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文檔簡介

1、生物及制藥工程圖書檢索實習(xí)課程:文獻(xiàn)信息檢索 班級:生物制藥一班姓名:張忠寶 四角號碼:122345033630103 學(xué)號1、 使用我校圖書館書目查詢系統(tǒng)查找有關(guān)信息檢索與利用有53本圖書,寫出相關(guān)圖書書名等信息。用截屏方式標(biāo)識出其中一本圖書的外部特征信息及現(xiàn)在的館藏情況。2、 利用“超星數(shù)字圖書館”查詢一本自己專業(yè)的圖書和一本計算機學(xué)科中關(guān)于Java的圖書,用截屏方式記錄封面、目錄和正文內(nèi)容P1-2頁,并用文字識別將此內(nèi)容轉(zhuǎn)換為WORD文檔格式。第一章 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能第一節(jié)蛋白質(zhì)在生命活動中的重要性 一、生命的物質(zhì)基礎(chǔ) 早在19世紀(jì),科學(xué)家們就發(fā)現(xiàn)含氮天然產(chǎn)物

2、對動物的生存是必須的,1839年,荷蘭化學(xué)家GJMulder首次采用蛋白質(zhì)(protein)(希臘語:proteios,意為原始的)來表示這類化合物。 生物體可以看作是一個由物質(zhì)組成的不均一體系,此體系的特征是其構(gòu)成布置合宜,變化協(xié)調(diào),并可以自我更新;體系的另一個特征是它含有大量的蛋白質(zhì)和核酸(nucleic acid)。病毒(virus)能夠生長、繁殖、遺傳、致病,然而它卻連最簡單的細(xì)胞形態(tài)或結(jié)構(gòu)都沒有,它只是一種蛋白質(zhì)與核酸結(jié)合而成的核蛋白(nucleoprotein)。例如煙草花葉病毒(tobacco mosaic virus,TMV),它能使煙草致病,人們將其純化結(jié)晶,儲存數(shù)年后再接種

3、到宿主煙葉上,它照樣能夠生長、繁殖,并使煙葉感染花葉病,同時病毒核蛋白也大量增加。這說明了核蛋白是最簡單的生命形式。近年來,美國神經(jīng)生物化學(xué)家SBPrusiner發(fā)現(xiàn)一類只有蛋白質(zhì)而沒有核酸的病原體朊病毒(prion),若其結(jié)構(gòu)發(fā)生某種確定的改變,則可引起動物或人的朊病毒病。朊病毒的發(fā)現(xiàn)打破了“病毒必須有核酸”的傳統(tǒng)觀念。SBPrusiner因發(fā)現(xiàn)朊病毒而榮獲1997年度諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。 生物體所攜帶的全部遺傳信息在基因組(genome)中,而生物學(xué)功能的主要體現(xiàn)者是蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組(proteome)指的是基因組編碼的全部蛋白質(zhì)(詳見后)。今后,在蛋白質(zhì)組水平上揭示生命現(xiàn)象的本質(zhì)及活動

4、規(guī)律將成為生命科學(xué)的重點。 蛋白質(zhì)是生物體中含量最豐富的高分子物質(zhì),約占人體固體成分的45,分布廣泛,幾乎所有的器官、組織都含有蛋白質(zhì)。生物體結(jié)構(gòu)越復(fù)雜,其蛋白質(zhì)種類和功能也越繁多,即使在單細(xì)胞生物中所發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)也有數(shù)千種。有些蛋白質(zhì)的功能相當(dāng)特異,例如南極水域中的有些魚類,其血液中含有抗凍蛋白(antifreeze protein),可保護(hù)血液不被凍凝,使生物體在低溫下得以生存,生命得以繁衍。綜上所述,蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ)。 二、蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能 1酶 某些蛋白質(zhì)是酶,催化生物體內(nèi)的代謝反應(yīng)。如己糖激酶催化腺苷三磷酸(ATP)的磷酸根轉(zhuǎn)移至葡萄糖,使葡萄糖磷酸化而活化;乳酸脫氫酶可催化

