計算化學9常用計算化學應用軟件及資源.ppt

1、常用計算化學應用軟件及資源,Gaussian 軟件,Gaussian的功能很強大 可以做從頭算 半經(jīng)驗 DFT,Gaussian 軟件,可用來研究分子的能量與幾何結(jié)構(gòu) 化學反應過渡態(tài)的能量與幾何結(jié)構(gòu) 振動頻率分析、紅外與拉曼光譜; 分子的熱化學性質(zhì)、鍵能 化學反應能 化學反應途徑,研究分子軌道的能量與性質(zhì) 原子電荷分布（布居分析）和自旋密度分布 分子的多極矩（永久偶極矩和四極至十六極矩） NMR 屏蔽常數(shù)、化學位移及分子的磁化率、振動園二色強度 電子親和性與電離勢、極化率與超極化率、靜電勢與電子密度分布等,第一步工作準備輸入文件。Gaussian程序?qū)斎胛募幸欢ǖ母袷揭?，如圖顯示了一個完

2、整的Gaussian輸入文件,準備好輸入文件后，便可在Gaussian程序中讀入此輸入文件進行計算,程序運算完后，Gaussian會給出正常結(jié)束的信息。此時，可打開文本格式的輸出文件，提取所需信息。,MOPAC 軟件,MOPAC 軟件是一款大眾化、功能強大的半經(jīng)驗量化程序 可以計算分子、自由基、離子和聚合物的電子結(jié)構(gòu)、光譜，熱化學性質(zhì)、同位素取代效應和力常數(shù)等。其中的一個過渡態(tài)定位程序和兩個過渡態(tài)優(yōu)化程序用于研究化學反應。 此外，它還常用作定量結(jié)構(gòu)性質(zhì)（或活性）關(guān)系研究中結(jié)構(gòu)參數(shù)的計算。,ADF軟件,ADF可以進行單點計算、幾何優(yōu)化、尋找過渡態(tài)、計算力常數(shù)和熱化學性質(zhì)、跟蹤反應路徑、研究電子結(jié)

3、構(gòu)、通過比較離子的激發(fā)態(tài)和基態(tài)而獲得激發(fā)能。,新版本的ADF包括了含時密度泛函理論，基組庫中包含了1118號所有元素，而且對常見元素有不同大小的基組，從最小的到高質(zhì)量的。,ADF軟件在材料科學和生命科學均有應用，但更側(cè)重于前者，尤其在重元素化學、無機化學、催化領域非常流行。最新版的ADF加入了QM/MM方法，可用于生物大分子體系的研究。,量子化學資源,International Journal of Quantum chemistry Journal of molecular modeling Journal of physical chemistry Journal of chemical

4、theory and computation （美國化學會2005年推出） Journal of molecular structure (Theochem) Reviews in Computational Chemistry （叢書） Journal of theoretical and computational chemistry Theoretical chemical accounts Journal of computational chemistry,Gaussian公司的官方網(wǎng)站,國際上著名的計算化學列表網(wǎng)站，開通較早，內(nèi)有大量關(guān)于計算化學的郵件列表。,北京大學化學系開設的量化計算論壇,廈門大學化學系開設的量化計算論壇,國內(nèi)著名的量子化學論壇,國內(nèi)著名的量子化學論壇,化學數(shù)據(jù)庫（Data base） 分子結(jié)構(gòu)庫 晶體庫 熱力學數(shù)據(jù)庫 藥物庫 高分子庫 分子光譜、波譜圖譜庫 生物數(shù)據(jù)庫（蛋白質(zhì)、核酸、多糖庫） 化學文獻