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1、RNA體外干擾肝癌Hep 3B細(xì)胞VEGF基因的表達(dá) 作者:蔣冬貴夏昆劉劫羅紅潘乾龍志高夏家輝 【摘要】 目的: 通過(guò)自主構(gòu)建的RNAi載體和體外合成siRNA的方法,尋找能有效干擾VEGF基因表達(dá)的載體和siRNA片段治療腫瘤. 方法:將自主構(gòu)建的pcDUVEGF1和pcDUVEGF2,以及體外合成的TWvegf1和TWvegf2 siRNA片段轉(zhuǎn)染肝癌Hep3B細(xì)胞,通過(guò)RTPCR,Western Blot和ELISA檢測(cè)轉(zhuǎn)染前后VEGF的mRNA及蛋白表達(dá)水平,以了解RNA干擾效果. 結(jié)果:兩種RNA干擾的方法均能抑制VEGF基因的表達(dá)且差異具有顯著性(mRNA,0.28,0.47,0.

2、76,0.58 vs 1.2, P<0.01;蛋白質(zhì),138, 121, 249, 227 vs 389 g/L, P<0.01). 結(jié)論:兩個(gè)質(zhì)粒及siRNA片段均能有效的抑制VEGF基因的表達(dá). 【關(guān)鍵詞】 RNAi; siRNA; 血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子; 肝癌細(xì)胞 【Abstract】 AIM: To construct RNAi plasmids and synthesize siRNA in vitro, transport them into Hep3B cells, so as to find some effective VEGF RNAi plasmi

3、ds and siRNA segments. METHODS: The RNAi plasmids pcDUVEGF1, pcDUVEGF2 and siRNA segments TWvegf1, TWvegf2 were transported into Hep3B cells, and the expressions of VEGF mRNA and protein in the transfected Hep2 / 133B cells were checked using RTPCR, Western Blot and ELISA. The results were compared

4、between the transfected and the normal Hep3B cells. RESULTS: There were prominent differences between the two groups in depressing the expression of mRNA (0.28, 0.47, 0.76, 0.58 vs 1.2, P<0.01) and protein (138, 121, 249, 227 vs 389 g/L, P<0.01) of VEGF gene. CONCLUSION: The two RNAi p

5、lasmids and siRNA segments inhibit the expression of VEGF gene effectively. 【Keywords】 RNAi; siRNA; VEGF; hepatocarcinoma 0引言 VEGF/VEGFR系統(tǒng)在惡性腫瘤中的協(xié)同表達(dá),旁/自分泌作用機(jī)制的確立為腫瘤的臨床治療提供了新的靶點(diǎn). 在哺乳動(dòng)物的細(xì)胞種發(fā)夾結(jié)構(gòu)的雙鏈RNA被剪切成siRNA,在體內(nèi)組裝成蛋白復(fù)合體,在siRNA的引導(dǎo)下Dicer酶切割靶RNA,或者以靶RNA為模板合成新的雙鏈RNA,進(jìn)一步被Dicer識(shí)別和剪切,21nt siRNA在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中可以誘導(dǎo)

6、強(qiáng)有力的特異性RNAi作用1-4. 我們使用自主構(gòu)建的RNAi真核基因表達(dá)載體pcDU6選擇特異的VEGF基因片段構(gòu)建VEGF基因的RNAi質(zhì)粒,選擇特異的VEGF基因片段體外合成21nt siRNA,并將它們脂轉(zhuǎn)入肝癌Hep3B細(xì)胞后,通過(guò)RTPCR,Western Blot和ELISA的方法檢測(cè)它們對(duì)VEGF mRNA和蛋白表達(dá)的抑制作用,以期找到可靠的抑制VEGF基因表達(dá)的質(zhì)粒和siRNA片段,為肝癌的基因治療提供一種新的方法. 1材料和方法 1.1材料 設(shè)計(jì)合成兩段人U6 promoter315至+1的PCR寡核苷酸引物從人的gDNA中擴(kuò)增出U6 promoter(5端增加Bgl II

7、,3增加Apa I的酶切位點(diǎn)).將PCR產(chǎn)物用Bgl II和Apa I雙酶切后, 再將pcDNA3.1(-)質(zhì)粒用Bgl II和Apa I雙酶切,構(gòu)建成RNAi質(zhì)粒pcDU6,構(gòu)建pcDU6的引物序列為 正向: 5 gcagatctacgcgcaggcaaaacgcacc, 反向:5 ttgggcccggtgtttcgtcctttccac. 根據(jù)高效RNAi基因片段的設(shè)計(jì)原則2,我們?cè)O(shè)計(jì)并從上海博亞生物制品有限公司申請(qǐng)合成了構(gòu)建VEGF基因RNAi載體的寡核苷酸片段以及體外合成針對(duì)VEGF基因的siRNA的寡核苷酸片段,肝癌Hep3B細(xì)胞株購(gòu)自CCTCC,非必需氨基酸(NAA)、丙酮酸鈉、胎牛