5、乳酸脫氫,轉(zhuǎn)變成丙酮酸;DNA聚合酶參與DNA的復(fù)制和修復(fù)。2調(diào)節(jié)蛋白 某些蛋白質(zhì)是激素,具有一定的調(diào)節(jié)功能,如調(diào)節(jié)糖代謝的胰島素(insulin),與生長和生殖有關(guān)的促甲狀腺素(thyrotropin)、促生長素(somatotropin)、黃體生成素(1uteinizinghormone,LH)和促卵泡激素(follicle stimulating hormone,F(xiàn)SH)等。重要的肽類激素包括促腎上腺皮質(zhì)激素(adrenocorticotropic hormone,ACTH)、抗利尿激素(antidiuretic hormone)、胰高血糖素(glucagon)和降鈣素(calciton

6、in)。另外,許多激素的信號常常通過G蛋白(GTP結(jié)合蛋白)介導(dǎo)。其他還有轉(zhuǎn)錄和翻譯調(diào)控蛋白,包括與DNA緊密結(jié)合的組蛋白及某些酸性蛋白等。 3轉(zhuǎn)運蛋白 某些蛋白質(zhì)具有運載功能,它們攜帶小分子從一處到另一處,通過細(xì)胞膜,在血液循環(huán)中,在不同組織間運載代謝物。如血紅蛋白是轉(zhuǎn)運氧氣和二氧化碳的工具;血清蛋白可運輸自由脂肪酸及膽紅素等。 4收縮或運動蛋白 某些蛋白質(zhì)賦予細(xì)胞和器官收縮的能力,可使其改變形狀或運動。如骨骼肌收縮靠肌動蛋白(actin)和肌球蛋白(myosin),這兩種蛋白質(zhì)在非肌肉細(xì)胞中也存在。微管蛋白用于構(gòu)建微管,微管的作用是與鞭毛及纖毛中的動力蛋白(dynein)協(xié)同推動細(xì)胞運動。

7、 5防御蛋白 有些蛋白質(zhì)具有保護(hù)或防御功能。凝血酶與纖維蛋白原參與血液凝固,從而防止血管系統(tǒng)失血。最重要的起保護(hù)作用的蛋白質(zhì)是抗體或免疫球蛋白,它們可以中和外來的有害物質(zhì)。 6營養(yǎng)和儲存蛋白 如卵清蛋白和牛奶中的酪蛋白是提供氨基酸的儲存蛋白。在某些植物、細(xì)菌及動物組織中發(fā)現(xiàn)的鐵蛋白可以儲存鐵。 7結(jié)構(gòu)蛋白 許多蛋白質(zhì)起類似細(xì)絲、薄片或纜繩的支持作用,給生物結(jié)構(gòu)以強度及保護(hù)。肌腱和軟骨的主要成分是膠原(collagen),它具有很高的抗張強度。韌帶含有彈性蛋白(elastin),形成蛋白質(zhì)“纜繩”,具有雙向抗拉強度。頭發(fā)、指甲和皮膚主要由堅韌的不溶性角蛋白(keratin)組成。蠶絲和蜘蛛網(wǎng)的主

8、要成分是纖維蛋白(fibrin)。某些昆蟲的翅膀具有近乎完美的回彈特性,它是由節(jié)肢彈性蛋白(resilin)構(gòu)成。 8其他蛋白 有些蛋白質(zhì)的功能相當(dāng)特異,如M一甜蛋白(monellin),這是非洲的一種植物蛋白,味很甜,可作為一種非脂肪性、非毒性的甜味劑。還有蛋白質(zhì)毒素,如蓖麻蛋白、白喉毒素。目    錄第1章Java虛擬機綜述1  11什么是Java虛擬機1  12  由Java程序生成(實際機器的)可執(zhí)行代碼的過程1  13 Java虛擬機規(guī)范2 &#

