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轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程(一)轉(zhuǎn)錄過程1.轉(zhuǎn)錄起始基因的轉(zhuǎn)錄是由RNA聚合酶催化進行的?;虻纳嫌尉哂薪Y(jié)合RNA聚合酶的區(qū)域,叫作啟動子。啟動子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特異性結(jié)合的位點,決定了基因轉(zhuǎn)錄的起始位點。RNA聚合酶與啟動子結(jié)合后,在特定區(qū)域?qū)NA雙螺旋兩條鏈之間的氫鍵斷開,使DNA解旋,形成單鏈區(qū),以非編碼鏈為模板合成RNA互補鏈的過程就開始了。2.轉(zhuǎn)錄延長轉(zhuǎn)錄的延長是以首位核苷酸的3′-OH為基礎(chǔ)逐個加入NTP,形成磷酸二酯鍵,使RNA逐步從5′向3′端延伸的過程。在原核生物中,因為沒有核膜的分隔,轉(zhuǎn)錄未完成即已開始翻譯,而且在同一個DNA模板上同時進行多個轉(zhuǎn)錄過程。電鏡下看到的羽毛狀圖形和羽毛上的小黑點(多聚核糖體),是轉(zhuǎn)錄和翻譯高效率的直觀表現(xiàn)。3.轉(zhuǎn)錄終止轉(zhuǎn)錄的終止在原核生物分為依賴Rho因子與非依賴Rho因子兩類。在依賴Rho因子的生物類型中,因為Rho因子有ATP酶和解旋酶兩種活性,能結(jié)合在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的3′末端區(qū)并使轉(zhuǎn)錄停頓產(chǎn)物RNA脫離DNA模板,所以可以終止轉(zhuǎn)錄。對于非依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止,其RNA產(chǎn)物的3′端往往形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),其后又有一串寡聚U。莖環(huán)結(jié)構(gòu)可使RNA聚合酶變構(gòu)而不再前移,寡聚U則有利于RNA脫離依附的DNA模板。因此,無論哪一種轉(zhuǎn)錄終止都有RNA聚合酶停頓和RNA產(chǎn)物脫出這兩個必要過程。(二)翻譯過程遺傳信息的翻譯是在核糖體上進行的,核糖體與RNA、35個堿基的mRNA片段的大小比較如圖4-2所示。核糖體的小亞基負(fù)責(zé)識別模板mRNA,并與mRNA上大約35個堿基結(jié)合。每個核糖體有3個RNA結(jié)合位點,稱為A位、P位和E位(圖4-3),其中A位和P位橫跨核糖體的兩個亞基,E位僅位于大亞基上。A位負(fù)責(zé)結(jié)合氨酰-tRNA,P位結(jié)合肽酰-tRNA,E位是延長的肽鏈轉(zhuǎn)移到氨酰-tRNA之后所釋放的脫酰-tRNA的結(jié)合位點,也稱釋放位點。在蛋白質(zhì)合成過程中,A位和P位上的tRNA處于活性狀態(tài),肽鏈的延伸只涉及核糖體所覆蓋的約10個密碼子中的2個。遺傳信息的翻譯過程包括起始、延伸和終止。1.起始反應(yīng)涉及mRNA和rRNA之間的堿基配對。細(xì)菌mRNA的起始位點由AUG(少數(shù)情況下是GUG或UUG)及其上游約10個堿基位置的SD序列(嘌呤六連體5′-AGGAGG-3′)構(gòu)成。細(xì)菌核糖體30S小亞基上的rRNA有一段可與SD序列互補配對的序列(3′-UCCUCC-5′)。這兩段序列的互補配對,對起始復(fù)合體的形成以及起始反應(yīng)非常重要。真核生物核糖體的40S小亞基與些起始因子(initiationfactor,IF)共同作用,識別mRNA的5′-末端帽結(jié)構(gòu)并掃描mRNA,直到找到起始位點。在起始位點處,核糖體結(jié)合在mRNA上,構(gòu)建成一個包含氨酰-tRNA的起始復(fù)合體,核糖體的60S亞基也加入到復(fù)合體中。翻譯通常由AUG編碼的甲硫氨酸開始。每個細(xì)胞中至少含有兩種不同的可攜帶甲硫氨酸的tRNA,一種能特異性地識別位于mRNA上的甲硫氨酸起始密碼子AUG,這樣的tRNA稱為起始tRNA(tRNAimet),另一種只能識別mRNA內(nèi)部的甲硫氨酸密碼子AUG,簡寫為tRNAmet。原核生物和真核生物分別具有不同的起始tRNA。在原核生物中,起始tRNA攜帶的是氨基基團被甲酰化的甲硫氨酸,而真核生物翻譯起始所利用的甲硫氨酸并未甲?;?,但它們都能識別mRNA中的起始密碼子AUG。最終,若干起始因子、核糖體的大小亞基、mRNA、tRNA等相互識別,共同作用,成為完整的翻譯起始復(fù)合物,為遺傳信息的翻譯做好準(zhǔn)備。2.延伸包括從第一個肽鍵的合成到加入最后一個氨基酸的全部反應(yīng)過程,這一反應(yīng)是蛋白質(zhì)合成中最快的一步。一旦完整的核糖體在起始密碼子附近形成,便為氨酰-tRNA進入A位提供了場所,而核糖體的P位被肽酰-tRNA占據(jù)。除了起始tRNA以外的氨酰-tRNA均可進入核糖體的A位(翻譯起始復(fù)合物形成時,起始tRNA就已經(jīng)占據(jù)了P位),并受延伸因子的催化,同時,核糖體的大亞基具有肽基轉(zhuǎn)移酶活性,催化氨酰-tRNA上的氨基酸與肽酰-tRNA上的肽鏈形成新的肽鍵。在肽鍵形成后,核糖體沿著mRNA位移一個密碼子的距離,將空載的tRNA位移到E位,而肽酰-tRNA從A位位移到P位,這一過程需要GTP的水解。3.終止包括釋放翻譯完成的肽鏈,同時核糖體從mRNA上解離,并成為亞基。三種密碼子UAA、UGA、UAG均可終止翻譯。沒有任何一種tRNA與終止密碼子相對應(yīng),終止密碼子由蛋白質(zhì)釋放因子而不是氨酰-tRNA所識別。在遺傳信息的翻譯過程中,tRNA與氨基酸的結(jié)合、tRNA與mRNA的解離等反應(yīng)都需要ATP。據(jù)估計,在快速生長的細(xì)菌中,多至90%的ATP都是用來合成蛋白質(zhì)的。在翻譯過程中,核糖體處于解離、結(jié)合的動態(tài)變化中。在翻譯起始階段,需要游離的亞基,隨后才結(jié)合成70S(或80S)顆粒,開始翻譯進程。而大腸桿菌的起始因子IF3與小亞基結(jié)合,
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