8、血清、胰酶、EDTA, G418均購(gòu)自Gibcol公司,RPMI 1640干粉培養(yǎng)基購(gòu)自Hyclone公司,脂質(zhì)體2000 Invitrogen公司. T7 RiboMAXTM Express Large Scale RNA Production System(Promega公司);Klenow Fragment(Takara公司);DEPC(Sigma公司). Trizol Reagent(Gibcol BRL);174 Hinc digest DNA Marker,Taq酶寶生物工程有限公司;AMV逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(Promega公司);蛋白質(zhì)Marker(上海生化試劑公司);Xfilm(上海

9、愛克發(fā)感光器材有限公司)VEGF ELISA檢測(cè)試劑盒(Diognostics Systems公司);兔抗人VEGF多抗(NEOMARKERS公司);山羊抗兔二抗(PKD公司). 1.2方法 實(shí)驗(yàn)組為pcDUVEGF1,pcDUVEGF2陽(yáng)性克隆和轉(zhuǎn)染Tvegf1,Tvegf2 siRNA的Hep3B細(xì)胞,對(duì)照組為常規(guī)培養(yǎng)的Hep3B細(xì)胞. 用Apa I 和BamH I雙酶切pcDU6質(zhì)粒,分別取RVEGF1,RVEGF2的Reverse,Forward,將酶切產(chǎn)物與雙鏈的RVEGF1做連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化JM109,挑取陽(yáng)性克隆并測(cè)序證實(shí)后擴(kuò)增質(zhì)粒. 將連接上RVEGF1的質(zhì)粒取1 L用Bam

10、H I和Hind III雙酶切,將RVEGF2連接到帶有RVEGF1的質(zhì)粒上并測(cè)序證實(shí),命名為pcDUVEGF1. 將RVEGF3和RVEGF4連接pcDU6質(zhì)粒上并測(cè)序證實(shí),命名為pcDUVEGF2. 將T7 promoter分別與TWvegf1,TWvegf2,TWvegf3,TWvegf4(均為1g/L)退火,用Klenow Fragment補(bǔ)平. 用T7 RiboMAXTM Express Large Scale RNA Production System試劑盒體外合成雙鏈的RDNA,按TWvegf1與TWvegf2混合,TWvegf3與TWvegf4混合,分別往上述RDNA混合液中加

11、入RnaseFreeDNase 1 L于37溫浴15 min后立即于95滅活酶活性5 min,常溫下冷卻,Qiagen小寡核苷酸純化柱純化. 所得產(chǎn)物分別命名為Tvegf1,Tvegf2,電泳跑2.0膠檢測(cè)證實(shí),-20保存待用. 按質(zhì)粒、寡核苷酸(dNTP與siRNA的混合物)與脂質(zhì)體的比例為1 g2 L混勻5 min,溶于不含血清的RPMI 1640液中,室溫30 min后轉(zhuǎn)染Hep3B細(xì)胞. siRNA轉(zhuǎn)染Hep3B細(xì)胞24 h后換無(wú)血清培養(yǎng)24 h,取上清行Western Blot,ELISA檢測(cè),抽總RNA行RTPCR檢測(cè). 1.2.1VEGF mRNA表達(dá)的檢測(cè)Hep3B細(xì)胞用有血清

12、的RMPI1640培養(yǎng)基重懸. 當(dāng)T25培養(yǎng)瓶細(xì)胞匯合率達(dá)到90%95%時(shí)換液,PBS洗滌,各取20 L脂質(zhì)體和20 g pEGFPN1(用以了解脂轉(zhuǎn)效率),pcDUVEGF1 和pcDUVEGF2質(zhì)粒混勻5 min后加無(wú)血清RPMI 1640培養(yǎng)基800 L混勻后加入到上述T25瓶培養(yǎng)的Hep3B細(xì)胞上,50 mL/L CO2,37溫箱培養(yǎng)24 h后加G418(800 mg/L)篩選. 將陽(yáng)性克隆加有血清RMPI 1640培養(yǎng)基重懸并轉(zhuǎn)移到6孔板中培養(yǎng). 用Trizol抽實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組細(xì)胞的總RNA,同時(shí)用一對(duì)actin引物做對(duì)照,做半定量RTPCR. 經(jīng)電泳圖像分析掃描得到VEGF與act

13、in條帶峰面積積分值比值作為計(jì)算VEGF PCR產(chǎn)物相對(duì)定量,比較實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組VEGF mRNA的表達(dá)豐度. 1.2.2VEGF蛋白的檢測(cè)將實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的變性上清跑100 g/L的PAGE膠,用Marker及陰陽(yáng)性對(duì)照,行Western Blot檢測(cè). 另將實(shí)驗(yàn)組每種質(zhì)粒、siRNA和對(duì)照組均設(shè)4孔50 mL/L CO2, 37培養(yǎng)24 h后,換無(wú)血清RMPI 1640培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h,取上清凍存于-20. 用VEGF ELISA檢測(cè)試劑盒的檢測(cè)實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的Hep3B細(xì)胞分泌的VEGF的量. 1.2.3Hep3B細(xì)胞生長(zhǎng)曲線的測(cè)定將篩選出的RNAi陽(yáng)性克隆細(xì)胞(包括空載體pcDU6)