9、160;14采用Java虛擬機的意義2  15為什么要學(xué)習(xí)Java虛擬機4第2章Java虛擬機的體系結(jié)構(gòu)5    21支持的數(shù)據(jù)類型5    22寄存器6    23局部變量6    24操作數(shù)棧·”6    25運行環(huán)境7    26無用單元收集堆8    27方法區(qū)8 

10、60;  28 Java指令集8    29限制9第3章類文件格式10    31  格式10    32  簽名13    33常數(shù)池14    34域18    35方法1 9    36屬性20第4章虛擬機指令集26 

11、60;  41指令的格式26    42把常數(shù)壓入棧內(nèi)26    43把局部變量裝載到棧內(nèi)29    44把棧中的值存儲到局部變量內(nèi)32    45使用更寬的索引進(jìn)行裝載、存儲和增量35李京華  陳文光,Java虛擬機規(guī)范,清華大學(xué)出版社,1996年12月第1版,第1頁Iris 2015/10/13 21:13:2446管理數(shù)組35  47棧指令42

12、0; 48數(shù)學(xué)指令44  49邏輯指令50  410  轉(zhuǎn)換操作53  411  控制轉(zhuǎn)移操作56  412  函數(shù)返回64  413  表跳轉(zhuǎn)65  414  操作對象域67  415  調(diào)用方法69  416  異常處理71  417  其他對象

13、操作72  418  監(jiān)視器73第5章類文件格式與指令分析舉例74    51源程序及其編譯后的類文件74    52類文件格式中的版本信息75    53常數(shù)池75    54對hello類結(jié)構(gòu)的描述78    55屬性表79    56代碼80附錄A優(yōu)化83    A1常數(shù)池

14、解析83    A2把常數(shù)壓入棧內(nèi)(一quick變體)84    A3管理數(shù)組(quick變體)84    A4操作對象域(一quick變體)85    A5調(diào)用方法(quick變體)88    A6其他對象操作91附錄B指令集索引93附錄C Java虛擬機詞匯表95第1章Java虛擬機綜述11什么是Java虛擬機    什么是Java虛擬機(Ja

15、va Virtual Machine)呢?也許這是你最為關(guān)心的問題。我們認(rèn)為Java虛擬機可以定義為:運行經(jīng)過編譯的Java目標(biāo)代碼的計算機的實現(xiàn)。它能運行的Java程序,既包括獨立的Java應(yīng)用程序(application),也包括下載到諸如Netscape Navigator,HotJava等web瀏覽器中的applet。    一般認(rèn)為,Java虛擬機是建立在實際的處理器基礎(chǔ)上的假想的計算機。在Java語言剛剛推出的一段時間里,Java虛擬機都是通過軟件仿真的方法實現(xiàn)的。經(jīng)過編譯的Java目標(biāo)代碼,我們稱為Java字節(jié)

16、碼(bytecode),再經(jīng)過本地計算機上的Java解釋器的解釋,或者經(jīng)過編譯器的編譯,就可以運行了。    Java虛擬機不但可以用軟件實現(xiàn),也可以用硬件實現(xiàn)。最近就有了硬件實現(xiàn)的Java虛擬機。1992年2月,Sun Microelectronics公司公布了他們的最新產(chǎn)品專門為Java而優(yōu)化設(shè)計的微處理器系列產(chǎn)品。包括性能價格比最高的、用于蜂窩電話、打印機等小型嵌入式設(shè)備的picoJava;建立在picoJava的基礎(chǔ)上、增加了IO、內(nèi)存、通信、控制等功能的通用型的microJava;高檔的、工業(yè)界最快速的Java處理器UltraJava

17、等。    Java虛擬機可以是假想的計算機,也可以是像Sun Microelectronics公司實現(xiàn)的處理器那樣的實際的計算機。當(dāng)然,目前大多數(shù)的Java虛擬機還是用軟件方法實現(xiàn)的。所以,為簡便和通用起見,我們在綜述中介紹的內(nèi)容也大多基于這種軟件實現(xiàn)。但是,本書中介紹的Java虛擬機規(guī)范,是無論哪種實現(xiàn)都要遵從的。12  由Java程序生成(實際機器的)可執(zhí)行    代碼的過程    許多程序設(shè)計語言通過對源程序進(jìn)行編譯和鏈接,直接生成可執(zhí)行

