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1、.瓊脂糖凝膠電泳注意事項(xiàng)及操作流程凝膠電泳操作注意事項(xiàng):1. 緩沖系統(tǒng):在沒(méi)有離子存在時(shí),電導(dǎo)率最小,dna不遷移,或遷移極慢,在高離子強(qiáng)度的緩沖液中,電導(dǎo)很高并產(chǎn)熱,可能導(dǎo)致dna變性,因此應(yīng)注意緩沖液的使用是否正確。長(zhǎng)時(shí)間高壓電泳時(shí),常更新緩沖液或在兩槽間進(jìn)行緩沖液的循環(huán)是可取的。2. 瓊脂糖:不同廠(chǎng)家、不同批號(hào)的瓊脂糖,其雜質(zhì)含量不同,影響dna的遷移及熒光背景的強(qiáng)度,應(yīng)有選擇地使用。3. 凝膠的制備:凝膠中所加緩沖液應(yīng)與電泳槽中的相一致,溶解的凝膠應(yīng)及時(shí)倒入板中,避免倒入前凝固結(jié)塊。倒入板中的凝膠應(yīng)避免出現(xiàn)氣泡,影響電泳結(jié)果。4. 樣品加入量:一般情況下,0.5cm寬的梳子可加0.5u
2、g的dna量,加樣量的多少依據(jù)加樣孔的大小及dna中片段的數(shù)量和大小而定,過(guò)多的量會(huì)造成加樣孔超載,從而導(dǎo)致拖尾和彌散,對(duì)于較大的dna此現(xiàn)象更明顯。5. 電泳系統(tǒng)的變化會(huì)影響dna的遷移,加入dna標(biāo)準(zhǔn)參照物進(jìn)行判定是必要的。6. dna樣品中鹽濃度會(huì)影響dna的遷移率,平行對(duì)照樣品應(yīng)使用同樣的緩沖條件以消除這種影響。7. dna遷移率取決于瓊脂糖凝膠的濃度,遷移分子的形狀及大小。采用不同濃度的凝膠有可能分辨范圍廣泛的dna分子,制備瓊脂糖凝膠可根據(jù)dna分子的范圍來(lái)決定凝膠的濃度。小片段的dna電泳應(yīng)采用聚丙烯酰胺凝膠電泳以提高分辨率。瓊脂糖加樣時(shí)候注意事項(xiàng):精品.1、 用移液搶將樣品加至
3、點(diǎn)樣孔。每孔點(diǎn)樣的體積一般少于25ul,因此吸取每一個(gè)樣品時(shí),操作要穩(wěn)當(dāng)且細(xì)心。2、 常加一定量的蔗糖來(lái)增加樣品的濃度,以使每個(gè)樣品停留在各自的點(diǎn)樣孔中。3、 在樣品中加入水溶性的陰離子追蹤染料(如溴酚藍(lán)),用以看出樣品移動(dòng)的距離。4、 在一個(gè)或幾個(gè)孔中加入標(biāo)準(zhǔn)分子質(zhì)量樣品,電泳結(jié)束后,根據(jù)已知分子質(zhì)量的帶的相應(yīng)位置可用來(lái)做出標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。5、 電泳一般是在追蹤染料泳動(dòng)到膠的80%部位時(shí)停止。注意電泳期間,電泳槽蓋要安全蓋好,以防止液體蒸發(fā),又可以降低電擊的可能性。6、 電泳結(jié)束后,將膠浸沒(méi)在1mg/l的溴化乙錠(eb)中,5min后即可看到dna帶,eb通過(guò)插入在雙螺旋的配對(duì)核苷酸之間同nda結(jié)
4、合。另一種方法是電泳時(shí),在膠中加入eb。7、 在紫外燈下,由于eb發(fā)出強(qiáng)烈的橘紅色的熒光,所以可以看到dna帶。利用這種方法檢測(cè)的界限是每條帶約10ng dna。帶上塑料安全眼鏡可防止紫外光對(duì)眼睛的傷害??捎贸咦觼?lái)測(cè)量每條帶至點(diǎn)樣孔的距離。同樣,利用特制的照相機(jī)和調(diào)焦器,也可以對(duì)凝膠拍照。8、 如果要對(duì)某一條帶(如質(zhì)粒)進(jìn)一步分析,可用小刀將含該帶的凝膠切割下來(lái),從帶中回收dna。瓊脂糖核酸電泳實(shí)驗(yàn)操作流程 1.用蒸餾水將制膠模具和梳子沖洗干凈,放在制膠平板上,封閉模具邊緣,架好梳子;精品.2.根據(jù)欲分離dna片段大小用凝膠緩沖液配制適宜濃度的瓊脂糖凝膠:準(zhǔn)確稱(chēng)量瓊脂糖干粉,加入到配膠用的三角
5、燒瓶?jī)?nèi),定量加入電泳緩沖液(一般2030 ml);3.放入到微波爐內(nèi)加熱熔化。冷卻片刻,加入一滴熒光染料,輕輕旋轉(zhuǎn)以充分混勻凝膠溶液,倒入電泳槽中,待其凝固;4.室溫下3045分鐘后凝膠完全凝結(jié),小心拔出梳子,將凝膠安放在電泳槽內(nèi);5.向電泳槽中倒入電泳緩沖液,其量以沒(méi)過(guò)膠面1mm為宜,如樣品孔內(nèi)有氣泡,應(yīng)設(shè)法除去;6.在dna樣品中加入10體積的載樣緩沖液(loading buffer),混勻后,用槍將樣品混合液緩慢加入被浸沒(méi)的凝膠加樣孔內(nèi);7.接通電源,紅色為正極,黑色為負(fù)極,切記dna樣品由負(fù)極往正極泳動(dòng) (靠近加樣孔的一端為負(fù))。一般60100v電壓,電泳2040min即可;8. 根據(jù)指示劑泳動(dòng)的位置,判斷是否終止電泳;9.電泳完畢,關(guān)上電源,在凝膠成像儀上觀(guān)察電泳帶及其位置,并與核酸分子量標(biāo)準(zhǔn)marker比較被擴(kuò)增產(chǎn)物的大小。 瓊脂糖凝膠濃度與線(xiàn)形dna的最佳分辨范圍 瓊脂糖凝膠濃度線(xiàn)形dna的最佳分辨范圍(bp) 0.5%1,00030,000 0
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