14、和轉(zhuǎn)染siRNA(轉(zhuǎn)染24 h后)接種于96孔培養(yǎng)板中,設(shè)空白對(duì)照(不含細(xì)胞的PBS)進(jìn)行MTT法測(cè)細(xì)胞的活力. 測(cè)定570 nm處的吸光度A值,A值的大小反映Hep3B細(xì)胞成活數(shù)量及活性. 以時(shí)間為橫坐標(biāo)(d ),減去空白對(duì)照的吸光度A值為縱坐標(biāo)繪制生長(zhǎng)曲線圖. 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:SPSS10.0軟件進(jìn)行t檢驗(yàn)和F檢驗(yàn). 2結(jié)果 21RNAi質(zhì)粒和siRNA對(duì)VEGF mRNA表達(dá)的影響構(gòu)建好的pcDUVEGF1和pcDUVEGF2質(zhì)粒,體外合成的Tvegf1和Tvegf2 siRNA. actin為內(nèi)參照,按100 ng/mL培養(yǎng)基的Tvegf1,Tvegf2作用于Hep3B細(xì)胞后RTPCR擴(kuò)增

15、掃描Tvegf1組、VEGF2組與無(wú)血清對(duì)照組比較VEGF mRNA表達(dá)水平明顯降低, pcDUVEGF1組、pcDUVEGF2組與無(wú)血清對(duì)照組比較VEGF mRNA表達(dá)水平明顯降低. 而pcDUVEGF1組、pcDUVEGF2組、pcDU6組與無(wú)血清對(duì)照組比較VEGF mRNA表達(dá)水平無(wú)明顯差別,有血清對(duì)照組與無(wú)血清對(duì)照組比較VEGF mRNA表達(dá)水平無(wú)明顯差別(圖1). 2.2VEGF蛋白質(zhì)檢測(cè)將實(shí)驗(yàn)組中pcDUVEGF1組、pcDUVEGF2組、Tvegf1組和Tvegf2組與對(duì)照組即無(wú)血清培養(yǎng)組及PRMPI 1640培養(yǎng)基行Western Blot檢測(cè),發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)組的VEGF相對(duì)蛋白濃度

16、(VEGF/actin)高于對(duì)照組(0.28,0.47,0.76,0.58 vs 1.2, P<0.01). 將實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的Hep3B的上清進(jìn)行ElISA檢測(cè)發(fā)現(xiàn),實(shí)驗(yàn)組各組的VEGF蛋白質(zhì)濃度均明顯低于對(duì)照組(138, 121, 249, 227 vs 389 g/L, P<0.01), Tvegf1組與Tvegf2組比較無(wú)明顯差異(P>0.05), pcDUVEGF2組明顯低于pcDUVEGF1組(P<0.01). 2.3Hep3B細(xì)胞生長(zhǎng)曲線TWvegf1和pcDUvegf2二組細(xì)胞生長(zhǎng)均明顯受到抑制(P<0.01

17、),TWvegf2和pcDUvegf1二組細(xì)胞生長(zhǎng)均明顯受到抑制(P<0.05,圖2). 3討論 原發(fā)性肝癌(HCC)是典型的富血供惡性腫瘤. 腫瘤血管生成是HCC生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移的先決條件. 預(yù)先存在的血管發(fā)芽形成新血管包括釋放血管新生因子、激活基質(zhì)金屬蛋白酶、降解細(xì)胞外基質(zhì)及爾后的重塑細(xì)胞外基質(zhì)等步驟5. 對(duì)HCC腫瘤血管生成分子機(jī)制的研究表明,血管內(nèi)皮細(xì)胞生長(zhǎng)因子(VEGF)是目前已知在HCC 腫瘤血管生成中作用最強(qiáng)的血管生成誘導(dǎo)因子. 因此我們選擇了VEGF基因作為RNAi肝癌基因治療和肝癌與VEGF關(guān)系的研究的出發(fā)點(diǎn). 按照選擇高效的RNAi基因治療的片段的原則,分別選擇了2段針對(duì)VEGF基因的DNA片段用于構(gòu)建VEGF基因的RNAi載體,2段針對(duì)VEGF基因的DNA片段用于體外合成siRNA片段,并分別將它們用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染Hep3B細(xì)胞,通過(guò)半定量RTPCR,Western Blot和ElISA檢測(cè)VEGF基因的表達(dá)發(fā)現(xiàn),這4個(gè)片段均能有效但(不完全)抑制VEGF基因的表達(dá),且不同位置的RNA干擾效果存在明顯的差別. 細(xì)胞抑制實(shí)驗(yàn)也得到了

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