18、的代碼。而Java語言和它們不同,它的這個過程包括Java程序的編譯,字節(jié)碼的裝入、校驗、解釋或編譯。了解Java語言的這個過程,對掌握J(rèn)ava虛擬機會有所幫助。    Java程序首先經(jīng)過編譯,生成字節(jié)碼。這個過程由程序開發(fā)者的Java編譯程序完成。字節(jié)碼的層次大致相當(dāng)于匯編語言一級。當(dāng)然,它并不是針對某種特定的計算機硬件平臺的。對變量和方法(相當(dāng)于函數(shù))的引用,并不在編譯過程中確定為數(shù)值引用,即通過具體的偏移量的值引用,而是將符號引用的信息保存在字節(jié)碼中。    字節(jié)碼的裝入、校驗、解釋或編譯,由本地計算機的解

19、釋器或編譯器完成。首先,類裝入器裝入程序所需的所有代碼,包括程序中調(diào)用(use)、包含(contain)、繼承(inherit)的所有類李京華  陳文光,Java虛擬機規(guī)范,清華大學(xué)出版社,1996年12月第1版,第1頁Iris 2015/10/13 21:14:01的代碼。每個類都被裝入一個獨立的名字空間內(nèi),彼此之間只有通過符號引用才能互相作用。本地的類和外部的類在地址空間上是區(qū)分開的。所有的類都裝入以后,可執(zhí)行代碼的內(nèi)存布局就被確定。由符號引用到內(nèi)存地址空間的查詢表也建立起來了。然后,字節(jié)碼校驗器對裝入的字節(jié)碼進(jìn)行校驗,以排除錯誤和不安全的因素。最后

20、,目前通常由解釋器解釋執(zhí)行字節(jié)碼。但是,解釋執(zhí)行的速度較慢,一般比C語言慢15倍左右。而如果編譯執(zhí)行,速度將基本能和C語言匹敵。截止到我們寫稿時為止,Sun公司還未推出Java字節(jié)碼的編譯器。但是可以預(yù)計,今后各方開發(fā)商將會逐漸推出Java編譯器,以滿足速度要求較高的程序的要求。13 Java虛擬機規(guī)范    為什么要為Java虛擬機制定規(guī)范呢?一個最明顯的理由就是要保證Java代碼在任何系統(tǒng)上都能夠運行。凡是符合Java虛擬機規(guī)范的實現(xiàn),都是百分之百兼容的。Java虛擬機對其實現(xiàn)作出了具體的規(guī)定。    

21、;Java虛擬機的體系結(jié)構(gòu)直接支持Java語言的這些基本數(shù)據(jù)類型,包括byte、short、int、long、float、double和char。它們的定義是獨立于具體的平臺的,這為Java程序的可移植性打下了基礎(chǔ)。規(guī)范沒有對object的內(nèi)部結(jié)構(gòu)作特殊的要求。由于在各種計算機體系結(jié)構(gòu)中,寄存器的設(shè)置千差萬別,所以Java虛擬機采用了面向堆棧的體系結(jié)構(gòu),只設(shè)置了數(shù)量很少的寄存器。這幾個寄存器是程序計數(shù)器,棧頂指針,運行環(huán)境指針和局部變量指針。這種設(shè)置減少了在只有少量寄存器或非通用寄存器的計算機上實現(xiàn)的困難。而對于擁有較多寄存器的計算機,可以通過具體實現(xiàn)時的優(yōu)化以充分利用計算機的資源。Java虛擬機的局部變量和操作數(shù)棧都是32位的,long和double類型需要占據(jù)兩個32位空間。除了以上方面的內(nèi)容,Java虛擬機還對運行環(huán)境、無用單元收集堆、方法區(qū)、指令集和限制等方面作了規(guī)定。 &

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