǎn)化:(pGM-T克隆試劑盒)連接:1、取載體冰上融化,分裝,每管15ml,標記為“pGM-T”;2、取PCR小管:按下述配比加入(單位:ul)反應體系Control反應體系Control10X2X目的PCR片段x-x-10X T4 DNA Ligation Buffer11-2X T4 DNA Rapid Ligati

9、on Buffer-55對照插入片段(700bp,50ng/ul)-1-1pGM-T 載體(約 50ng/ul)1111T4 DNA Ligase (3U/ul)1111無菌去離子水補至10ul10X: 2226C水浴 12h 或 16C過夜2X Rapid: 2226C,510min (小于 15min)3、放冰上(一部分用于下步實驗,一部分用于冰上存)轉(zhuǎn)化:1、取部分(5ul)連接產(chǎn)物加到50ul100ul (50ul) TOP10感受態(tài)細胞中(不超過10%),轉(zhuǎn) 動混勻,冰浴30min。(準備42C的水浴)。2、42C水浴90s (嚴格),立即冰浴23min。3、加 250500ul (300ul) LB (Amp-)培養(yǎng)基,150rpm, 37C, 45min 培養(yǎng)。4、3600rpm,離心90s,棄部分上清,留100ul涂板。5、 板上涂IPTG (40mg/ul) 20ul,X-Gal (40mg/ul)

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